MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_022108	AGT	2	6	387978	387983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_022108	T	6	6	388000	388005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_022108	CT	4	8	388105	388112	0 %	50 %	0 %	50 %	532351684
8505	NC_022108	AAC	2	6	388166	388171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351684
8506	NC_022108	TAA	2	6	388172	388177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351684
8507	NC_022108	T	7	7	388186	388192	0 %	100 %	0 %	0 %	532351684
8508	NC_022108	GAA	2	6	388372	388377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351684
8509	NC_022108	AGA	2	6	388385	388390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351684
8510	NC_022108	CGT	2	6	388400	388405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351684
8511	NC_022108	TAAA	2	8	388408	388415	75 %	25 %	0 %	0 %	532351684
8512	NC_022108	ACC	2	6	388449	388454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351684
8513	NC_022108	AGC	2	6	388472	388477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351684
8514	NC_022108	TAA	2	6	388481	388486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351684
8515	NC_022108	GCA	2	6	388500	388505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351684
8516	NC_022108	ACC	2	6	388518	388523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351684
8517	NC_022108	TTA	2	6	388609	388614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351684
8518	NC_022108	TAG	2	6	388647	388652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351684
8519	NC_022108	GCT	2	6	388659	388664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351684
8520	NC_022108	CAG	2	6	388756	388761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351684
8521	NC_022108	ATA	2	6	388767	388772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351684
8522	NC_022108	ACT	2	6	388887	388892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351684
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8524	NC_022108	AGG	2	6	388969	388974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351684
8525	NC_022108	ATC	2	6	389150	389155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351684
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8529	NC_022108	CAT	2	6	389687	389692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351684
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8532	NC_022108	TAA	2	6	389790	389795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351684
8533	NC_022108	AAC	3	9	389907	389915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351684
8534	NC_022108	CAG	2	6	389968	389973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351684
8535	NC_022108	CAG	2	6	390001	390006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351684
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8537	NC_022108	A	8	8	390053	390060	100 %	0 %	0 %	0 %	532351684
8538	NC_022108	AGC	2	6	390117	390122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351685
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8540	NC_022108	CTT	2	6	390321	390326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351685
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8542	NC_022108	ATC	2	6	390375	390380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351685
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8551	NC_022108	TCC	2	6	390984	390989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351685
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8553	NC_022108	CTTT	2	8	391154	391161	0 %	75 %	0 %	25 %	532351685
8554	NC_022108	TTC	2	6	391164	391169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351685
8555	NC_022108	GTA	2	6	391203	391208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351685
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8557	NC_022108	T	7	7	391285	391291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_022108	CTT	2	6	391341	391346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351686
8559	NC_022108	T	7	7	391353	391359	0 %	100 %	0 %	0 %	532351686
8560	NC_022108	TAA	2	6	391450	391455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351686
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8562	NC_022108	TTTA	2	8	391504	391511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_022108	CTT	2	6	391541	391546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_022108	GTT	2	6	391591	391596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_022108	A	7	7	391618	391624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8579	NC_022108	AATT	2	8	392312	392319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8582	NC_022108	TTG	2	6	392455	392460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_022108	GTA	2	6	392468	392473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8585	NC_022108	CA	3	6	392506	392511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8591	NC_022108	T	6	6	392710	392715	0 %	100 %	0 %	0 %	532351688
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8596	NC_022108	A	7	7	392817	392823	100 %	0 %	0 %	0 %	532351688
8597	NC_022108	CG	3	6	392880	392885	0 %	0 %	50 %	50 %	532351688
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8603	NC_022108	A	6	6	393262	393267	100 %	0 %	0 %	0 %	532351688
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8606	NC_022108	A	6	6	393305	393310	100 %	0 %	0 %	0 %	532351688
8607	NC_022108	AGAA	2	8	393335	393342	75 %	0 %	25 %	0 %	532351688
8608	NC_022108	AAC	2	6	393356	393361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351688
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8613	NC_022108	TAAA	2	8	393623	393630	75 %	25 %	0 %	0 %	532351688
8614	NC_022108	AGA	2	6	393645	393650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351688
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