MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_022108	GCTCA	2	10	365373	365382	20 %	20 %	20 %	40 %	532351667
8002	NC_022108	CTCTT	2	10	365493	365502	0 %	60 %	0 %	40 %	532351668
8003	NC_022108	ACAA	2	8	365532	365539	75 %	0 %	0 %	25 %	532351668
8004	NC_022108	T	8	8	365660	365667	0 %	100 %	0 %	0 %	532351668
8005	NC_022108	T	6	6	365768	365773	0 %	100 %	0 %	0 %	532351668
8006	NC_022108	GGA	2	6	365813	365818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351668
8007	NC_022108	TCC	2	6	365909	365914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351668
8008	NC_022108	ACT	2	6	365925	365930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351668
8009	NC_022108	CGA	2	6	365940	365945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_022108	GC	3	6	366029	366034	0 %	0 %	50 %	50 %	532352227
8011	NC_022108	TGT	2	6	366041	366046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352227
8012	NC_022108	GAA	2	6	366082	366087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352227
8013	NC_022108	TAT	2	6	366124	366129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352227
8014	NC_022108	ACG	2	6	366133	366138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352227
8015	NC_022108	TTG	2	6	366183	366188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352227
8016	NC_022108	GCA	2	6	366306	366311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352227
8017	NC_022108	TGT	2	6	366312	366317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352227
8018	NC_022108	TC	3	6	366333	366338	0 %	50 %	0 %	50 %	532352227
8019	NC_022108	ATC	2	6	366341	366346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352227
8020	NC_022108	TCT	2	6	366396	366401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352227
8021	NC_022108	TA	3	6	366403	366408	50 %	50 %	0 %	0 %	532352227
8022	NC_022108	CAA	2	6	366439	366444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352227
8023	NC_022108	AGGC	2	8	366457	366464	25 %	0 %	50 %	25 %	532352227
8024	NC_022108	TCCA	2	8	366513	366520	25 %	25 %	0 %	50 %	532352227
8025	NC_022108	A	7	7	366520	366526	100 %	0 %	0 %	0 %	532352227
8026	NC_022108	AGC	2	6	366564	366569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352227
8027	NC_022108	ACCA	2	8	366590	366597	50 %	0 %	0 %	50 %	532352228
8028	NC_022108	CTT	2	6	366653	366658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352228
8029	NC_022108	CTC	2	6	366696	366701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352228
8030	NC_022108	AAG	2	6	366708	366713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352228
8031	NC_022108	AGT	2	6	366808	366813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352228
8032	NC_022108	CAA	2	6	366814	366819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352228
8033	NC_022108	AGGGA	2	10	366844	366853	40 %	0 %	60 %	0 %	532352228
8034	NC_022108	GCT	2	6	366857	366862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352228
8035	NC_022108	AGA	2	6	366868	366873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352228
8036	NC_022108	TCT	2	6	366923	366928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352228
8037	NC_022108	TAC	2	6	366934	366939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352228
8038	NC_022108	TAG	2	6	366978	366983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352228
8039	NC_022108	GCAT	2	8	367054	367061	25 %	25 %	25 %	25 %	532352228
8040	NC_022108	TGAG	2	8	367087	367094	25 %	25 %	50 %	0 %	532352228
8041	NC_022108	AC	3	6	367115	367120	50 %	0 %	0 %	50 %	532352228
8042	NC_022108	A	6	6	367216	367221	100 %	0 %	0 %	0 %	532352228
8043	NC_022108	CAA	2	6	367236	367241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352228
8044	NC_022108	CT	4	8	367287	367294	0 %	50 %	0 %	50 %	532352228
8045	NC_022108	CAA	2	6	367375	367380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352228
8046	NC_022108	TGA	2	6	367397	367402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352228
8047	NC_022108	CCA	2	6	367463	367468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352228
8048	NC_022108	TGA	2	6	367493	367498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352228
8049	NC_022108	CT	3	6	367520	367525	0 %	50 %	0 %	50 %	532352228
8050	NC_022108	CA	3	6	367529	367534	50 %	0 %	0 %	50 %	532352228
8051	NC_022108	CAA	2	6	367575	367580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352228
8052	NC_022108	GTC	3	9	367594	367602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352228
8053	NC_022108	ATC	3	9	367603	367611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352228
8054	NC_022108	GCA	2	6	367649	367654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352228
8055	NC_022108	C	9	9	367698	367706	0 %	0 %	0 %	100 %	532352228
8056	NC_022108	TCT	2	6	367777	367782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352229
8057	NC_022108	GAA	2	6	367786	367791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352229
8058	NC_022108	TCG	2	6	367822	367827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352229
8059	NC_022108	TATG	2	8	367829	367836	25 %	50 %	25 %	0 %	532352229
8060	NC_022108	GT	3	6	367847	367852	0 %	50 %	50 %	0 %	532352229
8061	NC_022108	TAT	2	6	367859	367864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352229
8062	NC_022108	TCT	2	6	367885	367890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352229
8063	NC_022108	AAC	2	6	367923	367928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352229
8064	NC_022108	A	6	6	367973	367978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_022108	A	8	8	367993	368000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_022108	ATC	2	6	368038	368043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_022108	TCTCT	2	10	368060	368069	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8068	NC_022108	CCT	2	6	368076	368081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8069	NC_022108	CAT	2	6	368129	368134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351669
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8071	NC_022108	AAC	2	6	368144	368149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351669
8072	NC_022108	AACA	2	8	368173	368180	75 %	0 %	0 %	25 %	532351669
8073	NC_022108	CTG	3	9	368192	368200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351669
8074	NC_022108	GT	3	6	368245	368250	0 %	50 %	50 %	0 %	532351669
8075	NC_022108	AT	3	6	368253	368258	50 %	50 %	0 %	0 %	532351669
8076	NC_022108	AAT	2	6	368262	368267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351669
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8079	NC_022108	AAG	2	6	368417	368422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_022108	AACAA	2	10	368443	368452	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8081	NC_022108	GAA	2	6	368453	368458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_022108	GCTT	2	8	368502	368509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8083	NC_022108	ACA	2	6	368621	368626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_022108	TGA	2	6	368646	368651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_022108	TCA	2	6	368700	368705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_022108	TAA	2	6	368706	368711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_022108	A	6	6	368714	368719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_022108	AAAAC	2	10	368765	368774	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8089	NC_022108	TAAA	2	8	368780	368787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_022108	TGC	2	6	369255	369260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351670
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8099	NC_022108	GAATA	2	10	369333	369342	60 %	20 %	20 %	0 %	532351670
8100	NC_022108	GTC	2	6	369376	369381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351670
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8103	NC_022108	CAT	2	6	369560	369565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351670
8104	NC_022108	A	6	6	369642	369647	100 %	0 %	0 %	0 %	532351670
8105	NC_022108	AAAT	2	8	369698	369705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_022108	CCTT	2	8	369720	369727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8107	NC_022108	ATCT	2	8	369753	369760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8108	NC_022108	ACAA	2	8	369762	369769	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8109	NC_022108	TCC	2	6	369991	369996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351671
8110	NC_022108	CTG	2	6	370004	370009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351671
8111	NC_022108	CAA	2	6	370019	370024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351671
8112	NC_022108	TCTT	2	8	370044	370051	0 %	75 %	0 %	25 %	532351671
8113	NC_022108	GCT	2	6	370205	370210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351671
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8116	NC_022108	GGA	2	6	370493	370498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351671
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8118	NC_022108	GGA	2	6	370562	370567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351671
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8120	NC_022108	CCT	2	6	370653	370658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351671
8121	NC_022108	A	7	7	370702	370708	100 %	0 %	0 %	0 %	532351672
8122	NC_022108	TTC	2	6	370711	370716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351672
8123	NC_022108	ACAA	2	8	370754	370761	75 %	0 %	0 %	25 %	532351672
8124	NC_022108	T	7	7	370814	370820	0 %	100 %	0 %	0 %	532351672
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8126	NC_022108	TGC	2	6	370960	370965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351672
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8242	NC_022108	A	6	6	376209	376214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8243	NC_022108	GA	3	6	376238	376243	50 %	0 %	50 %	0 %	532351677
8244	NC_022108	TCT	2	6	376279	376284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351677
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8246	NC_022108	CCCTC	2	10	376334	376343	0 %	20 %	0 %	80 %	532351677
8247	NC_022108	ACA	2	6	376351	376356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351677
8248	NC_022108	A	6	6	376386	376391	100 %	0 %	0 %	0 %	532351677
8249	NC_022108	AAC	2	6	376439	376444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351677
8250	NC_022108	ACAT	2	8	376445	376452	50 %	25 %	0 %	25 %	532351677
8251	NC_022108	GTA	2	6	376463	376468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351677
8252	NC_022108	AACT	2	8	376476	376483	50 %	25 %	0 %	25 %	532351677
8253	NC_022108	TACAC	2	10	376533	376542	40 %	20 %	0 %	40 %	532351677
8254	NC_022108	A	6	6	376565	376570	100 %	0 %	0 %	0 %	532351677
8255	NC_022108	GCTC	2	8	376617	376624	0 %	25 %	25 %	50 %	532351677
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8293	NC_022108	TCA	2	6	378729	378734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351677
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8349	NC_022108	A	8	8	381159	381166	100 %	0 %	0 %	0 %	532351677
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8351	NC_022108	CT	3	6	381234	381239	0 %	50 %	0 %	50 %	532351677
8352	NC_022108	A	6	6	381251	381256	100 %	0 %	0 %	0 %	532351677
8353	NC_022108	TTCC	2	8	381283	381290	0 %	50 %	0 %	50 %	532351677
8354	NC_022108	CT	3	6	381333	381338	0 %	50 %	0 %	50 %	532351677
8355	NC_022108	CAA	3	9	381346	381354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351677
8356	NC_022108	AGT	2	6	381402	381407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351677
8357	NC_022108	ACC	2	6	381419	381424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351677
8358	NC_022108	TC	3	6	381431	381436	0 %	50 %	0 %	50 %	532351677
8359	NC_022108	ATCT	2	8	381509	381516	25 %	50 %	0 %	25 %	532351677
8360	NC_022108	TAAA	2	8	381536	381543	75 %	25 %	0 %	0 %	532351677
8361	NC_022108	A	6	6	381607	381612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8362	NC_022108	CT	4	8	381617	381624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8363	NC_022108	TCA	2	6	381710	381715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8364	NC_022108	AAG	2	6	381766	381771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8365	NC_022108	GCA	2	6	381854	381859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351678
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8367	NC_022108	TC	3	6	381993	381998	0 %	50 %	0 %	50 %	532351678
8368	NC_022108	TAT	2	6	382117	382122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351678
8369	NC_022108	TGA	2	6	382123	382128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351678
8370	NC_022108	CTAA	2	8	382139	382146	50 %	25 %	0 %	25 %	532351678
8371	NC_022108	CTA	2	6	382163	382168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351678
8372	NC_022108	CCT	2	6	382184	382189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351678
8373	NC_022108	CAT	2	6	382294	382299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351678
8374	NC_022108	AAG	2	6	382326	382331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351678
8375	NC_022108	GCT	2	6	382373	382378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351678
8376	NC_022108	GTA	2	6	382418	382423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351678
8377	NC_022108	ACAGC	2	10	382452	382461	40 %	0 %	20 %	40 %	532351678
8378	NC_022108	TAC	2	6	382516	382521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351678
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8380	NC_022108	CTC	2	6	382672	382677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351678
8381	NC_022108	A	6	6	382746	382751	100 %	0 %	0 %	0 %	532351678
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8383	NC_022108	TCT	2	6	382777	382782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351678
8384	NC_022108	TC	3	6	382806	382811	0 %	50 %	0 %	50 %	532351678
8385	NC_022108	CAC	2	6	382890	382895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351678
8386	NC_022108	AAATC	2	10	382896	382905	60 %	20 %	0 %	20 %	532351678
8387	NC_022108	ATC	3	9	382927	382935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351678
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8389	NC_022108	TCA	2	6	382988	382993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351678
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8393	NC_022108	TC	3	6	383036	383041	0 %	50 %	0 %	50 %	532351678
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8396	NC_022108	CT	3	6	383207	383212	0 %	50 %	0 %	50 %	532351679
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8400	NC_022108	AGC	2	6	383375	383380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351679
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8408	NC_022108	TGA	2	6	383680	383685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351680
8409	NC_022108	TAA	2	6	383693	383698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351680
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8412	NC_022108	ATC	2	6	383824	383829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351680
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8421	NC_022108	TACT	2	8	384275	384282	25 %	50 %	0 %	25 %	532351680
8422	NC_022108	GA	5	10	384292	384301	50 %	0 %	50 %	0 %	532351680
8423	NC_022108	CTGCAC	2	12	384324	384335	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532351680
8424	NC_022108	GCTT	2	8	384358	384365	0 %	50 %	25 %	25 %	532351680
8425	NC_022108	ATA	2	6	384369	384374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351680
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8430	NC_022108	TC	3	6	384773	384778	0 %	50 %	0 %	50 %	532351680
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8445	NC_022108	CTG	2	6	385405	385410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351681
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8447	NC_022108	C	6	6	385469	385474	0 %	0 %	0 %	100 %	532351681
8448	NC_022108	TTC	2	6	385485	385490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351681
8449	NC_022108	ATG	2	6	385511	385516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351681
8450	NC_022108	ATA	2	6	385545	385550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351681
8451	NC_022108	CTT	2	6	385562	385567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351681
8452	NC_022108	AGA	2	6	385581	385586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351681
8453	NC_022108	T	8	8	385596	385603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8454	NC_022108	CCAG	2	8	385647	385654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8455	NC_022108	GAT	2	6	385780	385785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351682
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8460	NC_022108	A	8	8	385974	385981	100 %	0 %	0 %	0 %	532351682
8461	NC_022108	AAC	2	6	386014	386019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351682
8462	NC_022108	AGG	2	6	386035	386040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351682
8463	NC_022108	CAT	2	6	386085	386090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351682
8464	NC_022108	A	7	7	386145	386151	100 %	0 %	0 %	0 %	532351682
8465	NC_022108	CTT	2	6	386291	386296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352230
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8471	NC_022108	CTG	2	6	386527	386532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351683
8472	NC_022108	CTA	2	6	386621	386626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351683
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8474	NC_022108	TTAA	2	8	386717	386724	50 %	50 %	0 %	0 %	532351683
8475	NC_022108	A	9	9	386723	386731	100 %	0 %	0 %	0 %	532351683
8476	NC_022108	CTCA	2	8	386732	386739	25 %	25 %	0 %	50 %	532351683
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8482	NC_022108	TCA	2	6	386998	387003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351683
8483	NC_022108	CT	3	6	387074	387079	0 %	50 %	0 %	50 %	532351683
8484	NC_022108	T	6	6	387123	387128	0 %	100 %	0 %	0 %	532351683
8485	NC_022108	CTT	3	9	387166	387174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351683
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8487	NC_022108	CT	4	8	387227	387234	0 %	50 %	0 %	50 %	532351683
8488	NC_022108	TATTC	2	10	387289	387298	20 %	60 %	0 %	20 %	532351683
8489	NC_022108	T	6	6	387360	387365	0 %	100 %	0 %	0 %	532351683
8490	NC_022108	GCTC	2	8	387366	387373	0 %	25 %	25 %	50 %	532351683
8491	NC_022108	ATC	2	6	387385	387390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351683
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8493	NC_022108	ATTTT	2	10	387428	387437	20 %	80 %	0 %	0 %	532351683
8494	NC_022108	ATT	2	6	387481	387486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351683
8495	NC_022108	TC	3	6	387540	387545	0 %	50 %	0 %	50 %	532351683
8496	NC_022108	TGC	2	6	387547	387552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351683
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