MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_022108	T	6	6	341324	341329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_022108	CCA	3	9	341349	341357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351648
7503	NC_022108	ATA	2	6	341454	341459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351648
7504	NC_022108	ATA	2	6	341669	341674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351648
7505	NC_022108	CCT	2	6	341685	341690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351648
7506	NC_022108	ATAG	2	8	341741	341748	50 %	25 %	25 %	0 %	532351648
7507	NC_022108	AT	3	6	341757	341762	50 %	50 %	0 %	0 %	532351648
7508	NC_022108	AGA	2	6	341792	341797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351648
7509	NC_022108	TAC	2	6	341840	341845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351648
7510	NC_022108	AAC	2	6	341897	341902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351648
7511	NC_022108	TA	3	6	341908	341913	50 %	50 %	0 %	0 %	532351648
7512	NC_022108	CTA	2	6	341925	341930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351648
7513	NC_022108	AGA	2	6	341943	341948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351648
7514	NC_022108	TCT	2	6	341965	341970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351648
7515	NC_022108	ATA	2	6	342029	342034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351648
7516	NC_022108	TTC	2	6	342042	342047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351648
7517	NC_022108	A	6	6	342110	342115	100 %	0 %	0 %	0 %	532351648
7518	NC_022108	TGT	2	6	342119	342124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351648
7519	NC_022108	CTC	2	6	342127	342132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351648
7520	NC_022108	AC	4	8	342137	342144	50 %	0 %	0 %	50 %	532351648
7521	NC_022108	ATG	2	6	342235	342240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351648
7522	NC_022108	A	7	7	342246	342252	100 %	0 %	0 %	0 %	532351648
7523	NC_022108	TAA	2	6	342274	342279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351648
7524	NC_022108	A	7	7	342288	342294	100 %	0 %	0 %	0 %	532351648
7525	NC_022108	CTTCA	2	10	342476	342485	20 %	40 %	0 %	40 %	532351648
7526	NC_022108	ATC	2	6	342530	342535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351648
7527	NC_022108	TCT	2	6	342543	342548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351648
7528	NC_022108	CATTG	2	10	342580	342589	20 %	40 %	20 %	20 %	532351648
7529	NC_022108	CTT	2	6	342647	342652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351648
7530	NC_022108	TCC	2	6	342681	342686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351648
7531	NC_022108	TCT	2	6	342810	342815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351648
7532	NC_022108	A	7	7	342853	342859	100 %	0 %	0 %	0 %	532351648
7533	NC_022108	TTC	2	6	342899	342904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351648
7534	NC_022108	CTG	2	6	343057	343062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351648
7535	NC_022108	TTAG	2	8	343074	343081	25 %	50 %	25 %	0 %	532351648
7536	NC_022108	TC	3	6	343171	343176	0 %	50 %	0 %	50 %	532351648
7537	NC_022108	AGA	2	6	343186	343191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351648
7538	NC_022108	CTT	2	6	343199	343204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351648
7539	NC_022108	AATA	2	8	343211	343218	75 %	25 %	0 %	0 %	532351648
7540	NC_022108	ACT	2	6	343248	343253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351648
7541	NC_022108	TGC	2	6	343259	343264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351648
7542	NC_022108	T	7	7	343269	343275	0 %	100 %	0 %	0 %	532351648
7543	NC_022108	T	6	6	343369	343374	0 %	100 %	0 %	0 %	532351649
7544	NC_022108	TTC	3	9	343411	343419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351649
7545	NC_022108	AGC	2	6	343424	343429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351649
7546	NC_022108	AAG	2	6	343489	343494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351649
7547	NC_022108	AG	3	6	343493	343498	50 %	0 %	50 %	0 %	532351649
7548	NC_022108	TAA	2	6	343519	343524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351649
7549	NC_022108	AAGT	2	8	343539	343546	50 %	25 %	25 %	0 %	532351649
7550	NC_022108	AG	3	6	343643	343648	50 %	0 %	50 %	0 %	532351649
7551	NC_022108	CTTT	2	8	343760	343767	0 %	75 %	0 %	25 %	532351649
7552	NC_022108	CTT	2	6	343903	343908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351649
7553	NC_022108	CTT	2	6	343954	343959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351650
7554	NC_022108	AAT	2	6	344001	344006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351650
7555	NC_022108	TAA	2	6	344018	344023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351650
7556	NC_022108	AG	3	6	344039	344044	50 %	0 %	50 %	0 %	532351650
7557	NC_022108	TCT	2	6	344137	344142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351650
7558	NC_022108	TAA	2	6	344224	344229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351650
7559	NC_022108	TG	3	6	344253	344258	0 %	50 %	50 %	0 %	532351650
7560	NC_022108	ATC	2	6	344261	344266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351650
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7562	NC_022108	ATGA	2	8	344552	344559	50 %	25 %	25 %	0 %	532351650
7563	NC_022108	GAA	2	6	344606	344611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351650
7564	NC_022108	CAA	2	6	344620	344625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351650
7565	NC_022108	ATCCC	2	10	344632	344641	20 %	20 %	0 %	60 %	532351650
7566	NC_022108	C	6	6	344639	344644	0 %	0 %	0 %	100 %	532351650
7567	NC_022108	AAT	2	6	344645	344650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351650
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7571	NC_022108	ATCA	2	8	344762	344769	50 %	25 %	0 %	25 %	532351650
7572	NC_022108	GTTC	2	8	344777	344784	0 %	50 %	25 %	25 %	532351650
7573	NC_022108	ACC	2	6	344987	344992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351650
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7575	NC_022108	TTC	2	6	345226	345231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351651
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7582	NC_022108	TCT	2	6	345643	345648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351651
7583	NC_022108	TTC	2	6	345718	345723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351651
7584	NC_022108	CCT	2	6	345731	345736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351651
7585	NC_022108	TCT	2	6	345869	345874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351651
7586	NC_022108	TC	3	6	345888	345893	0 %	50 %	0 %	50 %	532351651
7587	NC_022108	AAAT	2	8	345983	345990	75 %	25 %	0 %	0 %	532351651
7588	NC_022108	AGA	2	6	345991	345996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351651
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7591	NC_022108	CA	3	6	346137	346142	50 %	0 %	0 %	50 %	532351651
7592	NC_022108	CAG	2	6	346158	346163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351651
7593	NC_022108	TGC	2	6	346181	346186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351651
7594	NC_022108	TCC	2	6	346231	346236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351651
7595	NC_022108	A	6	6	346316	346321	100 %	0 %	0 %	0 %	532351651
7596	NC_022108	GCTT	2	8	346322	346329	0 %	50 %	25 %	25 %	532351651
7597	NC_022108	CAA	2	6	346392	346397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351651
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7605	NC_022108	AG	4	8	347100	347107	50 %	0 %	50 %	0 %	532351652
7606	NC_022108	TC	3	6	347152	347157	0 %	50 %	0 %	50 %	532351652
7607	NC_022108	GAA	2	6	347163	347168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351652
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7610	NC_022108	CTAA	2	8	347383	347390	50 %	25 %	0 %	25 %	532351652
7611	NC_022108	GAG	2	6	347417	347422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351652
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7613	NC_022108	CAA	2	6	347493	347498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351652
7614	NC_022108	AAAAG	2	10	347529	347538	80 %	0 %	20 %	0 %	532351652
7615	NC_022108	A	6	6	347560	347565	100 %	0 %	0 %	0 %	532351652
7616	NC_022108	A	7	7	347583	347589	100 %	0 %	0 %	0 %	532351652
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7622	NC_022108	GAG	2	6	347693	347698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351652
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7624	NC_022108	A	6	6	347713	347718	100 %	0 %	0 %	0 %	532351652
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7752	NC_022108	CCTTC	2	10	353709	353718	0 %	40 %	0 %	60 %	532351657
7753	NC_022108	ATT	2	6	353798	353803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351657
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7830	NC_022108	TCG	2	6	357652	357657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351658
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7998	NC_022108	AT	3	6	365221	365226	50 %	50 %	0 %	0 %	532351667
7999	NC_022108	GAA	2	6	365304	365309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351667
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