MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022108	CAA	2	6	296392	296397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351609
6502	NC_022108	CTA	2	6	296398	296403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351609
6503	NC_022108	AG	3	6	296447	296452	50 %	0 %	50 %	0 %	532351609
6504	NC_022108	CCT	2	6	296487	296492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351609
6505	NC_022108	CAA	2	6	296548	296553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351609
6506	NC_022108	TAT	2	6	296554	296559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351609
6507	NC_022108	AAG	2	6	296570	296575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351609
6508	NC_022108	CTCC	2	8	296614	296621	0 %	25 %	0 %	75 %	532351609
6509	NC_022108	AGA	2	6	296634	296639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351609
6510	NC_022108	A	6	6	296677	296682	100 %	0 %	0 %	0 %	532351609
6511	NC_022108	CTT	2	6	296750	296755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351609
6512	NC_022108	AGA	2	6	296775	296780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351609
6513	NC_022108	TGA	2	6	296914	296919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351610
6514	NC_022108	GCA	3	9	296998	297006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351610
6515	NC_022108	AAT	2	6	297068	297073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351610
6516	NC_022108	ACA	2	6	297094	297099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351610
6517	NC_022108	CCT	2	6	297124	297129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351610
6518	NC_022108	TTC	2	6	297222	297227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351610
6519	NC_022108	ATGC	2	8	297357	297364	25 %	25 %	25 %	25 %	532351610
6520	NC_022108	ATC	2	6	297450	297455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351610
6521	NC_022108	T	6	6	297584	297589	0 %	100 %	0 %	0 %	532351610
6522	NC_022108	ATCT	2	8	297596	297603	25 %	50 %	0 %	25 %	532351610
6523	NC_022108	GAA	3	9	297631	297639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351610
6524	NC_022108	T	7	7	297658	297664	0 %	100 %	0 %	0 %	532351610
6525	NC_022108	T	6	6	297683	297688	0 %	100 %	0 %	0 %	532351610
6526	NC_022108	AGT	2	6	297718	297723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351610
6527	NC_022108	CTT	2	6	297742	297747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351610
6528	NC_022108	A	6	6	297750	297755	100 %	0 %	0 %	0 %	532351610
6529	NC_022108	ACAA	2	8	297769	297776	75 %	0 %	0 %	25 %	532351610
6530	NC_022108	AAC	2	6	297785	297790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_022108	TG	3	6	297895	297900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_022108	A	6	6	297916	297921	100 %	0 %	0 %	0 %	532351611
6533	NC_022108	A	6	6	297956	297961	100 %	0 %	0 %	0 %	532351611
6534	NC_022108	AGA	2	6	297978	297983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351611
6535	NC_022108	A	6	6	298116	298121	100 %	0 %	0 %	0 %	532351611
6536	NC_022108	AGA	2	6	298146	298151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351611
6537	NC_022108	GAA	2	6	298246	298251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351611
6538	NC_022108	CTT	2	6	298286	298291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351611
6539	NC_022108	A	6	6	298405	298410	100 %	0 %	0 %	0 %	532351611
6540	NC_022108	ACCACT	2	12	298431	298442	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532351611
6541	NC_022108	AAG	2	6	298457	298462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351611
6542	NC_022108	TCT	2	6	298513	298518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351611
6543	NC_022108	CTT	2	6	298526	298531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351611
6544	NC_022108	T	6	6	298562	298567	0 %	100 %	0 %	0 %	532351611
6545	NC_022108	CTT	2	6	298586	298591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351611
6546	NC_022108	TC	3	6	298617	298622	0 %	50 %	0 %	50 %	532351611
6547	NC_022108	AAT	2	6	298630	298635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351611
6548	NC_022108	T	6	6	298655	298660	0 %	100 %	0 %	0 %	532351611
6549	NC_022108	ACA	2	6	298703	298708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351611
6550	NC_022108	AAGG	2	8	298739	298746	50 %	0 %	50 %	0 %	532351611
6551	NC_022108	A	6	6	298756	298761	100 %	0 %	0 %	0 %	532351611
6552	NC_022108	CGA	2	6	298768	298773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351611
6553	NC_022108	AAT	2	6	298774	298779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351611
6554	NC_022108	CTT	2	6	298838	298843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351611
6555	NC_022108	GAT	2	6	298898	298903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351611
6556	NC_022108	TTC	2	6	298925	298930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351611
6557	NC_022108	CTT	2	6	298935	298940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351611
6558	NC_022108	CTA	2	6	299033	299038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351611
6559	NC_022108	TAA	2	6	299046	299051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351611
6560	NC_022108	A	6	6	299068	299073	100 %	0 %	0 %	0 %	532351611
6561	NC_022108	GCTT	2	8	299099	299106	0 %	50 %	25 %	25 %	532351611
6562	NC_022108	AAAGC	2	10	299132	299141	60 %	0 %	20 %	20 %	532351611
6563	NC_022108	GAA	2	6	299152	299157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351611
6564	NC_022108	AAG	2	6	299162	299167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351611
6565	NC_022108	TTG	2	6	299171	299176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351611
6566	NC_022108	TCAA	2	8	299182	299189	50 %	25 %	0 %	25 %	532351611
6567	NC_022108	CTG	2	6	299252	299257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351612
6568	NC_022108	TC	3	6	299289	299294	0 %	50 %	0 %	50 %	532351612
6569	NC_022108	A	6	6	299368	299373	100 %	0 %	0 %	0 %	532351612
6570	NC_022108	TCT	2	6	299441	299446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351612
6571	NC_022108	TTG	2	6	299469	299474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351612
6572	NC_022108	CCT	2	6	299475	299480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351612
6573	NC_022108	AT	3	6	299518	299523	50 %	50 %	0 %	0 %	532351612
6574	NC_022108	T	7	7	299559	299565	0 %	100 %	0 %	0 %	532351612
6575	NC_022108	CCCT	2	8	299666	299673	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6576	NC_022108	ATT	2	6	299681	299686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_022108	T	7	7	299694	299700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_022108	GCGA	2	8	299786	299793	25 %	0 %	50 %	25 %	532351613
6579	NC_022108	GCTC	2	8	299815	299822	0 %	25 %	25 %	50 %	532351613
6580	NC_022108	GAAA	2	8	299833	299840	75 %	0 %	25 %	0 %	532351613
6581	NC_022108	GTT	2	6	299869	299874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351613
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6583	NC_022108	T	7	7	299929	299935	0 %	100 %	0 %	0 %	532351613
6584	NC_022108	CT	3	6	299965	299970	0 %	50 %	0 %	50 %	532351613
6585	NC_022108	AAAT	2	8	300007	300014	75 %	25 %	0 %	0 %	532351613
6586	NC_022108	CTTA	2	8	300105	300112	25 %	50 %	0 %	25 %	532351613
6587	NC_022108	GCA	2	6	300313	300318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351613
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6589	NC_022108	ACT	2	6	300339	300344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351613
6590	NC_022108	AGC	2	6	300352	300357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351613
6591	NC_022108	AAT	2	6	300364	300369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351613
6592	NC_022108	CA	4	8	300399	300406	50 %	0 %	0 %	50 %	532351613
6593	NC_022108	ATC	2	6	300415	300420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351613
6594	NC_022108	CAA	2	6	300543	300548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351614
6595	NC_022108	AT	3	6	300576	300581	50 %	50 %	0 %	0 %	532351614
6596	NC_022108	AAT	2	6	300586	300591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351614
6597	NC_022108	TCT	2	6	300602	300607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351614
6598	NC_022108	CCA	2	6	300695	300700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351614
6599	NC_022108	AAT	2	6	300712	300717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351614
6600	NC_022108	AGGA	2	8	300733	300740	50 %	0 %	50 %	0 %	532351614
6601	NC_022108	TAA	2	6	300745	300750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351614
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6603	NC_022108	TA	3	6	300933	300938	50 %	50 %	0 %	0 %	532351614
6604	NC_022108	AAG	2	6	301002	301007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351614
6605	NC_022108	TGA	2	6	301012	301017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351614
6606	NC_022108	ATCT	2	8	301029	301036	25 %	50 %	0 %	25 %	532351614
6607	NC_022108	CTT	2	6	301050	301055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351614
6608	NC_022108	ACA	2	6	301130	301135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351614
6609	NC_022108	AT	3	6	301184	301189	50 %	50 %	0 %	0 %	532351614
6610	NC_022108	GTTA	2	8	301231	301238	25 %	50 %	25 %	0 %	532351614
6611	NC_022108	AGA	2	6	301291	301296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351614
6612	NC_022108	CAA	2	6	301386	301391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351614
6613	NC_022108	TTC	3	9	301437	301445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351614
6614	NC_022108	TGT	2	6	301483	301488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351614
6615	NC_022108	ATT	2	6	301537	301542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351614
6616	NC_022108	TGC	2	6	301552	301557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351614
6617	NC_022108	TCT	2	6	301583	301588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351614
6618	NC_022108	AAC	2	6	301600	301605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351614
6619	NC_022108	A	6	6	301610	301615	100 %	0 %	0 %	0 %	532351614
6620	NC_022108	AGAGA	2	10	301625	301634	60 %	0 %	40 %	0 %	532351614
6621	NC_022108	GAA	2	6	301667	301672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351614
6622	NC_022108	CATTGC	2	12	301677	301688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532351614
6623	NC_022108	GAA	2	6	301806	301811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351614
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6625	NC_022108	AC	3	6	301888	301893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6999	NC_022108	CTT	3	9	318821	318829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351631
7000	NC_022108	TCT	3	9	318835	318843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351631

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