MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022106	TGA	2	6	182720	182725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350363
4002	NC_022106	TGC	2	6	182756	182761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350363
4003	NC_022106	CCAG	2	8	182776	182783	25 %	0 %	25 %	50 %	532350363
4004	NC_022106	TTG	2	6	182785	182790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350363
4005	NC_022106	GAC	2	6	182794	182799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350363
4006	NC_022106	GAT	2	6	182824	182829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350363
4007	NC_022106	GA	3	6	182850	182855	50 %	0 %	50 %	0 %	532350363
4008	NC_022106	GCG	2	6	182858	182863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350363
4009	NC_022106	ACT	2	6	182906	182911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350364
4010	NC_022106	TAG	2	6	182940	182945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350364
4011	NC_022106	GCA	2	6	182995	183000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350364
4012	NC_022106	TCGC	2	8	183038	183045	0 %	25 %	25 %	50 %	532350364
4013	NC_022106	AGA	2	6	183049	183054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350364
4014	NC_022106	GCA	2	6	183058	183063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350364
4015	NC_022106	GAA	2	6	183086	183091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350364
4016	NC_022106	AGA	2	6	183125	183130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350364
4017	NC_022106	GA	3	6	183164	183169	50 %	0 %	50 %	0 %	532350364
4018	NC_022106	GTT	2	6	183181	183186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350364
4019	NC_022106	GTT	2	6	183216	183221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350364
4020	NC_022106	CTT	2	6	183224	183229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350364
4021	NC_022106	GA	3	6	183267	183272	50 %	0 %	50 %	0 %	532350364
4022	NC_022106	GTT	2	6	183278	183283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350364
4023	NC_022106	GAG	2	6	183299	183304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350364
4024	NC_022106	GAA	2	6	183319	183324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350364
4025	NC_022106	TTG	2	6	183330	183335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350364
4026	NC_022106	AGG	2	6	183369	183374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350364
4027	NC_022106	AGA	2	6	183465	183470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350364
4028	NC_022106	TGA	2	6	183487	183492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350364
4029	NC_022106	CAG	3	9	183560	183568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350364
4030	NC_022106	GTA	2	6	183603	183608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350364
4031	NC_022106	GTTG	2	8	183643	183650	0 %	50 %	50 %	0 %	532350364
4032	NC_022106	GGA	3	9	183658	183666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350364
4033	NC_022106	TC	3	6	183674	183679	0 %	50 %	0 %	50 %	532350364
4034	NC_022106	ATT	2	6	183693	183698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350364
4035	NC_022106	A	7	7	183723	183729	100 %	0 %	0 %	0 %	532350364
4036	NC_022106	T	8	8	183735	183742	0 %	100 %	0 %	0 %	532350364
4037	NC_022106	ATA	2	6	183785	183790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350364
4038	NC_022106	A	6	6	183790	183795	100 %	0 %	0 %	0 %	532350364
4039	NC_022106	TAT	2	6	183866	183871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_022106	GA	3	6	183906	183911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_022106	AGA	2	6	183948	183953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349655
4042	NC_022106	TGT	2	6	184007	184012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349655
4043	NC_022106	TCT	3	9	184076	184084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349655
4044	NC_022106	TTTC	2	8	184149	184156	0 %	75 %	0 %	25 %	532349655
4045	NC_022106	CTG	2	6	184197	184202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349655
4046	NC_022106	GGA	2	6	184224	184229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349655
4047	NC_022106	TAG	2	6	184249	184254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349655
4048	NC_022106	AGT	2	6	184379	184384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349655
4049	NC_022106	ATCG	2	8	184406	184413	25 %	25 %	25 %	25 %	532349655
4050	NC_022106	TCA	2	6	184489	184494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349656
4051	NC_022106	GGA	2	6	184504	184509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349656
4052	NC_022106	AGAGA	2	10	184597	184606	60 %	0 %	40 %	0 %	532349656
4053	NC_022106	GCA	2	6	184693	184698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349656
4054	NC_022106	TTA	2	6	184990	184995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349656
4055	NC_022106	GAA	2	6	185059	185064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349656
4056	NC_022106	ATA	2	6	185119	185124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349656
4057	NC_022106	TCTA	2	8	185160	185167	25 %	50 %	0 %	25 %	532349656
4058	NC_022106	GTT	2	6	185228	185233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_022106	TGC	2	6	185361	185366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349657
4060	NC_022106	CA	3	6	185382	185387	50 %	0 %	0 %	50 %	532349657
4061	NC_022106	AGA	2	6	185497	185502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349657
4062	NC_022106	GTT	4	12	185626	185637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_022106	T	6	6	185643	185648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_022106	T	7	7	185651	185657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_022106	T	6	6	185663	185668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_022106	T	7	7	185713	185719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_022106	A	7	7	185735	185741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_022106	T	6	6	185758	185763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_022106	T	7	7	185853	185859	0 %	100 %	0 %	0 %	532349658
4070	NC_022106	TCT	2	6	185877	185882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349658
4071	NC_022106	TG	3	6	185887	185892	0 %	50 %	50 %	0 %	532349658
4072	NC_022106	GTC	2	6	185978	185983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349658
4073	NC_022106	ATT	2	6	186048	186053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349658
4074	NC_022106	TCT	2	6	186067	186072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349658
4075	NC_022106	CTT	2	6	186083	186088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349658
4076	NC_022106	AAGC	2	8	186121	186128	50 %	0 %	25 %	25 %	532349658
4077	NC_022106	GAA	2	6	186151	186156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349658
4078	NC_022106	AAC	2	6	186228	186233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349658
4079	NC_022106	TA	3	6	186305	186310	50 %	50 %	0 %	0 %	532349658
4080	NC_022106	CTT	2	6	186326	186331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349658
4081	NC_022106	TAG	2	6	186332	186337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349658
4082	NC_022106	CAT	2	6	186376	186381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349658
4083	NC_022106	T	6	6	186383	186388	0 %	100 %	0 %	0 %	532349658
4084	NC_022106	GCTT	2	8	186402	186409	0 %	50 %	25 %	25 %	532349658
4085	NC_022106	CAC	2	6	186434	186439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349658
4086	NC_022106	GAA	2	6	186469	186474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349658
4087	NC_022106	AAG	2	6	186575	186580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349658
4088	NC_022106	TGT	2	6	186597	186602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349658
4089	NC_022106	ACGAT	2	10	186669	186678	40 %	20 %	20 %	20 %	532349658
4090	NC_022106	TTTA	2	8	186687	186694	25 %	75 %	0 %	0 %	532349658
4091	NC_022106	AAG	2	6	186698	186703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349658
4092	NC_022106	AGA	2	6	186783	186788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349658
4093	NC_022106	CTT	2	6	186820	186825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349658
4094	NC_022106	A	6	6	186838	186843	100 %	0 %	0 %	0 %	532349658
4095	NC_022106	AGG	2	6	186866	186871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349658
4096	NC_022106	GCTT	2	8	186894	186901	0 %	50 %	25 %	25 %	532349658
4097	NC_022106	T	7	7	186900	186906	0 %	100 %	0 %	0 %	532349658
4098	NC_022106	A	6	6	186941	186946	100 %	0 %	0 %	0 %	532349658
4099	NC_022106	GCT	2	6	187030	187035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349658
4100	NC_022106	TTC	2	6	187209	187214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349658
4101	NC_022106	GCTT	2	8	187335	187342	0 %	50 %	25 %	25 %	532349658
4102	NC_022106	TAG	2	6	187373	187378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349658
4103	NC_022106	GAT	2	6	187411	187416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349658
4104	NC_022106	T	7	7	187416	187422	0 %	100 %	0 %	0 %	532349658
4105	NC_022106	TTA	2	6	187446	187451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349658
4106	NC_022106	ATC	2	6	187453	187458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_022106	CGATA	2	10	187481	187490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4108	NC_022106	T	6	6	187494	187499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_022106	TCC	2	6	187514	187519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_022106	ACA	3	9	187520	187528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_022106	AGT	2	6	187538	187543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_022106	AAAC	2	8	187563	187570	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_022106	TGC	2	6	187629	187634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_022106	AGT	2	6	187697	187702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_022106	AGT	2	6	187720	187725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_022106	TTG	2	6	187728	187733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_022106	TAT	2	6	187808	187813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_022106	T	6	6	187827	187832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_022106	GCA	2	6	187880	187885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_022106	CTT	2	6	187895	187900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_022106	GGAC	2	8	187922	187929	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4122	NC_022106	AAG	2	6	188032	188037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_022106	TTG	2	6	188054	188059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_022106	CAT	2	6	188064	188069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_022106	T	7	7	188103	188109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_022106	TAA	2	6	188182	188187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_022106	TTG	2	6	188210	188215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_022106	CTC	2	6	188285	188290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350365
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4130	NC_022106	TAC	2	6	188412	188417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350365
4131	NC_022106	CAT	2	6	188428	188433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350365
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4133	NC_022106	CCT	2	6	188536	188541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350365
4134	NC_022106	CCT	2	6	188551	188556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350365
4135	NC_022106	CTC	2	6	188644	188649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350365
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4143	NC_022106	GAA	2	6	188792	188797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350366
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4147	NC_022106	TAAA	2	8	188920	188927	75 %	25 %	0 %	0 %	532350366
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4158	NC_022106	GAC	2	6	189446	189451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350366
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4231	NC_022106	T	6	6	193152	193157	0 %	100 %	0 %	0 %	532349660
4232	NC_022106	CTC	2	6	193202	193207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349660
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4247	NC_022106	GATTA	2	10	193943	193952	40 %	40 %	20 %	0 %	532349660
4248	NC_022106	T	6	6	194040	194045	0 %	100 %	0 %	0 %	532349660
4249	NC_022106	ATT	2	6	194068	194073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349660
4250	NC_022106	ATC	2	6	194191	194196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349660
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4252	NC_022106	GGC	2	6	194305	194310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532349661
4253	NC_022106	AGG	2	6	194326	194331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349661
4254	NC_022106	AAG	2	6	194478	194483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349661
4255	NC_022106	TA	3	6	194496	194501	50 %	50 %	0 %	0 %	532349661
4256	NC_022106	CTA	2	6	194503	194508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349661
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4258	NC_022106	T	6	6	194624	194629	0 %	100 %	0 %	0 %	532349661
4259	NC_022106	TAT	2	6	194732	194737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349661
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4262	NC_022106	TAGA	2	8	194823	194830	50 %	25 %	25 %	0 %	532349661
4263	NC_022106	A	6	6	194846	194851	100 %	0 %	0 %	0 %	532349661
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4270	NC_022106	AAC	2	6	195043	195048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4271	NC_022106	ATA	2	6	195063	195068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_022106	T	7	7	195088	195094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_022106	TGA	2	6	195198	195203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4280	NC_022106	AT	3	6	195538	195543	50 %	50 %	0 %	0 %	532350370
4281	NC_022106	ATT	2	6	195545	195550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350370
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4288	NC_022106	TCT	2	6	195844	195849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350371
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4301	NC_022106	TTTG	2	8	196445	196452	0 %	75 %	25 %	0 %	532349662
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4307	NC_022106	A	7	7	196811	196817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4308	NC_022106	AG	3	6	196833	196838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4311	NC_022106	T	6	6	196909	196914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4312	NC_022106	TAC	2	6	196953	196958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4363	NC_022106	AT	3	6	199339	199344	50 %	50 %	0 %	0 %	532349665
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4367	NC_022106	T	6	6	199473	199478	0 %	100 %	0 %	0 %	532349665
4368	NC_022106	GAA	2	6	199498	199503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349665
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4371	NC_022106	GT	3	6	199636	199641	0 %	50 %	50 %	0 %	532349665
4372	NC_022106	AC	3	6	199654	199659	50 %	0 %	0 %	50 %	532349665
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