MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022106	ATT	2	6	159193	159198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349641
3502	NC_022106	CAT	2	6	159345	159350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349641
3503	NC_022106	TCAA	2	8	159406	159413	50 %	25 %	0 %	25 %	532349641
3504	NC_022106	TGA	2	6	159603	159608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349641
3505	NC_022106	GAA	2	6	159631	159636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349641
3506	NC_022106	TC	3	6	159666	159671	0 %	50 %	0 %	50 %	532349641
3507	NC_022106	GT	3	6	159704	159709	0 %	50 %	50 %	0 %	532349641
3508	NC_022106	AAT	2	6	159748	159753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349641
3509	NC_022106	GGA	2	6	159760	159765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349641
3510	NC_022106	AGGAA	2	10	159789	159798	60 %	0 %	40 %	0 %	532349641
3511	NC_022106	TAG	2	6	159819	159824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349641
3512	NC_022106	AGG	2	6	159825	159830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349641
3513	NC_022106	CTG	2	6	159845	159850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349641
3514	NC_022106	AG	3	6	159876	159881	50 %	0 %	50 %	0 %	532349641
3515	NC_022106	TCT	2	6	159904	159909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349641
3516	NC_022106	AGG	2	6	160023	160028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349641
3517	NC_022106	GAA	2	6	160036	160041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349642
3518	NC_022106	AGA	2	6	160084	160089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349642
3519	NC_022106	ATAC	2	8	160208	160215	50 %	25 %	0 %	25 %	532349642
3520	NC_022106	AGG	2	6	160234	160239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349642
3521	NC_022106	AGG	2	6	160249	160254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349642
3522	NC_022106	CT	3	6	160347	160352	0 %	50 %	0 %	50 %	532349642
3523	NC_022106	GA	3	6	160357	160362	50 %	0 %	50 %	0 %	532349642
3524	NC_022106	ATT	2	6	160377	160382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349642
3525	NC_022106	ATA	2	6	160473	160478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349642
3526	NC_022106	AC	3	6	160497	160502	50 %	0 %	0 %	50 %	532349642
3527	NC_022106	A	8	8	160542	160549	100 %	0 %	0 %	0 %	532349642
3528	NC_022106	ATG	2	6	160623	160628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349642
3529	NC_022106	TCT	2	6	160638	160643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349642
3530	NC_022106	TTC	2	6	160852	160857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349642
3531	NC_022106	AGG	2	6	160863	160868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349642
3532	NC_022106	ACA	2	6	160879	160884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349643
3533	NC_022106	ATA	3	9	160889	160897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349643
3534	NC_022106	TTTC	2	8	160907	160914	0 %	75 %	0 %	25 %	532349643
3535	NC_022106	AACAGC	2	12	160992	161003	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532349643
3536	NC_022106	AGT	2	6	161035	161040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349643
3537	NC_022106	TGG	2	6	161121	161126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349643
3538	NC_022106	TC	3	6	161448	161453	0 %	50 %	0 %	50 %	532349643
3539	NC_022106	A	6	6	161466	161471	100 %	0 %	0 %	0 %	532349643
3540	NC_022106	CTG	2	6	161534	161539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349643
3541	NC_022106	TTA	2	6	161557	161562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349643
3542	NC_022106	ACA	2	6	161596	161601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349643
3543	NC_022106	GCA	2	6	161620	161625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349643
3544	NC_022106	CTT	2	6	161639	161644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349643
3545	NC_022106	ATTG	2	8	161658	161665	25 %	50 %	25 %	0 %	532349643
3546	NC_022106	TCT	2	6	161689	161694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349643
3547	NC_022106	CT	4	8	161693	161700	0 %	50 %	0 %	50 %	532349643
3548	NC_022106	TGT	2	6	161721	161726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349643
3549	NC_022106	GCTT	2	8	161762	161769	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3550	NC_022106	CAAAA	2	10	161792	161801	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3551	NC_022106	TGT	2	6	161814	161819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_022106	CAA	2	6	161894	161899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_022106	GAG	2	6	161913	161918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_022106	TGG	2	6	162136	162141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349644
3555	NC_022106	TGT	2	6	162179	162184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349644
3556	NC_022106	GAA	2	6	162189	162194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349644
3557	NC_022106	GGAA	2	8	162231	162238	50 %	0 %	50 %	0 %	532349644
3558	NC_022106	GAA	3	9	162246	162254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349644
3559	NC_022106	TTTC	2	8	162349	162356	0 %	75 %	0 %	25 %	532349644
3560	NC_022106	ATCT	2	8	162375	162382	25 %	50 %	0 %	25 %	532349644
3561	NC_022106	CTT	2	6	162400	162405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349644
3562	NC_022106	GA	3	6	162454	162459	50 %	0 %	50 %	0 %	532349644
3563	NC_022106	TTG	2	6	162480	162485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349644
3564	NC_022106	GAA	2	6	162501	162506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349644
3565	NC_022106	TTA	2	6	162557	162562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349644
3566	NC_022106	TAG	2	6	162568	162573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349644
3567	NC_022106	GTT	2	6	162655	162660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349644
3568	NC_022106	ACA	3	9	162662	162670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349644
3569	NC_022106	AGA	2	6	162782	162787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349644
3570	NC_022106	TG	3	6	162841	162846	0 %	50 %	50 %	0 %	532349644
3571	NC_022106	AGC	2	6	162859	162864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349644
3572	NC_022106	TAG	2	6	162877	162882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349644
3573	NC_022106	TCGA	2	8	162891	162898	25 %	25 %	25 %	25 %	532349644
3574	NC_022106	AGAGA	2	10	163020	163029	60 %	0 %	40 %	0 %	532349644
3575	NC_022106	ATT	2	6	163043	163048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349644
3576	NC_022106	GAGG	2	8	163068	163075	25 %	0 %	75 %	0 %	532349644
3577	NC_022106	TC	3	6	163081	163086	0 %	50 %	0 %	50 %	532349644
3578	NC_022106	TGT	2	6	163313	163318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349644
3579	NC_022106	CTT	3	9	163339	163347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349644
3580	NC_022106	TTG	2	6	163352	163357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349644
3581	NC_022106	AGC	2	6	163397	163402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349644
3582	NC_022106	AGG	2	6	163406	163411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349644
3583	NC_022106	GAA	2	6	163440	163445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349644
3584	NC_022106	AGCAA	2	10	163455	163464	60 %	0 %	20 %	20 %	532349644
3585	NC_022106	TAC	2	6	163481	163486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349644
3586	NC_022106	TGGC	2	8	163531	163538	0 %	25 %	50 %	25 %	532349644
3587	NC_022106	CCT	2	6	163620	163625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349644
3588	NC_022106	GT	3	6	163639	163644	0 %	50 %	50 %	0 %	532349644
3589	NC_022106	GAG	2	6	163648	163653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349644
3590	NC_022106	GAT	2	6	163674	163679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349644
3591	NC_022106	AAT	2	6	163704	163709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349644
3592	NC_022106	GAT	2	6	163792	163797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349645
3593	NC_022106	TAT	2	6	163840	163845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349645
3594	NC_022106	TCAA	2	8	163850	163857	50 %	25 %	0 %	25 %	532349645
3595	NC_022106	CGA	2	6	163859	163864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349645
3596	NC_022106	ATG	2	6	163880	163885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349645
3597	NC_022106	TGT	2	6	164012	164017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349645
3598	NC_022106	T	7	7	164056	164062	0 %	100 %	0 %	0 %	532349645
3599	NC_022106	ATT	2	6	164076	164081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349645
3600	NC_022106	GAG	2	6	164279	164284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349645
3601	NC_022106	TTTC	2	8	164290	164297	0 %	75 %	0 %	25 %	532349645
3602	NC_022106	GGA	2	6	164377	164382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349645
3603	NC_022106	TCT	2	6	164398	164403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349645
3604	NC_022106	GCT	2	6	164410	164415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349645
3605	NC_022106	A	8	8	164459	164466	100 %	0 %	0 %	0 %	532349645
3606	NC_022106	GGT	2	6	164553	164558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349645
3607	NC_022106	GA	3	6	164570	164575	50 %	0 %	50 %	0 %	532349645
3608	NC_022106	GC	3	6	164586	164591	0 %	0 %	50 %	50 %	532349645
3609	NC_022106	GTC	2	6	164617	164622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349645
3610	NC_022106	GGA	2	6	164730	164735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349645
3611	NC_022106	T	7	7	164795	164801	0 %	100 %	0 %	0 %	532349645
3612	NC_022106	A	8	8	164852	164859	100 %	0 %	0 %	0 %	532349645
3613	NC_022106	AGG	2	6	164895	164900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349645
3614	NC_022106	TTG	2	6	164918	164923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349645
3615	NC_022106	AG	3	6	164949	164954	50 %	0 %	50 %	0 %	532349645
3616	NC_022106	TGT	2	6	165000	165005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349645
3617	NC_022106	G	6	6	165049	165054	0 %	0 %	100 %	0 %	532349645
3618	NC_022106	GA	3	6	165113	165118	50 %	0 %	50 %	0 %	532349645
3619	NC_022106	ATT	2	6	165132	165137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349645
3620	NC_022106	AT	3	6	165167	165172	50 %	50 %	0 %	0 %	532349645
3621	NC_022106	AGA	3	9	165183	165191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349645
3622	NC_022106	CTT	2	6	165371	165376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349645
3623	NC_022106	ATCG	2	8	165423	165430	25 %	25 %	25 %	25 %	532349645
3624	NC_022106	TTC	2	6	165436	165441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349645
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3874	NC_022106	GCT	2	6	176753	176758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349652
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3881	NC_022106	T	8	8	177054	177061	0 %	100 %	0 %	0 %	532349652
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3903	NC_022106	GCTG	2	8	178526	178533	0 %	25 %	50 %	25 %	532350362
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3931	NC_022106	TGA	2	6	179614	179619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3982	NC_022106	AAGA	2	8	182166	182173	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3983	NC_022106	T	8	8	182190	182197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3984	NC_022106	AGAAAA	2	12	182208	182219	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3985	NC_022106	A	7	7	182216	182222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3988	NC_022106	T	6	6	182287	182292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3989	NC_022106	T	7	7	182294	182300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3990	NC_022106	AAAG	2	8	182346	182353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3991	NC_022106	GATG	2	8	182378	182385	25 %	25 %	50 %	0 %	532350363
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