MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022106	GCTA	2	8	136126	136133	25 %	25 %	25 %	25 %	532349617
3002	NC_022106	CGC	2	6	136159	136164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532349617
3003	NC_022106	TG	3	6	136185	136190	0 %	50 %	50 %	0 %	532349617
3004	NC_022106	TG	3	6	136211	136216	0 %	50 %	50 %	0 %	532349617
3005	NC_022106	TAG	2	6	136248	136253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349617
3006	NC_022106	ACA	2	6	136256	136261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349617
3007	NC_022106	CTT	2	6	136270	136275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349617
3008	NC_022106	TGTTT	2	10	136288	136297	0 %	80 %	20 %	0 %	532349617
3009	NC_022106	GCT	2	6	136301	136306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349617
3010	NC_022106	GGAT	2	8	136316	136323	25 %	25 %	50 %	0 %	532349617
3011	NC_022106	CTG	2	6	136437	136442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349618
3012	NC_022106	CAAT	2	8	136465	136472	50 %	25 %	0 %	25 %	532349618
3013	NC_022106	AAGC	2	8	136519	136526	50 %	0 %	25 %	25 %	532349618
3014	NC_022106	TTTG	2	8	136545	136552	0 %	75 %	25 %	0 %	532349618
3015	NC_022106	GCG	2	6	136588	136593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532349618
3016	NC_022106	TGC	2	6	136611	136616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349618
3017	NC_022106	TTC	2	6	136619	136624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349618
3018	NC_022106	CTG	2	6	136630	136635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349618
3019	NC_022106	CAG	2	6	136643	136648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349618
3020	NC_022106	TTTG	2	8	136660	136667	0 %	75 %	25 %	0 %	532349618
3021	NC_022106	CAG	2	6	136697	136702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349618
3022	NC_022106	GAA	2	6	136732	136737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349618
3023	NC_022106	GCT	2	6	136747	136752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349618
3024	NC_022106	CAG	2	6	136765	136770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349618
3025	NC_022106	AGG	2	6	136776	136781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349618
3026	NC_022106	GAG	2	6	136792	136797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349618
3027	NC_022106	CAC	2	6	136805	136810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349618
3028	NC_022106	GAT	2	6	136888	136893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349618
3029	NC_022106	ATAA	2	8	136894	136901	75 %	25 %	0 %	0 %	532349618
3030	NC_022106	ACA	2	6	136904	136909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349618
3031	NC_022106	AGG	2	6	136965	136970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_022106	CCT	2	6	136975	136980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_022106	T	9	9	136982	136990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_022106	TTGCA	2	10	137078	137087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3035	NC_022106	GAG	2	6	137142	137147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349619
3036	NC_022106	TC	3	6	137152	137157	0 %	50 %	0 %	50 %	532349619
3037	NC_022106	CT	3	6	137181	137186	0 %	50 %	0 %	50 %	532349619
3038	NC_022106	TTC	2	6	137279	137284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349619
3039	NC_022106	CTT	2	6	137329	137334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349619
3040	NC_022106	CT	3	6	137363	137368	0 %	50 %	0 %	50 %	532349619
3041	NC_022106	A	6	6	137413	137418	100 %	0 %	0 %	0 %	532349619
3042	NC_022106	TCT	2	6	137430	137435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349619
3043	NC_022106	CAG	2	6	137524	137529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349619
3044	NC_022106	AG	3	6	137528	137533	50 %	0 %	50 %	0 %	532349619
3045	NC_022106	GAA	2	6	137569	137574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349619
3046	NC_022106	T	6	6	137576	137581	0 %	100 %	0 %	0 %	532349619
3047	NC_022106	AATT	2	8	137602	137609	50 %	50 %	0 %	0 %	532349619
3048	NC_022106	AAG	2	6	137714	137719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349619
3049	NC_022106	CAA	2	6	137752	137757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349619
3050	NC_022106	TGT	2	6	137783	137788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349619
3051	NC_022106	GCT	2	6	137814	137819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349619
3052	NC_022106	AAG	2	6	137842	137847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349619
3053	NC_022106	GGA	2	6	137892	137897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349619
3054	NC_022106	TTG	2	6	138032	138037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350360
3055	NC_022106	ATGT	2	8	138182	138189	25 %	50 %	25 %	0 %	532350360
3056	NC_022106	AGG	2	6	138199	138204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350360
3057	NC_022106	AAT	2	6	138232	138237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350360
3058	NC_022106	CTT	2	6	138255	138260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_022106	AG	3	6	138266	138271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_022106	GA	3	6	138329	138334	50 %	0 %	50 %	0 %	532349620
3061	NC_022106	A	6	6	138345	138350	100 %	0 %	0 %	0 %	532349620
3062	NC_022106	TAT	2	6	138374	138379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349620
3063	NC_022106	AGA	2	6	138422	138427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349620
3064	NC_022106	ATGG	2	8	138459	138466	25 %	25 %	50 %	0 %	532349620
3065	NC_022106	GTT	2	6	138501	138506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349620
3066	NC_022106	TC	3	6	138694	138699	0 %	50 %	0 %	50 %	532349620
3067	NC_022106	AGAA	2	8	138809	138816	75 %	0 %	25 %	0 %	532349620
3068	NC_022106	GAAG	2	8	138855	138862	50 %	0 %	50 %	0 %	532349620
3069	NC_022106	TTGA	2	8	138867	138874	25 %	50 %	25 %	0 %	532349620
3070	NC_022106	GGT	2	6	138882	138887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349620
3071	NC_022106	CCT	2	6	138946	138951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349620
3072	NC_022106	T	7	7	138953	138959	0 %	100 %	0 %	0 %	532349620
3073	NC_022106	GAAA	2	8	138980	138987	75 %	0 %	25 %	0 %	532349620
3074	NC_022106	GAA	2	6	139008	139013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349620
3075	NC_022106	AGT	2	6	139077	139082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349621
3076	NC_022106	TTA	2	6	139121	139126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349621
3077	NC_022106	GA	3	6	139165	139170	50 %	0 %	50 %	0 %	532349621
3078	NC_022106	AAG	2	6	139196	139201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349621
3079	NC_022106	T	6	6	139373	139378	0 %	100 %	0 %	0 %	532349621
3080	NC_022106	AGG	2	6	139452	139457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349621
3081	NC_022106	A	6	6	139462	139467	100 %	0 %	0 %	0 %	532349621
3082	NC_022106	TTA	2	6	139526	139531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349621
3083	NC_022106	TAA	2	6	139629	139634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349622
3084	NC_022106	GAGTTA	2	12	139669	139680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349622
3085	NC_022106	AAGA	2	8	139751	139758	75 %	0 %	25 %	0 %	532349622
3086	NC_022106	AG	3	6	139800	139805	50 %	0 %	50 %	0 %	532349622
3087	NC_022106	GAA	2	6	139812	139817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349622
3088	NC_022106	TTA	2	6	139907	139912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349622
3089	NC_022106	GTT	2	6	139942	139947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349622
3090	NC_022106	AGA	2	6	140007	140012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349622
3091	NC_022106	TCCAG	2	10	140034	140043	20 %	20 %	20 %	40 %	532349622
3092	NC_022106	GAA	2	6	140085	140090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349623
3093	NC_022106	ATTG	2	8	140094	140101	25 %	50 %	25 %	0 %	532349623
3094	NC_022106	ATT	2	6	140128	140133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349623
3095	NC_022106	AAG	2	6	140189	140194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349623
3096	NC_022106	CTT	2	6	140206	140211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349623
3097	NC_022106	GCA	2	6	140245	140250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349623
3098	NC_022106	CCTA	2	8	140255	140262	25 %	25 %	0 %	50 %	532349623
3099	NC_022106	GCT	2	6	140281	140286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349623
3100	NC_022106	TCA	2	6	140546	140551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349623
3101	NC_022106	TAA	2	6	140655	140660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349623
3102	NC_022106	GTACA	2	10	140765	140774	40 %	20 %	20 %	20 %	532349623
3103	NC_022106	AGA	2	6	140796	140801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349623
3104	NC_022106	GAA	2	6	140980	140985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349623
3105	NC_022106	TAA	2	6	141114	141119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349623
3106	NC_022106	TAGAT	2	10	141138	141147	40 %	40 %	20 %	0 %	532349623
3107	NC_022106	TAT	2	6	141148	141153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349623
3108	NC_022106	CTCC	2	8	141154	141161	0 %	25 %	0 %	75 %	532349623
3109	NC_022106	CTG	2	6	141170	141175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349623
3110	NC_022106	CCT	2	6	141214	141219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349623
3111	NC_022106	TAT	2	6	141220	141225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349623
3112	NC_022106	TGG	2	6	141315	141320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349623
3113	NC_022106	TCA	2	6	141342	141347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349623
3114	NC_022106	TCT	2	6	141372	141377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349623
3115	NC_022106	ATTA	2	8	141391	141398	50 %	50 %	0 %	0 %	532349623
3116	NC_022106	T	8	8	141460	141467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_022106	T	6	6	141505	141510	0 %	100 %	0 %	0 %	532350361
3118	NC_022106	AAG	2	6	141514	141519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350361
3119	NC_022106	AAAAG	2	10	141550	141559	80 %	0 %	20 %	0 %	532350361
3120	NC_022106	T	6	6	141574	141579	0 %	100 %	0 %	0 %	532350361
3121	NC_022106	GCT	2	6	141610	141615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_022106	A	6	6	141626	141631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_022106	ATC	2	6	141634	141639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_022106	A	6	6	141683	141688	100 %	0 %	0 %	0 %	532349624
3125	NC_022106	CTC	2	6	141833	141838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349624
3126	NC_022106	AAAAC	2	10	142030	142039	80 %	0 %	0 %	20 %	532349624
3127	NC_022106	AGA	2	6	142184	142189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349625
3128	NC_022106	GGA	2	6	142358	142363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349625
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3130	NC_022106	CTT	2	6	142459	142464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349625
3131	NC_022106	AAGA	2	8	142481	142488	75 %	0 %	25 %	0 %	532349625
3132	NC_022106	A	6	6	142493	142498	100 %	0 %	0 %	0 %	532349625
3133	NC_022106	AT	3	6	142561	142566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_022106	CTT	2	6	142588	142593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_022106	AAG	2	6	142598	142603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349626
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3137	NC_022106	T	6	6	142722	142727	0 %	100 %	0 %	0 %	532349626
3138	NC_022106	GCA	2	6	142730	142735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349626
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3140	NC_022106	TCA	2	6	142761	142766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349626
3141	NC_022106	TGCT	2	8	142788	142795	0 %	50 %	25 %	25 %	532349626
3142	NC_022106	TCC	2	6	142813	142818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349626
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3146	NC_022106	GAAA	2	8	143011	143018	75 %	0 %	25 %	0 %	532349626
3147	NC_022106	AG	3	6	143030	143035	50 %	0 %	50 %	0 %	532349626
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3153	NC_022106	GGAGC	2	10	143163	143172	20 %	0 %	60 %	20 %	532349626
3154	NC_022106	A	6	6	143204	143209	100 %	0 %	0 %	0 %	532349626
3155	NC_022106	CTT	2	6	143211	143216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349626
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3159	NC_022106	AGA	2	6	143305	143310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349626
3160	NC_022106	ATGGTT	2	12	143341	143352	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532349626
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3162	NC_022106	TCA	2	6	143548	143553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349627
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3164	NC_022106	TTG	2	6	143631	143636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349627
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3172	NC_022106	GTC	2	6	144014	144019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349627
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3176	NC_022106	ATC	2	6	144279	144284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3177	NC_022106	TAA	2	6	144286	144291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3178	NC_022106	T	7	7	144350	144356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3179	NC_022106	T	6	6	144378	144383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3180	NC_022106	T	7	7	144411	144417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3181	NC_022106	CTT	2	6	144514	144519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349628
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3183	NC_022106	CTGGG	2	10	144577	144586	0 %	20 %	60 %	20 %	532349628
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3233	NC_022106	T	7	7	147013	147019	0 %	100 %	0 %	0 %	532349630
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3241	NC_022106	AAT	2	6	147498	147503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349630
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3243	NC_022106	AG	3	6	147636	147641	50 %	0 %	50 %	0 %	532349630
3244	NC_022106	AGA	2	6	147775	147780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349630
3245	NC_022106	AG	3	6	147932	147937	50 %	0 %	50 %	0 %	532349630
3246	NC_022106	GAA	2	6	148018	148023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349630
3247	NC_022106	TG	3	6	148037	148042	0 %	50 %	50 %	0 %	532349630
3248	NC_022106	AG	3	6	148097	148102	50 %	0 %	50 %	0 %	532349630
3249	NC_022106	AGGA	2	8	148117	148124	50 %	0 %	50 %	0 %	532349630
3250	NC_022106	CTC	2	6	148129	148134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349630
3251	NC_022106	GAA	3	9	148149	148157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349630
3252	NC_022106	GAT	2	6	148171	148176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349630
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3254	NC_022106	CTT	2	6	148339	148344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349630
3255	NC_022106	GA	3	6	148369	148374	50 %	0 %	50 %	0 %	532349630
3256	NC_022106	AG	3	6	148379	148384	50 %	0 %	50 %	0 %	532349630
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3259	NC_022106	CGTA	2	8	148458	148465	25 %	25 %	25 %	25 %	532349630
3260	NC_022106	TGA	2	6	148533	148538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349630
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3289	NC_022106	GA	3	6	149817	149822	50 %	0 %	50 %	0 %	532349631
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3341	NC_022106	GCTG	2	8	151747	151754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3358	NC_022106	TGC	2	6	152413	152418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349634
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3365	NC_022106	CTGTG	2	10	152758	152767	0 %	40 %	40 %	20 %	532349634
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3372	NC_022106	GCA	2	6	153035	153040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349634
3373	NC_022106	GTT	2	6	153257	153262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349634
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3497	NC_022106	ATT	2	6	159038	159043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3500	NC_022106	TAAT	2	8	159126	159133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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