MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_022106	CTC	2	6	954012	954017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350285
21003	NC_022106	GGA	2	6	954032	954037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350285
21004	NC_022106	AGTT	2	8	954069	954076	25 %	50 %	25 %	0 %	532350285
21005	NC_022106	ACA	2	6	954080	954085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350285
21006	NC_022106	GAA	2	6	954115	954120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350285
21007	NC_022106	TGA	2	6	954160	954165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350285
21008	NC_022106	GTA	2	6	954215	954220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350285
21009	NC_022106	GAA	2	6	954233	954238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350285
21010	NC_022106	GAA	2	6	954371	954376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350285
21011	NC_022106	TGTCT	2	10	954382	954391	0 %	60 %	20 %	20 %	532350285
21012	NC_022106	ATT	2	6	954447	954452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350285
21013	NC_022106	TG	3	6	954460	954465	0 %	50 %	50 %	0 %	532350285
21014	NC_022106	TGG	2	6	954478	954483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350285
21015	NC_022106	CTG	2	6	954552	954557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350285
21016	NC_022106	GCT	2	6	954605	954610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350285
21017	NC_022106	GTT	2	6	954665	954670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350285
21018	NC_022106	TA	3	6	954678	954683	50 %	50 %	0 %	0 %	532350285
21019	NC_022106	TTC	2	6	954707	954712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350285
21020	NC_022106	CTT	2	6	954786	954791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350285
21021	NC_022106	GAG	2	6	954801	954806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350285
21022	NC_022106	AGG	2	6	955090	955095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350285
21023	NC_022106	GGGA	2	8	955128	955135	25 %	0 %	75 %	0 %	532350285
21024	NC_022106	ATA	2	6	955182	955187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350285
21025	NC_022106	GGA	2	6	955238	955243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350285
21026	NC_022106	T	8	8	955366	955373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21027	NC_022106	T	8	8	955409	955416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21028	NC_022106	GAG	2	6	955436	955441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350427
21029	NC_022106	T	8	8	955459	955466	0 %	100 %	0 %	0 %	532350427
21030	NC_022106	CAA	2	6	955474	955479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350427
21031	NC_022106	T	6	6	955508	955513	0 %	100 %	0 %	0 %	532350427
21032	NC_022106	ACT	2	6	955553	955558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350427
21033	NC_022106	AAT	2	6	955565	955570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350427
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21045	NC_022106	A	6	6	956108	956113	100 %	0 %	0 %	0 %	532350286
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21053	NC_022106	AGA	3	9	956343	956351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350286
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21055	NC_022106	T	7	7	956370	956376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21056	NC_022106	GTA	2	6	956393	956398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21057	NC_022106	T	7	7	956413	956419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21058	NC_022106	CGA	2	6	956434	956439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350287
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21081	NC_022106	AGTT	2	8	957315	957322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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21093	NC_022106	TGA	2	6	958226	958231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350289
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21102	NC_022106	TG	3	6	958743	958748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21103	NC_022106	TTGT	2	8	958865	958872	0 %	75 %	25 %	0 %	532350290
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21122	NC_022106	GCTA	2	8	959761	959768	25 %	25 %	25 %	25 %	532350290
21123	NC_022106	TCA	2	6	959772	959777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350290
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21127	NC_022106	GCAA	2	8	960034	960041	50 %	0 %	25 %	25 %	532350290
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21139	NC_022106	CT	3	6	960578	960583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21140	NC_022106	TGA	2	6	960584	960589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21142	NC_022106	A	6	6	960650	960655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21143	NC_022106	CTTG	2	8	960691	960698	0 %	50 %	25 %	25 %	532350291
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21161	NC_022106	GAAA	2	8	961743	961750	75 %	0 %	25 %	0 %	532350291
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21233	NC_022106	T	8	8	964902	964909	0 %	100 %	0 %	0 %	532350294
21234	NC_022106	AG	3	6	964913	964918	50 %	0 %	50 %	0 %	532350294
21235	NC_022106	GTTT	2	8	964923	964930	0 %	75 %	25 %	0 %	532350294
21236	NC_022106	TTGA	2	8	964961	964968	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21237	NC_022106	AAT	2	6	964978	964983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21238	NC_022106	AGG	2	6	964992	964997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21239	NC_022106	TTAT	2	8	965011	965018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21240	NC_022106	C	6	6	965074	965079	0 %	0 %	0 %	100 %	532350295
21241	NC_022106	GGA	2	6	965170	965175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350295
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21243	NC_022106	GGT	2	6	965193	965198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350295
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