MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_022106	TCA	2	6	885784	885789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350232
19502	NC_022106	TTG	2	6	885835	885840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350232
19503	NC_022106	GAAGA	2	10	885889	885898	60 %	0 %	40 %	0 %	532350232
19504	NC_022106	ACCA	2	8	885955	885962	50 %	0 %	0 %	50 %	532350232
19505	NC_022106	GAA	2	6	885982	885987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350232
19506	NC_022106	ACC	2	6	885991	885996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350232
19507	NC_022106	GAGT	2	8	886003	886010	25 %	25 %	50 %	0 %	532350232
19508	NC_022106	T	6	6	886010	886015	0 %	100 %	0 %	0 %	532350232
19509	NC_022106	TTA	2	6	886044	886049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350232
19510	NC_022106	GTTT	2	8	886068	886075	0 %	75 %	25 %	0 %	532350232
19511	NC_022106	T	6	6	886073	886078	0 %	100 %	0 %	0 %	532350232
19512	NC_022106	CAT	2	6	886099	886104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350232
19513	NC_022106	TA	3	6	886118	886123	50 %	50 %	0 %	0 %	532350232
19514	NC_022106	GAAA	2	8	886149	886156	75 %	0 %	25 %	0 %	532350232
19515	NC_022106	CA	3	6	886211	886216	50 %	0 %	0 %	50 %	532350232
19516	NC_022106	GCT	2	6	886234	886239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350232
19517	NC_022106	GA	3	6	886261	886266	50 %	0 %	50 %	0 %	532350232
19518	NC_022106	CCT	2	6	886290	886295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350232
19519	NC_022106	TTA	2	6	886451	886456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19520	NC_022106	TAGT	2	8	886488	886495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19521	NC_022106	T	7	7	886506	886512	0 %	100 %	0 %	0 %	532350233
19522	NC_022106	AAG	2	6	886545	886550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350233
19523	NC_022106	AGA	2	6	886556	886561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350233
19524	NC_022106	A	6	6	886587	886592	100 %	0 %	0 %	0 %	532350233
19525	NC_022106	TCT	2	6	886640	886645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350233
19526	NC_022106	TTG	2	6	886648	886653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350233
19527	NC_022106	ACA	2	6	886658	886663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350233
19528	NC_022106	AG	3	6	886688	886693	50 %	0 %	50 %	0 %	532350233
19529	NC_022106	CAA	2	6	886707	886712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350233
19530	NC_022106	TCCA	2	8	886717	886724	25 %	25 %	0 %	50 %	532350233
19531	NC_022106	GTT	2	6	886743	886748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350233
19532	NC_022106	AG	3	6	886752	886757	50 %	0 %	50 %	0 %	532350233
19533	NC_022106	CAG	2	6	886785	886790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350233
19534	NC_022106	TTC	2	6	886795	886800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350233
19535	NC_022106	AG	3	6	886822	886827	50 %	0 %	50 %	0 %	532350233
19536	NC_022106	AGA	2	6	886844	886849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350233
19537	NC_022106	T	7	7	886980	886986	0 %	100 %	0 %	0 %	532350233
19538	NC_022106	TCT	2	6	887009	887014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350233
19539	NC_022106	ACT	2	6	887057	887062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350233
19540	NC_022106	TAG	2	6	887131	887136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350233
19541	NC_022106	AGG	2	6	887149	887154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350233
19542	NC_022106	TTA	2	6	887156	887161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350233
19543	NC_022106	GGC	2	6	887168	887173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350233
19544	NC_022106	TCT	2	6	887210	887215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350233
19545	NC_022106	ACT	2	6	887240	887245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350233
19546	NC_022106	A	6	6	887316	887321	100 %	0 %	0 %	0 %	532350233
19547	NC_022106	TTC	2	6	887338	887343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350233
19548	NC_022106	T	6	6	887350	887355	0 %	100 %	0 %	0 %	532350233
19549	NC_022106	CTT	2	6	887519	887524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350233
19550	NC_022106	GAG	2	6	887718	887723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350233
19551	NC_022106	AGA	2	6	887782	887787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350233
19552	NC_022106	A	6	6	887912	887917	100 %	0 %	0 %	0 %	532350233
19553	NC_022106	GAA	2	6	887924	887929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350233
19554	NC_022106	GAG	2	6	887930	887935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350233
19555	NC_022106	TGA	2	6	887996	888001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350233
19556	NC_022106	TTG	2	6	888023	888028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350233
19557	NC_022106	TTC	2	6	888061	888066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19558	NC_022106	AAG	2	6	888113	888118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19559	NC_022106	T	8	8	888254	888261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19560	NC_022106	GAA	2	6	888273	888278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19561	NC_022106	A	6	6	888277	888282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19562	NC_022106	T	6	6	888296	888301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19563	NC_022106	AAT	2	6	888351	888356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19564	NC_022106	TAG	2	6	888369	888374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19565	NC_022106	GAAA	2	8	888377	888384	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19566	NC_022106	TCT	2	6	888419	888424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19567	NC_022106	T	6	6	888444	888449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19568	NC_022106	GTT	2	6	888451	888456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19569	NC_022106	GAA	2	6	888505	888510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350234
19570	NC_022106	TCT	2	6	888514	888519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350234
19571	NC_022106	TTA	2	6	888523	888528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350234
19572	NC_022106	CTCG	2	8	888542	888549	0 %	25 %	25 %	50 %	532350234
19573	NC_022106	GAA	2	6	888552	888557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350234
19574	NC_022106	T	6	6	888607	888612	0 %	100 %	0 %	0 %	532350234
19575	NC_022106	AGC	2	6	888657	888662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350234
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19580	NC_022106	TAA	2	6	888990	888995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350234
19581	NC_022106	GAA	2	6	888999	889004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350234
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19583	NC_022106	GCA	2	6	889056	889061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350234
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19588	NC_022106	A	6	6	889179	889184	100 %	0 %	0 %	0 %	532350234
19589	NC_022106	GCA	2	6	889192	889197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350234
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19592	NC_022106	ATTC	2	8	889252	889259	25 %	50 %	0 %	25 %	532350234
19593	NC_022106	TTA	2	6	889271	889276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350234
19594	NC_022106	TGCC	2	8	889301	889308	0 %	25 %	25 %	50 %	532350234
19595	NC_022106	TAT	2	6	889341	889346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350234
19596	NC_022106	AGTC	2	8	889402	889409	25 %	25 %	25 %	25 %	532350234
19597	NC_022106	TGCC	2	8	889418	889425	0 %	25 %	25 %	50 %	532350234
19598	NC_022106	ATG	2	6	889469	889474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350234
19599	NC_022106	GCT	2	6	889504	889509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350234
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19602	NC_022106	T	6	6	889645	889650	0 %	100 %	0 %	0 %	532350234
19603	NC_022106	GA	3	6	889655	889660	50 %	0 %	50 %	0 %	532350234
19604	NC_022106	TGT	2	6	889770	889775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350234
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19606	NC_022106	TTA	2	6	889813	889818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350234
19607	NC_022106	TAGAA	2	10	889862	889871	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19608	NC_022106	ATA	2	6	889965	889970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19609	NC_022106	TGC	2	6	889986	889991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19610	NC_022106	TGT	2	6	890002	890007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350235
19611	NC_022106	T	6	6	890030	890035	0 %	100 %	0 %	0 %	532350235
19612	NC_022106	T	7	7	890040	890046	0 %	100 %	0 %	0 %	532350235
19613	NC_022106	A	7	7	890071	890077	100 %	0 %	0 %	0 %	532350235
19614	NC_022106	AGA	2	6	890122	890127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350235
19615	NC_022106	AT	3	6	890146	890151	50 %	50 %	0 %	0 %	532350235
19616	NC_022106	GTTTTT	2	12	890171	890182	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	532350235
19617	NC_022106	CTATT	2	10	890250	890259	20 %	60 %	0 %	20 %	532350235
19618	NC_022106	GAT	2	6	890282	890287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350235
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19621	NC_022106	TAT	2	6	890380	890385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350235
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19623	NC_022106	CAT	2	6	890450	890455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350235
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19626	NC_022106	TGGAT	2	10	890533	890542	20 %	40 %	40 %	0 %	532350235
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