MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_022106	ACA	2	6	860662	860667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350218
19002	NC_022106	AAG	3	9	860678	860686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350218
19003	NC_022106	CTTCTA	2	12	860702	860713	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532350218
19004	NC_022106	TGC	2	6	860770	860775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350218
19005	NC_022106	TCA	2	6	860809	860814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350218
19006	NC_022106	AGC	2	6	860850	860855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350218
19007	NC_022106	TAA	2	6	860895	860900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350218
19008	NC_022106	ATC	2	6	860946	860951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350218
19009	NC_022106	ATT	2	6	860952	860957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350218
19010	NC_022106	TAA	2	6	860984	860989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350218
19011	NC_022106	TGC	2	6	861045	861050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350218
19012	NC_022106	A	6	6	861153	861158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19013	NC_022106	T	6	6	861168	861173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_022106	TTA	2	6	861180	861185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_022106	AGC	2	6	861265	861270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350219
19016	NC_022106	TG	3	6	861313	861318	0 %	50 %	50 %	0 %	532350219
19017	NC_022106	CTTTTT	2	12	861386	861397	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532350219
19018	NC_022106	GAC	2	6	861408	861413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350219
19019	NC_022106	GAG	2	6	861501	861506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350219
19020	NC_022106	A	6	6	861559	861564	100 %	0 %	0 %	0 %	532350219
19021	NC_022106	TTA	2	6	861591	861596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19022	NC_022106	T	7	7	861836	861842	0 %	100 %	0 %	0 %	532350220
19023	NC_022106	GAG	2	6	861893	861898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350220
19024	NC_022106	GAAG	2	8	861922	861929	50 %	0 %	50 %	0 %	532350220
19025	NC_022106	AAT	2	6	862047	862052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350220
19026	NC_022106	T	8	8	862052	862059	0 %	100 %	0 %	0 %	532350220
19027	NC_022106	AG	3	6	862112	862117	50 %	0 %	50 %	0 %	532350220
19028	NC_022106	TCT	2	6	862120	862125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350220
19029	NC_022106	T	6	6	862163	862168	0 %	100 %	0 %	0 %	532350220
19030	NC_022106	CTT	2	6	862198	862203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350220
19031	NC_022106	TTG	2	6	862245	862250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350220
19032	NC_022106	TTC	2	6	862320	862325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350220
19033	NC_022106	TAA	2	6	862359	862364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350220
19034	NC_022106	TTG	2	6	862368	862373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350220
19035	NC_022106	TTC	2	6	862407	862412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350220
19036	NC_022106	AAT	2	6	862431	862436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350220
19037	NC_022106	TTTA	2	8	862491	862498	25 %	75 %	0 %	0 %	532350220
19038	NC_022106	TGG	2	6	862500	862505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350220
19039	NC_022106	CCA	2	6	862536	862541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350220
19040	NC_022106	TCA	2	6	862576	862581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350220
19041	NC_022106	T	6	6	862611	862616	0 %	100 %	0 %	0 %	532350220
19042	NC_022106	T	6	6	862646	862651	0 %	100 %	0 %	0 %	532350220
19043	NC_022106	TTC	2	6	862691	862696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350220
19044	NC_022106	GAA	2	6	862700	862705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350220
19045	NC_022106	GAG	2	6	862706	862711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350220
19046	NC_022106	TGGGA	2	10	862738	862747	20 %	20 %	60 %	0 %	532350220
19047	NC_022106	AAAT	2	8	862758	862765	75 %	25 %	0 %	0 %	532350220
19048	NC_022106	GAG	2	6	862814	862819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350220
19049	NC_022106	AAAG	2	8	862885	862892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19050	NC_022106	TCC	2	6	862904	862909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19051	NC_022106	AGG	2	6	862912	862917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19052	NC_022106	A	8	8	862975	862982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19053	NC_022106	A	6	6	863039	863044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_022106	ATT	2	6	863061	863066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19055	NC_022106	T	7	7	863065	863071	0 %	100 %	0 %	0 %	532350221
19056	NC_022106	T	7	7	863082	863088	0 %	100 %	0 %	0 %	532350221
19057	NC_022106	T	7	7	863119	863125	0 %	100 %	0 %	0 %	532350221
19058	NC_022106	TAG	2	6	863145	863150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350221
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19060	NC_022106	CTT	2	6	863206	863211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350221
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19063	NC_022106	AGC	2	6	863233	863238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350221
19064	NC_022106	GCTTT	2	10	863240	863249	0 %	60 %	20 %	20 %	532350221
19065	NC_022106	T	7	7	863247	863253	0 %	100 %	0 %	0 %	532350221
19066	NC_022106	T	6	6	863265	863270	0 %	100 %	0 %	0 %	532350221
19067	NC_022106	TGC	2	6	863344	863349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350221
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19071	NC_022106	T	8	8	863412	863419	0 %	100 %	0 %	0 %	532350221
19072	NC_022106	A	6	6	863441	863446	100 %	0 %	0 %	0 %	532350221
19073	NC_022106	GTT	3	9	863456	863464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19074	NC_022106	T	7	7	863473	863479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19075	NC_022106	GTTT	2	8	863499	863506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19076	NC_022106	T	6	6	863626	863631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19082	NC_022106	ATG	2	6	863778	863783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19083	NC_022106	TCT	2	6	863798	863803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19084	NC_022106	T	6	6	863825	863830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19088	NC_022106	CTT	2	6	864210	864215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350222
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19092	NC_022106	ATA	2	6	864291	864296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350222
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19097	NC_022106	A	7	7	864590	864596	100 %	0 %	0 %	0 %	532350222
19098	NC_022106	AAG	2	6	864624	864629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350222
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19103	NC_022106	AGA	2	6	864919	864924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350222
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19105	NC_022106	TTCT	2	8	865040	865047	0 %	75 %	0 %	25 %	532350222
19106	NC_022106	GA	3	6	865069	865074	50 %	0 %	50 %	0 %	532350222
19107	NC_022106	CAG	2	6	865133	865138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350222
19108	NC_022106	ATGG	2	8	865186	865193	25 %	25 %	50 %	0 %	532350222
19109	NC_022106	AAG	2	6	865221	865226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350222
19110	NC_022106	CTT	2	6	865230	865235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350222
19111	NC_022106	T	7	7	865234	865240	0 %	100 %	0 %	0 %	532350222
19112	NC_022106	GAA	2	6	865271	865276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350222
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19115	NC_022106	AG	3	6	865322	865327	50 %	0 %	50 %	0 %	532350222
19116	NC_022106	CT	3	6	865331	865336	0 %	50 %	0 %	50 %	532350222
19117	NC_022106	GA	3	6	865377	865382	50 %	0 %	50 %	0 %	532350222
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19119	NC_022106	TCT	2	6	865423	865428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350222
19120	NC_022106	CT	3	6	865442	865447	0 %	50 %	0 %	50 %	532350222
19121	NC_022106	TCA	2	6	865495	865500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350222
19122	NC_022106	GCA	2	6	865552	865557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350222
19123	NC_022106	TTC	2	6	865594	865599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350222
19124	NC_022106	ATT	2	6	865768	865773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350222
19125	NC_022106	ATT	2	6	865798	865803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350222
19126	NC_022106	TTG	2	6	865817	865822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350222
19127	NC_022106	TAT	2	6	865832	865837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350222
19128	NC_022106	TAT	2	6	865955	865960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350222
19129	NC_022106	ACCT	2	8	865985	865992	25 %	25 %	0 %	50 %	532350222
19130	NC_022106	AAG	2	6	866040	866045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350222
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19133	NC_022106	TTA	2	6	866180	866185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350222
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19138	NC_022106	GACCTG	2	12	866347	866358	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532350223
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19142	NC_022106	GCT	2	6	866517	866522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350223
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19156	NC_022106	TCT	2	6	867134	867139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350223
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19163	NC_022106	TA	3	6	867319	867324	50 %	50 %	0 %	0 %	532350223
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19211	NC_022106	TTTG	2	8	870026	870033	0 %	75 %	25 %	0 %	532350226
19212	NC_022106	CTG	2	6	870048	870053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350226
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19228	NC_022106	AG	3	6	871005	871010	50 %	0 %	50 %	0 %	532350226
19229	NC_022106	GTT	2	6	871106	871111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350226
19230	NC_022106	TCA	2	6	871114	871119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350226
19231	NC_022106	ATA	2	6	871120	871125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350226
19232	NC_022106	T	7	7	871220	871226	0 %	100 %	0 %	0 %	532350226
19233	NC_022106	CAGCC	2	10	871275	871284	20 %	0 %	20 %	60 %	532350226
19234	NC_022106	GTA	2	6	871327	871332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350226
19235	NC_022106	CTTG	2	8	871349	871356	0 %	50 %	25 %	25 %	532350226
19236	NC_022106	CA	4	8	871364	871371	50 %	0 %	0 %	50 %	532350226
19237	NC_022106	CAT	2	6	871455	871460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350226
19238	NC_022106	TTC	2	6	871503	871508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350226
19239	NC_022106	GATA	2	8	871556	871563	50 %	25 %	25 %	0 %	532350226
19240	NC_022106	TCG	2	6	871650	871655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350226
19241	NC_022106	GAT	2	6	871802	871807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350226
19242	NC_022106	TC	3	6	871865	871870	0 %	50 %	0 %	50 %	532350226
19243	NC_022106	CTT	2	6	871889	871894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350226
19244	NC_022106	GTA	2	6	871900	871905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350226
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19246	NC_022106	GGA	2	6	871934	871939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350226
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19248	NC_022106	CTA	2	6	871988	871993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350226
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19251	NC_022106	GCT	2	6	872053	872058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350226
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19372	NC_022106	GCG	2	6	878396	878401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19373	NC_022106	GATG	2	8	878497	878504	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19374	NC_022106	GA	3	6	878534	878539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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19500	NC_022106	GAT	2	6	885724	885729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350232

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