MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_022106	TGA	2	6	835143	835148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350201
18503	NC_022106	A	6	6	835195	835200	100 %	0 %	0 %	0 %	532350201
18504	NC_022106	TGT	2	6	835283	835288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350201
18505	NC_022106	GTT	2	6	835305	835310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350201
18506	NC_022106	ATG	2	6	835361	835366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350201
18507	NC_022106	TATT	2	8	835417	835424	25 %	75 %	0 %	0 %	532350201
18508	NC_022106	TGAT	2	8	835481	835488	25 %	50 %	25 %	0 %	532350201
18509	NC_022106	CCG	2	6	835524	835529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532350201
18510	NC_022106	ATT	2	6	835543	835548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350201
18511	NC_022106	TGAA	2	8	835550	835557	50 %	25 %	25 %	0 %	532350201
18512	NC_022106	A	6	6	835561	835566	100 %	0 %	0 %	0 %	532350201
18513	NC_022106	TCG	2	6	835727	835732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350201
18514	NC_022106	TTAGA	2	10	835734	835743	40 %	40 %	20 %	0 %	532350201
18515	NC_022106	T	8	8	835791	835798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18516	NC_022106	T	6	6	835860	835865	0 %	100 %	0 %	0 %	532350202
18517	NC_022106	AGG	2	6	835888	835893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350202
18518	NC_022106	A	8	8	835975	835982	100 %	0 %	0 %	0 %	532350202
18519	NC_022106	AGA	2	6	836035	836040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350202
18520	NC_022106	T	6	6	836138	836143	0 %	100 %	0 %	0 %	532350202
18521	NC_022106	GAA	2	6	836216	836221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350202
18522	NC_022106	GAAA	2	8	836409	836416	75 %	0 %	25 %	0 %	532350203
18523	NC_022106	TAT	2	6	836419	836424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350203
18524	NC_022106	CTTT	2	8	836470	836477	0 %	75 %	0 %	25 %	532350203
18525	NC_022106	CGG	2	6	836522	836527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350203
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18527	NC_022106	AAG	2	6	836681	836686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350203
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18529	NC_022106	A	6	6	836725	836730	100 %	0 %	0 %	0 %	532350203
18530	NC_022106	TG	3	6	836744	836749	0 %	50 %	50 %	0 %	532350203
18531	NC_022106	GT	3	6	836775	836780	0 %	50 %	50 %	0 %	532350203
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18533	NC_022106	TGA	2	6	836817	836822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350203
18534	NC_022106	TC	3	6	836851	836856	0 %	50 %	0 %	50 %	532350203
18535	NC_022106	GAA	2	6	836887	836892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350203
18536	NC_022106	GAAA	2	8	836910	836917	75 %	0 %	25 %	0 %	532350203
18537	NC_022106	TAGT	2	8	836965	836972	25 %	50 %	25 %	0 %	532350203
18538	NC_022106	AAG	2	6	837015	837020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350204
18539	NC_022106	TAG	2	6	837024	837029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350204
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18543	NC_022106	ATC	2	6	837169	837174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350204
18544	NC_022106	ATA	2	6	837228	837233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350204
18545	NC_022106	TTC	2	6	837259	837264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350204
18546	NC_022106	AGCC	2	8	837305	837312	25 %	0 %	25 %	50 %	532350204
18547	NC_022106	CCT	2	6	837356	837361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350204
18548	NC_022106	AG	3	6	837377	837382	50 %	0 %	50 %	0 %	532350204
18549	NC_022106	AGA	2	6	837483	837488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350204
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18551	NC_022106	AG	3	6	837494	837499	50 %	0 %	50 %	0 %	532350204
18552	NC_022106	GGA	2	6	837545	837550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350204
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18554	NC_022106	AAT	2	6	837652	837657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350204
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18557	NC_022106	TACA	2	8	837898	837905	50 %	25 %	0 %	25 %	532350204
18558	NC_022106	T	6	6	837952	837957	0 %	100 %	0 %	0 %	532350204
18559	NC_022106	AGA	2	6	838000	838005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350204
18560	NC_022106	ATCACA	2	12	838022	838033	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532350204
18561	NC_022106	ATG	2	6	838052	838057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350204
18562	NC_022106	T	7	7	838098	838104	0 %	100 %	0 %	0 %	532350204
18563	NC_022106	GAAG	2	8	838141	838148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_022106	T	6	6	838206	838211	0 %	100 %	0 %	0 %	532350205
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18566	NC_022106	AAT	2	6	838319	838324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350205
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18574	NC_022106	AAGC	2	8	838761	838768	50 %	0 %	25 %	25 %	532350205
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18593	NC_022106	AAG	2	6	840002	840007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350205
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18597	NC_022106	A	7	7	840122	840128	100 %	0 %	0 %	0 %	532350205
18598	NC_022106	A	6	6	840160	840165	100 %	0 %	0 %	0 %	532350205
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18605	NC_022106	CTTG	2	8	840429	840436	0 %	50 %	25 %	25 %	532350206
18606	NC_022106	TCT	2	6	840452	840457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350206
18607	NC_022106	AAGAG	2	10	840494	840503	60 %	0 %	40 %	0 %	532350206
18608	NC_022106	AC	3	6	840514	840519	50 %	0 %	0 %	50 %	532350206
18609	NC_022106	TCTT	2	8	840617	840624	0 %	75 %	0 %	25 %	532350206
18610	NC_022106	TGC	2	6	840667	840672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350206
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18612	NC_022106	AGAA	2	8	840764	840771	75 %	0 %	25 %	0 %	532350206
18613	NC_022106	A	6	6	840784	840789	100 %	0 %	0 %	0 %	532350206
18614	NC_022106	CAAT	2	8	840803	840810	50 %	25 %	0 %	25 %	532350206
18615	NC_022106	T	7	7	840841	840847	0 %	100 %	0 %	0 %	532350206
18616	NC_022106	TGA	2	6	840851	840856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350206
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18619	NC_022106	CTC	2	6	840956	840961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18620	NC_022106	GAA	2	6	841035	841040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350207
18621	NC_022106	GAC	2	6	841051	841056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350207
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18623	NC_022106	TCG	2	6	841183	841188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350207
18624	NC_022106	ATCG	2	8	841264	841271	25 %	25 %	25 %	25 %	532350207
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18628	NC_022106	CTT	3	9	841383	841391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350207
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18653	NC_022106	TGGG	2	8	842403	842410	0 %	25 %	75 %	0 %	532350208
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18656	NC_022106	TGT	2	6	842550	842555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350208
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18724	NC_022106	CT	3	6	846124	846129	0 %	50 %	0 %	50 %	532350211
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18733	NC_022106	TG	3	6	846745	846750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18735	NC_022106	GA	3	6	846843	846848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18736	NC_022106	T	6	6	846874	846879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18737	NC_022106	AG	3	6	846922	846927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18738	NC_022106	AG	3	6	846931	846936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18739	NC_022106	TAA	2	6	846995	847000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18740	NC_022106	TAC	2	6	847015	847020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18741	NC_022106	ATTT	2	8	847023	847030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18742	NC_022106	CT	3	6	847082	847087	0 %	50 %	0 %	50 %	532350212
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18997	NC_022106	AAG	2	6	860408	860413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350218
18998	NC_022106	AGAT	2	8	860451	860458	50 %	25 %	25 %	0 %	532350218
18999	NC_022106	AGG	2	6	860553	860558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350218
19000	NC_022106	AGAA	2	8	860616	860623	75 %	0 %	25 %	0 %	532350218

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