MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_022106	TC	4	8	812630	812637	0 %	50 %	0 %	50 %	532350185
18003	NC_022106	T	6	6	812652	812657	0 %	100 %	0 %	0 %	532350185
18004	NC_022106	T	6	6	812701	812706	0 %	100 %	0 %	0 %	532350185
18005	NC_022106	CAG	2	6	812721	812726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350185
18006	NC_022106	CCT	2	6	812762	812767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350185
18007	NC_022106	ATC	2	6	812780	812785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350185
18008	NC_022106	ATA	2	6	812832	812837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350185
18009	NC_022106	CTG	2	6	812925	812930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350185
18010	NC_022106	AT	3	6	812933	812938	50 %	50 %	0 %	0 %	532350185
18011	NC_022106	TGA	2	6	812952	812957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350185
18012	NC_022106	TAG	2	6	812973	812978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350185
18013	NC_022106	AATA	2	8	813081	813088	75 %	25 %	0 %	0 %	532350185
18014	NC_022106	CGC	2	6	813102	813107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532350185
18015	NC_022106	CAA	2	6	813120	813125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350185
18016	NC_022106	TG	3	6	813146	813151	0 %	50 %	50 %	0 %	532350185
18017	NC_022106	AGAAA	2	10	813209	813218	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_022106	ATG	2	6	813255	813260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_022106	AAG	2	6	813313	813318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350186
18020	NC_022106	AAC	2	6	813320	813325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350186
18021	NC_022106	T	6	6	813335	813340	0 %	100 %	0 %	0 %	532350186
18022	NC_022106	CAA	2	6	813391	813396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350186
18023	NC_022106	AACT	2	8	813398	813405	50 %	25 %	0 %	25 %	532350186
18024	NC_022106	ATC	2	6	813411	813416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350186
18025	NC_022106	TCA	2	6	813472	813477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350186
18026	NC_022106	TTC	2	6	813488	813493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350186
18027	NC_022106	CCTT	2	8	813556	813563	0 %	50 %	0 %	50 %	532350186
18028	NC_022106	CTT	2	6	813577	813582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350186
18029	NC_022106	AG	3	6	813662	813667	50 %	0 %	50 %	0 %	532350186
18030	NC_022106	TTC	2	6	813671	813676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350186
18031	NC_022106	CT	3	6	813693	813698	0 %	50 %	0 %	50 %	532350186
18032	NC_022106	CTT	2	6	813766	813771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350186
18033	NC_022106	TTC	2	6	813804	813809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350186
18034	NC_022106	AAG	2	6	813902	813907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350186
18035	NC_022106	AGGA	2	8	813918	813925	50 %	0 %	50 %	0 %	532350186
18036	NC_022106	ATTT	2	8	814033	814040	25 %	75 %	0 %	0 %	532350186
18037	NC_022106	TCA	2	6	814068	814073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350186
18038	NC_022106	A	6	6	814151	814156	100 %	0 %	0 %	0 %	532350186
18039	NC_022106	T	6	6	814167	814172	0 %	100 %	0 %	0 %	532350186
18040	NC_022106	TCT	2	6	814188	814193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350186
18041	NC_022106	GAAA	2	8	814280	814287	75 %	0 %	25 %	0 %	532350186
18042	NC_022106	GAG	2	6	814326	814331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350186
18043	NC_022106	CA	3	6	814363	814368	50 %	0 %	0 %	50 %	532350186
18044	NC_022106	CAA	2	6	814447	814452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350186
18045	NC_022106	TAT	2	6	814453	814458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350186
18046	NC_022106	ACA	2	6	814491	814496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350186
18047	NC_022106	T	8	8	814497	814504	0 %	100 %	0 %	0 %	532350186
18048	NC_022106	CTT	2	6	814519	814524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350186
18049	NC_022106	TG	3	6	814536	814541	0 %	50 %	50 %	0 %	532350186
18050	NC_022106	ACACA	2	10	814570	814579	60 %	0 %	0 %	40 %	532350186
18051	NC_022106	TCT	2	6	814590	814595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350186
18052	NC_022106	TGA	2	6	814680	814685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_022106	GAA	2	6	814748	814753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18054	NC_022106	A	8	8	814809	814816	100 %	0 %	0 %	0 %	532350412
18055	NC_022106	T	6	6	814830	814835	0 %	100 %	0 %	0 %	532350412
18056	NC_022106	GGT	2	6	814849	814854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350412
18057	NC_022106	A	7	7	814855	814861	100 %	0 %	0 %	0 %	532350412
18058	NC_022106	GAA	2	6	814906	814911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350412
18059	NC_022106	AAG	2	6	815017	815022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350187
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18061	NC_022106	TCTT	2	8	815317	815324	0 %	75 %	0 %	25 %	532350187
18062	NC_022106	GAG	2	6	815330	815335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350187
18063	NC_022106	GAG	2	6	815381	815386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350187
18064	NC_022106	TGC	2	6	815437	815442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350187
18065	NC_022106	CTT	3	9	815464	815472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350187
18066	NC_022106	TGTTT	2	10	815512	815521	0 %	80 %	20 %	0 %	532350187
18067	NC_022106	A	7	7	815529	815535	100 %	0 %	0 %	0 %	532350187
18068	NC_022106	TCT	2	6	815547	815552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350187
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18070	NC_022106	ATT	2	6	815785	815790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350187
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18073	NC_022106	AGA	2	6	815923	815928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350187
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18081	NC_022106	ACG	2	6	816357	816362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350187
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18089	NC_022106	TTTA	2	8	816623	816630	25 %	75 %	0 %	0 %	532350187
18090	NC_022106	TGA	2	6	816631	816636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350187
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18092	NC_022106	ACTT	2	8	816732	816739	25 %	50 %	0 %	25 %	532350187
18093	NC_022106	GAA	2	6	816757	816762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350187
18094	NC_022106	CTT	2	6	816766	816771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350187
18095	NC_022106	A	6	6	816800	816805	100 %	0 %	0 %	0 %	532350187
18096	NC_022106	GCG	2	6	816808	816813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350187
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18102	NC_022106	ATT	2	6	817199	817204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350187
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18105	NC_022106	AGA	2	6	817372	817377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350187
18106	NC_022106	ATG	2	6	817380	817385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350187
18107	NC_022106	CTT	2	6	817395	817400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350187
18108	NC_022106	GTT	2	6	817454	817459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350187
18109	NC_022106	AGC	2	6	817619	817624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350187
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18112	NC_022106	AGA	2	6	817750	817755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350187
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18114	NC_022106	AAG	2	6	817869	817874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350187
18115	NC_022106	GA	3	6	817880	817885	50 %	0 %	50 %	0 %	532350187
18116	NC_022106	TGT	2	6	817931	817936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350187
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18119	NC_022106	TCT	2	6	818179	818184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350187
18120	NC_022106	GGA	2	6	818210	818215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350187
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18122	NC_022106	TGG	2	6	818264	818269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350187
18123	NC_022106	CTG	2	6	818274	818279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350187
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18125	NC_022106	A	6	6	818370	818375	100 %	0 %	0 %	0 %	532350187
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18142	NC_022106	TAG	2	6	819406	819411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350188
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18235	NC_022106	AGC	2	6	823656	823661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350190
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18240	NC_022106	CAA	2	6	823874	823879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350191
18241	NC_022106	CTC	2	6	823892	823897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350191
18242	NC_022106	AGC	2	6	823926	823931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350191
18243	NC_022106	GGC	2	6	823953	823958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350191
18244	NC_022106	TAAA	2	8	824012	824019	75 %	25 %	0 %	0 %	532350191
18245	NC_022106	AG	3	6	824028	824033	50 %	0 %	50 %	0 %	532350191
18246	NC_022106	AG	3	6	824097	824102	50 %	0 %	50 %	0 %	532350191
18247	NC_022106	AG	5	10	824120	824129	50 %	0 %	50 %	0 %	532350191
18248	NC_022106	CAA	2	6	824143	824148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350191
18249	NC_022106	CTG	2	6	824186	824191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350191
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18254	NC_022106	TAA	2	6	824379	824384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350191
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18256	NC_022106	AGC	3	9	824531	824539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350191
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18263	NC_022106	TA	3	6	824978	824983	50 %	50 %	0 %	0 %	532350191
18264	NC_022106	CTAG	2	8	824996	825003	25 %	25 %	25 %	25 %	532350191
18265	NC_022106	TCT	2	6	825017	825022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18266	NC_022106	AAGAG	2	10	825048	825057	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18267	NC_022106	G	6	6	825063	825068	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18268	NC_022106	TCC	2	6	825081	825086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350192
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18274	NC_022106	GTC	2	6	825255	825260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350192
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18295	NC_022106	TC	3	6	826176	826181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18296	NC_022106	GAA	3	9	826214	826222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18297	NC_022106	TTC	2	6	826234	826239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350193
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18349	NC_022106	AGC	2	6	828544	828549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350194
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18352	NC_022106	TA	3	6	828733	828738	50 %	50 %	0 %	0 %	532350195
18353	NC_022106	CT	3	6	828749	828754	0 %	50 %	0 %	50 %	532350195
18354	NC_022106	TTGT	2	8	828809	828816	0 %	75 %	25 %	0 %	532350195
18355	NC_022106	TGT	2	6	828855	828860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350195
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18357	NC_022106	T	6	6	828959	828964	0 %	100 %	0 %	0 %	532350195
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18360	NC_022106	GA	3	6	829156	829161	50 %	0 %	50 %	0 %	532350196
18361	NC_022106	GCA	2	6	829174	829179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350196
18362	NC_022106	ATG	2	6	829182	829187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350196
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18367	NC_022106	AGA	2	6	829291	829296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350196
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18487	NC_022106	AGGG	2	8	834800	834807	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18488	NC_022106	G	6	6	834805	834810	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18489	NC_022106	GAG	2	6	834837	834842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18490	NC_022106	CTT	2	6	834845	834850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18491	NC_022106	CT	3	6	834856	834861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18492	NC_022106	ATG	2	6	834876	834881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18493	NC_022106	ATTTTT	2	12	834889	834900	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18494	NC_022106	AG	3	6	834914	834919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18495	NC_022106	GTT	2	6	834928	834933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18496	NC_022106	GA	3	6	834937	834942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18497	NC_022106	TTA	2	6	834962	834967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18498	NC_022106	TGGCA	2	10	835008	835017	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18499	NC_022106	CAG	2	6	835046	835051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350201
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