MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_022106	GCG	2	6	789703	789708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350166
17502	NC_022106	ATT	2	6	789713	789718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350166
17503	NC_022106	AGC	2	6	789779	789784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350166
17504	NC_022106	GTA	2	6	789848	789853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350166
17505	NC_022106	T	6	6	789888	789893	0 %	100 %	0 %	0 %	532350166
17506	NC_022106	CAGC	2	8	789940	789947	25 %	0 %	25 %	50 %	532350166
17507	NC_022106	TTC	2	6	790016	790021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350166
17508	NC_022106	TCGT	2	8	790059	790066	0 %	50 %	25 %	25 %	532350166
17509	NC_022106	AG	3	6	790085	790090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17510	NC_022106	CTGT	2	8	790158	790165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17511	NC_022106	TTCT	2	8	790316	790323	0 %	75 %	0 %	25 %	532350167
17512	NC_022106	TCC	2	6	790347	790352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350167
17513	NC_022106	TAT	2	6	790390	790395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350167
17514	NC_022106	GC	3	6	790422	790427	0 %	0 %	50 %	50 %	532350167
17515	NC_022106	TGT	2	6	790458	790463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350167
17516	NC_022106	TGA	2	6	790482	790487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350167
17517	NC_022106	GCA	2	6	790492	790497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350167
17518	NC_022106	TAAACC	2	12	790529	790540	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532350167
17519	NC_022106	TTG	2	6	790574	790579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350167
17520	NC_022106	A	6	6	790609	790614	100 %	0 %	0 %	0 %	532350167
17521	NC_022106	GAA	2	6	790620	790625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350167
17522	NC_022106	TC	3	6	790658	790663	0 %	50 %	0 %	50 %	532350167
17523	NC_022106	A	6	6	790682	790687	100 %	0 %	0 %	0 %	532350167
17524	NC_022106	GA	3	6	790697	790702	50 %	0 %	50 %	0 %	532350167
17525	NC_022106	CTT	2	6	790844	790849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350167
17526	NC_022106	AAG	2	6	790853	790858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350167
17527	NC_022106	TTC	2	6	790863	790868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350167
17528	NC_022106	CTT	2	6	790874	790879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350167
17529	NC_022106	CAA	2	6	790910	790915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350167
17530	NC_022106	T	6	6	790969	790974	0 %	100 %	0 %	0 %	532350167
17531	NC_022106	TCT	3	9	791023	791031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350167
17532	NC_022106	CTTAA	2	10	791040	791049	40 %	40 %	0 %	20 %	532350167
17533	NC_022106	CGG	2	6	791066	791071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350168
17534	NC_022106	AGC	2	6	791102	791107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350168
17535	NC_022106	GT	3	6	791112	791117	0 %	50 %	50 %	0 %	532350168
17536	NC_022106	TGC	2	6	791123	791128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350168
17537	NC_022106	TCT	2	6	791144	791149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350168
17538	NC_022106	GAC	2	6	791212	791217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350168
17539	NC_022106	AAAT	2	8	791232	791239	75 %	25 %	0 %	0 %	532350168
17540	NC_022106	TTG	2	6	791257	791262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350168
17541	NC_022106	ATAG	2	8	791300	791307	50 %	25 %	25 %	0 %	532350168
17542	NC_022106	TCA	2	6	791327	791332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350168
17543	NC_022106	AG	3	6	791434	791439	50 %	0 %	50 %	0 %	532350168
17544	NC_022106	CCA	2	6	791442	791447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350168
17545	NC_022106	TTC	2	6	791479	791484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350168
17546	NC_022106	GAT	2	6	791499	791504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350168
17547	NC_022106	CCTT	2	8	791605	791612	0 %	50 %	0 %	50 %	532350168
17548	NC_022106	T	6	6	791611	791616	0 %	100 %	0 %	0 %	532350168
17549	NC_022106	AAT	2	6	791734	791739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350168
17550	NC_022106	T	6	6	791791	791796	0 %	100 %	0 %	0 %	532350168
17551	NC_022106	TAA	2	6	791822	791827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350168
17552	NC_022106	GCTT	2	8	791842	791849	0 %	50 %	25 %	25 %	532350168
17553	NC_022106	ATT	2	6	791863	791868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350168
17554	NC_022106	GAT	3	9	791890	791898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350169
17555	NC_022106	GAG	2	6	791959	791964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350169
17556	NC_022106	CTG	2	6	792029	792034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350169
17557	NC_022106	TCT	2	6	792066	792071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350169
17558	NC_022106	AGA	2	6	792110	792115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350169
17559	NC_022106	ACAAA	2	10	792139	792148	80 %	0 %	0 %	20 %	532350169
17560	NC_022106	T	9	9	792214	792222	0 %	100 %	0 %	0 %	532350169
17561	NC_022106	TAA	2	6	792296	792301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350169
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17564	NC_022106	TTG	2	6	792488	792493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350169
17565	NC_022106	GAG	2	6	792593	792598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350169
17566	NC_022106	TTA	2	6	792606	792611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350169
17567	NC_022106	CCCTGA	2	12	792686	792697	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532350169
17568	NC_022106	AAT	2	6	792704	792709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350169
17569	NC_022106	CA	3	6	792823	792828	50 %	0 %	0 %	50 %	532350169
17570	NC_022106	CTA	2	6	792843	792848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17571	NC_022106	A	7	7	792882	792888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17572	NC_022106	A	6	6	792890	792895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17573	NC_022106	AT	5	10	792926	792935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17574	NC_022106	AGG	2	6	792938	792943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17575	NC_022106	A	6	6	792977	792982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17576	NC_022106	TTC	2	6	793058	793063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350170
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17581	NC_022106	CG	3	6	793225	793230	0 %	0 %	50 %	50 %	532350170
17582	NC_022106	TTG	2	6	793296	793301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350170
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17592	NC_022106	AGA	2	6	793652	793657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350170
17593	NC_022106	TGC	2	6	793674	793679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350171
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17604	NC_022106	ATT	2	6	794219	794224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350171
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17606	NC_022106	T	6	6	794323	794328	0 %	100 %	0 %	0 %	532350171
17607	NC_022106	CTT	2	6	794350	794355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350171
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17609	NC_022106	TTC	2	6	794382	794387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350171
17610	NC_022106	ATT	2	6	794395	794400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350171
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17612	NC_022106	CTTA	2	8	794466	794473	25 %	50 %	0 %	25 %	532350171
17613	NC_022106	GAT	2	6	794476	794481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350171
17614	NC_022106	ATG	2	6	794517	794522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350171
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17616	NC_022106	GGA	2	6	794615	794620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350171
17617	NC_022106	TGAT	2	8	794661	794668	25 %	50 %	25 %	0 %	532350171
17618	NC_022106	A	7	7	794678	794684	100 %	0 %	0 %	0 %	532350171
17619	NC_022106	TCC	2	6	794753	794758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350171
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17988	NC_022106	GAT	2	6	811873	811878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350184
17989	NC_022106	TTG	2	6	811891	811896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350184
17990	NC_022106	TCA	2	6	811964	811969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350184
17991	NC_022106	AAT	2	6	811975	811980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350184
17992	NC_022106	CAT	2	6	812001	812006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350184
17993	NC_022106	CTG	2	6	812010	812015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350184
17994	NC_022106	TCT	2	6	812048	812053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350184
17995	NC_022106	TAA	2	6	812167	812172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350184
17996	NC_022106	T	7	7	812259	812265	0 %	100 %	0 %	0 %	532350184
17997	NC_022106	CG	3	6	812266	812271	0 %	0 %	50 %	50 %	532350184
17998	NC_022106	TTG	2	6	812337	812342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350184
17999	NC_022106	T	9	9	812510	812518	0 %	100 %	0 %	0 %	532350184
18000	NC_022106	AGA	2	6	812569	812574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350185

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