MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_022106	TCG	2	6	766394	766399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350149
17003	NC_022106	GGATC	2	10	766401	766410	20 %	20 %	40 %	20 %	532350149
17004	NC_022106	TAAAT	2	10	766442	766451	60 %	40 %	0 %	0 %	532350149
17005	NC_022106	A	6	6	766477	766482	100 %	0 %	0 %	0 %	532350149
17006	NC_022106	GCT	2	6	766497	766502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350149
17007	NC_022106	TAG	2	6	766540	766545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_022106	TG	3	6	766549	766554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_022106	AAG	2	6	766588	766593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350150
17010	NC_022106	CAGAG	2	10	766605	766614	40 %	0 %	40 %	20 %	532350150
17011	NC_022106	GTT	2	6	766618	766623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350150
17012	NC_022106	AAC	2	6	766749	766754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350150
17013	NC_022106	GCGAT	2	10	766757	766766	20 %	20 %	40 %	20 %	532350150
17014	NC_022106	AGT	2	6	766791	766796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350150
17015	NC_022106	GAA	4	12	766813	766824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350150
17016	NC_022106	AGAA	2	8	766838	766845	75 %	0 %	25 %	0 %	532350150
17017	NC_022106	GCA	3	9	766855	766863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350150
17018	NC_022106	ACG	2	6	766899	766904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350150
17019	NC_022106	AGA	3	9	766908	766916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350150
17020	NC_022106	A	6	6	766916	766921	100 %	0 %	0 %	0 %	532350150
17021	NC_022106	AGA	2	6	766935	766940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350150
17022	NC_022106	AAG	2	6	766949	766954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350150
17023	NC_022106	AGA	2	6	766962	766967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350150
17024	NC_022106	GAA	2	6	766978	766983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350150
17025	NC_022106	AGATG	2	10	766992	767001	40 %	20 %	40 %	0 %	532350150
17026	NC_022106	TCA	2	6	767013	767018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350150
17027	NC_022106	AAC	2	6	767033	767038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350150
17028	NC_022106	TAAA	2	8	767069	767076	75 %	25 %	0 %	0 %	532350151
17029	NC_022106	ATC	2	6	767114	767119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350151
17030	NC_022106	GAAG	2	8	767176	767183	50 %	0 %	50 %	0 %	532350151
17031	NC_022106	GAA	2	6	767222	767227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350151
17032	NC_022106	CGTCA	2	10	767231	767240	20 %	20 %	20 %	40 %	532350151
17033	NC_022106	TCT	2	6	767245	767250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350151
17034	NC_022106	CAG	2	6	767285	767290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350151
17035	NC_022106	TCT	2	6	767296	767301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350151
17036	NC_022106	AGA	3	9	767304	767312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350151
17037	NC_022106	TTC	2	6	767329	767334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350151
17038	NC_022106	TGG	2	6	767337	767342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350151
17039	NC_022106	ATG	2	6	767401	767406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350151
17040	NC_022106	TAG	2	6	767513	767518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350151
17041	NC_022106	ATA	2	6	767531	767536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350151
17042	NC_022106	GAA	2	6	767593	767598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350151
17043	NC_022106	CAG	2	6	767662	767667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350151
17044	NC_022106	AGC	2	6	767675	767680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350151
17045	NC_022106	TGG	2	6	767690	767695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350151
17046	NC_022106	TCA	2	6	767709	767714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350151
17047	NC_022106	GTTG	2	8	767730	767737	0 %	50 %	50 %	0 %	532350151
17048	NC_022106	A	6	6	767771	767776	100 %	0 %	0 %	0 %	532350151
17049	NC_022106	TGC	2	6	767799	767804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350151
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17052	NC_022106	AAG	2	6	767837	767842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350151
17053	NC_022106	GTC	2	6	767849	767854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350151
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17055	NC_022106	AGA	2	6	767892	767897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350151
17056	NC_022106	AT	3	6	767903	767908	50 %	50 %	0 %	0 %	532350151
17057	NC_022106	GCA	2	6	767929	767934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350152
17058	NC_022106	TAG	2	6	767940	767945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350152
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17060	NC_022106	TTTTC	2	10	768007	768016	0 %	80 %	0 %	20 %	532350152
17061	NC_022106	GAA	2	6	768070	768075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350152
17062	NC_022106	TCTG	2	8	768105	768112	0 %	50 %	25 %	25 %	532350152
17063	NC_022106	GCT	2	6	768118	768123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350152
17064	NC_022106	GAA	2	6	768208	768213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350152
17065	NC_022106	CTT	2	6	768260	768265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350152
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17069	NC_022106	GCT	2	6	768327	768332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350152
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17071	NC_022106	AGA	2	6	768513	768518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350152
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17088	NC_022106	GAGCA	2	10	769698	769707	40 %	0 %	40 %	20 %	532350153
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17092	NC_022106	TGT	2	6	769955	769960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350153
17093	NC_022106	AG	3	6	769987	769992	50 %	0 %	50 %	0 %	532350153
17094	NC_022106	ATA	2	6	770074	770079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350153
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17101	NC_022106	G	7	7	770364	770370	0 %	0 %	100 %	0 %	532350153
17102	NC_022106	GGA	2	6	770405	770410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350153
17103	NC_022106	AC	3	6	770471	770476	50 %	0 %	0 %	50 %	532350153
17104	NC_022106	TATATT	2	12	770497	770508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350153
17105	NC_022106	CTT	2	6	770512	770517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350153
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17107	NC_022106	GTT	2	6	770729	770734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350154
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17113	NC_022106	AGA	2	6	771056	771061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350154
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17115	NC_022106	CTG	2	6	771108	771113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350154
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17117	NC_022106	AAG	4	12	771153	771164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350154
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17120	NC_022106	GAA	2	6	771298	771303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350154
17121	NC_022106	AAG	3	9	771363	771371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350154
17122	NC_022106	A	6	6	771374	771379	100 %	0 %	0 %	0 %	532350154
17123	NC_022106	AAAC	2	8	771394	771401	75 %	0 %	0 %	25 %	532350154
17124	NC_022106	AAG	2	6	771426	771431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350154
17125	NC_022106	GAT	2	6	771575	771580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350154
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17152	NC_022106	TCA	2	6	773235	773240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350154
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17190	NC_022106	TGA	2	6	775376	775381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17243	NC_022106	CTT	2	6	777971	777976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350159
17244	NC_022106	ATC	2	6	778034	778039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350159
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17482	NC_022106	AGGGA	2	10	788168	788177	40 %	0 %	60 %	0 %	532350165
17483	NC_022106	AGAA	2	8	788306	788313	75 %	0 %	25 %	0 %	532350165
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17488	NC_022106	ACT	2	6	788511	788516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350165
17489	NC_022106	G	6	6	788567	788572	0 %	0 %	100 %	0 %	532350165
17490	NC_022106	TTA	2	6	788631	788636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350165
17491	NC_022106	A	6	6	788875	788880	100 %	0 %	0 %	0 %	532350165
17492	NC_022106	GT	3	6	788955	788960	0 %	50 %	50 %	0 %	532350166
17493	NC_022106	TTC	2	6	788988	788993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350166
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17495	NC_022106	GAT	2	6	789280	789285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350166
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17500	NC_022106	ATTAGG	2	12	789690	789701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350166

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