MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_022106	AGA	2	6	742647	742652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350125
16502	NC_022106	TTCC	2	8	742655	742662	0 %	50 %	0 %	50 %	532350125
16503	NC_022106	GAG	2	6	742663	742668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350125
16504	NC_022106	TTCT	2	8	742775	742782	0 %	75 %	0 %	25 %	532350125
16505	NC_022106	AGGG	2	8	742827	742834	25 %	0 %	75 %	0 %	532350125
16506	NC_022106	GCT	2	6	742884	742889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350126
16507	NC_022106	CAG	2	6	742930	742935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350126
16508	NC_022106	GA	3	6	742964	742969	50 %	0 %	50 %	0 %	532350126
16509	NC_022106	TCT	2	6	742992	742997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350126
16510	NC_022106	AGC	2	6	743027	743032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350126
16511	NC_022106	GA	3	6	743071	743076	50 %	0 %	50 %	0 %	532350126
16512	NC_022106	GTG	2	6	743136	743141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350126
16513	NC_022106	AGA	2	6	743177	743182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350126
16514	NC_022106	GA	3	6	743215	743220	50 %	0 %	50 %	0 %	532350126
16515	NC_022106	TTTC	2	8	743233	743240	0 %	75 %	0 %	25 %	532350126
16516	NC_022106	TAT	2	6	743278	743283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350126
16517	NC_022106	TCTT	2	8	743327	743334	0 %	75 %	0 %	25 %	532350126
16518	NC_022106	TCA	2	6	743358	743363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350126
16519	NC_022106	TG	3	6	743409	743414	0 %	50 %	50 %	0 %	532350126
16520	NC_022106	TC	4	8	743584	743591	0 %	50 %	0 %	50 %	532350127
16521	NC_022106	TACA	2	8	743617	743624	50 %	25 %	0 %	25 %	532350127
16522	NC_022106	GCA	2	6	743630	743635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350127
16523	NC_022106	ACG	2	6	743657	743662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350127
16524	NC_022106	AAT	2	6	743705	743710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350127
16525	NC_022106	GTT	2	6	743818	743823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350127
16526	NC_022106	AAC	2	6	743830	743835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350127
16527	NC_022106	GGAA	2	8	743937	743944	50 %	0 %	50 %	0 %	532350127
16528	NC_022106	GAA	2	6	743993	743998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350127
16529	NC_022106	AAAC	2	8	744014	744021	75 %	0 %	0 %	25 %	532350127
16530	NC_022106	TTG	2	6	744080	744085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350127
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16532	NC_022106	GAA	2	6	744149	744154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350127
16533	NC_022106	TGA	2	6	744265	744270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350127
16534	NC_022106	TTG	2	6	744284	744289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350127
16535	NC_022106	GAA	2	6	744326	744331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350127
16536	NC_022106	TTA	2	6	744368	744373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350127
16537	NC_022106	GAC	2	6	744527	744532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350127
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16541	NC_022106	GTT	2	6	744710	744715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350128
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16544	NC_022106	AGC	2	6	744771	744776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350128
16545	NC_022106	TAT	2	6	744824	744829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350128
16546	NC_022106	CAAT	2	8	744866	744873	50 %	25 %	0 %	25 %	532350128
16547	NC_022106	CTC	2	6	744898	744903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350128
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16549	NC_022106	CTA	2	6	745092	745097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350128
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16551	NC_022106	GCT	2	6	745155	745160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350128
16552	NC_022106	ATG	2	6	745187	745192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350128
16553	NC_022106	A	6	6	745239	745244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16554	NC_022106	C	6	6	745247	745252	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16555	NC_022106	T	7	7	745273	745279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16556	NC_022106	A	6	6	745281	745286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16557	NC_022106	TCTT	2	8	745293	745300	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16559	NC_022106	A	7	7	745336	745342	100 %	0 %	0 %	0 %	532350406
16560	NC_022106	T	7	7	745351	745357	0 %	100 %	0 %	0 %	532350406
16561	NC_022106	TGT	2	6	745376	745381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350406
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16607	NC_022106	T	6	6	747596	747601	0 %	100 %	0 %	0 %	532350130
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16612	NC_022106	A	6	6	747862	747867	100 %	0 %	0 %	0 %	532350130
16613	NC_022106	T	6	6	747908	747913	0 %	100 %	0 %	0 %	532350130
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16746	NC_022106	TTG	2	6	754147	754152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350138
16747	NC_022106	CT	3	6	754181	754186	0 %	50 %	0 %	50 %	532350138
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16755	NC_022106	TATTTT	2	12	754732	754743	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16757	NC_022106	A	6	6	754814	754819	100 %	0 %	0 %	0 %	532350139
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16761	NC_022106	TCT	2	6	755097	755102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16993	NC_022106	GTC	2	6	765893	765898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350149
16994	NC_022106	TGC	2	6	765914	765919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350149
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