MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022106	AAC	2	6	699652	699657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350098
15502	NC_022106	AT	3	6	699675	699680	50 %	50 %	0 %	0 %	532350098
15503	NC_022106	TCCT	2	8	699740	699747	0 %	50 %	0 %	50 %	532350098
15504	NC_022106	GAA	2	6	699765	699770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350098
15505	NC_022106	GTA	2	6	699776	699781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350098
15506	NC_022106	TTA	2	6	699801	699806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350098
15507	NC_022106	AGG	2	6	699816	699821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350098
15508	NC_022106	AGC	2	6	699836	699841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350098
15509	NC_022106	TTG	2	6	699846	699851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350098
15510	NC_022106	CTT	2	6	699859	699864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350098
15511	NC_022106	AAG	2	6	699982	699987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350098
15512	NC_022106	AAG	2	6	700012	700017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350098
15513	NC_022106	TTG	2	6	700067	700072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350098
15514	NC_022106	CAG	3	9	700138	700146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350098
15515	NC_022106	T	6	6	700156	700161	0 %	100 %	0 %	0 %	532350098
15516	NC_022106	TTG	2	6	700209	700214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350098
15517	NC_022106	TAGT	2	8	700227	700234	25 %	50 %	25 %	0 %	532350098
15518	NC_022106	ATC	2	6	700247	700252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350098
15519	NC_022106	A	6	6	700271	700276	100 %	0 %	0 %	0 %	532350098
15520	NC_022106	T	6	6	700283	700288	0 %	100 %	0 %	0 %	532350098
15521	NC_022106	GTTC	2	8	700291	700298	0 %	50 %	25 %	25 %	532350098
15522	NC_022106	CT	3	6	700605	700610	0 %	50 %	0 %	50 %	532350098
15523	NC_022106	TGCTTG	2	12	700616	700627	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532350098
15524	NC_022106	AAG	2	6	700629	700634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350098
15525	NC_022106	ACC	2	6	700725	700730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350098
15526	NC_022106	TG	3	6	700803	700808	0 %	50 %	50 %	0 %	532350098
15527	NC_022106	TAC	2	6	700813	700818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350098
15528	NC_022106	TCC	2	6	700824	700829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350098
15529	NC_022106	CTT	2	6	700888	700893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350098
15530	NC_022106	ATT	2	6	700928	700933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350098
15531	NC_022106	TCCA	2	8	700941	700948	25 %	25 %	0 %	50 %	532350098
15532	NC_022106	TGCT	2	8	701065	701072	0 %	50 %	25 %	25 %	532350098
15533	NC_022106	TG	3	6	701100	701105	0 %	50 %	50 %	0 %	532350098
15534	NC_022106	TCA	2	6	701115	701120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350098
15535	NC_022106	ATA	2	6	701123	701128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350098
15536	NC_022106	AGCTG	2	10	701187	701196	20 %	20 %	40 %	20 %	532350098
15537	NC_022106	CTT	2	6	701212	701217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350098
15538	NC_022106	TTCT	2	8	701234	701241	0 %	75 %	0 %	25 %	532350098
15539	NC_022106	CTG	2	6	701327	701332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350098
15540	NC_022106	TGC	2	6	701354	701359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350098
15541	NC_022106	TCT	2	6	701400	701405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350098
15542	NC_022106	TAC	2	6	701479	701484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350098
15543	NC_022106	CTG	2	6	701497	701502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350098
15544	NC_022106	TGC	2	6	701509	701514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350098
15545	NC_022106	CTT	2	6	701526	701531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350098
15546	NC_022106	C	6	6	701533	701538	0 %	0 %	0 %	100 %	532350098
15547	NC_022106	TCC	2	6	701543	701548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350098
15548	NC_022106	CTC	2	6	701651	701656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350098
15549	NC_022106	TGGC	2	8	701665	701672	0 %	25 %	50 %	25 %	532350098
15550	NC_022106	TAAA	2	8	701719	701726	75 %	25 %	0 %	0 %	532350098
15551	NC_022106	AGT	2	6	701741	701746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350098
15552	NC_022106	AAG	2	6	701767	701772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350098
15553	NC_022106	AAAAC	2	10	701778	701787	80 %	0 %	0 %	20 %	532350098
15554	NC_022106	A	6	6	701819	701824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_022106	T	7	7	701826	701832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_022106	TGTT	2	8	701836	701843	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_022106	TAA	2	6	701912	701917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350099
15558	NC_022106	AGA	2	6	701951	701956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350099
15559	NC_022106	ATT	2	6	701957	701962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350099
15560	NC_022106	A	6	6	702016	702021	100 %	0 %	0 %	0 %	532350099
15561	NC_022106	ATG	2	6	702076	702081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350099
15562	NC_022106	AGTT	2	8	702100	702107	25 %	50 %	25 %	0 %	532350099
15563	NC_022106	TCT	2	6	702117	702122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350099
15564	NC_022106	TTGG	2	8	702237	702244	0 %	50 %	50 %	0 %	532350099
15565	NC_022106	TC	3	6	702248	702253	0 %	50 %	0 %	50 %	532350099
15566	NC_022106	CAA	2	6	702297	702302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350099
15567	NC_022106	TCC	2	6	702305	702310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350099
15568	NC_022106	TTTG	2	8	702338	702345	0 %	75 %	25 %	0 %	532350099
15569	NC_022106	ACT	2	6	702354	702359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350099
15570	NC_022106	TAG	2	6	702361	702366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350099
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15572	NC_022106	CAAT	2	8	702488	702495	50 %	25 %	0 %	25 %	532350099
15573	NC_022106	GAT	2	6	702632	702637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350099
15574	NC_022106	ATCT	2	8	702712	702719	25 %	50 %	0 %	25 %	532350099
15575	NC_022106	ATC	2	6	702726	702731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350099
15576	NC_022106	TTC	2	6	702734	702739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350099
15577	NC_022106	TC	4	8	702738	702745	0 %	50 %	0 %	50 %	532350099
15578	NC_022106	TATC	2	8	702805	702812	25 %	50 %	0 %	25 %	532350099
15579	NC_022106	TA	3	6	702846	702851	50 %	50 %	0 %	0 %	532350099
15580	NC_022106	CT	3	6	702866	702871	0 %	50 %	0 %	50 %	532350099
15581	NC_022106	TCA	2	6	702901	702906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350099
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15584	NC_022106	GC	3	6	702989	702994	0 %	0 %	50 %	50 %	532350099
15585	NC_022106	AACT	2	8	703015	703022	50 %	25 %	0 %	25 %	532350099
15586	NC_022106	TGA	2	6	703064	703069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350099
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15591	NC_022106	CTT	2	6	703362	703367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350099
15592	NC_022106	T	6	6	703443	703448	0 %	100 %	0 %	0 %	532350099
15593	NC_022106	CTT	2	6	703514	703519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350099
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15596	NC_022106	CT	3	6	703589	703594	0 %	50 %	0 %	50 %	532350099
15597	NC_022106	CTTC	2	8	703599	703606	0 %	50 %	0 %	50 %	532350099
15598	NC_022106	GATT	2	8	703649	703656	25 %	50 %	25 %	0 %	532350099
15599	NC_022106	CTAC	2	8	703753	703760	25 %	25 %	0 %	50 %	532350099
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15602	NC_022106	ATG	2	6	704077	704082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350099
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15605	NC_022106	CTTC	2	8	704199	704206	0 %	50 %	0 %	50 %	532350099
15606	NC_022106	ATC	2	6	704211	704216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350099
15607	NC_022106	GGA	2	6	704220	704225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350099
15608	NC_022106	CAAG	2	8	704238	704245	50 %	0 %	25 %	25 %	532350099
15609	NC_022106	CAA	2	6	704259	704264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350099
15610	NC_022106	AAATGC	2	12	704299	704310	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532350099
15611	NC_022106	GCA	2	6	704324	704329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350099
15612	NC_022106	GTA	2	6	704340	704345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350099
15613	NC_022106	ATCT	2	8	704373	704380	25 %	50 %	0 %	25 %	532350099
15614	NC_022106	CTAG	2	8	704397	704404	25 %	25 %	25 %	25 %	532350099
15615	NC_022106	AGC	2	6	704417	704422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15616	NC_022106	GCT	2	6	704443	704448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15617	NC_022106	ATT	2	6	704459	704464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_022106	AAAT	2	8	704500	704507	75 %	25 %	0 %	0 %	532350100
15619	NC_022106	ACC	2	6	704536	704541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350100
15620	NC_022106	CTG	2	6	704616	704621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350100
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15622	NC_022106	TCA	2	6	704917	704922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350100
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15885	NC_022106	GTT	2	6	716541	716546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15991	NC_022106	TAA	2	6	721293	721298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350112
15992	NC_022106	TTA	2	6	721307	721312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350112
15993	NC_022106	AG	3	6	721320	721325	50 %	0 %	50 %	0 %	532350112
15994	NC_022106	GCTA	2	8	721375	721382	25 %	25 %	25 %	25 %	532350112
15995	NC_022106	GA	3	6	721400	721405	50 %	0 %	50 %	0 %	532350112
15996	NC_022106	GAA	2	6	721416	721421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350112
15997	NC_022106	GCA	2	6	721428	721433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15998	NC_022106	GAG	2	6	721447	721452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350113
15999	NC_022106	GCGTA	2	10	721471	721480	20 %	20 %	40 %	20 %	532350113
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