MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_022106	CTC	2	6	677749	677754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350076
15003	NC_022106	TTA	2	6	677806	677811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350076
15004	NC_022106	A	6	6	677862	677867	100 %	0 %	0 %	0 %	532350076
15005	NC_022106	ACCAT	2	10	677905	677914	40 %	20 %	0 %	40 %	532350076
15006	NC_022106	TC	3	6	677937	677942	0 %	50 %	0 %	50 %	532350076
15007	NC_022106	GCT	2	6	677999	678004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350076
15008	NC_022106	GAA	2	6	678060	678065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350076
15009	NC_022106	AACT	2	8	678099	678106	50 %	25 %	0 %	25 %	532350076
15010	NC_022106	ATC	2	6	678149	678154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350077
15011	NC_022106	GGA	2	6	678167	678172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350077
15012	NC_022106	A	7	7	678195	678201	100 %	0 %	0 %	0 %	532350077
15013	NC_022106	TC	3	6	678211	678216	0 %	50 %	0 %	50 %	532350077
15014	NC_022106	TCG	2	6	678234	678239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350077
15015	NC_022106	A	6	6	678310	678315	100 %	0 %	0 %	0 %	532350077
15016	NC_022106	A	6	6	678332	678337	100 %	0 %	0 %	0 %	532350077
15017	NC_022106	CAAA	2	8	678387	678394	75 %	0 %	0 %	25 %	532350077
15018	NC_022106	CGC	2	6	678405	678410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532350077
15019	NC_022106	A	6	6	678428	678433	100 %	0 %	0 %	0 %	532350077
15020	NC_022106	A	6	6	678446	678451	100 %	0 %	0 %	0 %	532350077
15021	NC_022106	CAG	2	6	678590	678595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350077
15022	NC_022106	TCT	2	6	678658	678663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350077
15023	NC_022106	CTA	2	6	678681	678686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350077
15024	NC_022106	ACA	2	6	678703	678708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350077
15025	NC_022106	TCTT	2	8	678743	678750	0 %	75 %	0 %	25 %	532350077
15026	NC_022106	TGA	2	6	678812	678817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350077
15027	NC_022106	TTCTC	2	10	678840	678849	0 %	60 %	0 %	40 %	532350078
15028	NC_022106	TCT	2	6	678861	678866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350078
15029	NC_022106	CT	3	6	678865	678870	0 %	50 %	0 %	50 %	532350078
15030	NC_022106	CT	3	6	678918	678923	0 %	50 %	0 %	50 %	532350078
15031	NC_022106	TCA	2	6	678949	678954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350078
15032	NC_022106	TCA	2	6	678966	678971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350078
15033	NC_022106	CTG	2	6	679030	679035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350078
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15035	NC_022106	A	7	7	679107	679113	100 %	0 %	0 %	0 %	532350078
15036	NC_022106	A	6	6	679130	679135	100 %	0 %	0 %	0 %	532350078
15037	NC_022106	TC	3	6	679139	679144	0 %	50 %	0 %	50 %	532350078
15038	NC_022106	CT	3	6	679150	679155	0 %	50 %	0 %	50 %	532350078
15039	NC_022106	ATC	2	6	679172	679177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350078
15040	NC_022106	TCT	2	6	679212	679217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350078
15041	NC_022106	ATT	2	6	679249	679254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350078
15042	NC_022106	T	6	6	679253	679258	0 %	100 %	0 %	0 %	532350078
15043	NC_022106	ACA	2	6	679326	679331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350078
15044	NC_022106	TATG	2	8	679407	679414	25 %	50 %	25 %	0 %	532350078
15045	NC_022106	A	7	7	679474	679480	100 %	0 %	0 %	0 %	532350078
15046	NC_022106	TC	3	6	679517	679522	0 %	50 %	0 %	50 %	532350078
15047	NC_022106	CTC	2	6	679534	679539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350078
15048	NC_022106	A	7	7	679620	679626	100 %	0 %	0 %	0 %	532350078
15049	NC_022106	CCTT	2	8	679660	679667	0 %	50 %	0 %	50 %	532350078
15050	NC_022106	TC	3	6	679739	679744	0 %	50 %	0 %	50 %	532350078
15051	NC_022106	AAC	2	6	679748	679753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350078
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15054	NC_022106	A	7	7	679819	679825	100 %	0 %	0 %	0 %	532350078
15055	NC_022106	TG	3	6	679864	679869	0 %	50 %	50 %	0 %	532350078
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15062	NC_022106	TAT	2	6	680137	680142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350079
15063	NC_022106	CTT	2	6	680148	680153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350079
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15088	NC_022106	CTG	2	6	681293	681298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15102	NC_022106	AGCG	2	8	681946	681953	25 %	0 %	50 %	25 %	532350082
15103	NC_022106	AAG	2	6	681996	682001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350082
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15106	NC_022106	ATCT	2	8	682137	682144	25 %	50 %	0 %	25 %	532350082
15107	NC_022106	AC	3	6	682168	682173	50 %	0 %	0 %	50 %	532350082
15108	NC_022106	AGA	2	6	682197	682202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350082
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15110	NC_022106	TTTC	2	8	682239	682246	0 %	75 %	0 %	25 %	532350082
15111	NC_022106	TCT	2	6	682247	682252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350082
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15113	NC_022106	ATA	2	6	682310	682315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350082
15114	NC_022106	CTC	2	6	682316	682321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15115	NC_022106	AGAA	2	8	682324	682331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_022106	AG	3	6	682342	682347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_022106	ACC	2	6	682362	682367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15118	NC_022106	GAA	2	6	682424	682429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_022106	A	6	6	682478	682483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_022106	TTC	2	6	682523	682528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_022106	AAC	2	6	682584	682589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_022106	GTC	2	6	682596	682601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_022106	GA	3	6	682717	682722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_022106	CCT	3	9	682738	682746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15125	NC_022106	GCG	2	6	682791	682796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15126	NC_022106	GAAT	2	8	682870	682877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_022106	CACC	2	8	682881	682888	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15128	NC_022106	AGA	2	6	682934	682939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15129	NC_022106	TCC	2	6	682956	682961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15130	NC_022106	GCA	2	6	682977	682982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15132	NC_022106	GAA	2	6	683004	683009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15133	NC_022106	CTT	2	6	683047	683052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15134	NC_022106	A	6	6	683079	683084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15135	NC_022106	CT	3	6	683101	683106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15136	NC_022106	AGA	2	6	683144	683149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15137	NC_022106	TC	3	6	683189	683194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15138	NC_022106	CACAG	2	10	683294	683303	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15139	NC_022106	CT	3	6	683316	683321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15140	NC_022106	TAA	2	6	683345	683350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15141	NC_022106	AAC	2	6	683402	683407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15142	NC_022106	GAA	2	6	683413	683418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15143	NC_022106	A	6	6	683424	683429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15144	NC_022106	AAT	2	6	683440	683445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15146	NC_022106	TAA	2	6	683512	683517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15147	NC_022106	CA	3	6	683544	683549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15148	NC_022106	TTC	2	6	683582	683587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15149	NC_022106	TTC	2	6	683591	683596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15150	NC_022106	TTC	2	6	683613	683618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15156	NC_022106	TAA	2	6	683828	683833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15157	NC_022106	CG	3	6	684063	684068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15158	NC_022106	AAC	2	6	684179	684184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15159	NC_022106	GAAG	2	8	684218	684225	50 %	0 %	50 %	0 %	532350083
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15162	NC_022106	TAA	2	6	684375	684380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350083
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15166	NC_022106	GAA	2	6	684545	684550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350083
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15239	NC_022106	TGC	2	6	687910	687915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350087
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15249	NC_022106	CTT	2	6	688304	688309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350087
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15251	NC_022106	A	6	6	688445	688450	100 %	0 %	0 %	0 %	532350087
15252	NC_022106	ACA	2	6	688499	688504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350087
15253	NC_022106	ACCT	2	8	688506	688513	25 %	25 %	0 %	50 %	532350087
15254	NC_022106	TTG	2	6	688525	688530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350087
15255	NC_022106	A	6	6	688544	688549	100 %	0 %	0 %	0 %	532350087
15256	NC_022106	A	6	6	688565	688570	100 %	0 %	0 %	0 %	532350087
15257	NC_022106	AGC	2	6	688617	688622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350087
15258	NC_022106	TCA	2	6	688650	688655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350087
15259	NC_022106	AGA	2	6	688696	688701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350087
15260	NC_022106	A	6	6	688723	688728	100 %	0 %	0 %	0 %	532350087
15261	NC_022106	ATT	2	6	688741	688746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350087
15262	NC_022106	AGA	2	6	688798	688803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350087
15263	NC_022106	GAA	2	6	688919	688924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350087
15264	NC_022106	CTT	2	6	688928	688933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350087
15265	NC_022106	GAACG	2	10	689058	689067	40 %	0 %	40 %	20 %	532350087
15266	NC_022106	CAG	2	6	689080	689085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350087
15267	NC_022106	TTA	2	6	689088	689093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350087
15268	NC_022106	GCATCA	2	12	689137	689148	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532350088
15269	NC_022106	TCC	2	6	689290	689295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350088
15270	NC_022106	CTT	2	6	689360	689365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350088
15271	NC_022106	CAA	2	6	689528	689533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350088
15272	NC_022106	CTA	2	6	689585	689590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350088
15273	NC_022106	AGG	2	6	689607	689612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350088
15274	NC_022106	TAT	2	6	689620	689625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350088
15275	NC_022106	ACT	2	6	689663	689668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350088
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15278	NC_022106	C	6	6	689776	689781	0 %	0 %	0 %	100 %	532350088
15279	NC_022106	TAA	2	6	689845	689850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350088
15280	NC_022106	ACC	2	6	689925	689930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350088
15281	NC_022106	CAA	2	6	689936	689941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350088
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15283	NC_022106	A	7	7	689974	689980	100 %	0 %	0 %	0 %	532350088
15284	NC_022106	GAA	2	6	689984	689989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350088
15285	NC_022106	AAG	2	6	690027	690032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350088
15286	NC_022106	CTT	2	6	690038	690043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350088
15287	NC_022106	A	6	6	690044	690049	100 %	0 %	0 %	0 %	532350088
15288	NC_022106	CT	4	8	690095	690102	0 %	50 %	0 %	50 %	532350088
15289	NC_022106	ATA	2	6	690132	690137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350088
15290	NC_022106	CCA	2	6	690241	690246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350088
15291	NC_022106	A	6	6	690294	690299	100 %	0 %	0 %	0 %	532350088
15292	NC_022106	ACG	2	6	690325	690330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350088
15293	NC_022106	AAC	3	9	690403	690411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350088
15294	NC_022106	GCT	2	6	690456	690461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15295	NC_022106	GTT	2	6	690516	690521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15296	NC_022106	TAA	2	6	690551	690556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350089
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15299	NC_022106	CTT	2	6	690627	690632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350089
15300	NC_022106	TCT	2	6	690692	690697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350089
15301	NC_022106	CTT	2	6	690717	690722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350089
15302	NC_022106	TC	3	6	690792	690797	0 %	50 %	0 %	50 %	532350089
15303	NC_022106	AGC	2	6	690835	690840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350089
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15305	NC_022106	TGC	2	6	690901	690906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350089
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15307	NC_022106	ATC	2	6	691045	691050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350089
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15311	NC_022106	A	6	6	691220	691225	100 %	0 %	0 %	0 %	532350089
15312	NC_022106	CAT	2	6	691240	691245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350089
15313	NC_022106	TTCTT	2	10	691246	691255	0 %	80 %	0 %	20 %	532350089
15314	NC_022106	A	6	6	691276	691281	100 %	0 %	0 %	0 %	532350090
15315	NC_022106	ACAA	2	8	691416	691423	75 %	0 %	0 %	25 %	532350090
15316	NC_022106	GAC	2	6	691475	691480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350090
15317	NC_022106	TA	3	6	691500	691505	50 %	50 %	0 %	0 %	532350090
15318	NC_022106	CGC	2	6	691558	691563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532350090
15319	NC_022106	AGT	2	6	691569	691574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350090
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15321	NC_022106	TCA	2	6	691702	691707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350090
15322	NC_022106	CTT	2	6	691733	691738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350090
15323	NC_022106	T	6	6	691737	691742	0 %	100 %	0 %	0 %	532350090
15324	NC_022106	AT	3	6	691749	691754	50 %	50 %	0 %	0 %	532350090
15325	NC_022106	ACAAA	2	10	691767	691776	80 %	0 %	0 %	20 %	532350090
15326	NC_022106	T	8	8	691790	691797	0 %	100 %	0 %	0 %	532350090
15327	NC_022106	GGC	2	6	691894	691899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350090
15328	NC_022106	ATA	3	9	691972	691980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350090
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15330	NC_022106	GAA	2	6	692044	692049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350091
15331	NC_022106	TG	3	6	692078	692083	0 %	50 %	50 %	0 %	532350091
15332	NC_022106	A	6	6	692114	692119	100 %	0 %	0 %	0 %	532350091
15333	NC_022106	GCTCC	2	10	692130	692139	0 %	20 %	20 %	60 %	532350091
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15336	NC_022106	TGG	2	6	692209	692214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350091
15337	NC_022106	ATG	2	6	692297	692302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350091
15338	NC_022106	GAT	2	6	692304	692309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350091
15339	NC_022106	A	7	7	692326	692332	100 %	0 %	0 %	0 %	532350091
15340	NC_022106	CTC	2	6	692382	692387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350091
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15343	NC_022106	TCCA	2	8	692646	692653	25 %	25 %	0 %	50 %	532350092
15344	NC_022106	AAC	2	6	692706	692711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350092
15345	NC_022106	TTC	2	6	692793	692798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350092
15346	NC_022106	TTA	2	6	692846	692851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350092
15347	NC_022106	CAT	2	6	692909	692914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350092
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15350	NC_022106	GATA	2	8	692976	692983	50 %	25 %	25 %	0 %	532350092
15351	NC_022106	TTG	2	6	692994	692999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350092
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15353	NC_022106	C	6	6	693005	693010	0 %	0 %	0 %	100 %	532350092
15354	NC_022106	CCGCT	2	10	693012	693021	0 %	20 %	20 %	60 %	532350092
15355	NC_022106	TTGC	2	8	693095	693102	0 %	50 %	25 %	25 %	532350092
15356	NC_022106	AAT	2	6	693114	693119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350092
15357	NC_022106	TC	3	6	693141	693146	0 %	50 %	0 %	50 %	532350092
15358	NC_022106	TCC	3	9	693262	693270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350092
15359	NC_022106	AGC	2	6	693285	693290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350092
15360	NC_022106	AAG	2	6	693317	693322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350092
15361	NC_022106	ACG	2	6	693339	693344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350092
15362	NC_022106	CAT	2	6	693363	693368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350092
15363	NC_022106	AGAA	2	8	693369	693376	75 %	0 %	25 %	0 %	532350092
15364	NC_022106	ATCAAT	2	12	693462	693473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532350092
15365	NC_022106	AAG	2	6	693494	693499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350092
15366	NC_022106	AAC	2	6	693512	693517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350092
15367	NC_022106	ATC	2	6	693523	693528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350092
15368	NC_022106	TCAA	2	8	693538	693545	50 %	25 %	0 %	25 %	532350092
15369	NC_022106	AAC	2	6	693625	693630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350092
15370	NC_022106	CTT	2	6	693681	693686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350092
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15372	NC_022106	CT	3	6	693779	693784	0 %	50 %	0 %	50 %	532350093
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15497	NC_022106	AG	3	6	699489	699494	50 %	0 %	50 %	0 %	532350098
15498	NC_022106	ATA	2	6	699519	699524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350098
15499	NC_022106	TGCG	2	8	699552	699559	0 %	25 %	50 %	25 %	532350098
15500	NC_022106	CTAG	2	8	699615	699622	25 %	25 %	25 %	25 %	532350098

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