MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_022106	GTT	2	6	654906	654911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350062
14503	NC_022106	ACT	2	6	654928	654933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350062
14504	NC_022106	TCA	2	6	654944	654949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350062
14505	NC_022106	AG	3	6	654993	654998	50 %	0 %	50 %	0 %	532350062
14506	NC_022106	GAA	2	6	655062	655067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350062
14507	NC_022106	GAT	2	6	655383	655388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350062
14508	NC_022106	GA	3	6	655597	655602	50 %	0 %	50 %	0 %	532350062
14509	NC_022106	TAT	2	6	655613	655618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350062
14510	NC_022106	TTTG	2	8	655631	655638	0 %	75 %	25 %	0 %	532350062
14511	NC_022106	ATT	2	6	655722	655727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350062
14512	NC_022106	GT	3	6	655933	655938	0 %	50 %	50 %	0 %	532350062
14513	NC_022106	TC	3	6	655963	655968	0 %	50 %	0 %	50 %	532350062
14514	NC_022106	TCCT	2	8	656006	656013	0 %	50 %	0 %	50 %	532350062
14515	NC_022106	ATT	2	6	656056	656061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_022106	CA	3	6	656068	656073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14517	NC_022106	A	6	6	656146	656151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_022106	CAGG	2	8	656170	656177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14519	NC_022106	TTC	2	6	656218	656223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_022106	AAT	2	6	656311	656316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_022106	TCC	2	6	656435	656440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14522	NC_022106	GGC	2	6	656499	656504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350063
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14524	NC_022106	A	7	7	656665	656671	100 %	0 %	0 %	0 %	532350063
14525	NC_022106	AGA	2	6	656675	656680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350063
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14527	NC_022106	GCT	2	6	656766	656771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350063
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14530	NC_022106	CTT	2	6	656854	656859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350063
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14533	NC_022106	CTT	2	6	657087	657092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350063
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14540	NC_022106	ATT	2	6	657540	657545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350064
14541	NC_022106	TTA	2	6	657627	657632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350064
14542	NC_022106	A	6	6	657733	657738	100 %	0 %	0 %	0 %	532350064
14543	NC_022106	ATC	2	6	657834	657839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350064
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14545	NC_022106	CTTTT	2	10	657855	657864	0 %	80 %	0 %	20 %	532350064
14546	NC_022106	T	7	7	657861	657867	0 %	100 %	0 %	0 %	532350064
14547	NC_022106	ATT	2	6	657882	657887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350064
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14554	NC_022106	T	6	6	658159	658164	0 %	100 %	0 %	0 %	532350065
14555	NC_022106	GTT	2	6	658189	658194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350065
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14559	NC_022106	A	7	7	658455	658461	100 %	0 %	0 %	0 %	532350065
14560	NC_022106	A	7	7	658473	658479	100 %	0 %	0 %	0 %	532350065
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14566	NC_022106	A	9	9	658749	658757	100 %	0 %	0 %	0 %	532350066
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14582	NC_022106	A	6	6	659785	659790	100 %	0 %	0 %	0 %	532350066
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14615	NC_022106	A	7	7	661184	661190	100 %	0 %	0 %	0 %	532350067
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14623	NC_022106	ACG	2	6	661526	661531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350067
14624	NC_022106	CAA	2	6	661557	661562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350067
14625	NC_022106	TAT	2	6	661583	661588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350067
14626	NC_022106	AAG	2	6	661618	661623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350067
14627	NC_022106	AAG	2	6	661630	661635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350067
14628	NC_022106	AGC	2	6	661709	661714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350067
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14631	NC_022106	A	7	7	661769	661775	100 %	0 %	0 %	0 %	532350067
14632	NC_022106	CTC	2	6	661779	661784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350067
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14636	NC_022106	GTC	2	6	661988	661993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350068
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14638	NC_022106	TCA	2	6	662058	662063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350068
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14640	NC_022106	TGAT	2	8	662265	662272	25 %	50 %	25 %	0 %	532350068
14641	NC_022106	GCT	2	6	662345	662350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350068
14642	NC_022106	TGG	2	6	662386	662391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350068
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14655	NC_022106	TCA	2	6	662976	662981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350068
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14662	NC_022106	C	6	6	663302	663307	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14663	NC_022106	CTC	2	6	663357	663362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14664	NC_022106	A	7	7	663368	663374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14665	NC_022106	AATA	2	8	663401	663408	75 %	25 %	0 %	0 %	532350069
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14719	NC_022106	TCT	2	6	665426	665431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14721	NC_022106	GACA	2	8	665461	665468	50 %	0 %	25 %	25 %	532350070
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14724	NC_022106	CTTT	3	12	665538	665549	0 %	75 %	0 %	25 %	532350070
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14731	NC_022106	AACA	2	8	666030	666037	75 %	0 %	0 %	25 %	532350070
14732	NC_022106	TCT	2	6	666050	666055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350070
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14734	NC_022106	CT	4	8	666148	666155	0 %	50 %	0 %	50 %	532350070
14735	NC_022106	CTT	2	6	666166	666171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350070
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14744	NC_022106	TC	3	6	666666	666671	0 %	50 %	0 %	50 %	532350070
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14871	NC_022106	ACC	2	6	672299	672304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14872	NC_022106	AAT	2	6	672311	672316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14873	NC_022106	GAC	2	6	672365	672370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14874	NC_022106	CTTC	2	8	672384	672391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14875	NC_022106	AATC	2	8	672401	672408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14876	NC_022106	ACG	3	9	672455	672463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14877	NC_022106	CTG	2	6	672490	672495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14878	NC_022106	GAT	2	6	672525	672530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14879	NC_022106	AG	3	6	672531	672536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14880	NC_022106	CGC	2	6	672548	672553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14881	NC_022106	AAT	2	6	672613	672618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14882	NC_022106	AGG	2	6	672649	672654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14883	NC_022106	A	6	6	672665	672670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14884	NC_022106	TATCG	2	10	672682	672691	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14885	NC_022106	TCC	2	6	672748	672753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14886	NC_022106	CTA	2	6	672804	672809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14887	NC_022106	TCA	2	6	672891	672896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14902	NC_022106	GAT	2	6	673510	673515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14906	NC_022106	AC	3	6	673669	673674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14907	NC_022106	GAAT	2	8	673686	673693	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14983	NC_022106	GTT	2	6	676897	676902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14984	NC_022106	AC	3	6	676922	676927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14998	NC_022106	TAG	2	6	677585	677590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350075
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