MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022106	TAC	2	6	611130	611135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_022106	ATG	2	6	611147	611152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_022106	A	6	6	611182	611187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_022106	AC	3	6	611255	611260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13505	NC_022106	CCT	2	6	611307	611312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350025
13506	NC_022106	TCT	2	6	611380	611385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350025
13507	NC_022106	TTC	2	6	611409	611414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350025
13508	NC_022106	TGCCA	2	10	611441	611450	20 %	20 %	20 %	40 %	532350025
13509	NC_022106	GTA	2	6	611500	611505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350025
13510	NC_022106	CT	3	6	611506	611511	0 %	50 %	0 %	50 %	532350025
13511	NC_022106	GATT	2	8	611590	611597	25 %	50 %	25 %	0 %	532350025
13512	NC_022106	TCT	2	6	611617	611622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350025
13513	NC_022106	TC	3	6	611627	611632	0 %	50 %	0 %	50 %	532350025
13514	NC_022106	GGTT	2	8	611673	611680	0 %	50 %	50 %	0 %	532350025
13515	NC_022106	GGATGG	2	12	611685	611696	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532350025
13516	NC_022106	AG	4	8	611738	611745	50 %	0 %	50 %	0 %	532350025
13517	NC_022106	TGG	2	6	611751	611756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350025
13518	NC_022106	ATA	2	6	611776	611781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350025
13519	NC_022106	GGCGC	2	10	611836	611845	0 %	0 %	60 %	40 %	532350025
13520	NC_022106	ATT	2	6	611862	611867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350025
13521	NC_022106	TAT	2	6	611870	611875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350025
13522	NC_022106	ATCG	2	8	611892	611899	25 %	25 %	25 %	25 %	532350025
13523	NC_022106	AGA	2	6	611954	611959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350025
13524	NC_022106	GAA	2	6	611976	611981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350025
13525	NC_022106	AG	3	6	612015	612020	50 %	0 %	50 %	0 %	532350025
13526	NC_022106	CT	3	6	612021	612026	0 %	50 %	0 %	50 %	532350025
13527	NC_022106	TTAC	2	8	612043	612050	25 %	50 %	0 %	25 %	532350025
13528	NC_022106	TAA	2	6	612059	612064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350025
13529	NC_022106	CCT	2	6	612088	612093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350025
13530	NC_022106	TTTA	2	8	612096	612103	25 %	75 %	0 %	0 %	532350025
13531	NC_022106	CT	3	6	612136	612141	0 %	50 %	0 %	50 %	532350025
13532	NC_022106	ATT	2	6	612160	612165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350025
13533	NC_022106	TTTG	2	8	612194	612201	0 %	75 %	25 %	0 %	532350025
13534	NC_022106	ATT	2	6	612212	612217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350025
13535	NC_022106	GGCT	2	8	612234	612241	0 %	25 %	50 %	25 %	532350025
13536	NC_022106	TCT	2	6	612286	612291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350025
13537	NC_022106	ATT	2	6	612299	612304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350025
13538	NC_022106	TGG	2	6	612348	612353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350025
13539	NC_022106	T	6	6	612383	612388	0 %	100 %	0 %	0 %	532350025
13540	NC_022106	ATG	2	6	612405	612410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350025
13541	NC_022106	ATTGG	2	10	612411	612420	20 %	40 %	40 %	0 %	532350025
13542	NC_022106	A	6	6	612441	612446	100 %	0 %	0 %	0 %	532350025
13543	NC_022106	AGC	2	6	612494	612499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350025
13544	NC_022106	TTG	2	6	612556	612561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350025
13545	NC_022106	TCAA	2	8	612721	612728	50 %	25 %	0 %	25 %	532350026
13546	NC_022106	TTG	2	6	612734	612739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350026
13547	NC_022106	CGCT	2	8	612767	612774	0 %	25 %	25 %	50 %	532350026
13548	NC_022106	TTTG	2	8	612792	612799	0 %	75 %	25 %	0 %	532350026
13549	NC_022106	ATC	2	6	612847	612852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350026
13550	NC_022106	A	9	9	612892	612900	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
13551	NC_022106	CTT	2	6	612934	612939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350026
13552	NC_022106	GAA	2	6	612949	612954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350026
13553	NC_022106	TTTG	2	8	612968	612975	0 %	75 %	25 %	0 %	532350026
13554	NC_022106	CTCTC	2	10	612976	612985	0 %	40 %	0 %	60 %	532350026
13555	NC_022106	ATAG	2	8	613021	613028	50 %	25 %	25 %	0 %	532350026
13556	NC_022106	GAA	2	6	613114	613119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350026
13557	NC_022106	AAG	2	6	613160	613165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350026
13558	NC_022106	AGA	2	6	613200	613205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350026
13559	NC_022106	GAA	2	6	613222	613227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350026
13560	NC_022106	AAAAC	2	10	613236	613245	80 %	0 %	0 %	20 %	532350026
13561	NC_022106	AAC	2	6	613265	613270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350026
13562	NC_022106	GCTC	2	8	613365	613372	0 %	25 %	25 %	50 %	532350026
13563	NC_022106	AG	3	6	613399	613404	50 %	0 %	50 %	0 %	532350026
13564	NC_022106	TAG	2	6	613464	613469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350026
13565	NC_022106	ATTTT	2	10	613473	613482	20 %	80 %	0 %	0 %	532350026
13566	NC_022106	GCA	2	6	613513	613518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350026
13567	NC_022106	CTATC	2	10	613593	613602	20 %	40 %	0 %	40 %	532350026
13568	NC_022106	A	8	8	613622	613629	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
13569	NC_022106	AGA	2	6	613641	613646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350026
13570	NC_022106	CTT	2	6	613671	613676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350026
13571	NC_022106	AGA	2	6	613677	613682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350026
13572	NC_022106	AC	3	6	613712	613717	50 %	0 %	0 %	50 %	532350026
13573	NC_022106	TAT	3	9	613803	613811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350026
13574	NC_022106	ATT	2	6	613852	613857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350026
13575	NC_022106	TTC	2	6	613972	613977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350026
13576	NC_022106	TCA	2	6	613985	613990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350026
13577	NC_022106	CGATAT	3	18	614013	614030	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532350026
13578	NC_022106	AG	3	6	614044	614049	50 %	0 %	50 %	0 %	532350026
13579	NC_022106	TTA	2	6	614054	614059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350026
13580	NC_022106	ATT	2	6	614101	614106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350026
13581	NC_022106	TGTA	2	8	614261	614268	25 %	50 %	25 %	0 %	532350026
13582	NC_022106	A	6	6	614305	614310	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
13583	NC_022106	TGC	2	6	614343	614348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350026
13584	NC_022106	T	6	6	614475	614480	0 %	100 %	0 %	0 %	532350026
13585	NC_022106	CA	3	6	614514	614519	50 %	0 %	0 %	50 %	532350026
13586	NC_022106	A	7	7	614530	614536	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
13587	NC_022106	TC	3	6	614588	614593	0 %	50 %	0 %	50 %	532350026
13588	NC_022106	TTC	2	6	614594	614599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350026
13589	NC_022106	GAA	2	6	614683	614688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350026
13590	NC_022106	CAT	2	6	614738	614743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350026
13591	NC_022106	CGC	2	6	614902	614907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532350026
13592	NC_022106	GA	3	6	614948	614953	50 %	0 %	50 %	0 %	532350026
13593	NC_022106	TAA	2	6	615045	615050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350026
13594	NC_022106	ACA	2	6	615085	615090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350026
13595	NC_022106	GCC	2	6	615127	615132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532350026
13596	NC_022106	AAG	2	6	615182	615187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350026
13597	NC_022106	CCT	2	6	615214	615219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350026
13598	NC_022106	TTG	2	6	615320	615325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350026
13599	NC_022106	AG	4	8	615327	615334	50 %	0 %	50 %	0 %	532350026
13600	NC_022106	A	7	7	615335	615341	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
13601	NC_022106	A	6	6	615388	615393	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
13602	NC_022106	TGG	2	6	615419	615424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350026
13603	NC_022106	TAA	2	6	615453	615458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350026
13604	NC_022106	A	8	8	615509	615516	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
13605	NC_022106	GCT	2	6	615520	615525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350026
13606	NC_022106	T	7	7	615541	615547	0 %	100 %	0 %	0 %	532350026
13607	NC_022106	TC	3	6	615587	615592	0 %	50 %	0 %	50 %	532350026
13608	NC_022106	GTT	2	6	615624	615629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350026
13609	NC_022106	ATT	2	6	615754	615759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350026
13610	NC_022106	ACT	2	6	615787	615792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350026
13611	NC_022106	GCAGA	2	10	615805	615814	40 %	0 %	40 %	20 %	532350026
13612	NC_022106	A	6	6	615814	615819	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
13613	NC_022106	GAA	2	6	615907	615912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350026
13614	NC_022106	TTAT	2	8	615920	615927	25 %	75 %	0 %	0 %	532350026
13615	NC_022106	CGA	2	6	616026	616031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350026
13616	NC_022106	A	6	6	616075	616080	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
13617	NC_022106	A	7	7	616110	616116	100 %	0 %	0 %	0 %	532350026
13618	NC_022106	AG	3	6	616126	616131	50 %	0 %	50 %	0 %	532350026
13619	NC_022106	TC	3	6	616133	616138	0 %	50 %	0 %	50 %	532350026
13620	NC_022106	TAAA	2	8	616160	616167	75 %	25 %	0 %	0 %	532350026
13621	NC_022106	TTAT	2	8	616183	616190	25 %	75 %	0 %	0 %	532350026
13622	NC_022106	CT	4	8	616231	616238	0 %	50 %	0 %	50 %	532350026
13623	NC_022106	TC	3	6	616274	616279	0 %	50 %	0 %	50 %	532350026
13624	NC_022106	T	6	6	616290	616295	0 %	100 %	0 %	0 %	532350026
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13746	NC_022106	T	6	6	621514	621519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13989	NC_022106	TCCC	2	8	632753	632760	0 %	25 %	0 %	75 %	532350041
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13992	NC_022106	GCT	2	6	632855	632860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350041
13993	NC_022106	CTAC	2	8	632877	632884	25 %	25 %	0 %	50 %	532350041
13994	NC_022106	TCC	2	6	632910	632915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350041
13995	NC_022106	AGA	2	6	632925	632930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350041
13996	NC_022106	ATGCT	2	10	632957	632966	20 %	40 %	20 %	20 %	532350041
13997	NC_022106	ACGGA	2	10	633091	633100	40 %	0 %	40 %	20 %	532350041
13998	NC_022106	ATT	2	6	633110	633115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350041
13999	NC_022106	GGA	2	6	633168	633173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350041
14000	NC_022106	CTT	2	6	633216	633221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350041

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