MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022106	CT	3	6	564997	565002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12502	NC_022106	GAT	2	6	565043	565048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349971
12503	NC_022106	AAC	2	6	565061	565066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349971
12504	NC_022106	CAG	2	6	565137	565142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349971
12505	NC_022106	TCA	2	6	565146	565151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349971
12506	NC_022106	CAT	2	6	565226	565231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349971
12507	NC_022106	CA	3	6	565324	565329	50 %	0 %	0 %	50 %	532349971
12508	NC_022106	AAT	2	6	565358	565363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349971
12509	NC_022106	GAT	2	6	565375	565380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349971
12510	NC_022106	C	6	6	565400	565405	0 %	0 %	0 %	100 %	532349971
12511	NC_022106	TCA	2	6	565407	565412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349971
12512	NC_022106	TGT	2	6	565432	565437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349971
12513	NC_022106	TAA	2	6	565473	565478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349971
12514	NC_022106	CGT	2	6	565510	565515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349971
12515	NC_022106	ATC	2	6	565574	565579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349971
12516	NC_022106	TCT	2	6	565587	565592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349971
12517	NC_022106	T	6	6	565679	565684	0 %	100 %	0 %	0 %	532349971
12518	NC_022106	ATCA	2	8	565748	565755	50 %	25 %	0 %	25 %	532349971
12519	NC_022106	CTA	2	6	565861	565866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349971
12520	NC_022106	A	6	6	565911	565916	100 %	0 %	0 %	0 %	532349971
12521	NC_022106	AGA	2	6	565944	565949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349971
12522	NC_022106	AGGTA	2	10	566086	566095	40 %	20 %	40 %	0 %	532349971
12523	NC_022106	CAA	2	6	566202	566207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349971
12524	NC_022106	CTC	2	6	566233	566238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349971
12525	NC_022106	CTT	2	6	566302	566307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349971
12526	NC_022106	CGTC	2	8	566309	566316	0 %	25 %	25 %	50 %	532349971
12527	NC_022106	CCA	2	6	566336	566341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12528	NC_022106	A	6	6	566343	566348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_022106	ATT	2	6	566364	566369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_022106	A	6	6	566370	566375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_022106	ACAA	2	8	566381	566388	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12532	NC_022106	ATT	2	6	566396	566401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_022106	A	6	6	566410	566415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_022106	ATTTT	2	10	566419	566428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_022106	AAAAAT	2	12	566439	566450	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_022106	A	6	6	566465	566470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_022106	TTG	2	6	566534	566539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349972
12538	NC_022106	CCT	2	6	566575	566580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349972
12539	NC_022106	AAAG	2	8	566635	566642	75 %	0 %	25 %	0 %	532349972
12540	NC_022106	CTA	2	6	566683	566688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349972
12541	NC_022106	ATC	2	6	566740	566745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349972
12542	NC_022106	AAC	2	6	566888	566893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349973
12543	NC_022106	ACA	2	6	566922	566927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349973
12544	NC_022106	TTC	2	6	566929	566934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349973
12545	NC_022106	ATCA	2	8	567070	567077	50 %	25 %	0 %	25 %	532349973
12546	NC_022106	TCC	2	6	567103	567108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349973
12547	NC_022106	GAA	2	6	567133	567138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349973
12548	NC_022106	GTT	2	6	567330	567335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349973
12549	NC_022106	CGA	2	6	567351	567356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349973
12550	NC_022106	TCA	2	6	567404	567409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349973
12551	NC_022106	ATT	2	6	567439	567444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349973
12552	NC_022106	GAG	2	6	567495	567500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349973
12553	NC_022106	T	6	6	567748	567753	0 %	100 %	0 %	0 %	532349973
12554	NC_022106	ACG	2	6	567763	567768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349973
12555	NC_022106	TCT	2	6	567794	567799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349973
12556	NC_022106	GGAA	2	8	567802	567809	50 %	0 %	50 %	0 %	532349973
12557	NC_022106	TCA	2	6	567887	567892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349973
12558	NC_022106	TTTC	2	8	568050	568057	0 %	75 %	0 %	25 %	532349973
12559	NC_022106	TCT	2	6	568058	568063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349973
12560	NC_022106	CAA	2	6	568068	568073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349973
12561	NC_022106	CTT	2	6	568089	568094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349973
12562	NC_022106	CT	3	6	568160	568165	0 %	50 %	0 %	50 %	532349973
12563	NC_022106	CGA	2	6	568213	568218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349974
12564	NC_022106	TTC	2	6	568221	568226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349974
12565	NC_022106	ATT	2	6	568236	568241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349974
12566	NC_022106	T	6	6	568268	568273	0 %	100 %	0 %	0 %	532349974
12567	NC_022106	AGA	2	6	568281	568286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349974
12568	NC_022106	T	7	7	568331	568337	0 %	100 %	0 %	0 %	532349974
12569	NC_022106	ACA	2	6	568418	568423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349974
12570	NC_022106	CAA	2	6	568487	568492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349974
12571	NC_022106	AC	3	6	568497	568502	50 %	0 %	0 %	50 %	532349974
12572	NC_022106	TCT	2	6	568519	568524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349974
12573	NC_022106	CTA	2	6	568576	568581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349974
12574	NC_022106	T	6	6	568788	568793	0 %	100 %	0 %	0 %	532349975
12575	NC_022106	ACAG	2	8	568821	568828	50 %	0 %	25 %	25 %	532349975
12576	NC_022106	TTC	2	6	568880	568885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349975
12577	NC_022106	ATA	2	6	568900	568905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349975
12578	NC_022106	TAA	3	9	568922	568930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349975
12579	NC_022106	TTAA	2	8	568986	568993	50 %	50 %	0 %	0 %	532349975
12580	NC_022106	GCA	2	6	568998	569003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349975
12581	NC_022106	CT	3	6	569087	569092	0 %	50 %	0 %	50 %	532349975
12582	NC_022106	TAA	2	6	569146	569151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349975
12583	NC_022106	CTG	2	6	569155	569160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349975
12584	NC_022106	CTG	2	6	569246	569251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349975
12585	NC_022106	GCT	3	9	569293	569301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349975
12586	NC_022106	CT	3	6	569377	569382	0 %	50 %	0 %	50 %	532349975
12587	NC_022106	AAT	2	6	569434	569439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349975
12588	NC_022106	CAG	2	6	569440	569445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349975
12589	NC_022106	A	6	6	569448	569453	100 %	0 %	0 %	0 %	532349975
12590	NC_022106	T	6	6	569465	569470	0 %	100 %	0 %	0 %	532349975
12591	NC_022106	ACA	2	6	569644	569649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349975
12592	NC_022106	AAT	2	6	569684	569689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349975
12593	NC_022106	TCT	2	6	569700	569705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349975
12594	NC_022106	TTC	2	6	569849	569854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349975
12595	NC_022106	TCT	2	6	569988	569993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349975
12596	NC_022106	AAAT	2	8	570002	570009	75 %	25 %	0 %	0 %	532349975
12597	NC_022106	C	6	6	570097	570102	0 %	0 %	0 %	100 %	532349975
12598	NC_022106	A	7	7	570112	570118	100 %	0 %	0 %	0 %	532349975
12599	NC_022106	CTT	2	6	570124	570129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349975
12600	NC_022106	GAAA	2	8	570161	570168	75 %	0 %	25 %	0 %	532349975
12601	NC_022106	CACT	2	8	570181	570188	25 %	25 %	0 %	50 %	532349975
12602	NC_022106	CTG	2	6	570211	570216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349975
12603	NC_022106	A	6	6	570278	570283	100 %	0 %	0 %	0 %	532349975
12604	NC_022106	A	6	6	570302	570307	100 %	0 %	0 %	0 %	532349975
12605	NC_022106	AAGCA	2	10	570314	570323	60 %	0 %	20 %	20 %	532349975
12606	NC_022106	TA	3	6	570347	570352	50 %	50 %	0 %	0 %	532349975
12607	NC_022106	AAG	2	6	570397	570402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349975
12608	NC_022106	C	6	6	570444	570449	0 %	0 %	0 %	100 %	532349975
12609	NC_022106	TGC	2	6	570555	570560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349975
12610	NC_022106	CTC	2	6	570614	570619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349975
12611	NC_022106	GTC	2	6	570621	570626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349975
12612	NC_022106	TCT	2	6	570693	570698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349975
12613	NC_022106	AACT	2	8	570740	570747	50 %	25 %	0 %	25 %	532349975
12614	NC_022106	GAA	2	6	570825	570830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349975
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12617	NC_022106	T	6	6	571013	571018	0 %	100 %	0 %	0 %	532349975
12618	NC_022106	CAT	2	6	571036	571041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349975
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12621	NC_022106	GA	3	6	571225	571230	50 %	0 %	50 %	0 %	532349975
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