MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022106	GTT	2	6	542683	542688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349950
12002	NC_022106	TAC	2	6	542706	542711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349950
12003	NC_022106	TTA	2	6	542801	542806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349951
12004	NC_022106	GAT	2	6	542812	542817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349951
12005	NC_022106	CTT	2	6	542833	542838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349951
12006	NC_022106	TCT	2	6	542872	542877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349951
12007	NC_022106	ATT	2	6	542932	542937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349951
12008	NC_022106	GAA	2	6	543136	543141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349951
12009	NC_022106	ACA	2	6	543153	543158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349951
12010	NC_022106	TCC	2	6	543187	543192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349951
12011	NC_022106	AT	3	6	543275	543280	50 %	50 %	0 %	0 %	532349951
12012	NC_022106	GAAAA	2	10	543305	543314	80 %	0 %	20 %	0 %	532349951
12013	NC_022106	T	6	6	543322	543327	0 %	100 %	0 %	0 %	532349951
12014	NC_022106	CTA	2	6	543350	543355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349951
12015	NC_022106	TGC	2	6	543378	543383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349951
12016	NC_022106	GAA	2	6	543453	543458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349951
12017	NC_022106	CCA	2	6	543480	543485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349951
12018	NC_022106	ACAAGA	2	12	543555	543566	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532349951
12019	NC_022106	GGA	2	6	543580	543585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349951
12020	NC_022106	CCCT	2	8	543593	543600	0 %	25 %	0 %	75 %	532349951
12021	NC_022106	CTA	2	6	543678	543683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349951
12022	NC_022106	TCCC	2	8	543710	543717	0 %	25 %	0 %	75 %	532349951
12023	NC_022106	AGA	2	6	543732	543737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349951
12024	NC_022106	TCC	2	6	543740	543745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349951
12025	NC_022106	TAC	2	6	543757	543762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349951
12026	NC_022106	AAT	2	6	543784	543789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349951
12027	NC_022106	ATT	2	6	543836	543841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349951
12028	NC_022106	CT	3	6	543865	543870	0 %	50 %	0 %	50 %	532349951
12029	NC_022106	CGAA	2	8	543879	543886	50 %	0 %	25 %	25 %	532349951
12030	NC_022106	GCTC	2	8	543927	543934	0 %	25 %	25 %	50 %	532349951
12031	NC_022106	TCCT	2	8	543997	544004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12032	NC_022106	GGT	2	6	544050	544055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_022106	CTT	2	6	544094	544099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12034	NC_022106	T	7	7	544105	544111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_022106	CCT	2	6	544177	544182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349952
12036	NC_022106	TCCC	2	8	544226	544233	0 %	25 %	0 %	75 %	532349952
12037	NC_022106	GAG	2	6	544240	544245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349952
12038	NC_022106	CAA	2	6	544297	544302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349952
12039	NC_022106	A	7	7	544363	544369	100 %	0 %	0 %	0 %	532349952
12040	NC_022106	CTC	2	6	544404	544409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349952
12041	NC_022106	CTA	2	6	544459	544464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349952
12042	NC_022106	CT	5	10	544494	544503	0 %	50 %	0 %	50 %	532349952
12043	NC_022106	T	6	6	544584	544589	0 %	100 %	0 %	0 %	532349952
12044	NC_022106	TGA	2	6	544646	544651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349952
12045	NC_022106	GTT	2	6	544695	544700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349952
12046	NC_022106	ACA	2	6	544724	544729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349953
12047	NC_022106	CAG	2	6	544753	544758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349953
12048	NC_022106	CTT	2	6	544761	544766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349953
12049	NC_022106	A	6	6	544778	544783	100 %	0 %	0 %	0 %	532349953
12050	NC_022106	CAA	2	6	544851	544856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349953
12051	NC_022106	TCC	2	6	544859	544864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349953
12052	NC_022106	CTTC	2	8	545024	545031	0 %	50 %	0 %	50 %	532349953
12053	NC_022106	T	8	8	545060	545067	0 %	100 %	0 %	0 %	532349953
12054	NC_022106	CTA	2	6	545079	545084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349953
12055	NC_022106	ACA	2	6	545093	545098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349953
12056	NC_022106	GAA	2	6	545208	545213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349953
12057	NC_022106	AAG	3	9	545230	545238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349953
12058	NC_022106	A	7	7	545267	545273	100 %	0 %	0 %	0 %	532349953
12059	NC_022106	TCC	2	6	545340	545345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349953
12060	NC_022106	CTT	2	6	545368	545373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349953
12061	NC_022106	TA	3	6	545377	545382	50 %	50 %	0 %	0 %	532349953
12062	NC_022106	CTC	2	6	545421	545426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349953
12063	NC_022106	TTC	2	6	545495	545500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349954
12064	NC_022106	CT	3	6	545514	545519	0 %	50 %	0 %	50 %	532349954
12065	NC_022106	ACT	2	6	545540	545545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349954
12066	NC_022106	TAATTG	2	12	545601	545612	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532349954
12067	NC_022106	AGG	2	6	545685	545690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349954
12068	NC_022106	AAGA	2	8	545694	545701	75 %	0 %	25 %	0 %	532349954
12069	NC_022106	AGA	2	6	545707	545712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349954
12070	NC_022106	GCA	2	6	545745	545750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349954
12071	NC_022106	T	7	7	545821	545827	0 %	100 %	0 %	0 %	532349954
12072	NC_022106	AAAC	2	8	545877	545884	75 %	0 %	0 %	25 %	532349954
12073	NC_022106	CTT	2	6	545904	545909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349954
12074	NC_022106	GC	3	6	545922	545927	0 %	0 %	50 %	50 %	532349954
12075	NC_022106	CAA	2	6	545962	545967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349954
12076	NC_022106	CT	3	6	545994	545999	0 %	50 %	0 %	50 %	532349954
12077	NC_022106	CAT	2	6	546004	546009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349954
12078	NC_022106	GAAA	2	8	546010	546017	75 %	0 %	25 %	0 %	532349954
12079	NC_022106	GCAA	2	8	546047	546054	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12080	NC_022106	ACC	2	6	546177	546182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12081	NC_022106	A	6	6	546219	546224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12082	NC_022106	TAC	2	6	546263	546268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350394
12083	NC_022106	A	6	6	546273	546278	100 %	0 %	0 %	0 %	532350394
12084	NC_022106	CTAT	2	8	546298	546305	25 %	50 %	0 %	25 %	532350394
12085	NC_022106	A	6	6	546313	546318	100 %	0 %	0 %	0 %	532350394
12086	NC_022106	CT	3	6	546349	546354	0 %	50 %	0 %	50 %	532350394
12087	NC_022106	CAAA	2	8	546376	546383	75 %	0 %	0 %	25 %	532350394
12088	NC_022106	TCT	2	6	546527	546532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349955
12089	NC_022106	GCT	2	6	546609	546614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349955
12090	NC_022106	TTC	2	6	546618	546623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349955
12091	NC_022106	GAA	2	6	546654	546659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349955
12092	NC_022106	GAA	2	6	546663	546668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349955
12093	NC_022106	GA	3	6	546751	546756	50 %	0 %	50 %	0 %	532349955
12094	NC_022106	GAA	2	6	546861	546866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349955
12095	NC_022106	A	8	8	546956	546963	100 %	0 %	0 %	0 %	532349955
12096	NC_022106	TGA	2	6	547016	547021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349955
12097	NC_022106	TCT	2	6	547030	547035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349955
12098	NC_022106	CTC	2	6	547178	547183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349955
12099	NC_022106	ACT	2	6	547235	547240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349955
12100	NC_022106	CAT	2	6	547256	547261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349955
12101	NC_022106	T	6	6	547294	547299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12102	NC_022106	TTG	2	6	547389	547394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12103	NC_022106	AGG	2	6	547471	547476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12104	NC_022106	GAC	2	6	547547	547552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349956
12105	NC_022106	CA	3	6	547563	547568	50 %	0 %	0 %	50 %	532349956
12106	NC_022106	CTT	2	6	547578	547583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349956
12107	NC_022106	CT	3	6	547596	547601	0 %	50 %	0 %	50 %	532349956
12108	NC_022106	AAGAG	2	10	547678	547687	60 %	0 %	40 %	0 %	532349956
12109	NC_022106	TGA	2	6	547738	547743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349956
12110	NC_022106	ACA	2	6	547773	547778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349956
12111	NC_022106	TCC	2	6	547795	547800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349956
12112	NC_022106	CCT	2	6	547801	547806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349956
12113	NC_022106	AGC	2	6	547839	547844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349956
12114	NC_022106	GA	3	6	547866	547871	50 %	0 %	50 %	0 %	532349956
12115	NC_022106	CCA	2	6	547925	547930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349956
12116	NC_022106	ATA	2	6	547954	547959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349956
12117	NC_022106	A	7	7	547962	547968	100 %	0 %	0 %	0 %	532349956
12118	NC_022106	CT	3	6	547990	547995	0 %	50 %	0 %	50 %	532349956
12119	NC_022106	TAA	2	6	548078	548083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349956
12120	NC_022106	ATGG	2	8	548162	548169	25 %	25 %	50 %	0 %	532349956
12121	NC_022106	TC	3	6	548181	548186	0 %	50 %	0 %	50 %	532349956
12122	NC_022106	CAA	2	6	548193	548198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349956
12123	NC_022106	TAA	2	6	548202	548207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349956
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12245	NC_022106	TTG	2	6	553677	553682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349960
12246	NC_022106	GAA	2	6	553683	553688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349960
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12249	NC_022106	TAAAA	2	10	553873	553882	80 %	20 %	0 %	0 %	532349960
12250	NC_022106	A	6	6	553879	553884	100 %	0 %	0 %	0 %	532349960
12251	NC_022106	A	6	6	553909	553914	100 %	0 %	0 %	0 %	532349960
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12264	NC_022106	TTTA	2	8	554666	554673	25 %	75 %	0 %	0 %	532349961
12265	NC_022106	AAT	2	6	554687	554692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349961
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12272	NC_022106	TCC	2	6	555129	555134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349961
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12276	NC_022106	CTG	2	6	555187	555192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349961
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12300	NC_022106	AAAGA	2	10	556393	556402	80 %	0 %	20 %	0 %	532349962
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12303	NC_022106	CCTCT	2	10	556464	556473	0 %	40 %	0 %	60 %	532349962
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12313	NC_022106	AACG	2	8	556941	556948	50 %	0 %	25 %	25 %	532349962
12314	NC_022106	CCGAA	2	10	556972	556981	40 %	0 %	20 %	40 %	532349962
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12318	NC_022106	CTC	2	6	557251	557256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349962
12319	NC_022106	CCTT	2	8	557396	557403	0 %	50 %	0 %	50 %	532349962
12320	NC_022106	AAC	2	6	557405	557410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349962
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12323	NC_022106	ACA	2	6	557640	557645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349962
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12325	NC_022106	AAAAG	2	10	557798	557807	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12326	NC_022106	ACAA	2	8	557820	557827	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12327	NC_022106	GAT	2	6	557828	557833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12329	NC_022106	A	6	6	557857	557862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12330	NC_022106	AGGA	2	8	557868	557875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12331	NC_022106	A	9	9	557899	557907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12332	NC_022106	CT	3	6	557925	557930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12333	NC_022106	A	6	6	557936	557941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12334	NC_022106	AAT	2	6	557948	557953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350395
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12339	NC_022106	TCT	2	6	558027	558032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350395
12340	NC_022106	TCA	2	6	558039	558044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350395
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12345	NC_022106	TC	3	6	558159	558164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12346	NC_022106	A	6	6	558169	558174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12347	NC_022106	TG	3	6	558408	558413	0 %	50 %	50 %	0 %	532349963
12348	NC_022106	TAC	2	6	558485	558490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349963
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12350	NC_022106	ATA	2	6	558562	558567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349963
12351	NC_022106	TG	3	6	558575	558580	0 %	50 %	50 %	0 %	532349963
12352	NC_022106	AGG	2	6	558587	558592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349963
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12355	NC_022106	TGA	2	6	558690	558695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349963
12356	NC_022106	A	6	6	558723	558728	100 %	0 %	0 %	0 %	532349963
12357	NC_022106	GAA	2	6	558829	558834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349963
12358	NC_022106	TG	3	6	558846	558851	0 %	50 %	50 %	0 %	532349963
12359	NC_022106	AG	3	6	558945	558950	50 %	0 %	50 %	0 %	532349963
12360	NC_022106	TCT	2	6	559058	559063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350396
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12362	NC_022106	TTC	2	6	559111	559116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350396
12363	NC_022106	CTG	2	6	559128	559133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350396
12364	NC_022106	GAG	2	6	559163	559168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350396
12365	NC_022106	CTG	2	6	559211	559216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349964
12366	NC_022106	AAG	2	6	559402	559407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349964
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12368	NC_022106	AAT	2	6	559533	559538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349964
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12386	NC_022106	ACC	2	6	560106	560111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350397
12387	NC_022106	CGAA	2	8	560129	560136	50 %	0 %	25 %	25 %	532350397
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12389	NC_022106	T	8	8	560185	560192	0 %	100 %	0 %	0 %	532350397
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12392	NC_022106	A	9	9	560245	560253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12393	NC_022106	GGAT	2	8	560311	560318	25 %	25 %	50 %	0 %	532349965
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12399	NC_022106	CTC	2	6	560595	560600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349965
12400	NC_022106	AGG	2	6	560603	560608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349965
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12428	NC_022106	A	6	6	561506	561511	100 %	0 %	0 %	0 %	532349966
12429	NC_022106	AAAG	2	8	561514	561521	75 %	0 %	25 %	0 %	532349966
12430	NC_022106	GA	3	6	561717	561722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12431	NC_022106	AAG	2	6	561835	561840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349967
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12464	NC_022106	CCAC	2	8	563585	563592	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12465	NC_022106	GAAA	2	8	563649	563656	75 %	0 %	25 %	0 %	532349969
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12471	NC_022106	GAAC	2	8	563877	563884	50 %	0 %	25 %	25 %	532349969
12472	NC_022106	CTA	2	6	563997	564002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349969
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12478	NC_022106	CAAA	2	8	564291	564298	75 %	0 %	0 %	25 %	532349970
12479	NC_022106	GA	3	6	564303	564308	50 %	0 %	50 %	0 %	532349970
12480	NC_022106	CCAT	2	8	564314	564321	25 %	25 %	0 %	50 %	532349970
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