MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022106	CTAT	2	8	475376	475383	25 %	50 %	0 %	25 %	532349897
10502	NC_022106	AATA	2	8	475431	475438	75 %	25 %	0 %	0 %	532349897
10503	NC_022106	CTA	2	6	475442	475447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349897
10504	NC_022106	GGA	2	6	475453	475458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349897
10505	NC_022106	TTTC	2	8	475481	475488	0 %	75 %	0 %	25 %	532349897
10506	NC_022106	CAT	2	6	475499	475504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349897
10507	NC_022106	GAA	2	6	475528	475533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349897
10508	NC_022106	GAG	2	6	475538	475543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349897
10509	NC_022106	CTAT	2	8	475544	475551	25 %	50 %	0 %	25 %	532349897
10510	NC_022106	TCAAT	2	10	475567	475576	40 %	40 %	0 %	20 %	532349897
10511	NC_022106	G	7	7	475621	475627	0 %	0 %	100 %	0 %	532349897
10512	NC_022106	AGG	2	6	475641	475646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349897
10513	NC_022106	GAA	2	6	475666	475671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349897
10514	NC_022106	A	8	8	475710	475717	100 %	0 %	0 %	0 %	532349897
10515	NC_022106	CTT	2	6	475727	475732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349897
10516	NC_022106	TCCTC	2	10	475777	475786	0 %	40 %	0 %	60 %	532349897
10517	NC_022106	GGT	2	6	475972	475977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349897
10518	NC_022106	GGA	2	6	476056	476061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349897
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10521	NC_022106	TAAT	2	8	476207	476214	50 %	50 %	0 %	0 %	532349897
10522	NC_022106	TGG	3	9	476232	476240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349897
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10524	NC_022106	AGG	2	6	476349	476354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349897
10525	NC_022106	TGG	2	6	476358	476363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349897
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10529	NC_022106	CA	3	6	476452	476457	50 %	0 %	0 %	50 %	532349897
10530	NC_022106	CGG	2	6	476477	476482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532349897
10531	NC_022106	GCA	2	6	476500	476505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349897
10532	NC_022106	TCT	2	6	476569	476574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349897
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10535	NC_022106	A	6	6	476740	476745	100 %	0 %	0 %	0 %	532349897
10536	NC_022106	CTG	2	6	476814	476819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349897
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10538	NC_022106	AAG	2	6	476882	476887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349897
10539	NC_022106	AAC	2	6	476950	476955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349897
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10542	NC_022106	CTG	2	6	477002	477007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349897
10543	NC_022106	GCT	3	9	477010	477018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349897
10544	NC_022106	AGC	2	6	477027	477032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349897
10545	NC_022106	GCA	2	6	477034	477039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349897
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10550	NC_022106	TC	3	6	477116	477121	0 %	50 %	0 %	50 %	532349897
10551	NC_022106	TCCC	2	8	477171	477178	0 %	25 %	0 %	75 %	532349897
10552	NC_022106	ATC	2	6	477180	477185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349897
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10556	NC_022106	GAG	2	6	477320	477325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349897
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10558	NC_022106	GGA	2	6	477451	477456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349897
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10565	NC_022106	ATG	2	6	477725	477730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349897
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10573	NC_022106	A	7	7	478093	478099	100 %	0 %	0 %	0 %	532349897
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10588	NC_022106	TTG	2	6	478895	478900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349897
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10593	NC_022106	CTC	2	6	479009	479014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349897
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10600	NC_022106	TTC	2	6	479403	479408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349897
10601	NC_022106	GAT	2	6	479497	479502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349897
10602	NC_022106	TAA	2	6	479580	479585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349897
10603	NC_022106	TCTA	2	8	479608	479615	25 %	50 %	0 %	25 %	532349897
10604	NC_022106	CTGT	2	8	479627	479634	0 %	50 %	25 %	25 %	532349897
10605	NC_022106	CT	3	6	479747	479752	0 %	50 %	0 %	50 %	532349897
10606	NC_022106	ACTAT	2	10	479759	479768	40 %	40 %	0 %	20 %	532349897
10607	NC_022106	TCT	2	6	479822	479827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349897
10608	NC_022106	T	9	9	479939	479947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_022106	CAT	2	6	479970	479975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10610	NC_022106	GTT	2	6	479981	479986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_022106	CTG	2	6	480025	480030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349898
10612	NC_022106	TGC	2	6	480035	480040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349898
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10616	NC_022106	TAG	4	12	480239	480250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349898
10617	NC_022106	TCTTCA	2	12	480279	480290	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532349898
10618	NC_022106	TGA	2	6	480344	480349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349898
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10992	NC_022106	TCC	2	6	497078	497083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349911
10993	NC_022106	TAT	2	6	497090	497095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349911
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10999	NC_022106	A	7	7	497546	497552	100 %	0 %	0 %	0 %	532349912
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