MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022106	TCG	2	6	453148	453153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349880
10002	NC_022106	TTC	2	6	453154	453159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349880
10003	NC_022106	TCC	2	6	453221	453226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349880
10004	NC_022106	CTC	2	6	453229	453234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349880
10005	NC_022106	TGC	2	6	453305	453310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349880
10006	NC_022106	A	6	6	453325	453330	100 %	0 %	0 %	0 %	532349880
10007	NC_022106	AAGC	2	8	453340	453347	50 %	0 %	25 %	25 %	532349880
10008	NC_022106	AGA	2	6	453359	453364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349880
10009	NC_022106	CAA	2	6	453372	453377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349880
10010	NC_022106	ACAA	2	8	453412	453419	75 %	0 %	0 %	25 %	532349880
10011	NC_022106	AAG	2	6	453424	453429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349880
10012	NC_022106	AGA	2	6	453566	453571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349880
10013	NC_022106	AGC	2	6	453593	453598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349880
10014	NC_022106	TGA	2	6	453602	453607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349880
10015	NC_022106	A	6	6	453625	453630	100 %	0 %	0 %	0 %	532349880
10016	NC_022106	ATCCGC	2	12	453653	453664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532349880
10017	NC_022106	AGC	2	6	453665	453670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349880
10018	NC_022106	TCT	2	6	453672	453677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349880
10019	NC_022106	AGG	2	6	453692	453697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349880
10020	NC_022106	A	6	6	453723	453728	100 %	0 %	0 %	0 %	532349880
10021	NC_022106	CAG	2	6	453751	453756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349880
10022	NC_022106	ACA	2	6	453778	453783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349880
10023	NC_022106	TTG	2	6	453805	453810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349880
10024	NC_022106	T	8	8	453881	453888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_022106	A	6	6	453889	453894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_022106	CT	3	6	453903	453908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_022106	TCTT	2	8	453909	453916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10028	NC_022106	TAAT	2	8	453922	453929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_022106	CAT	2	6	454003	454008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_022106	CTA	2	6	454024	454029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_022106	A	6	6	454149	454154	100 %	0 %	0 %	0 %	532349881
10032	NC_022106	TGGA	2	8	454286	454293	25 %	25 %	50 %	0 %	532349881
10033	NC_022106	GGA	2	6	454330	454335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349881
10034	NC_022106	A	6	6	454337	454342	100 %	0 %	0 %	0 %	532349881
10035	NC_022106	TCAT	2	8	454352	454359	25 %	50 %	0 %	25 %	532349881
10036	NC_022106	TTCT	2	8	454364	454371	0 %	75 %	0 %	25 %	532349881
10037	NC_022106	TAG	2	6	454388	454393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349881
10038	NC_022106	TC	3	6	454403	454408	0 %	50 %	0 %	50 %	532349881
10039	NC_022106	TG	3	6	454435	454440	0 %	50 %	50 %	0 %	532349881
10040	NC_022106	GTT	2	6	454512	454517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349881
10041	NC_022106	TG	3	6	454530	454535	0 %	50 %	50 %	0 %	532349881
10042	NC_022106	ACC	2	6	454560	454565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349881
10043	NC_022106	TTA	2	6	454625	454630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349881
10044	NC_022106	AGA	2	6	454650	454655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349881
10045	NC_022106	GAC	2	6	454786	454791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349881
10046	NC_022106	GCT	2	6	454894	454899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349881
10047	NC_022106	TGC	2	6	454943	454948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349881
10048	NC_022106	CTGTAT	2	12	455003	455014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532349881
10049	NC_022106	GTA	2	6	455075	455080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349881
10050	NC_022106	ATG	2	6	455096	455101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349881
10051	NC_022106	A	6	6	455122	455127	100 %	0 %	0 %	0 %	532349881
10052	NC_022106	T	6	6	455180	455185	0 %	100 %	0 %	0 %	532349881
10053	NC_022106	AAC	2	6	455198	455203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349881
10054	NC_022106	TTC	2	6	455222	455227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349881
10055	NC_022106	ACAA	2	8	455282	455289	75 %	0 %	0 %	25 %	532349881
10056	NC_022106	GCT	2	6	455293	455298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349881
10057	NC_022106	CA	3	6	455385	455390	50 %	0 %	0 %	50 %	532349881
10058	NC_022106	CCT	2	6	455395	455400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349881
10059	NC_022106	GAA	2	6	455404	455409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349881
10060	NC_022106	ACT	2	6	455615	455620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349881
10061	NC_022106	AC	4	8	455621	455628	50 %	0 %	0 %	50 %	532349881
10062	NC_022106	CCG	2	6	455643	455648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532349881
10063	NC_022106	CT	4	8	455687	455694	0 %	50 %	0 %	50 %	532349881
10064	NC_022106	AGA	3	9	455697	455705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349881
10065	NC_022106	AAG	2	6	455785	455790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349881
10066	NC_022106	CTT	2	6	455796	455801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349881
10067	NC_022106	A	6	6	455803	455808	100 %	0 %	0 %	0 %	532349881
10068	NC_022106	AGA	2	6	455814	455819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349881
10069	NC_022106	ATT	2	6	455848	455853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349881
10070	NC_022106	TCC	2	6	455882	455887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349881
10071	NC_022106	CAAA	2	8	455947	455954	75 %	0 %	0 %	25 %	532349881
10072	NC_022106	AGA	2	6	455964	455969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349881
10073	NC_022106	CA	3	6	456033	456038	50 %	0 %	0 %	50 %	532349881
10074	NC_022106	GTTG	2	8	456054	456061	0 %	50 %	50 %	0 %	532349881
10075	NC_022106	CTAAAG	2	12	456071	456082	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532349881
10076	NC_022106	A	7	7	456103	456109	100 %	0 %	0 %	0 %	532349881
10077	NC_022106	AAAGA	2	10	456127	456136	80 %	0 %	20 %	0 %	532349881
10078	NC_022106	A	6	6	456157	456162	100 %	0 %	0 %	0 %	532349881
10079	NC_022106	GAA	2	6	456177	456182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349881
10080	NC_022106	ATT	2	6	456211	456216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_022106	T	6	6	456228	456233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_022106	CTT	2	6	456288	456293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_022106	T	6	6	456345	456350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_022106	CT	3	6	456356	456361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10085	NC_022106	GGA	2	6	456405	456410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_022106	CATG	2	8	456456	456463	25 %	25 %	25 %	25 %	532349882
10087	NC_022106	A	6	6	456529	456534	100 %	0 %	0 %	0 %	532349882
10088	NC_022106	GAA	2	6	456595	456600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349882
10089	NC_022106	AGATC	2	10	456627	456636	40 %	20 %	20 %	20 %	532349882
10090	NC_022106	GATCA	2	10	456670	456679	40 %	20 %	20 %	20 %	532349882
10091	NC_022106	GCT	2	6	456700	456705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349882
10092	NC_022106	A	8	8	456708	456715	100 %	0 %	0 %	0 %	532349882
10093	NC_022106	TAA	2	6	456756	456761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349882
10094	NC_022106	AAGC	2	8	456805	456812	50 %	0 %	25 %	25 %	532349882
10095	NC_022106	TCT	2	6	456825	456830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349882
10096	NC_022106	TC	3	6	456833	456838	0 %	50 %	0 %	50 %	532349882
10097	NC_022106	GAAA	2	8	456840	456847	75 %	0 %	25 %	0 %	532349882
10098	NC_022106	TC	3	6	456849	456854	0 %	50 %	0 %	50 %	532349882
10099	NC_022106	TAG	2	6	456867	456872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349882
10100	NC_022106	GAA	3	9	456883	456891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349882
10101	NC_022106	GA	3	6	456896	456901	50 %	0 %	50 %	0 %	532349882
10102	NC_022106	GAA	2	6	456919	456924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349882
10103	NC_022106	GAAA	2	8	456957	456964	75 %	0 %	25 %	0 %	532349882
10104	NC_022106	ATT	2	6	456978	456983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349882
10105	NC_022106	CAA	3	9	457005	457013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349882
10106	NC_022106	GTT	2	6	457024	457029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349882
10107	NC_022106	ATC	2	6	457109	457114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349882
10108	NC_022106	CAG	2	6	457172	457177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349882
10109	NC_022106	CGT	5	15	457195	457209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349882
10110	NC_022106	A	6	6	457266	457271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_022106	GCT	2	6	457423	457428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_022106	AAC	2	6	457492	457497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_022106	GAG	2	6	457536	457541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_022106	GCAA	2	8	457576	457583	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10115	NC_022106	T	7	7	457636	457642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_022106	TAA	2	6	457647	457652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349883
10117	NC_022106	GCAT	2	8	457669	457676	25 %	25 %	25 %	25 %	532349883
10118	NC_022106	GTA	2	6	457679	457684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349883
10119	NC_022106	CAA	2	6	457688	457693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349883
10120	NC_022106	GTT	3	9	457700	457708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349883
10121	NC_022106	CAT	2	6	457752	457757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349883
10122	NC_022106	TGT	2	6	457819	457824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349883
10123	NC_022106	TCC	2	6	457845	457850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349883
10124	NC_022106	TAA	2	6	457896	457901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349883
10125	NC_022106	TAC	2	6	457917	457922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349883
10126	NC_022106	AC	3	6	457927	457932	50 %	0 %	0 %	50 %	532349883
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10128	NC_022106	AGT	2	6	457974	457979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349883
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10143	NC_022106	TGA	2	6	458524	458529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349883
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10145	NC_022106	A	7	7	458649	458655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10146	NC_022106	TCT	2	6	458658	458663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349884
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10238	NC_022106	TAA	2	6	463588	463593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349888
10239	NC_022106	A	6	6	463598	463603	100 %	0 %	0 %	0 %	532349888
10240	NC_022106	TC	3	6	463623	463628	0 %	50 %	0 %	50 %	532349888
10241	NC_022106	TAGG	2	8	463646	463653	25 %	25 %	50 %	0 %	532349888
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10369	NC_022106	T	7	7	468979	468985	0 %	100 %	0 %	0 %	532349894
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10372	NC_022106	GCTT	2	8	469080	469087	0 %	50 %	25 %	25 %	532349894
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