MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022106	GCTT	2	8	23047	23054	0 %	50 %	25 %	25 %	532349526
502	NC_022106	GGTT	2	8	23095	23102	0 %	50 %	50 %	0 %	532349526
503	NC_022106	TGC	2	6	23121	23126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349526
504	NC_022106	ATT	2	6	23173	23178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349526
505	NC_022106	AAT	2	6	23215	23220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349526
506	NC_022106	TTG	2	6	23278	23283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349526
507	NC_022106	TTCT	2	8	23465	23472	0 %	75 %	0 %	25 %	532349526
508	NC_022106	TGC	2	6	23529	23534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349526
509	NC_022106	TAAC	2	8	23567	23574	50 %	25 %	0 %	25 %	532349526
510	NC_022106	GCA	2	6	23635	23640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349526
511	NC_022106	CATT	2	8	23690	23697	25 %	50 %	0 %	25 %	532349526
512	NC_022106	AGA	2	6	23709	23714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349526
513	NC_022106	GAG	2	6	23732	23737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349526
514	NC_022106	TTC	2	6	23795	23800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349526
515	NC_022106	GGAAA	2	10	23808	23817	60 %	0 %	40 %	0 %	532349526
516	NC_022106	GA	3	6	23831	23836	50 %	0 %	50 %	0 %	532349526
517	NC_022106	GA	3	6	23923	23928	50 %	0 %	50 %	0 %	532349526
518	NC_022106	GAA	2	6	24054	24059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349526
519	NC_022106	GGTA	2	8	24060	24067	25 %	25 %	50 %	0 %	532349526
520	NC_022106	GTT	2	6	24148	24153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349526
521	NC_022106	CTT	2	6	24242	24247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349526
522	NC_022106	AG	3	6	24304	24309	50 %	0 %	50 %	0 %	532349526
523	NC_022106	TAA	2	6	24315	24320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349526
524	NC_022106	GAA	2	6	24335	24340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349526
525	NC_022106	AAG	2	6	24476	24481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349526
526	NC_022106	A	7	7	24561	24567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022106	TTA	2	6	24574	24579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022106	T	10	10	24589	24598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022106	T	6	6	24622	24627	0 %	100 %	0 %	0 %	532349527
530	NC_022106	AGA	2	6	24749	24754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349527
531	NC_022106	TAA	2	6	24881	24886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349527
532	NC_022106	GGA	3	9	24913	24921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349527
533	NC_022106	GAT	2	6	24958	24963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349527
534	NC_022106	TTGA	2	8	25056	25063	25 %	50 %	25 %	0 %	532349527
535	NC_022106	TTCG	2	8	25201	25208	0 %	50 %	25 %	25 %	532349527
536	NC_022106	TAGG	2	8	25280	25287	25 %	25 %	50 %	0 %	532349527
537	NC_022106	TGT	2	6	25371	25376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349527
538	NC_022106	TTA	2	6	25381	25386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349527
539	NC_022106	TTCC	2	8	25404	25411	0 %	50 %	0 %	50 %	532349527
540	NC_022106	TAG	2	6	25442	25447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349527
541	NC_022106	GTGAGG	2	12	25476	25487	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532349527
542	NC_022106	TAGG	2	8	25518	25525	25 %	25 %	50 %	0 %	532349527
543	NC_022106	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	532349527
544	NC_022106	AGC	2	6	25560	25565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349527
545	NC_022106	T	6	6	25569	25574	0 %	100 %	0 %	0 %	532349527
546	NC_022106	T	6	6	25600	25605	0 %	100 %	0 %	0 %	532349527
547	NC_022106	AAG	2	6	25706	25711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349527
548	NC_022106	GA	3	6	25722	25727	50 %	0 %	50 %	0 %	532349527
549	NC_022106	GT	3	6	25742	25747	0 %	50 %	50 %	0 %	532349527
550	NC_022106	TTTC	2	8	25953	25960	0 %	75 %	0 %	25 %	532349527
551	NC_022106	GAT	2	6	25965	25970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349527
552	NC_022106	CTC	2	6	26033	26038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349527
553	NC_022106	TGT	2	6	26100	26105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349527
554	NC_022106	A	6	6	26197	26202	100 %	0 %	0 %	0 %	532349527
555	NC_022106	GCA	2	6	26212	26217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349527
556	NC_022106	AGT	2	6	26244	26249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349527
557	NC_022106	T	6	6	26273	26278	0 %	100 %	0 %	0 %	532349527
558	NC_022106	GCTT	2	8	26290	26297	0 %	50 %	25 %	25 %	532349527
559	NC_022106	CTT	2	6	26360	26365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349527
560	NC_022106	GA	3	6	26390	26395	50 %	0 %	50 %	0 %	532349527
561	NC_022106	GAA	2	6	26425	26430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349527
562	NC_022106	GAA	2	6	26432	26437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349527
563	NC_022106	CGA	2	6	26440	26445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349527
564	NC_022106	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022106	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_022106	ACT	2	6	26529	26534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_022106	A	6	6	26545	26550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022106	T	7	7	26557	26563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022106	GGC	2	6	26705	26710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532349528
570	NC_022106	TAA	2	6	26734	26739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349528
571	NC_022106	AT	3	6	26807	26812	50 %	50 %	0 %	0 %	532349528
572	NC_022106	T	7	7	26820	26826	0 %	100 %	0 %	0 %	532349528
573	NC_022106	GAA	2	6	26838	26843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349528
574	NC_022106	GGAA	2	8	26873	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	532349528
575	NC_022106	TTAA	2	8	26946	26953	50 %	50 %	0 %	0 %	532349528
576	NC_022106	AAAG	2	8	26996	27003	75 %	0 %	25 %	0 %	532349528
577	NC_022106	GA	3	6	27021	27026	50 %	0 %	50 %	0 %	532349528
578	NC_022106	T	7	7	27095	27101	0 %	100 %	0 %	0 %	532349528
579	NC_022106	TTC	2	6	27126	27131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349528
580	NC_022106	CTA	2	6	27145	27150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349528
581	NC_022106	T	8	8	27152	27159	0 %	100 %	0 %	0 %	532349528
582	NC_022106	GAA	2	6	27210	27215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349528
583	NC_022106	GGGC	2	8	27276	27283	0 %	0 %	75 %	25 %	532349528
584	NC_022106	T	6	6	27292	27297	0 %	100 %	0 %	0 %	532349528
585	NC_022106	TGA	2	6	27305	27310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349528
586	NC_022106	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	532349528
587	NC_022106	A	7	7	27363	27369	100 %	0 %	0 %	0 %	532349528
588	NC_022106	AAG	2	6	27380	27385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349528
589	NC_022106	T	6	6	27400	27405	0 %	100 %	0 %	0 %	532349528
590	NC_022106	A	8	8	27497	27504	100 %	0 %	0 %	0 %	532349529
591	NC_022106	TTC	2	6	27541	27546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349529
592	NC_022106	GTTT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	532349529
593	NC_022106	CAGA	2	8	27581	27588	50 %	0 %	25 %	25 %	532349529
594	NC_022106	TTC	2	6	27659	27664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349529
595	NC_022106	AAG	2	6	27674	27679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349529
596	NC_022106	TTC	2	6	27774	27779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349529
597	NC_022106	AAG	2	6	27788	27793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349529
598	NC_022106	AAG	2	6	27806	27811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349529
599	NC_022106	A	6	6	27812	27817	100 %	0 %	0 %	0 %	532349529
600	NC_022106	T	7	7	27871	27877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022106	TAA	2	6	27882	27887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022106	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_022106	ATTG	2	8	27940	27947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022106	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022106	AGA	2	6	27994	27999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022106	GAA	2	6	28044	28049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349530
607	NC_022106	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	532349530
608	NC_022106	TTC	2	6	28177	28182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349530
609	NC_022106	TAG	2	6	28225	28230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349530
610	NC_022106	AGA	2	6	28238	28243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349530
611	NC_022106	GAT	3	9	28320	28328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349530
612	NC_022106	GAG	2	6	28363	28368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349530
613	NC_022106	TG	3	6	28395	28400	0 %	50 %	50 %	0 %	532349530
614	NC_022106	GCA	2	6	28419	28424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349530
615	NC_022106	TC	3	6	28448	28453	0 %	50 %	0 %	50 %	532349530
616	NC_022106	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	532349530
617	NC_022106	TTC	2	6	28618	28623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349530
618	NC_022106	CAG	2	6	28630	28635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349530
619	NC_022106	GAA	2	6	28644	28649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349530
620	NC_022106	TGA	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349530
621	NC_022106	TTC	2	6	28691	28696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349530
622	NC_022106	GC	4	8	28862	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	532349530
623	NC_022106	AAG	2	6	28870	28875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349530
624	NC_022106	TA	3	6	28984	28989	50 %	50 %	0 %	0 %	532349530
625	NC_022106	GAA	2	6	29073	29078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349530
626	NC_022106	TGT	2	6	29105	29110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349531
627	NC_022106	TCT	2	6	29173	29178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349531
628	NC_022106	ACA	2	6	29401	29406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349531
629	NC_022106	ATG	2	6	29411	29416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349531
630	NC_022106	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	532349531
631	NC_022106	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	532349531
632	NC_022106	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	532349531
633	NC_022106	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	532349531
634	NC_022106	T	6	6	29638	29643	0 %	100 %	0 %	0 %	532349531
635	NC_022106	ATC	2	6	29717	29722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349531
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637	NC_022106	T	8	8	29872	29879	0 %	100 %	0 %	0 %	532349531
638	NC_022106	ATG	2	6	29897	29902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349531
639	NC_022106	GA	3	6	29935	29940	50 %	0 %	50 %	0 %	532349531
640	NC_022106	AG	3	6	30033	30038	50 %	0 %	50 %	0 %	532349532
641	NC_022106	GTT	2	6	30114	30119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349532
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643	NC_022106	TC	3	6	30142	30147	0 %	50 %	0 %	50 %	532349532
644	NC_022106	TCT	2	6	30189	30194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349532
645	NC_022106	ACT	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349532
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649	NC_022106	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	532349532
650	NC_022106	T	6	6	30413	30418	0 %	100 %	0 %	0 %	532349532
651	NC_022106	AAGGA	2	10	30422	30431	60 %	0 %	40 %	0 %	532349532
652	NC_022106	GGC	2	6	30449	30454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532349532
653	NC_022106	GAT	2	6	30528	30533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349532
654	NC_022106	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	532349532
655	NC_022106	TAG	2	6	30550	30555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349532
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657	NC_022106	TAA	2	6	30734	30739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349532
658	NC_022106	GA	3	6	30763	30768	50 %	0 %	50 %	0 %	532349532
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663	NC_022106	GAA	2	6	31035	31040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349532
664	NC_022106	ATT	2	6	31071	31076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349532
665	NC_022106	ATG	2	6	31194	31199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349532
666	NC_022106	AAG	2	6	31206	31211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349532
667	NC_022106	T	6	6	31212	31217	0 %	100 %	0 %	0 %	532349532
668	NC_022106	GA	3	6	31231	31236	50 %	0 %	50 %	0 %	532349532
669	NC_022106	A	7	7	31254	31260	100 %	0 %	0 %	0 %	532349532
670	NC_022106	ACA	2	6	31300	31305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349533
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672	NC_022106	T	6	6	31440	31445	0 %	100 %	0 %	0 %	532349533
673	NC_022106	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	532349533
674	NC_022106	A	6	6	31535	31540	100 %	0 %	0 %	0 %	532349533
675	NC_022106	A	6	6	31566	31571	100 %	0 %	0 %	0 %	532349533
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682	NC_022106	CTT	2	6	31907	31912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349534
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690	NC_022106	AAG	2	6	32423	32428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349534
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692	NC_022106	T	6	6	32578	32583	0 %	100 %	0 %	0 %	532349534
693	NC_022106	GGA	2	6	32603	32608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349534
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704	NC_022106	GTT	2	6	33423	33428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349536
705	NC_022106	AGG	2	6	33472	33477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349536
706	NC_022106	CTT	2	6	33496	33501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349536
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708	NC_022106	GTT	2	6	33536	33541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349536
709	NC_022106	TGA	2	6	33643	33648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349536
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724	NC_022106	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	532349537
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734	NC_022106	GA	4	8	34633	34640	50 %	0 %	50 %	0 %	532349538
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751	NC_022106	TTGG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	532349539
752	NC_022106	ATA	2	6	35589	35594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349539
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759	NC_022106	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	532349539
760	NC_022106	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	532349539
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762	NC_022106	T	6	6	36296	36301	0 %	100 %	0 %	0 %	532349539
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768	NC_022106	GA	3	6	36536	36541	50 %	0 %	50 %	0 %	532349540
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