MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_022106	GGA	2	6	409641	409646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350382
9002	NC_022106	CTT	2	6	409652	409657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350382
9003	NC_022106	CT	3	6	409665	409670	0 %	50 %	0 %	50 %	532350382
9004	NC_022106	T	6	6	409689	409694	0 %	100 %	0 %	0 %	532350382
9005	NC_022106	TAG	2	6	409702	409707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350382
9006	NC_022106	GTA	2	6	409720	409725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350382
9007	NC_022106	ACC	2	6	409793	409798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350382
9008	NC_022106	TCT	2	6	409845	409850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350383
9009	NC_022106	ATT	2	6	409861	409866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350383
9010	NC_022106	CTTG	2	8	409878	409885	0 %	50 %	25 %	25 %	532350383
9011	NC_022106	TAG	2	6	409913	409918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350383
9012	NC_022106	TCA	2	6	409975	409980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350383
9013	NC_022106	ACT	2	6	409992	409997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350383
9014	NC_022106	ACA	2	6	410026	410031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350383
9015	NC_022106	ACA	2	6	410037	410042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350383
9016	NC_022106	CTT	2	6	410097	410102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349845
9017	NC_022106	TCA	2	6	410108	410113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349845
9018	NC_022106	TCT	2	6	410117	410122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349845
9019	NC_022106	ACA	2	6	410172	410177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349845
9020	NC_022106	TAT	2	6	410245	410250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349845
9021	NC_022106	TCTCT	2	10	410334	410343	0 %	60 %	0 %	40 %	532349845
9022	NC_022106	AGA	2	6	410443	410448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349845
9023	NC_022106	AGA	2	6	410497	410502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349845
9024	NC_022106	TC	3	6	410520	410525	0 %	50 %	0 %	50 %	532349845
9025	NC_022106	CAC	2	6	410526	410531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349845
9026	NC_022106	TC	3	6	410532	410537	0 %	50 %	0 %	50 %	532349845
9027	NC_022106	TA	3	6	410552	410557	50 %	50 %	0 %	0 %	532349845
9028	NC_022106	ATC	2	6	410559	410564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349845
9029	NC_022106	CT	3	6	410652	410657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9030	NC_022106	ATAA	2	8	410678	410685	75 %	25 %	0 %	0 %	532349846
9031	NC_022106	AG	3	6	410783	410788	50 %	0 %	50 %	0 %	532349846
9032	NC_022106	CAAG	2	8	410816	410823	50 %	0 %	25 %	25 %	532349846
9033	NC_022106	ATC	2	6	410870	410875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349846
9034	NC_022106	CAG	2	6	410967	410972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349846
9035	NC_022106	CA	3	6	410997	411002	50 %	0 %	0 %	50 %	532349846
9036	NC_022106	GAA	2	6	411022	411027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349846
9037	NC_022106	ACT	2	6	411050	411055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349846
9038	NC_022106	A	6	6	411370	411375	100 %	0 %	0 %	0 %	532350384
9039	NC_022106	CAC	2	6	411383	411388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350384
9040	NC_022106	CT	3	6	411449	411454	0 %	50 %	0 %	50 %	532350384
9041	NC_022106	T	6	6	411473	411478	0 %	100 %	0 %	0 %	532350384
9042	NC_022106	ATGC	2	8	411480	411487	25 %	25 %	25 %	25 %	532350384
9043	NC_022106	TTC	2	6	411496	411501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350384
9044	NC_022106	CT	4	8	411517	411524	0 %	50 %	0 %	50 %	532350384
9045	NC_022106	AT	3	6	411539	411544	50 %	50 %	0 %	0 %	532350384
9046	NC_022106	TTCT	2	8	411565	411572	0 %	75 %	0 %	25 %	532349847
9047	NC_022106	TTC	2	6	411601	411606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349847
9048	NC_022106	CT	3	6	411619	411624	0 %	50 %	0 %	50 %	532349847
9049	NC_022106	TC	3	6	411646	411651	0 %	50 %	0 %	50 %	532349847
9050	NC_022106	A	6	6	411653	411658	100 %	0 %	0 %	0 %	532349847
9051	NC_022106	CTT	3	9	411666	411674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349847
9052	NC_022106	CACT	2	8	411731	411738	25 %	25 %	0 %	50 %	532349847
9053	NC_022106	CT	3	6	411749	411754	0 %	50 %	0 %	50 %	532349847
9054	NC_022106	A	6	6	411833	411838	100 %	0 %	0 %	0 %	532349847
9055	NC_022106	CAA	2	6	411855	411860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349847
9056	NC_022106	T	8	8	411864	411871	0 %	100 %	0 %	0 %	532349847
9057	NC_022106	AAT	2	6	411872	411877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349847
9058	NC_022106	TTCT	3	12	411973	411984	0 %	75 %	0 %	25 %	532349847
9059	NC_022106	CT	3	6	411983	411988	0 %	50 %	0 %	50 %	532349847
9060	NC_022106	CTG	2	6	412017	412022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349847
9061	NC_022106	AATG	2	8	412024	412031	50 %	25 %	25 %	0 %	532349847
9062	NC_022106	AGCA	2	8	412088	412095	50 %	0 %	25 %	25 %	532349847
9063	NC_022106	TTA	2	6	412179	412184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_022106	TAA	2	6	412201	412206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_022106	AGA	2	6	412229	412234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_022106	TTA	2	6	412268	412273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_022106	TGA	2	6	412279	412284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_022106	AAG	2	6	412314	412319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349848
9069	NC_022106	TCTCT	2	10	412366	412375	0 %	60 %	0 %	40 %	532349848
9070	NC_022106	TTC	2	6	412492	412497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349848
9071	NC_022106	GAC	2	6	412511	412516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349848
9072	NC_022106	GTC	2	6	412614	412619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349848
9073	NC_022106	AATC	2	8	412898	412905	50 %	25 %	0 %	25 %	532349848
9074	NC_022106	AAAC	2	8	412976	412983	75 %	0 %	0 %	25 %	532349848
9075	NC_022106	TAC	2	6	413033	413038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349848
9076	NC_022106	AAATA	2	10	413040	413049	80 %	20 %	0 %	0 %	532349848
9077	NC_022106	CGAA	2	8	413073	413080	50 %	0 %	25 %	25 %	532349848
9078	NC_022106	CT	3	6	413086	413091	0 %	50 %	0 %	50 %	532349848
9079	NC_022106	AGC	2	6	413094	413099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349848
9080	NC_022106	CAA	2	6	413187	413192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349849
9081	NC_022106	TTA	2	6	413218	413223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349849
9082	NC_022106	AATTA	2	10	413226	413235	60 %	40 %	0 %	0 %	532349849
9083	NC_022106	AGCT	2	8	413313	413320	25 %	25 %	25 %	25 %	532349849
9084	NC_022106	CTT	2	6	413624	413629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349849
9085	NC_022106	CT	3	6	413832	413837	0 %	50 %	0 %	50 %	532349849
9086	NC_022106	AG	3	6	413860	413865	50 %	0 %	50 %	0 %	532349849
9087	NC_022106	C	6	6	413880	413885	0 %	0 %	0 %	100 %	532349849
9088	NC_022106	TCT	2	6	413953	413958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349849
9089	NC_022106	CCGC	2	8	414008	414015	0 %	0 %	25 %	75 %	532349849
9090	NC_022106	CAG	2	6	414082	414087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349849
9091	NC_022106	AGAA	2	8	414150	414157	75 %	0 %	25 %	0 %	532349849
9092	NC_022106	CT	3	6	414275	414280	0 %	50 %	0 %	50 %	532349849
9093	NC_022106	AAC	3	9	414339	414347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349849
9094	NC_022106	TCTT	2	8	414357	414364	0 %	75 %	0 %	25 %	532349849
9095	NC_022106	TCG	2	6	414384	414389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349849
9096	NC_022106	AC	3	6	414429	414434	50 %	0 %	0 %	50 %	532349849
9097	NC_022106	CT	3	6	414470	414475	0 %	50 %	0 %	50 %	532349850
9098	NC_022106	TGA	2	6	414476	414481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349850
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9101	NC_022106	CCG	2	6	414590	414595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532349850
9102	NC_022106	ATC	2	6	414625	414630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349850
9103	NC_022106	AAG	2	6	414708	414713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349850
9104	NC_022106	TCT	2	6	414719	414724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349850
9105	NC_022106	TC	3	6	414852	414857	0 %	50 %	0 %	50 %	532349850
9106	NC_022106	TCT	2	6	414864	414869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349850
9107	NC_022106	ACATGC	2	12	414965	414976	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532349850
9108	NC_022106	ACA	2	6	414987	414992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349850
9109	NC_022106	ACA	2	6	415027	415032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349850
9110	NC_022106	TAA	2	6	415044	415049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349850
9111	NC_022106	A	6	6	415058	415063	100 %	0 %	0 %	0 %	532349850
9112	NC_022106	TTC	2	6	415069	415074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349850
9113	NC_022106	AGT	2	6	415183	415188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349850
9114	NC_022106	CTG	2	6	415191	415196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349850
9115	NC_022106	GAAG	2	8	415211	415218	50 %	0 %	50 %	0 %	532349850
9116	NC_022106	ACA	2	6	415226	415231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349850
9117	NC_022106	AACGC	2	10	415329	415338	40 %	0 %	20 %	40 %	532349850
9118	NC_022106	AGA	2	6	415348	415353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349850
9119	NC_022106	CAA	2	6	415416	415421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349850
9120	NC_022106	AAAC	2	8	415489	415496	75 %	0 %	0 %	25 %	532349851
9121	NC_022106	TCT	2	6	415551	415556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349851
9122	NC_022106	CCA	2	6	415574	415579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349851
9123	NC_022106	A	6	6	415581	415586	100 %	0 %	0 %	0 %	532349851
9124	NC_022106	GGCTCT	2	12	415700	415711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349851
9125	NC_022106	CT	3	6	415721	415726	0 %	50 %	0 %	50 %	532349851
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9378	NC_022106	ATTT	2	8	425778	425785	25 %	75 %	0 %	0 %	532349858
9379	NC_022106	ATTT	2	8	425802	425809	25 %	75 %	0 %	0 %	532349858
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9383	NC_022106	TCTT	2	8	425917	425924	0 %	75 %	0 %	25 %	532349858
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9496	NC_022106	A	7	7	430803	430809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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