MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8003	NC_022106	TTAT	2	8	364763	364770	25 %	75 %	0 %	0 %	532349811
8004	NC_022106	CTC	2	6	364775	364780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349811
8005	NC_022106	TAT	2	6	364794	364799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349811
8006	NC_022106	T	6	6	364806	364811	0 %	100 %	0 %	0 %	532349811
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8012	NC_022106	AGT	2	6	365097	365102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349811
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8014	NC_022106	CTCTT	2	10	365248	365257	0 %	60 %	0 %	40 %	532349812
8015	NC_022106	ACAA	2	8	365287	365294	75 %	0 %	0 %	25 %	532349812
8016	NC_022106	T	8	8	365415	365422	0 %	100 %	0 %	0 %	532349812
8017	NC_022106	T	6	6	365523	365528	0 %	100 %	0 %	0 %	532349812
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8101	NC_022106	TAAA	2	8	368536	368543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_022106	A	7	7	368781	368787	100 %	0 %	0 %	0 %	532349814
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8120	NC_022106	ATCT	2	8	369509	369516	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8126	NC_022106	GCT	2	6	369961	369966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349815
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8131	NC_022106	GGA	2	6	370318	370323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349815
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8200	NC_022106	TG	3	6	373246	373251	0 %	50 %	50 %	0 %	532349819
8201	NC_022106	AGCTGA	2	12	373273	373284	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532349819
8202	NC_022106	CT	3	6	373333	373338	0 %	50 %	0 %	50 %	532349819
8203	NC_022106	A	8	8	373339	373346	100 %	0 %	0 %	0 %	532349819
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8220	NC_022106	TTA	2	6	374043	374048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349819
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8222	NC_022106	AGA	2	6	374110	374115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349819
8223	NC_022106	GGC	2	6	374129	374134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532349819
8224	NC_022106	ATA	2	6	374169	374174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349819
8225	NC_022106	TC	3	6	374188	374193	0 %	50 %	0 %	50 %	532349819
8226	NC_022106	ATCAC	2	10	374268	374277	40 %	20 %	0 %	40 %	532349819
8227	NC_022106	T	6	6	374330	374335	0 %	100 %	0 %	0 %	532349819
8228	NC_022106	CTT	2	6	374381	374386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8229	NC_022106	AGA	2	6	374403	374408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8230	NC_022106	ATT	2	6	374459	374464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349820
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8232	NC_022106	TAT	2	6	374629	374634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349820
8233	NC_022106	AAAG	2	8	374741	374748	75 %	0 %	25 %	0 %	532349820
8234	NC_022106	TGA	2	6	374812	374817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349820
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8237	NC_022106	CAA	2	6	374899	374904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349820
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8240	NC_022106	GTC	2	6	375069	375074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349820
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8247	NC_022106	ATT	2	6	375572	375577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349820
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8376	NC_022106	AAG	2	6	381522	381527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349822
8377	NC_022106	GCA	2	6	381610	381615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349822
8378	NC_022106	AAC	2	6	381654	381659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349822
8379	NC_022106	TC	3	6	381749	381754	0 %	50 %	0 %	50 %	532349822
8380	NC_022106	TAT	2	6	381873	381878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349822
8381	NC_022106	TGA	2	6	381879	381884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349822
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8383	NC_022106	CTA	2	6	381919	381924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349822
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8401	NC_022106	TCA	2	6	382744	382749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349822
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8405	NC_022106	TC	3	6	382792	382797	0 %	50 %	0 %	50 %	532349822
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8408	NC_022106	CT	3	6	382963	382968	0 %	50 %	0 %	50 %	532349823
8409	NC_022106	AGT	2	6	383089	383094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349823
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8414	NC_022106	TGA	2	6	383208	383213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349824
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8434	NC_022106	GA	5	10	384048	384057	50 %	0 %	50 %	0 %	532349824
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8441	NC_022106	GTC	2	6	384495	384500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349824
8442	NC_022106	TC	3	6	384529	384534	0 %	50 %	0 %	50 %	532349824
8443	NC_022106	AGA	2	6	384542	384547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349824
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8482	NC_022106	TGCT	2	8	386261	386268	0 %	50 %	25 %	25 %	532349827
8483	NC_022106	CTG	2	6	386283	386288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349827
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8486	NC_022106	TTAA	2	8	386473	386480	50 %	50 %	0 %	0 %	532349827
8487	NC_022106	A	9	9	386479	386487	100 %	0 %	0 %	0 %	532349827
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8499	NC_022106	CT	4	8	386983	386990	0 %	50 %	0 %	50 %	532349827
8500	NC_022106	TATTC	2	10	387045	387054	20 %	60 %	0 %	20 %	532349827

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