MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_022106	AGG	2	6	318593	318598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349775
7002	NC_022106	TTAATT	2	12	318726	318737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349775
7003	NC_022106	GTC	2	6	318742	318747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349775
7004	NC_022106	GAA	2	6	318748	318753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349775
7005	NC_022106	A	6	6	318752	318757	100 %	0 %	0 %	0 %	532349775
7006	NC_022106	A	6	6	318858	318863	100 %	0 %	0 %	0 %	532349775
7007	NC_022106	GAA	2	6	318924	318929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349775
7008	NC_022106	GATG	2	8	318944	318951	25 %	25 %	50 %	0 %	532349775
7009	NC_022106	TTAT	2	8	318978	318985	25 %	75 %	0 %	0 %	532349775
7010	NC_022106	TGA	2	6	318986	318991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349775
7011	NC_022106	TTG	2	6	319003	319008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349775
7012	NC_022106	GCT	2	6	319017	319022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349775
7013	NC_022106	GAG	2	6	319069	319074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349775
7014	NC_022106	A	6	6	319156	319161	100 %	0 %	0 %	0 %	532349775
7015	NC_022106	GTT	2	6	319164	319169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349775
7016	NC_022106	CCT	2	6	319173	319178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349775
7017	NC_022106	A	6	6	319218	319223	100 %	0 %	0 %	0 %	532349775
7018	NC_022106	TCA	2	6	319246	319251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349775
7019	NC_022106	TGA	2	6	319253	319258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349775
7020	NC_022106	TGC	2	6	319268	319273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349775
7021	NC_022106	CT	3	6	319281	319286	0 %	50 %	0 %	50 %	532349775
7022	NC_022106	TTC	2	6	319309	319314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349775
7023	NC_022106	A	6	6	319414	319419	100 %	0 %	0 %	0 %	532349775
7024	NC_022106	GCT	2	6	319467	319472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349775
7025	NC_022106	TGA	2	6	319481	319486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349775
7026	NC_022106	AGA	2	6	319489	319494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349775
7027	NC_022106	ACA	2	6	319523	319528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349775
7028	NC_022106	GAA	2	6	319545	319550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349775
7029	NC_022106	TGA	2	6	319565	319570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349775
7030	NC_022106	AGT	2	6	319586	319591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349775
7031	NC_022106	AAAG	2	8	319673	319680	75 %	0 %	25 %	0 %	532349775
7032	NC_022106	CGT	2	6	319725	319730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349775
7033	NC_022106	TCCT	2	8	319770	319777	0 %	50 %	0 %	50 %	532349775
7034	NC_022106	GCA	2	6	319817	319822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349775
7035	NC_022106	GGA	2	6	319842	319847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349775
7036	NC_022106	GAT	2	6	319907	319912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349775
7037	NC_022106	TCC	2	6	319919	319924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349775
7038	NC_022106	AT	3	6	319928	319933	50 %	50 %	0 %	0 %	532349775
7039	NC_022106	CGC	2	6	319974	319979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532349775
7040	NC_022106	TGTGT	2	10	319986	319995	0 %	60 %	40 %	0 %	532349775
7041	NC_022106	TGA	2	6	320000	320005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349775
7042	NC_022106	CAT	3	9	320108	320116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349775
7043	NC_022106	GTG	2	6	320155	320160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349775
7044	NC_022106	TGC	2	6	320219	320224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349775
7045	NC_022106	AAG	2	6	320229	320234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349775
7046	NC_022106	AAG	2	6	320296	320301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349775
7047	NC_022106	TAA	2	6	320330	320335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349775
7048	NC_022106	GGA	2	6	320468	320473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349775
7049	NC_022106	AAG	2	6	320512	320517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349775
7050	NC_022106	CG	4	8	320529	320536	0 %	0 %	50 %	50 %	532349775
7051	NC_022106	AGA	2	6	320543	320548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349775
7052	NC_022106	GTT	2	6	320553	320558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349775
7053	NC_022106	AGA	3	9	320567	320575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349775
7054	NC_022106	TGA	2	6	320627	320632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349775
7055	NC_022106	CTC	3	9	320652	320660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349776
7056	NC_022106	TAAAG	2	10	320873	320882	60 %	20 %	20 %	0 %	532349776
7057	NC_022106	GAT	2	6	320883	320888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349776
7058	NC_022106	TCC	2	6	320959	320964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349776
7059	NC_022106	TAA	2	6	320996	321001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349776
7060	NC_022106	TGT	2	6	321029	321034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349776
7061	NC_022106	AAT	2	6	321046	321051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349776
7062	NC_022106	T	7	7	321133	321139	0 %	100 %	0 %	0 %	532349776
7063	NC_022106	CTT	2	6	321159	321164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349776
7064	NC_022106	CTC	2	6	321309	321314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349776
7065	NC_022106	AAT	2	6	321318	321323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349776
7066	NC_022106	A	6	6	321335	321340	100 %	0 %	0 %	0 %	532349776
7067	NC_022106	CTT	2	6	321361	321366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349776
7068	NC_022106	TAA	2	6	321370	321375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349776
7069	NC_022106	ATGGA	2	10	321498	321507	40 %	20 %	40 %	0 %	532349776
7070	NC_022106	CAA	2	6	321603	321608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349776
7071	NC_022106	CTT	2	6	321625	321630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349776
7072	NC_022106	CAA	2	6	321642	321647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349776
7073	NC_022106	CTC	2	6	321660	321665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349776
7074	NC_022106	CAA	2	6	321675	321680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349776
7075	NC_022106	CAT	2	6	321749	321754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350375
7076	NC_022106	A	7	7	321761	321767	100 %	0 %	0 %	0 %	532350375
7077	NC_022106	A	7	7	321775	321781	100 %	0 %	0 %	0 %	532350375
7078	NC_022106	GCC	2	6	321794	321799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532350375
7079	NC_022106	AAAAAT	2	12	321819	321830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	532350375
7080	NC_022106	CAATT	2	10	321831	321840	40 %	40 %	0 %	20 %	532350375
7081	NC_022106	A	7	7	321845	321851	100 %	0 %	0 %	0 %	532350375
7082	NC_022106	TAT	2	6	321886	321891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_022106	ATA	2	6	321895	321900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_022106	TCA	2	6	321944	321949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349777
7085	NC_022106	GAG	2	6	322105	322110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349777
7086	NC_022106	TGG	2	6	322133	322138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349777
7087	NC_022106	TGC	2	6	322142	322147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349777
7088	NC_022106	CCA	2	6	322171	322176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349777
7089	NC_022106	A	6	6	322190	322195	100 %	0 %	0 %	0 %	532349777
7090	NC_022106	AAAACA	2	12	322211	322222	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	532349777
7091	NC_022106	AGA	2	6	322226	322231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349777
7092	NC_022106	A	8	8	322366	322373	100 %	0 %	0 %	0 %	532349777
7093	NC_022106	AAG	2	6	322381	322386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349777
7094	NC_022106	CT	4	8	322455	322462	0 %	50 %	0 %	50 %	532349777
7095	NC_022106	GAG	2	6	322489	322494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349777
7096	NC_022106	CTC	2	6	322522	322527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349777
7097	NC_022106	GGT	2	6	322593	322598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349777
7098	NC_022106	T	6	6	322600	322605	0 %	100 %	0 %	0 %	532349777
7099	NC_022106	TA	3	6	322645	322650	50 %	50 %	0 %	0 %	532349777
7100	NC_022106	GCT	2	6	322695	322700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349777
7101	NC_022106	ATC	2	6	322704	322709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349777
7102	NC_022106	TTC	2	6	322711	322716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349777
7103	NC_022106	GCCT	2	8	322723	322730	0 %	25 %	25 %	50 %	532349777
7104	NC_022106	A	6	6	322855	322860	100 %	0 %	0 %	0 %	532349777
7105	NC_022106	GAGC	2	8	322961	322968	25 %	0 %	50 %	25 %	532349777
7106	NC_022106	CTT	2	6	322970	322975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349777
7107	NC_022106	AT	3	6	323029	323034	50 %	50 %	0 %	0 %	532349777
7108	NC_022106	TAA	2	6	323048	323053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349777
7109	NC_022106	ACA	2	6	323060	323065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349777
7110	NC_022106	CTTA	2	8	323101	323108	25 %	50 %	0 %	25 %	532349777
7111	NC_022106	TAA	2	6	323120	323125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349777
7112	NC_022106	CGA	2	6	323126	323131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349777
7113	NC_022106	TAAA	2	8	323203	323210	75 %	25 %	0 %	0 %	532349777
7114	NC_022106	ACG	2	6	323231	323236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349777
7115	NC_022106	AGA	2	6	323324	323329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349777
7116	NC_022106	CAA	2	6	323364	323369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349777
7117	NC_022106	CTC	2	6	323373	323378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349777
7118	NC_022106	AGA	2	6	323381	323386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349777
7119	NC_022106	GGC	2	6	323450	323455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532349777
7120	NC_022106	ATG	2	6	323520	323525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349777
7121	NC_022106	AC	3	6	323550	323555	50 %	0 %	0 %	50 %	532349777
7122	NC_022106	CT	3	6	323571	323576	0 %	50 %	0 %	50 %	532349777
7123	NC_022106	ACA	2	6	323582	323587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349777
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7152	NC_022106	T	6	6	324656	324661	0 %	100 %	0 %	0 %	532349778
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7156	NC_022106	T	7	7	324910	324916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7232	NC_022106	A	6	6	328316	328321	100 %	0 %	0 %	0 %	532349784
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7243	NC_022106	TA	3	6	328926	328931	50 %	50 %	0 %	0 %	532349784
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7497	NC_022106	CAG	2	6	340787	340792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350377
7498	NC_022106	TGA	2	6	340823	340828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350377
7499	NC_022106	CAGA	2	8	340837	340844	50 %	0 %	25 %	25 %	532350377
7500	NC_022106	AAT	2	6	340847	340852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350377

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