MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022106	GTT	2	6	296116	296121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349753
6502	NC_022106	CAA	2	6	296135	296140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349753
6503	NC_022106	CTA	2	6	296141	296146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349753
6504	NC_022106	AG	3	6	296190	296195	50 %	0 %	50 %	0 %	532349753
6505	NC_022106	CCT	2	6	296230	296235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349753
6506	NC_022106	CAA	2	6	296291	296296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349753
6507	NC_022106	TAT	2	6	296297	296302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349753
6508	NC_022106	AAG	2	6	296313	296318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349753
6509	NC_022106	CTCC	2	8	296357	296364	0 %	25 %	0 %	75 %	532349753
6510	NC_022106	AGA	2	6	296377	296382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349753
6511	NC_022106	A	6	6	296420	296425	100 %	0 %	0 %	0 %	532349753
6512	NC_022106	CTT	2	6	296493	296498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349753
6513	NC_022106	AGA	2	6	296518	296523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349753
6514	NC_022106	TGA	2	6	296657	296662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349754
6515	NC_022106	GCA	3	9	296741	296749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349754
6516	NC_022106	AAT	2	6	296811	296816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349754
6517	NC_022106	ACA	2	6	296837	296842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349754
6518	NC_022106	CCT	2	6	296867	296872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349754
6519	NC_022106	TTC	2	6	296965	296970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349754
6520	NC_022106	ATGC	2	8	297100	297107	25 %	25 %	25 %	25 %	532349754
6521	NC_022106	ATC	2	6	297193	297198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349754
6522	NC_022106	T	6	6	297327	297332	0 %	100 %	0 %	0 %	532349754
6523	NC_022106	ATCT	2	8	297339	297346	25 %	50 %	0 %	25 %	532349754
6524	NC_022106	GAA	3	9	297374	297382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349754
6525	NC_022106	T	7	7	297401	297407	0 %	100 %	0 %	0 %	532349754
6526	NC_022106	T	6	6	297426	297431	0 %	100 %	0 %	0 %	532349754
6527	NC_022106	AGT	2	6	297461	297466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349754
6528	NC_022106	CTT	2	6	297485	297490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_022106	A	6	6	297493	297498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_022106	ACAA	2	8	297512	297519	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6531	NC_022106	AAC	2	6	297528	297533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_022106	TG	3	6	297638	297643	0 %	50 %	50 %	0 %	532349755
6533	NC_022106	A	6	6	297659	297664	100 %	0 %	0 %	0 %	532349755
6534	NC_022106	A	6	6	297699	297704	100 %	0 %	0 %	0 %	532349755
6535	NC_022106	AGA	2	6	297721	297726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349755
6536	NC_022106	A	6	6	297859	297864	100 %	0 %	0 %	0 %	532349755
6537	NC_022106	AGA	2	6	297889	297894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349755
6538	NC_022106	GAA	2	6	297989	297994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349755
6539	NC_022106	CTT	2	6	298029	298034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349755
6540	NC_022106	A	6	6	298148	298153	100 %	0 %	0 %	0 %	532349755
6541	NC_022106	ACCACT	2	12	298174	298185	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532349755
6542	NC_022106	AAG	2	6	298200	298205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349755
6543	NC_022106	TCT	2	6	298256	298261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349755
6544	NC_022106	CTT	2	6	298269	298274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349755
6545	NC_022106	T	6	6	298305	298310	0 %	100 %	0 %	0 %	532349755
6546	NC_022106	CTT	2	6	298329	298334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349755
6547	NC_022106	TC	3	6	298360	298365	0 %	50 %	0 %	50 %	532349755
6548	NC_022106	AAT	2	6	298373	298378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349755
6549	NC_022106	T	6	6	298398	298403	0 %	100 %	0 %	0 %	532349755
6550	NC_022106	ACA	2	6	298446	298451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349755
6551	NC_022106	AAGG	2	8	298482	298489	50 %	0 %	50 %	0 %	532349755
6552	NC_022106	A	6	6	298499	298504	100 %	0 %	0 %	0 %	532349755
6553	NC_022106	CGA	2	6	298511	298516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349755
6554	NC_022106	AAT	2	6	298517	298522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349755
6555	NC_022106	CTT	2	6	298581	298586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349755
6556	NC_022106	GAT	2	6	298641	298646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349755
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6558	NC_022106	CTT	2	6	298678	298683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349755
6559	NC_022106	CTA	2	6	298776	298781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349755
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6561	NC_022106	A	6	6	298811	298816	100 %	0 %	0 %	0 %	532349755
6562	NC_022106	GCTT	2	8	298842	298849	0 %	50 %	25 %	25 %	532349755
6563	NC_022106	AAAGC	2	10	298875	298884	60 %	0 %	20 %	20 %	532349755
6564	NC_022106	GAA	2	6	298895	298900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_022106	AAG	2	6	298905	298910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349756
6566	NC_022106	TTG	2	6	298914	298919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349756
6567	NC_022106	TCAA	2	8	298925	298932	50 %	25 %	0 %	25 %	532349756
6568	NC_022106	CTG	2	6	298995	299000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349756
6569	NC_022106	TC	3	6	299032	299037	0 %	50 %	0 %	50 %	532349756
6570	NC_022106	A	6	6	299111	299116	100 %	0 %	0 %	0 %	532349756
6571	NC_022106	TCT	2	6	299184	299189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349756
6572	NC_022106	TTG	2	6	299212	299217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349756
6573	NC_022106	CCT	2	6	299218	299223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349756
6574	NC_022106	T	7	7	299302	299308	0 %	100 %	0 %	0 %	532349756
6575	NC_022106	CCCT	2	8	299409	299416	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6576	NC_022106	ATT	2	6	299424	299429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349757
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6578	NC_022106	GCGA	2	8	299529	299536	25 %	0 %	50 %	25 %	532349757
6579	NC_022106	GCTC	2	8	299558	299565	0 %	25 %	25 %	50 %	532349757
6580	NC_022106	GAAA	2	8	299576	299583	75 %	0 %	25 %	0 %	532349757
6581	NC_022106	GTT	2	6	299612	299617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349757
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6583	NC_022106	T	7	7	299672	299678	0 %	100 %	0 %	0 %	532349757
6584	NC_022106	CT	3	6	299708	299713	0 %	50 %	0 %	50 %	532349757
6585	NC_022106	AAAT	2	8	299750	299757	75 %	25 %	0 %	0 %	532349757
6586	NC_022106	CTTA	2	8	299848	299855	25 %	50 %	0 %	25 %	532349757
6587	NC_022106	GCA	2	6	300056	300061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349757
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6589	NC_022106	ACT	2	6	300082	300087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349757
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6592	NC_022106	CA	4	8	300142	300149	50 %	0 %	0 %	50 %	532349757
6593	NC_022106	ATC	2	6	300158	300163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349758
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6595	NC_022106	AT	3	6	300319	300324	50 %	50 %	0 %	0 %	532349758
6596	NC_022106	AAT	2	6	300329	300334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349758
6597	NC_022106	TCT	2	6	300345	300350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349758
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6601	NC_022106	TAA	2	6	300488	300493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349758
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6604	NC_022106	AAG	2	6	300745	300750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349758
6605	NC_022106	TGA	2	6	300755	300760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349758
6606	NC_022106	ATCT	2	8	300772	300779	25 %	50 %	0 %	25 %	532349758
6607	NC_022106	CTT	2	6	300793	300798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349758
6608	NC_022106	ACA	2	6	300873	300878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349758
6609	NC_022106	AT	3	6	300927	300932	50 %	50 %	0 %	0 %	532349758
6610	NC_022106	GTTA	2	8	300974	300981	25 %	50 %	25 %	0 %	532349758
6611	NC_022106	AGA	2	6	301034	301039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349758
6612	NC_022106	CAA	2	6	301129	301134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349758
6613	NC_022106	TTC	3	9	301180	301188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349758
6614	NC_022106	TGT	2	6	301226	301231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349758
6615	NC_022106	ATT	2	6	301280	301285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349758
6616	NC_022106	TGC	2	6	301295	301300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349758
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6619	NC_022106	A	6	6	301353	301358	100 %	0 %	0 %	0 %	532349758
6620	NC_022106	AGAGA	2	10	301368	301377	60 %	0 %	40 %	0 %	532349758
6621	NC_022106	GAA	2	6	301410	301415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349758
6622	NC_022106	CATTGC	2	12	301420	301431	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532349758
6623	NC_022106	GAA	2	6	301549	301554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349758
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