MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022106	TGG	2	6	274066	274071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349734
6002	NC_022106	GCA	2	6	274094	274099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349734
6003	NC_022106	TCT	2	6	274124	274129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349734
6004	NC_022106	TCCCT	2	10	274208	274217	0 %	40 %	0 %	60 %	532349734
6005	NC_022106	ATT	2	6	274226	274231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349734
6006	NC_022106	ATGG	2	8	274239	274246	25 %	25 %	50 %	0 %	532349734
6007	NC_022106	TCTT	2	8	274318	274325	0 %	75 %	0 %	25 %	532349734
6008	NC_022106	ATTT	2	8	274347	274354	25 %	75 %	0 %	0 %	532349734
6009	NC_022106	CAC	2	6	274385	274390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349734
6010	NC_022106	CAA	2	6	274394	274399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349734
6011	NC_022106	TAT	2	6	274411	274416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349734
6012	NC_022106	TCT	2	6	274498	274503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349734
6013	NC_022106	ATCCT	2	10	274512	274521	20 %	40 %	0 %	40 %	532349734
6014	NC_022106	GAT	2	6	274565	274570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349734
6015	NC_022106	AGA	2	6	274660	274665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349734
6016	NC_022106	TGA	2	6	274724	274729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349735
6017	NC_022106	AGGAG	2	10	274763	274772	40 %	0 %	60 %	0 %	532349735
6018	NC_022106	GCT	2	6	274863	274868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349735
6019	NC_022106	TGGAAT	2	12	274874	274885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349735
6020	NC_022106	AGC	2	6	274889	274894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349735
6021	NC_022106	ATT	2	6	274914	274919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349735
6022	NC_022106	TC	3	6	274939	274944	0 %	50 %	0 %	50 %	532349735
6023	NC_022106	TGC	2	6	274949	274954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349735
6024	NC_022106	GCA	2	6	274974	274979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349735
6025	NC_022106	TAT	2	6	274986	274991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349735
6026	NC_022106	GCT	2	6	275043	275048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349735
6027	NC_022106	CTT	2	6	275151	275156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349735
6028	NC_022106	AAC	2	6	275175	275180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349735
6029	NC_022106	AGA	2	6	275237	275242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349735
6030	NC_022106	AAG	2	6	275278	275283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349735
6031	NC_022106	GCT	2	6	275337	275342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349735
6032	NC_022106	AAC	2	6	275353	275358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349735
6033	NC_022106	CT	3	6	275367	275372	0 %	50 %	0 %	50 %	532349735
6034	NC_022106	ACGA	2	8	275390	275397	50 %	0 %	25 %	25 %	532349735
6035	NC_022106	CTC	2	6	275421	275426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349735
6036	NC_022106	A	7	7	275436	275442	100 %	0 %	0 %	0 %	532349735
6037	NC_022106	TTGTC	2	10	275450	275459	0 %	60 %	20 %	20 %	532349735
6038	NC_022106	GAA	2	6	275463	275468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349735
6039	NC_022106	ATT	2	6	275473	275478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349735
6040	NC_022106	ACG	2	6	275505	275510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349735
6041	NC_022106	ATC	2	6	275539	275544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349735
6042	NC_022106	CTC	2	6	275545	275550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349735
6043	NC_022106	ATA	2	6	275584	275589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349735
6044	NC_022106	A	6	6	275644	275649	100 %	0 %	0 %	0 %	532349735
6045	NC_022106	A	6	6	275734	275739	100 %	0 %	0 %	0 %	532349736
6046	NC_022106	TGGT	2	8	275823	275830	0 %	50 %	50 %	0 %	532349736
6047	NC_022106	AAG	2	6	275849	275854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349736
6048	NC_022106	GAA	2	6	275941	275946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349736
6049	NC_022106	TGT	2	6	275949	275954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349736
6050	NC_022106	ATG	2	6	276034	276039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349736
6051	NC_022106	TCCG	2	8	276044	276051	0 %	25 %	25 %	50 %	532349736
6052	NC_022106	ACC	2	6	276054	276059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349736
6053	NC_022106	CTC	2	6	276068	276073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349736
6054	NC_022106	A	7	7	276120	276126	100 %	0 %	0 %	0 %	532349736
6055	NC_022106	CT	3	6	276151	276156	0 %	50 %	0 %	50 %	532349736
6056	NC_022106	GGA	2	6	276178	276183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349736
6057	NC_022106	AAAG	2	8	276192	276199	75 %	0 %	25 %	0 %	532349736
6058	NC_022106	CTC	2	6	276212	276217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349736
6059	NC_022106	TA	3	6	276274	276279	50 %	50 %	0 %	0 %	532349736
6060	NC_022106	GAA	2	6	276280	276285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349736
6061	NC_022106	GCT	2	6	276328	276333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349736
6062	NC_022106	C	6	6	276380	276385	0 %	0 %	0 %	100 %	532349736
6063	NC_022106	ATT	2	6	276393	276398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349736
6064	NC_022106	CT	3	6	276427	276432	0 %	50 %	0 %	50 %	532349736
6065	NC_022106	ATTGT	2	10	276440	276449	20 %	60 %	20 %	0 %	532349736
6066	NC_022106	AATT	2	8	276486	276493	50 %	50 %	0 %	0 %	532349736
6067	NC_022106	ATT	2	6	276520	276525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349736
6068	NC_022106	A	6	6	276606	276611	100 %	0 %	0 %	0 %	532349736
6069	NC_022106	CAG	2	6	276661	276666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349736
6070	NC_022106	AGA	3	9	276675	276683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349736
6071	NC_022106	AGG	2	6	276690	276695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349736
6072	NC_022106	TTCT	2	8	276696	276703	0 %	75 %	0 %	25 %	532349736
6073	NC_022106	TCC	2	6	276756	276761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349736
6074	NC_022106	GCT	2	6	276766	276771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349736
6075	NC_022106	AAC	2	6	276797	276802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349736
6076	NC_022106	AGCT	2	8	276821	276828	25 %	25 %	25 %	25 %	532349736
6077	NC_022106	TGAT	2	8	276872	276879	25 %	50 %	25 %	0 %	532349736
6078	NC_022106	CTC	2	6	276919	276924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349736
6079	NC_022106	AAG	2	6	276954	276959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349736
6080	NC_022106	CTT	2	6	276971	276976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_022106	TCT	2	6	276977	276982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349737
6082	NC_022106	AAG	2	6	276983	276988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349737
6083	NC_022106	C	6	6	277059	277064	0 %	0 %	0 %	100 %	532349737
6084	NC_022106	CTT	2	6	277080	277085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349737
6085	NC_022106	TA	3	6	277137	277142	50 %	50 %	0 %	0 %	532349737
6086	NC_022106	TCT	2	6	277222	277227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349737
6087	NC_022106	GA	3	6	277229	277234	50 %	0 %	50 %	0 %	532349737
6088	NC_022106	TTG	2	6	277271	277276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349737
6089	NC_022106	AGA	2	6	277339	277344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349737
6090	NC_022106	CCAT	2	8	277399	277406	25 %	25 %	0 %	50 %	532349737
6091	NC_022106	ATT	2	6	277584	277589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349737
6092	NC_022106	AAC	2	6	277590	277595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349737
6093	NC_022106	GCT	2	6	277597	277602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349737
6094	NC_022106	ATT	2	6	277605	277610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349737
6095	NC_022106	CATAG	2	10	277635	277644	40 %	20 %	20 %	20 %	532349737
6096	NC_022106	TC	3	6	277688	277693	0 %	50 %	0 %	50 %	532349737
6097	NC_022106	AAAT	2	8	277720	277727	75 %	25 %	0 %	0 %	532349737
6098	NC_022106	GCT	2	6	277837	277842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349737
6099	NC_022106	AACTT	2	10	277976	277985	40 %	40 %	0 %	20 %	532349737
6100	NC_022106	CCAA	2	8	278000	278007	50 %	0 %	0 %	50 %	532349737
6101	NC_022106	CAA	2	6	278060	278065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349737
6102	NC_022106	CAA	2	6	278135	278140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349737
6103	NC_022106	CTTC	2	8	278173	278180	0 %	50 %	0 %	50 %	532349737
6104	NC_022106	ATA	2	6	278185	278190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349737
6105	NC_022106	ATAA	2	8	278265	278272	75 %	25 %	0 %	0 %	532349737
6106	NC_022106	GAA	2	6	278288	278293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349737
6107	NC_022106	AAAT	2	8	278301	278308	75 %	25 %	0 %	0 %	532349737
6108	NC_022106	TC	3	6	278319	278324	0 %	50 %	0 %	50 %	532349737
6109	NC_022106	GAA	2	6	278336	278341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349737
6110	NC_022106	TAA	2	6	278418	278423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349737
6111	NC_022106	CAT	2	6	278427	278432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349737
6112	NC_022106	ACG	2	6	278523	278528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349737
6113	NC_022106	ATT	2	6	278748	278753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349737
6114	NC_022106	GGAACA	2	12	278761	278772	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532349737
6115	NC_022106	ATGCT	2	10	278839	278848	20 %	40 %	20 %	20 %	532349737
6116	NC_022106	TCT	2	6	278960	278965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349737
6117	NC_022106	CAT	2	6	279083	279088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349737
6118	NC_022106	CTT	2	6	279137	279142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349737
6119	NC_022106	AGA	2	6	279154	279159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349737
6120	NC_022106	GTA	2	6	279216	279221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349737
6121	NC_022106	ATA	2	6	279243	279248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349737
6122	NC_022106	ACC	2	6	279266	279271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349737
6123	NC_022106	CCAT	2	8	279278	279285	25 %	25 %	0 %	50 %	532349737
6124	NC_022106	GAG	2	6	279338	279343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349737
6125	NC_022106	GCTT	2	8	279379	279386	0 %	50 %	25 %	25 %	532349737
6126	NC_022106	GTTT	2	8	279446	279453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_022106	ATATTA	2	12	279469	279480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6130	NC_022106	T	6	6	279560	279565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_022106	AGG	2	6	279571	279576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6142	NC_022106	TCT	2	6	279989	279994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349739
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6222	NC_022106	GGGA	2	8	283817	283824	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6223	NC_022106	CAAA	2	8	283862	283869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6224	NC_022106	C	6	6	284024	284029	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6225	NC_022106	AT	4	8	284083	284090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6226	NC_022106	CAT	2	6	284103	284108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349741
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6233	NC_022106	CAC	2	6	284588	284593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349741
6234	NC_022106	CCT	2	6	284622	284627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349741
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6236	NC_022106	AAGC	2	8	284692	284699	50 %	0 %	25 %	25 %	532349741
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6238	NC_022106	T	6	6	284765	284770	0 %	100 %	0 %	0 %	532349741
6239	NC_022106	CTC	2	6	284771	284776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349741
6240	NC_022106	GAT	2	6	284820	284825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349741
6241	NC_022106	A	7	7	284826	284832	100 %	0 %	0 %	0 %	532349741
6242	NC_022106	AG	3	6	284893	284898	50 %	0 %	50 %	0 %	532349741
6243	NC_022106	CT	3	6	284935	284940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6244	NC_022106	AGA	2	6	284946	284951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_022106	TAAA	2	8	284959	284966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_022106	A	6	6	284964	284969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6247	NC_022106	T	6	6	284984	284989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6248	NC_022106	A	6	6	285004	285009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6250	NC_022106	T	6	6	285154	285159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6495	NC_022106	ACT	2	6	295882	295887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349753
6496	NC_022106	ACT	2	6	295980	295985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349753
6497	NC_022106	AAG	2	6	296041	296046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349753
6498	NC_022106	AGC	2	6	296063	296068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349753
6499	NC_022106	AATT	2	8	296082	296089	50 %	50 %	0 %	0 %	532349753
6500	NC_022106	A	6	6	296106	296111	100 %	0 %	0 %	0 %	532349753

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