MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022106	CTT	2	6	251677	251682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349712
5502	NC_022106	ACA	2	6	251693	251698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349712
5503	NC_022106	TC	3	6	251735	251740	0 %	50 %	0 %	50 %	532349712
5504	NC_022106	TTG	2	6	251792	251797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349712
5505	NC_022106	TCT	2	6	251814	251819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349712
5506	NC_022106	T	7	7	251854	251860	0 %	100 %	0 %	0 %	532349712
5507	NC_022106	CAA	2	6	251871	251876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349712
5508	NC_022106	AGA	3	9	251944	251952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349712
5509	NC_022106	GGC	2	6	251955	251960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532349712
5510	NC_022106	ACA	2	6	251985	251990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349712
5511	NC_022106	CAC	2	6	251992	251997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349712
5512	NC_022106	CAG	2	6	251998	252003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349712
5513	NC_022106	T	8	8	252067	252074	0 %	100 %	0 %	0 %	532349712
5514	NC_022106	TCC	2	6	252158	252163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_022106	GAAA	2	8	252179	252186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_022106	T	7	7	252200	252206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_022106	GCAG	2	8	252228	252235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5518	NC_022106	AGAA	2	8	252261	252268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_022106	AG	3	6	252303	252308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_022106	TAT	2	6	252326	252331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_022106	ACA	2	6	252367	252372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_022106	A	6	6	252416	252421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_022106	TTG	2	6	252596	252601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349713
5524	NC_022106	TCT	2	6	252618	252623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349713
5525	NC_022106	TC	3	6	252665	252670	0 %	50 %	0 %	50 %	532349713
5526	NC_022106	T	7	7	252701	252707	0 %	100 %	0 %	0 %	532349713
5527	NC_022106	CCA	2	6	252714	252719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349713
5528	NC_022106	AAC	2	6	252767	252772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349713
5529	NC_022106	AATA	2	8	252821	252828	75 %	25 %	0 %	0 %	532349713
5530	NC_022106	GCT	2	6	252831	252836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349713
5531	NC_022106	ACA	2	6	252896	252901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349713
5532	NC_022106	CCA	2	6	252928	252933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349713
5533	NC_022106	CAA	2	6	252976	252981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349713
5534	NC_022106	CCCA	2	8	253084	253091	25 %	0 %	0 %	75 %	532349714
5535	NC_022106	CTT	2	6	253213	253218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349714
5536	NC_022106	AAT	2	6	253292	253297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349714
5537	NC_022106	CTC	2	6	253303	253308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349714
5538	NC_022106	ACT	2	6	253311	253316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349714
5539	NC_022106	GAA	2	6	253329	253334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349714
5540	NC_022106	CTC	2	6	253360	253365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349714
5541	NC_022106	GCAA	2	8	253374	253381	50 %	0 %	25 %	25 %	532349714
5542	NC_022106	AAC	2	6	253391	253396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349714
5543	NC_022106	GTT	2	6	253436	253441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349714
5544	NC_022106	AAC	2	6	253475	253480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_022106	A	6	6	253489	253494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_022106	TAA	2	6	253540	253545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_022106	TTC	2	6	253558	253563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349715
5548	NC_022106	GCT	2	6	253590	253595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349715
5549	NC_022106	T	7	7	253599	253605	0 %	100 %	0 %	0 %	532349715
5550	NC_022106	AGCA	2	8	253636	253643	50 %	0 %	25 %	25 %	532349715
5551	NC_022106	CTT	2	6	253653	253658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349715
5552	NC_022106	TCT	3	9	253664	253672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349715
5553	NC_022106	GATAA	2	10	253692	253701	60 %	20 %	20 %	0 %	532349715
5554	NC_022106	TCG	2	6	253758	253763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349715
5555	NC_022106	CATA	2	8	253779	253786	50 %	25 %	0 %	25 %	532349715
5556	NC_022106	TCC	2	6	253798	253803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349715
5557	NC_022106	TAA	2	6	253831	253836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349715
5558	NC_022106	AG	3	6	253856	253861	50 %	0 %	50 %	0 %	532349715
5559	NC_022106	A	6	6	253875	253880	100 %	0 %	0 %	0 %	532349715
5560	NC_022106	AGA	2	6	253886	253891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349715
5561	NC_022106	CAC	2	6	253893	253898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349715
5562	NC_022106	CAA	2	6	253939	253944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349715
5563	NC_022106	GTA	2	6	253961	253966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349715
5564	NC_022106	ACA	2	6	254020	254025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349715
5565	NC_022106	A	8	8	254060	254067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_022106	TA	3	6	254109	254114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_022106	CCAA	2	8	254144	254151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_022106	A	7	7	254168	254174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_022106	TAT	2	6	254187	254192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349716
5570	NC_022106	TTCA	2	8	254219	254226	25 %	50 %	0 %	25 %	532349716
5571	NC_022106	AGA	2	6	254255	254260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349716
5572	NC_022106	TGTT	2	8	254293	254300	0 %	75 %	25 %	0 %	532349716
5573	NC_022106	CGA	2	6	254414	254419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349716
5574	NC_022106	GCAAA	2	10	254426	254435	60 %	0 %	20 %	20 %	532349716
5575	NC_022106	AATA	2	8	254512	254519	75 %	25 %	0 %	0 %	532349716
5576	NC_022106	A	6	6	254578	254583	100 %	0 %	0 %	0 %	532349716
5577	NC_022106	A	7	7	254609	254615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_022106	ATA	2	6	254622	254627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_022106	AACCCT	2	12	254668	254679	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_022106	AAAC	2	8	254751	254758	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5581	NC_022106	AAG	2	6	254875	254880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349717
5582	NC_022106	AGC	2	6	254909	254914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349717
5583	NC_022106	CAAT	2	8	255015	255022	50 %	25 %	0 %	25 %	532349717
5584	NC_022106	TTA	2	6	255087	255092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349717
5585	NC_022106	CTTCT	2	10	255119	255128	0 %	60 %	0 %	40 %	532349717
5586	NC_022106	T	6	6	255162	255167	0 %	100 %	0 %	0 %	532349717
5587	NC_022106	CA	3	6	255221	255226	50 %	0 %	0 %	50 %	532349717
5588	NC_022106	AAT	2	6	255236	255241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349717
5589	NC_022106	GCA	2	6	255246	255251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349717
5590	NC_022106	ACA	2	6	255312	255317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349717
5591	NC_022106	TTG	2	6	255376	255381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349717
5592	NC_022106	AGA	2	6	255431	255436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349717
5593	NC_022106	TAG	2	6	255451	255456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349717
5594	NC_022106	ATTTTT	2	12	255472	255483	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_022106	GAG	2	6	255600	255605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_022106	ATT	2	6	255612	255617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349718
5597	NC_022106	T	6	6	255616	255621	0 %	100 %	0 %	0 %	532349718
5598	NC_022106	ACG	2	6	255622	255627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349718
5599	NC_022106	CCTGCA	2	12	255633	255644	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532349718
5600	NC_022106	CTG	2	6	255690	255695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349718
5601	NC_022106	TTG	2	6	255721	255726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349718
5602	NC_022106	TCTG	2	8	255746	255753	0 %	50 %	25 %	25 %	532349718
5603	NC_022106	TCC	2	6	255776	255781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349718
5604	NC_022106	TTC	2	6	255832	255837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349718
5605	NC_022106	CGA	2	6	255866	255871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349718
5606	NC_022106	TTC	2	6	255913	255918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349718
5607	NC_022106	ACG	2	6	255973	255978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349718
5608	NC_022106	AACC	2	8	256017	256024	50 %	0 %	0 %	50 %	532349718
5609	NC_022106	AAG	2	6	256050	256055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349718
5610	NC_022106	CTG	2	6	256074	256079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349718
5611	NC_022106	GCT	2	6	256202	256207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349718
5612	NC_022106	ATTT	2	8	256259	256266	25 %	75 %	0 %	0 %	532349718
5613	NC_022106	TAT	2	6	256304	256309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_022106	ATA	2	6	256313	256318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_022106	AAT	2	6	256337	256342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_022106	A	8	8	256417	256424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_022106	TC	3	6	256425	256430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_022106	TC	3	6	256511	256516	0 %	50 %	0 %	50 %	532349719
5619	NC_022106	A	6	6	256520	256525	100 %	0 %	0 %	0 %	532349719
5620	NC_022106	ATG	2	6	256531	256536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349719
5621	NC_022106	ATCT	2	8	256580	256587	25 %	50 %	0 %	25 %	532349719
5622	NC_022106	T	7	7	256622	256628	0 %	100 %	0 %	0 %	532349719
5623	NC_022106	GCT	2	6	256632	256637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349719
5624	NC_022106	CTT	2	6	256642	256647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349719
5625	NC_022106	T	6	6	256663	256668	0 %	100 %	0 %	0 %	532349719
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5627	NC_022106	TTA	2	6	256796	256801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349719
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5986	NC_022106	TCTA	2	8	273458	273465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5987	NC_022106	T	9	9	273489	273497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5991	NC_022106	A	7	7	273761	273767	100 %	0 %	0 %	0 %	532349734
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5996	NC_022106	T	7	7	273905	273911	0 %	100 %	0 %	0 %	532349734
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6000	NC_022106	TG	3	6	274029	274034	0 %	50 %	50 %	0 %	532349734

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