MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022106	ATT	2	6	228191	228196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349691
5002	NC_022106	AGA	2	6	228253	228258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349691
5003	NC_022106	TC	3	6	228259	228264	0 %	50 %	0 %	50 %	532349691
5004	NC_022106	TGA	2	6	228286	228291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349691
5005	NC_022106	TCG	2	6	228375	228380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349691
5006	NC_022106	A	7	7	228447	228453	100 %	0 %	0 %	0 %	532349691
5007	NC_022106	CCTT	2	8	228455	228462	0 %	50 %	0 %	50 %	532349691
5008	NC_022106	TTG	2	6	228477	228482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349691
5009	NC_022106	T	6	6	228513	228518	0 %	100 %	0 %	0 %	532349691
5010	NC_022106	GATA	2	8	228550	228557	50 %	25 %	25 %	0 %	532349691
5011	NC_022106	ATT	2	6	228590	228595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349691
5012	NC_022106	GAA	2	6	228599	228604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349691
5013	NC_022106	TCCTC	2	10	228630	228639	0 %	40 %	0 %	60 %	532349691
5014	NC_022106	AGA	2	6	228664	228669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349691
5015	NC_022106	CTT	2	6	228756	228761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349692
5016	NC_022106	TAC	2	6	228858	228863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349692
5017	NC_022106	TAT	2	6	228867	228872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349692
5018	NC_022106	TCT	2	6	228927	228932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349692
5019	NC_022106	TTTC	2	8	229003	229010	0 %	75 %	0 %	25 %	532349692
5020	NC_022106	CTT	2	6	229065	229070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349692
5021	NC_022106	TTA	2	6	229132	229137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349692
5022	NC_022106	TGT	2	6	229188	229193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349692
5023	NC_022106	T	6	6	229257	229262	0 %	100 %	0 %	0 %	532349692
5024	NC_022106	TAT	2	6	229332	229337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349692
5025	NC_022106	ATT	2	6	229411	229416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349692
5026	NC_022106	CAC	2	6	229457	229462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349692
5027	NC_022106	GAA	2	6	229477	229482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349692
5028	NC_022106	ATT	2	6	229543	229548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349692
5029	NC_022106	CAA	2	6	229610	229615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349692
5030	NC_022106	TTCT	2	8	229679	229686	0 %	75 %	0 %	25 %	532349692
5031	NC_022106	ACT	2	6	229690	229695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349692
5032	NC_022106	ATG	2	6	229732	229737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349692
5033	NC_022106	CTTC	2	8	229739	229746	0 %	50 %	0 %	50 %	532349692
5034	NC_022106	TTAT	2	8	229841	229848	25 %	75 %	0 %	0 %	532349692
5035	NC_022106	CTAT	2	8	229860	229867	25 %	50 %	0 %	25 %	532349692
5036	NC_022106	TCTT	2	8	229907	229914	0 %	75 %	0 %	25 %	532349692
5037	NC_022106	TGC	2	6	229950	229955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349692
5038	NC_022106	CTTAGC	2	12	229956	229967	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532349692
5039	NC_022106	GGA	2	6	229987	229992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349692
5040	NC_022106	CA	3	6	229995	230000	50 %	0 %	0 %	50 %	532349692
5041	NC_022106	TGG	2	6	230059	230064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349692
5042	NC_022106	TTGG	2	8	230103	230110	0 %	50 %	50 %	0 %	532349692
5043	NC_022106	TGG	3	9	230122	230130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349692
5044	NC_022106	GTC	2	6	230176	230181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349693
5045	NC_022106	CTT	2	6	230214	230219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349693
5046	NC_022106	AGA	2	6	230260	230265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349693
5047	NC_022106	CTT	2	6	230282	230287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349693
5048	NC_022106	CTA	2	6	230341	230346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349693
5049	NC_022106	ATTT	2	8	230350	230357	25 %	75 %	0 %	0 %	532349693
5050	NC_022106	TGG	2	6	230428	230433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349693
5051	NC_022106	AAT	3	9	230528	230536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349693
5052	NC_022106	GAA	2	6	230627	230632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349693
5053	NC_022106	GC	3	6	230639	230644	0 %	0 %	50 %	50 %	532349693
5054	NC_022106	ATT	2	6	230687	230692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349693
5055	NC_022106	GCA	2	6	230800	230805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349693
5056	NC_022106	CTA	2	6	230841	230846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349693
5057	NC_022106	CATC	2	8	230856	230863	25 %	25 %	0 %	50 %	532349693
5058	NC_022106	TTA	2	6	230913	230918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349693
5059	NC_022106	TCT	3	9	230933	230941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349693
5060	NC_022106	A	6	6	231009	231014	100 %	0 %	0 %	0 %	532349693
5061	NC_022106	GCT	2	6	231068	231073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349693
5062	NC_022106	TCT	2	6	231203	231208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349693
5063	NC_022106	T	6	6	231382	231387	0 %	100 %	0 %	0 %	532349693
5064	NC_022106	GC	3	6	231541	231546	0 %	0 %	50 %	50 %	532349693
5065	NC_022106	GAC	2	6	231568	231573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349693
5066	NC_022106	A	8	8	231610	231617	100 %	0 %	0 %	0 %	532349693
5067	NC_022106	TAA	2	6	231646	231651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349693
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5069	NC_022106	GGA	2	6	231727	231732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349693
5070	NC_022106	TGA	2	6	231742	231747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349693
5071	NC_022106	TCC	2	6	231751	231756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349693
5072	NC_022106	AATG	2	8	231779	231786	50 %	25 %	25 %	0 %	532349693
5073	NC_022106	ATT	2	6	231828	231833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349693
5074	NC_022106	ATG	2	6	231874	231879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349694
5075	NC_022106	CAA	2	6	231880	231885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349694
5076	NC_022106	A	6	6	231906	231911	100 %	0 %	0 %	0 %	532349694
5077	NC_022106	A	6	6	231980	231985	100 %	0 %	0 %	0 %	532349694
5078	NC_022106	AAG	2	6	232076	232081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349694
5079	NC_022106	A	6	6	232175	232180	100 %	0 %	0 %	0 %	532349694
5080	NC_022106	AGG	2	6	232245	232250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349694
5081	NC_022106	TGC	2	6	232296	232301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349694
5082	NC_022106	AGA	2	6	232338	232343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349694
5083	NC_022106	CT	3	6	232365	232370	0 %	50 %	0 %	50 %	532349694
5084	NC_022106	C	6	6	232377	232382	0 %	0 %	0 %	100 %	532349694
5085	NC_022106	A	6	6	232417	232422	100 %	0 %	0 %	0 %	532349694
5086	NC_022106	AAG	2	6	232478	232483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349694
5087	NC_022106	TTAC	2	8	232494	232501	25 %	50 %	0 %	25 %	532349694
5088	NC_022106	TCA	2	6	232533	232538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349694
5089	NC_022106	AT	3	6	232582	232587	50 %	50 %	0 %	0 %	532349694
5090	NC_022106	TCA	2	6	232599	232604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349694
5091	NC_022106	ATT	2	6	232659	232664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349694
5092	NC_022106	CT	3	6	232683	232688	0 %	50 %	0 %	50 %	532349694
5093	NC_022106	CTT	2	6	232786	232791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349695
5094	NC_022106	GCTA	2	8	232811	232818	25 %	25 %	25 %	25 %	532349695
5095	NC_022106	CTT	3	9	232873	232881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349695
5096	NC_022106	AGG	2	6	232913	232918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349695
5097	NC_022106	ATT	2	6	232952	232957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349695
5098	NC_022106	TAA	2	6	232976	232981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349695
5099	NC_022106	TTA	2	6	233002	233007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349695
5100	NC_022106	TA	3	6	233035	233040	50 %	50 %	0 %	0 %	532349695
5101	NC_022106	ATT	2	6	233068	233073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349695
5102	NC_022106	CT	3	6	233097	233102	0 %	50 %	0 %	50 %	532349695
5103	NC_022106	A	6	6	233113	233118	100 %	0 %	0 %	0 %	532349695
5104	NC_022106	CAAAA	2	10	233120	233129	80 %	0 %	0 %	20 %	532349695
5105	NC_022106	AGA	2	6	233134	233139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349695
5106	NC_022106	A	8	8	233159	233166	100 %	0 %	0 %	0 %	532349695
5107	NC_022106	AGG	2	6	233192	233197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349695
5108	NC_022106	CAG	2	6	233260	233265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349695
5109	NC_022106	A	6	6	233300	233305	100 %	0 %	0 %	0 %	532349695
5110	NC_022106	TTCT	2	8	233386	233393	0 %	75 %	0 %	25 %	532349695
5111	NC_022106	CAT	2	6	233406	233411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349695
5112	NC_022106	GAA	2	6	233496	233501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349695
5113	NC_022106	CAAA	2	8	233618	233625	75 %	0 %	0 %	25 %	532349695
5114	NC_022106	CAA	2	6	233703	233708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349695
5115	NC_022106	TCTCT	2	10	233734	233743	0 %	60 %	0 %	40 %	532349695
5116	NC_022106	CTT	2	6	233833	233838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349695
5117	NC_022106	TC	3	6	233976	233981	0 %	50 %	0 %	50 %	532349695
5118	NC_022106	ATG	2	6	234078	234083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349695
5119	NC_022106	TCAA	2	8	234100	234107	50 %	25 %	0 %	25 %	532349695
5120	NC_022106	TTA	2	6	234189	234194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349695
5121	NC_022106	GAA	2	6	234234	234239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349695
5122	NC_022106	TTG	2	6	234247	234252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349695
5123	NC_022106	AAC	2	6	234324	234329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_022106	AGA	2	6	234351	234356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_022106	GAG	2	6	234368	234373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_022106	GCT	2	6	234420	234425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_022106	ACC	2	6	234429	234434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_022106	A	6	6	234460	234465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_022106	ACT	2	6	234524	234529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_022106	TTC	2	6	234626	234631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349696
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5132	NC_022106	T	7	7	234675	234681	0 %	100 %	0 %	0 %	532349696
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5134	NC_022106	CTT	2	6	234742	234747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349696
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5137	NC_022106	CCT	2	6	234843	234848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349696
5138	NC_022106	TCC	2	6	234866	234871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349696
5139	NC_022106	CTG	2	6	234886	234891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349696
5140	NC_022106	AAG	2	6	234952	234957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349696
5141	NC_022106	TAG	2	6	234998	235003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349696
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5144	NC_022106	GTT	2	6	235270	235275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349696
5145	NC_022106	GTA	2	6	235291	235296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349696
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5153	NC_022106	AAG	2	6	235637	235642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349696
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5156	NC_022106	A	6	6	235780	235785	100 %	0 %	0 %	0 %	532349696
5157	NC_022106	A	7	7	235802	235808	100 %	0 %	0 %	0 %	532349696
5158	NC_022106	CAT	2	6	235825	235830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349696
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5162	NC_022106	ATA	2	6	235982	235987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349697
5163	NC_022106	CTGT	2	8	236034	236041	0 %	50 %	25 %	25 %	532349697
5164	NC_022106	AAC	2	6	236105	236110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349697
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5168	NC_022106	TTGA	2	8	236644	236651	25 %	50 %	25 %	0 %	532349697
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5170	NC_022106	AAGT	2	8	236725	236732	50 %	25 %	25 %	0 %	532349697
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5179	NC_022106	CTT	2	6	237234	237239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349697
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5187	NC_022106	A	7	7	237899	237905	100 %	0 %	0 %	0 %	532349697
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5192	NC_022106	TCT	2	6	238289	238294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349697
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5194	NC_022106	TC	3	6	238349	238354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5195	NC_022106	AG	3	6	238375	238380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5203	NC_022106	CTG	2	6	238872	238877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349698
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5236	NC_022106	T	7	7	240817	240823	0 %	100 %	0 %	0 %	532349701
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5240	NC_022106	CTA	2	6	241134	241139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349701
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5242	NC_022106	T	6	6	241173	241178	0 %	100 %	0 %	0 %	532349701
5243	NC_022106	CTC	2	6	241197	241202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349701
5244	NC_022106	TCCA	2	8	241240	241247	25 %	25 %	0 %	50 %	532349701
5245	NC_022106	CT	3	6	241393	241398	0 %	50 %	0 %	50 %	532349701
5246	NC_022106	CA	4	8	241423	241430	50 %	0 %	0 %	50 %	532349701
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5249	NC_022106	GTT	2	6	241515	241520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349701
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5252	NC_022106	CT	3	6	241672	241677	0 %	50 %	0 %	50 %	532349702
5253	NC_022106	TAG	2	6	241711	241716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349702
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5257	NC_022106	T	8	8	241799	241806	0 %	100 %	0 %	0 %	532349702
5258	NC_022106	TGA	2	6	241808	241813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349702
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5370	NC_022106	TC	3	6	246380	246385	0 %	50 %	0 %	50 %	532349705
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5381	NC_022106	ATA	2	6	246924	246929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5382	NC_022106	TTA	2	6	246945	246950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5469	NC_022106	GA	3	6	250383	250388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5470	NC_022106	ACT	2	6	250443	250448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5471	NC_022106	TG	3	6	250493	250498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5472	NC_022106	AATA	2	8	250560	250567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5473	NC_022106	T	6	6	250582	250587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5474	NC_022106	T	7	7	250601	250607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5475	NC_022106	A	6	6	250609	250614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5480	NC_022106	TTG	2	6	250786	250791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5481	NC_022106	CAAA	2	8	250950	250957	75 %	0 %	0 %	25 %	532349711
5482	NC_022106	ATA	2	6	250973	250978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349711
5483	NC_022106	CAAT	2	8	251060	251067	50 %	25 %	0 %	25 %	532349711
5484	NC_022106	CTTT	3	12	251112	251123	0 %	75 %	0 %	25 %	532349711
5485	NC_022106	CGA	2	6	251154	251159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349711
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5488	NC_022106	CTC	2	6	251206	251211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5489	NC_022106	CAA	2	6	251250	251255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5490	NC_022106	AG	3	6	251295	251300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5491	NC_022106	A	8	8	251301	251308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_022106	AG	3	6	251320	251325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_022106	CAT	4	12	251368	251379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349712
5494	NC_022106	TTA	2	6	251514	251519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349712
5495	NC_022106	CTC	2	6	251545	251550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349712
5496	NC_022106	AGT	2	6	251569	251574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349712
5497	NC_022106	GCAG	2	8	251616	251623	25 %	0 %	50 %	25 %	532349712
5498	NC_022106	TCTT	2	8	251633	251640	0 %	75 %	0 %	25 %	532349712
5499	NC_022106	C	7	7	251645	251651	0 %	0 %	0 %	100 %	532349712
5500	NC_022106	AGA	2	6	251661	251666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349712

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