MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/971

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_021899	T	6	6	584611	584616	0 %	100 %	0 %	0 %	527328827
13003	NC_021899	AGC	2	6	584619	584624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328827
13004	NC_021899	AAACT	2	10	584722	584731	60 %	20 %	0 %	20 %	527328827
13005	NC_021899	CCT	2	6	584737	584742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328827
13006	NC_021899	AAC	2	6	584745	584750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328827
13007	NC_021899	ACA	2	6	584754	584759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328827
13008	NC_021899	GAC	2	6	584766	584771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328827
13009	NC_021899	CT	3	6	584858	584863	0 %	50 %	0 %	50 %	527328828
13010	NC_021899	CTA	2	6	584884	584889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328828
13011	NC_021899	CTC	2	6	584908	584913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328828
13012	NC_021899	AAC	2	6	584921	584926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328828
13013	NC_021899	T	6	6	584994	584999	0 %	100 %	0 %	0 %	527328828
13014	NC_021899	AAAT	2	8	585040	585047	75 %	25 %	0 %	0 %	527328828
13015	NC_021899	CAT	2	6	585067	585072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328828
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13017	NC_021899	T	6	6	585236	585241	0 %	100 %	0 %	0 %	527328829
13018	NC_021899	GCT	2	6	585252	585257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328829
13019	NC_021899	ACG	2	6	585269	585274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328829
13020	NC_021899	AACT	2	8	585359	585366	50 %	25 %	0 %	25 %	527328829
13021	NC_021899	GTCT	2	8	585601	585608	0 %	50 %	25 %	25 %	527328829
13022	NC_021899	CAA	2	6	585628	585633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328829
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13024	NC_021899	TCA	2	6	585717	585722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328829
13025	NC_021899	ACCAA	2	10	585814	585823	60 %	0 %	0 %	40 %	527328830
13026	NC_021899	CGC	2	6	585835	585840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527328830
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13030	NC_021899	TCT	2	6	586050	586055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328830
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13033	NC_021899	ATTC	2	8	586318	586325	25 %	50 %	0 %	25 %	527328831
13034	NC_021899	ATC	2	6	586375	586380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328831
13035	NC_021899	CATA	2	8	586482	586489	50 %	25 %	0 %	25 %	527328831
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13038	NC_021899	TCTT	2	8	586731	586738	0 %	75 %	0 %	25 %	527328831
13039	NC_021899	TA	3	6	586749	586754	50 %	50 %	0 %	0 %	527328831
13040	NC_021899	T	7	7	586756	586762	0 %	100 %	0 %	0 %	527328831
13041	NC_021899	TC	4	8	586784	586791	0 %	50 %	0 %	50 %	527328832
13042	NC_021899	GAA	2	6	586809	586814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328832
13043	NC_021899	ACGT	2	8	586901	586908	25 %	25 %	25 %	25 %	527328832
13044	NC_021899	GAG	2	6	586921	586926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527328832
13045	NC_021899	T	6	6	586977	586982	0 %	100 %	0 %	0 %	527328832
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13053	NC_021899	ATCAC	2	10	587376	587385	40 %	20 %	0 %	40 %	527328833
13054	NC_021899	CGA	2	6	587403	587408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328833
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13065	NC_021899	TAT	2	6	587785	587790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328835
13066	NC_021899	TGA	2	6	587828	587833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328835
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13069	NC_021899	AG	3	6	587880	587885	50 %	0 %	50 %	0 %	527328835
13070	NC_021899	T	6	6	587887	587892	0 %	100 %	0 %	0 %	527328835
13071	NC_021899	TC	3	6	587931	587936	0 %	50 %	0 %	50 %	527328835
13072	NC_021899	TAA	2	6	587947	587952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328835
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13079	NC_021899	GGC	2	6	588253	588258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527328836
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13089	NC_021899	CCGA	2	8	588600	588607	25 %	0 %	25 %	50 %	527328837
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13091	NC_021899	CGA	2	6	588747	588752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328837
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13100	NC_021899	T	6	6	589297	589302	0 %	100 %	0 %	0 %	527328838
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13103	NC_021899	GTAT	2	8	589413	589420	25 %	50 %	25 %	0 %	527328838
13104	NC_021899	T	6	6	589465	589470	0 %	100 %	0 %	0 %	527328839
13105	NC_021899	TTG	2	6	589494	589499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328839
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13107	NC_021899	ACG	2	6	589615	589620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328839
13108	NC_021899	TCT	2	6	589644	589649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328839
13109	NC_021899	TGA	2	6	589685	589690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328839
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13111	NC_021899	TTA	2	6	589759	589764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328840
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13113	NC_021899	CGA	2	6	589918	589923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328840
13114	NC_021899	AC	3	6	589942	589947	50 %	0 %	0 %	50 %	527328840
13115	NC_021899	TTCA	2	8	589995	590002	25 %	50 %	0 %	25 %	527328840
13116	NC_021899	GAT	2	6	590058	590063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527328840
13117	NC_021899	GCA	2	6	590166	590171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328840
13118	NC_021899	CTTC	2	8	590188	590195	0 %	50 %	0 %	50 %	527328840
13119	NC_021899	TTA	2	6	590341	590346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328840
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13494	NC_021899	TAT	2	6	607706	607711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328859
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