MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_021896	CCT	2	6	630800	630805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326103
14003	NC_021896	AAG	2	6	630807	630812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326103
14004	NC_021896	TCC	2	6	630818	630823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326103
14005	NC_021896	CCT	2	6	630915	630920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326103
14006	NC_021896	ATT	2	6	630932	630937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326103
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14009	NC_021896	CCT	2	6	630980	630985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326103
14010	NC_021896	A	6	6	631067	631072	100 %	0 %	0 %	0 %	527326103
14011	NC_021896	TCGAG	2	10	631077	631086	20 %	20 %	40 %	20 %	527326103
14012	NC_021896	T	6	6	631104	631109	0 %	100 %	0 %	0 %	527326103
14013	NC_021896	TTG	2	6	631134	631139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326103
14014	NC_021896	TCCT	2	8	631169	631176	0 %	50 %	0 %	50 %	527326103
14015	NC_021896	CAA	2	6	631253	631258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326103
14016	NC_021896	ATC	2	6	631280	631285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326103
14017	NC_021896	TCA	2	6	631296	631301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326103
14018	NC_021896	CTTT	2	8	631350	631357	0 %	75 %	0 %	25 %	527326103
14019	NC_021896	ATG	3	9	631400	631408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326103
14020	NC_021896	TC	4	8	631425	631432	0 %	50 %	0 %	50 %	527326103
14021	NC_021896	CTA	2	6	631478	631483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326103
14022	NC_021896	TGA	2	6	631491	631496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326103
14023	NC_021896	CAA	2	6	631535	631540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326104
14024	NC_021896	TTTG	2	8	631554	631561	0 %	75 %	25 %	0 %	527326104
14025	NC_021896	TTA	2	6	631582	631587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326104
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14027	NC_021896	TAT	2	6	631611	631616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326104
14028	NC_021896	TGG	2	6	631640	631645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527326104
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14032	NC_021896	GGCTC	2	10	631841	631850	0 %	20 %	40 %	40 %	527326105
14033	NC_021896	TA	3	6	631864	631869	50 %	50 %	0 %	0 %	527326105
14034	NC_021896	AGCC	2	8	631877	631884	25 %	0 %	25 %	50 %	527326105
14035	NC_021896	TCTT	2	8	631901	631908	0 %	75 %	0 %	25 %	527326105
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14038	NC_021896	TGC	2	6	632015	632020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326105
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14040	NC_021896	TGC	2	6	632145	632150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326105
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14050	NC_021896	CTAC	2	8	632529	632536	25 %	25 %	0 %	50 %	527326105
14051	NC_021896	TGG	2	6	632584	632589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527326105
14052	NC_021896	ATT	2	6	632609	632614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326105
14053	NC_021896	CTA	2	6	632642	632647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326105
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14056	NC_021896	CTCC	2	8	632698	632705	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14057	NC_021896	A	6	6	632706	632711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14059	NC_021896	TTG	2	6	632745	632750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14065	NC_021896	TG	3	6	633112	633117	0 %	50 %	50 %	0 %	527326106
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14068	NC_021896	T	6	6	633218	633223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_021896	A	6	6	633284	633289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_021896	TCT	2	6	633306	633311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326107
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14103	NC_021896	A	6	6	634579	634584	100 %	0 %	0 %	0 %	527326108
14104	NC_021896	CTCTTT	2	12	634682	634693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326108
14105	NC_021896	ATATCC	2	12	634699	634710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326108
14106	NC_021896	AGC	2	6	634737	634742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326108
14107	NC_021896	T	6	6	634797	634802	0 %	100 %	0 %	0 %	527326108
14108	NC_021896	TAAACA	2	12	634810	634821	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	527326108
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14111	NC_021896	GA	3	6	635012	635017	50 %	0 %	50 %	0 %	527326109
14112	NC_021896	TCC	2	6	635048	635053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326109
14113	NC_021896	A	7	7	635059	635065	100 %	0 %	0 %	0 %	527326109
14114	NC_021896	ATGC	2	8	635075	635082	25 %	25 %	25 %	25 %	527326109
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14116	NC_021896	GA	4	8	635174	635181	50 %	0 %	50 %	0 %	527326109
14117	NC_021896	AAG	2	6	635182	635187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326109
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14120	NC_021896	ACA	2	6	635277	635282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326110
14121	NC_021896	TCAT	2	8	635298	635305	25 %	50 %	0 %	25 %	527326110
14122	NC_021896	AAG	2	6	635312	635317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326110
14123	NC_021896	TCT	2	6	635319	635324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326110
14124	NC_021896	AAG	2	6	635339	635344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326110
14125	NC_021896	TTTC	2	8	635345	635352	0 %	75 %	0 %	25 %	527326110
14126	NC_021896	CAC	2	6	635361	635366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527326110
14127	NC_021896	TCT	2	6	635373	635378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326110
14128	NC_021896	CAT	2	6	635438	635443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326110
14129	NC_021896	CCA	2	6	635532	635537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527326110
14130	NC_021896	ATA	2	6	635538	635543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326110
14131	NC_021896	CAT	2	6	635564	635569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326110
14132	NC_021896	T	8	8	635596	635603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_021896	TTC	2	6	635607	635612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14134	NC_021896	CCT	2	6	635621	635626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14135	NC_021896	GAA	2	6	635660	635665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326111
14136	NC_021896	AATC	2	8	635679	635686	50 %	25 %	0 %	25 %	527326111
14137	NC_021896	ACC	2	6	635794	635799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527326111
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14139	NC_021896	TCC	2	6	635889	635894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326111
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14146	NC_021896	TCC	2	6	636150	636155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326111
14147	NC_021896	TTTC	2	8	636245	636252	0 %	75 %	0 %	25 %	527326111
14148	NC_021896	AGAA	2	8	636274	636281	75 %	0 %	25 %	0 %	527326111
14149	NC_021896	CAC	2	6	636282	636287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527326111
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14153	NC_021896	AAG	2	6	636518	636523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326111
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14155	NC_021896	TAA	3	9	636603	636611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326111
14156	NC_021896	TC	4	8	636663	636670	0 %	50 %	0 %	50 %	527326111
14157	NC_021896	AGC	2	6	636705	636710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326111
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14159	NC_021896	CT	3	6	636717	636722	0 %	50 %	0 %	50 %	527326111
14160	NC_021896	CGT	2	6	636757	636762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326111
14161	NC_021896	T	6	6	636762	636767	0 %	100 %	0 %	0 %	527326111
14162	NC_021896	CCT	2	6	636811	636816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14163	NC_021896	CGGAA	2	10	637027	637036	40 %	0 %	40 %	20 %	527326112
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14165	NC_021896	CA	3	6	637124	637129	50 %	0 %	0 %	50 %	527326112
14166	NC_021896	TTG	2	6	637189	637194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326112
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14171	NC_021896	TA	3	6	637513	637518	50 %	50 %	0 %	0 %	527326112
14172	NC_021896	GTC	2	6	637524	637529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326112
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14182	NC_021896	AAT	2	6	638108	638113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326112
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14187	NC_021896	A	6	6	638262	638267	100 %	0 %	0 %	0 %	527326112
14188	NC_021896	CAT	2	6	638318	638323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326112
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14218	NC_021896	AGCG	2	8	639595	639602	25 %	0 %	50 %	25 %	527326113
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14228	NC_021896	C	9	9	640253	640261	0 %	0 %	0 %	100 %	527326113
14229	NC_021896	GTT	2	6	640307	640312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326113
14230	NC_021896	TC	3	6	640361	640366	0 %	50 %	0 %	50 %	527326113
14231	NC_021896	GA	3	6	640377	640382	50 %	0 %	50 %	0 %	527326113
14232	NC_021896	CTT	2	6	640388	640393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326113
14233	NC_021896	CAT	2	6	640412	640417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326113
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14235	NC_021896	TCC	2	6	640596	640601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326114
14236	NC_021896	CAA	2	6	640694	640699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326114
14237	NC_021896	TCT	2	6	640807	640812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326114
14238	NC_021896	ATC	2	6	640866	640871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326114
14239	NC_021896	AGAA	2	8	640875	640882	75 %	0 %	25 %	0 %	527326114
14240	NC_021896	CTG	2	6	640898	640903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326114
14241	NC_021896	TAA	2	6	640904	640909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326114
14242	NC_021896	GAA	2	6	640978	640983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326114
14243	NC_021896	CTG	2	6	641004	641009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326114
14244	NC_021896	TCA	2	6	641012	641017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326114
14245	NC_021896	CAT	2	6	641046	641051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326114
14246	NC_021896	ATC	2	6	641055	641060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326114
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14248	NC_021896	CA	3	6	641274	641279	50 %	0 %	0 %	50 %	527326114
14249	NC_021896	GCT	2	6	641288	641293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326114
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14251	NC_021896	CCT	2	6	641404	641409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326114
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14255	NC_021896	GAA	2	6	641531	641536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326114
14256	NC_021896	CTT	2	6	641558	641563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326114
14257	NC_021896	A	8	8	641590	641597	100 %	0 %	0 %	0 %	527326114
14258	NC_021896	TTA	2	6	641623	641628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326114
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14261	NC_021896	CTG	2	6	641729	641734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326114
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14264	NC_021896	AAC	2	6	641820	641825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14265	NC_021896	A	6	6	641834	641839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14266	NC_021896	A	8	8	641866	641873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14267	NC_021896	T	7	7	641906	641912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14268	NC_021896	A	7	7	641916	641922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14269	NC_021896	A	7	7	641924	641930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14270	NC_021896	TTAAAT	2	12	641986	641997	50 %	50 %	0 %	0 %	527326115
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14272	NC_021896	CT	3	6	642140	642145	0 %	50 %	0 %	50 %	527326115
14273	NC_021896	ATGA	2	8	642167	642174	50 %	25 %	25 %	0 %	527326115
14274	NC_021896	TCCAT	2	10	642183	642192	20 %	40 %	0 %	40 %	527326115
14275	NC_021896	ATCC	2	8	642295	642302	25 %	25 %	0 %	50 %	527326115
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14280	NC_021896	TTC	2	6	642623	642628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326115
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14329	NC_021896	GA	3	6	644812	644817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14330	NC_021896	AGG	2	6	644844	644849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14332	NC_021896	GCT	2	6	644880	644885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14334	NC_021896	TTA	2	6	644953	644958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14335	NC_021896	TAG	2	6	644998	645003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14336	NC_021896	TTATT	2	10	645011	645020	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14337	NC_021896	T	7	7	645019	645025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14338	NC_021896	TCT	2	6	645051	645056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326117
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14352	NC_021896	CGAT	2	8	645553	645560	25 %	25 %	25 %	25 %	527326117
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14357	NC_021896	GCT	2	6	645708	645713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326117
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14359	NC_021896	A	6	6	645760	645765	100 %	0 %	0 %	0 %	527326118
14360	NC_021896	CAAG	2	8	645774	645781	50 %	0 %	25 %	25 %	527326118
14361	NC_021896	CA	3	6	645782	645787	50 %	0 %	0 %	50 %	527326118
14362	NC_021896	CTT	2	6	645788	645793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326118
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14489	NC_021896	CA	3	6	652286	652291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14490	NC_021896	A	6	6	652364	652369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14491	NC_021896	TTC	2	6	652436	652441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14492	NC_021896	AAT	2	6	652529	652534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14493	NC_021896	TCC	2	6	652653	652658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14494	NC_021896	GGC	2	6	652718	652723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527326123
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14499	NC_021896	GCT	2	6	652985	652990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326123
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