MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021896	CCTT	2	8	540205	540212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12002	NC_021896	GGT	2	6	540257	540262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_021896	CTT	2	6	540301	540306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12004	NC_021896	T	7	7	540312	540318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_021896	CCT	2	6	540384	540389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326004
12006	NC_021896	TCCC	2	8	540433	540440	0 %	25 %	0 %	75 %	527326004
12007	NC_021896	GAG	2	6	540447	540452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326004
12008	NC_021896	CAA	2	6	540504	540509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326004
12009	NC_021896	A	7	7	540570	540576	100 %	0 %	0 %	0 %	527326004
12010	NC_021896	CTC	2	6	540611	540616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326004
12011	NC_021896	CTA	2	6	540666	540671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326004
12012	NC_021896	CT	5	10	540701	540710	0 %	50 %	0 %	50 %	527326004
12013	NC_021896	T	6	6	540791	540796	0 %	100 %	0 %	0 %	527326004
12014	NC_021896	TGA	2	6	540853	540858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326004
12015	NC_021896	GTT	2	6	540902	540907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326004
12016	NC_021896	ACA	2	6	540931	540936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326005
12017	NC_021896	CAG	2	6	540960	540965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326005
12018	NC_021896	CTT	2	6	540968	540973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326005
12019	NC_021896	A	6	6	540985	540990	100 %	0 %	0 %	0 %	527326005
12020	NC_021896	CAA	2	6	541058	541063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326005
12021	NC_021896	TCC	2	6	541066	541071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326005
12022	NC_021896	T	8	8	541221	541228	0 %	100 %	0 %	0 %	527326005
12023	NC_021896	CTTC	2	8	541231	541238	0 %	50 %	0 %	50 %	527326005
12024	NC_021896	T	8	8	541267	541274	0 %	100 %	0 %	0 %	527326005
12025	NC_021896	CTA	2	6	541286	541291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326005
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12027	NC_021896	GAA	2	6	541415	541420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326005
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12029	NC_021896	A	7	7	541474	541480	100 %	0 %	0 %	0 %	527326005
12030	NC_021896	TCC	2	6	541547	541552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326005
12031	NC_021896	CTT	2	6	541575	541580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326005
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12033	NC_021896	TTC	2	6	541700	541705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326006
12034	NC_021896	CT	3	6	541719	541724	0 %	50 %	0 %	50 %	527326006
12035	NC_021896	ACT	2	6	541745	541750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326006
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12038	NC_021896	AAGA	2	8	541899	541906	75 %	0 %	25 %	0 %	527326006
12039	NC_021896	AGA	2	6	541912	541917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326006
12040	NC_021896	GCA	2	6	541950	541955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326006
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12042	NC_021896	AAAC	2	8	542082	542089	75 %	0 %	0 %	25 %	527326006
12043	NC_021896	CTT	2	6	542109	542114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326006
12044	NC_021896	GC	3	6	542127	542132	0 %	0 %	50 %	50 %	527326006
12045	NC_021896	CAA	2	6	542167	542172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326006
12046	NC_021896	CT	3	6	542199	542204	0 %	50 %	0 %	50 %	527326006
12047	NC_021896	GAAA	2	8	542215	542222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_021896	GCAA	2	8	542252	542259	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12049	NC_021896	ACC	2	6	542382	542387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12050	NC_021896	A	6	6	542424	542429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_021896	GAA	2	6	542438	542443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_021896	TAC	2	6	542468	542473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12053	NC_021896	A	6	6	542478	542483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_021896	CTAT	2	8	542503	542510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12055	NC_021896	A	6	6	542518	542523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12056	NC_021896	CT	3	6	542554	542559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12057	NC_021896	CAAA	2	8	542581	542588	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12058	NC_021896	TCT	2	6	542745	542750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326007
12059	NC_021896	GCT	2	6	542827	542832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326007
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12061	NC_021896	GAA	2	6	542872	542877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326007
12062	NC_021896	GAA	2	6	542881	542886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326007
12063	NC_021896	GA	3	6	542969	542974	50 %	0 %	50 %	0 %	527326007
12064	NC_021896	GAA	2	6	543079	543084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326007
12065	NC_021896	A	8	8	543174	543181	100 %	0 %	0 %	0 %	527326007
12066	NC_021896	TGA	2	6	543234	543239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326007
12067	NC_021896	TCT	2	6	543248	543253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326007
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12072	NC_021896	TTG	2	6	543607	543612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326008
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12078	NC_021896	CT	3	6	543814	543819	0 %	50 %	0 %	50 %	527326009
12079	NC_021896	AAGAG	2	10	543896	543905	60 %	0 %	40 %	0 %	527326009
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12083	NC_021896	CCT	2	6	544019	544024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326009
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12086	NC_021896	CCA	2	6	544143	544148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527326009
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12088	NC_021896	A	7	7	544180	544186	100 %	0 %	0 %	0 %	527326009
12089	NC_021896	CT	3	6	544208	544213	0 %	50 %	0 %	50 %	527326009
12090	NC_021896	TAA	2	6	544296	544301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326009
12091	NC_021896	ATGG	2	8	544380	544387	25 %	25 %	50 %	0 %	527326009
12092	NC_021896	TC	3	6	544399	544404	0 %	50 %	0 %	50 %	527326009
12093	NC_021896	CAA	2	6	544411	544416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326009
12094	NC_021896	TAA	2	6	544420	544425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326009
12095	NC_021896	GCTT	2	8	544604	544611	0 %	50 %	25 %	25 %	527326009
12096	NC_021896	T	7	7	544626	544632	0 %	100 %	0 %	0 %	527326009
12097	NC_021896	CTTC	2	8	544655	544662	0 %	50 %	0 %	50 %	527326009
12098	NC_021896	TCCCTC	2	12	544685	544696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12099	NC_021896	CTA	2	6	544707	544712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12100	NC_021896	A	8	8	544738	544745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_021896	TTC	2	6	544789	544794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326010
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12103	NC_021896	CT	4	8	544802	544809	0 %	50 %	0 %	50 %	527326010
12104	NC_021896	TGT	2	6	544890	544895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326010
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12107	NC_021896	CAT	2	6	545016	545021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326010
12108	NC_021896	A	6	6	545083	545088	100 %	0 %	0 %	0 %	527326010
12109	NC_021896	TGT	2	6	545122	545127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326010
12110	NC_021896	CTC	2	6	545198	545203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326010
12111	NC_021896	GAA	2	6	545341	545346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326010
12112	NC_021896	TATTC	2	10	545414	545423	20 %	60 %	0 %	20 %	527326010
12113	NC_021896	CGA	2	6	545449	545454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326010
12114	NC_021896	AGC	2	6	545472	545477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326010
12115	NC_021896	TC	3	6	545593	545598	0 %	50 %	0 %	50 %	527326010
12116	NC_021896	ATA	2	6	545693	545698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326010
12117	NC_021896	TGC	2	6	545727	545732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326010
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12120	NC_021896	CA	3	6	545827	545832	50 %	0 %	0 %	50 %	527326010
12121	NC_021896	GAG	2	6	545855	545860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326010
12122	NC_021896	TGC	2	6	545892	545897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326010
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12247	NC_021896	CTG	2	6	551405	551410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326014
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12363	NC_021896	A	9	9	556461	556469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12364	NC_021896	GGAT	2	8	556527	556534	25 %	25 %	50 %	0 %	527326021
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