MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_021896	CTG	2	6	517848	517853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325982
11503	NC_021896	TCA	2	6	517940	517945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325982
11504	NC_021896	TAA	2	6	517975	517980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325982
11505	NC_021896	CCT	2	6	518021	518026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325982
11506	NC_021896	TCT	2	6	518208	518213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325982
11507	NC_021896	TAC	2	6	518224	518229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325982
11508	NC_021896	TGT	2	6	518414	518419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325982
11509	NC_021896	AGC	2	6	518425	518430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325982
11510	NC_021896	TTC	2	6	518431	518436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325982
11511	NC_021896	GCC	2	6	518708	518713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527325982
11512	NC_021896	AACT	2	8	518833	518840	50 %	25 %	0 %	25 %	527325982
11513	NC_021896	AGC	2	6	518851	518856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325982
11514	NC_021896	AAC	2	6	518879	518884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325982
11515	NC_021896	GA	3	6	518922	518927	50 %	0 %	50 %	0 %	527325982
11516	NC_021896	CAA	2	6	518940	518945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325982
11517	NC_021896	AAG	2	6	519006	519011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325982
11518	NC_021896	CTC	2	6	519022	519027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325982
11519	NC_021896	CTTC	2	8	519033	519040	0 %	50 %	0 %	50 %	527325982
11520	NC_021896	TGT	2	6	519050	519055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325982
11521	NC_021896	ATAA	2	8	519254	519261	75 %	25 %	0 %	0 %	527325982
11522	NC_021896	TTG	2	6	519264	519269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325982
11523	NC_021896	AAAG	2	8	519323	519330	75 %	0 %	25 %	0 %	527325982
11524	NC_021896	AAG	2	6	519345	519350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325982
11525	NC_021896	AAC	2	6	519373	519378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325982
11526	NC_021896	TC	3	6	519381	519386	0 %	50 %	0 %	50 %	527325982
11527	NC_021896	ACA	2	6	519407	519412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325982
11528	NC_021896	AATA	2	8	519466	519473	75 %	25 %	0 %	0 %	527325982
11529	NC_021896	TCT	2	6	519482	519487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325982
11530	NC_021896	TGC	2	6	519530	519535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325982
11531	NC_021896	CAAAGC	2	12	519712	519723	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	527325982
11532	NC_021896	AAT	3	9	519733	519741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325982
11533	NC_021896	AGC	2	6	519830	519835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_021896	GAAG	2	8	519838	519845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_021896	AT	3	6	519864	519869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_021896	AAAG	2	8	519877	519884	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_021896	T	6	6	519925	519930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_021896	TTGGA	2	10	519948	519957	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_021896	T	6	6	519971	519976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_021896	ACA	2	6	519979	519984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_021896	AACC	2	8	520012	520019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11542	NC_021896	A	7	7	520083	520089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_021896	T	6	6	520105	520110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_021896	A	7	7	520156	520162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_021896	AGA	2	6	520209	520214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325983
11546	NC_021896	AAAG	2	8	520222	520229	75 %	0 %	25 %	0 %	527325983
11547	NC_021896	CAA	2	6	520278	520283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325983
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11551	NC_021896	TCA	2	6	520539	520544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_021896	A	7	7	520549	520555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_021896	CTAA	2	8	520570	520577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11554	NC_021896	AAT	2	6	520594	520599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_021896	ACTT	2	8	520604	520611	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11556	NC_021896	GCT	2	6	520695	520700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_021896	CAAAA	2	10	520714	520723	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11558	NC_021896	AGA	2	6	520772	520777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_021896	ATA	2	6	520806	520811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_021896	CTA	2	6	520880	520885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_021896	CTTTAG	2	12	520990	521001	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527325984
11562	NC_021896	TCCC	2	8	521043	521050	0 %	25 %	0 %	75 %	527325984
11563	NC_021896	CAT	3	9	521063	521071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325984
11564	NC_021896	TCG	2	6	521081	521086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325984
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11572	NC_021896	A	7	7	521502	521508	100 %	0 %	0 %	0 %	527325984
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11575	NC_021896	GTC	2	6	521807	521812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325985
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11581	NC_021896	TTCT	2	8	522068	522075	0 %	75 %	0 %	25 %	527325986
11582	NC_021896	CTT	2	6	522076	522081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325986
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11594	NC_021896	CTT	2	6	522605	522610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325986
11595	NC_021896	TCC	2	6	522633	522638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325986
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11602	NC_021896	AAG	2	6	522926	522931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325987
11603	NC_021896	TCT	2	6	523079	523084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325987
11604	NC_021896	ACG	2	6	523113	523118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325987
11605	NC_021896	CCTC	2	8	523128	523135	0 %	25 %	0 %	75 %	527325987
11606	NC_021896	CAA	2	6	523195	523200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325987
11607	NC_021896	AG	3	6	523201	523206	50 %	0 %	50 %	0 %	527325987
11608	NC_021896	AGA	2	6	523368	523373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325988
11609	NC_021896	AAGC	2	8	523390	523397	50 %	0 %	25 %	25 %	527325988
11610	NC_021896	TAT	2	6	523418	523423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325988
11611	NC_021896	CAT	2	6	523454	523459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325988
11612	NC_021896	AGCT	2	8	523492	523499	25 %	25 %	25 %	25 %	527325988
11613	NC_021896	TGC	2	6	523583	523588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325988
11614	NC_021896	GCT	2	6	523599	523604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325988
11615	NC_021896	GGAG	2	8	523623	523630	25 %	0 %	75 %	0 %	527325988
11616	NC_021896	TCA	2	6	523633	523638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325988
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11623	NC_021896	TCA	2	6	524026	524031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325989
11624	NC_021896	CTA	2	6	524076	524081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325989
11625	NC_021896	ATCG	2	8	524164	524171	25 %	25 %	25 %	25 %	527325989
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11628	NC_021896	TGC	2	6	524305	524310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325989
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11653	NC_021896	GC	3	6	525868	525873	0 %	0 %	50 %	50 %	527325990
11654	NC_021896	ATGA	2	8	525918	525925	50 %	25 %	25 %	0 %	527325990
11655	NC_021896	GAT	2	6	525938	525943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325990
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11690	NC_021896	TGT	2	6	527230	527235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11692	NC_021896	CAT	2	6	527301	527306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325991
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11727	NC_021896	AGT	2	6	528347	528352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325991
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