MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 23101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021895	A	8	8	585798	585805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_021895	CTT	2	6	585814	585819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325120
13003	NC_021895	GAA	2	6	585828	585833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325120
13004	NC_021895	TCT	2	6	585855	585860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325120
13005	NC_021895	GCT	2	6	585874	585879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325120
13006	NC_021895	TTC	2	6	585887	585892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325120
13007	NC_021895	AAC	2	6	585920	585925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325120
13008	NC_021895	TTC	2	6	586037	586042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325120
13009	NC_021895	AATC	2	8	586055	586062	50 %	25 %	0 %	25 %	527325120
13010	NC_021895	AGG	3	9	586067	586075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325120
13011	NC_021895	AGA	2	6	586115	586120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325120
13012	NC_021895	ATC	2	6	586155	586160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325120
13013	NC_021895	CGA	2	6	586203	586208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325120
13014	NC_021895	T	6	6	586217	586222	0 %	100 %	0 %	0 %	527325120
13015	NC_021895	TC	3	6	586259	586264	0 %	50 %	0 %	50 %	527325120
13016	NC_021895	CTT	2	6	586330	586335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325120
13017	NC_021895	TAT	2	6	586348	586353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325120
13018	NC_021895	CAA	2	6	586414	586419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325120
13019	NC_021895	A	6	6	586536	586541	100 %	0 %	0 %	0 %	527325120
13020	NC_021895	CCT	2	6	586548	586553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325120
13021	NC_021895	TAA	2	6	586645	586650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325120
13022	NC_021895	ACGA	2	8	586683	586690	50 %	0 %	25 %	25 %	527325120
13023	NC_021895	TTTA	2	8	586694	586701	25 %	75 %	0 %	0 %	527325121
13024	NC_021895	GTAC	2	8	586712	586719	25 %	25 %	25 %	25 %	527325121
13025	NC_021895	TAA	2	6	586722	586727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325121
13026	NC_021895	ATCG	2	8	586787	586794	25 %	25 %	25 %	25 %	527325121
13027	NC_021895	AGA	2	6	586854	586859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325121
13028	NC_021895	CTT	2	6	586868	586873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325121
13029	NC_021895	GTA	2	6	586878	586883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325121
13030	NC_021895	ATA	2	6	586885	586890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325121
13031	NC_021895	TTC	2	6	586891	586896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325121
13032	NC_021895	TGC	2	6	586908	586913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325121
13033	NC_021895	CGT	2	6	586944	586949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325121
13034	NC_021895	CTA	2	6	586976	586981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325121
13035	NC_021895	AGC	2	6	587064	587069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325121
13036	NC_021895	CTC	2	6	587102	587107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325121
13037	NC_021895	TGT	2	6	587175	587180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325121
13038	NC_021895	CTT	2	6	587189	587194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325121
13039	NC_021895	GTA	2	6	587245	587250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325121
13040	NC_021895	ATG	2	6	587266	587271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325121
13041	NC_021895	CTG	2	6	587289	587294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325121
13042	NC_021895	CT	3	6	587354	587359	0 %	50 %	0 %	50 %	527325121
13043	NC_021895	GCA	2	6	587383	587388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325121
13044	NC_021895	ACAA	2	8	587401	587408	75 %	0 %	0 %	25 %	527325121
13045	NC_021895	CGA	3	9	587420	587428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325121
13046	NC_021895	TCTT	2	8	587489	587496	0 %	75 %	0 %	25 %	527325121
13047	NC_021895	CATC	2	8	587512	587519	25 %	25 %	0 %	50 %	527325121
13048	NC_021895	GAG	2	6	587534	587539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325121
13049	NC_021895	GT	3	6	587550	587555	0 %	50 %	50 %	0 %	527325121
13050	NC_021895	TAAA	2	8	587567	587574	75 %	25 %	0 %	0 %	527325121
13051	NC_021895	GAA	2	6	587831	587836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325122
13052	NC_021895	TAT	2	6	587943	587948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325122
13053	NC_021895	TCT	2	6	587977	587982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325122
13054	NC_021895	ATC	2	6	588014	588019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325122
13055	NC_021895	CT	3	6	588040	588045	0 %	50 %	0 %	50 %	527325122
13056	NC_021895	T	7	7	588148	588154	0 %	100 %	0 %	0 %	527325122
13057	NC_021895	T	6	6	588206	588211	0 %	100 %	0 %	0 %	527325123
13058	NC_021895	T	6	6	588227	588232	0 %	100 %	0 %	0 %	527325123
13059	NC_021895	ATTTC	2	10	588287	588296	20 %	60 %	0 %	20 %	527325123
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13061	NC_021895	CTT	2	6	588327	588332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325123
13062	NC_021895	GAA	2	6	588470	588475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325123
13063	NC_021895	TTTC	2	8	588488	588495	0 %	75 %	0 %	25 %	527325123
13064	NC_021895	TTCTC	2	10	588524	588533	0 %	60 %	0 %	40 %	527325123
13065	NC_021895	T	6	6	588539	588544	0 %	100 %	0 %	0 %	527325123
13066	NC_021895	CTT	2	6	588593	588598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325123
13067	NC_021895	CAA	2	6	588677	588682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325123
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13069	NC_021895	GA	3	6	588704	588709	50 %	0 %	50 %	0 %	527325123
13070	NC_021895	TCAT	2	8	588730	588737	25 %	50 %	0 %	25 %	527325123
13071	NC_021895	TTC	2	6	588744	588749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325123
13072	NC_021895	CTT	2	6	588872	588877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325123
13073	NC_021895	CTTC	2	8	588899	588906	0 %	50 %	0 %	50 %	527325123
13074	NC_021895	CAG	3	9	588914	588922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325123
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13077	NC_021895	CAA	2	6	589196	589201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325123
13078	NC_021895	GCC	2	6	589221	589226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527325123
13079	NC_021895	TG	3	6	589292	589297	0 %	50 %	50 %	0 %	527325123
13080	NC_021895	TCG	2	6	589340	589345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325124
13081	NC_021895	AGA	2	6	589412	589417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325124
13082	NC_021895	CAG	2	6	589432	589437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325124
13083	NC_021895	TCCC	2	8	589440	589447	0 %	25 %	0 %	75 %	527325124
13084	NC_021895	CTT	2	6	589477	589482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325124
13085	NC_021895	AGC	2	6	589499	589504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325124
13086	NC_021895	AGC	2	6	589508	589513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325124
13087	NC_021895	GCA	2	6	589533	589538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325124
13088	NC_021895	CAG	2	6	589579	589584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325124
13089	NC_021895	CAG	2	6	589606	589611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325124
13090	NC_021895	TAT	2	6	589633	589638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325124
13091	NC_021895	T	6	6	589677	589682	0 %	100 %	0 %	0 %	527325124
13092	NC_021895	T	8	8	589703	589710	0 %	100 %	0 %	0 %	527325124
13093	NC_021895	CT	3	6	589734	589739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13094	NC_021895	ATT	3	9	589747	589755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325125
13095	NC_021895	TCT	2	6	589756	589761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325125
13096	NC_021895	TTTGTT	2	12	589803	589814	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	527325125
13097	NC_021895	AAAG	2	8	589833	589840	75 %	0 %	25 %	0 %	527325125
13098	NC_021895	ACG	2	6	589901	589906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325125
13099	NC_021895	CAA	2	6	589921	589926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325125
13100	NC_021895	AT	3	6	590055	590060	50 %	50 %	0 %	0 %	527325125
13101	NC_021895	ATG	2	6	590106	590111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325125
13102	NC_021895	AGT	2	6	590138	590143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_021895	TCTT	2	8	590197	590204	0 %	75 %	0 %	25 %	527325126
13104	NC_021895	ACA	2	6	590365	590370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325126
13105	NC_021895	GGTT	2	8	590430	590437	0 %	50 %	50 %	0 %	527325126
13106	NC_021895	TTC	2	6	590473	590478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325126
13107	NC_021895	ATA	2	6	590539	590544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325126
13108	NC_021895	A	6	6	590555	590560	100 %	0 %	0 %	0 %	527325126
13109	NC_021895	AAG	2	6	590612	590617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325126
13110	NC_021895	GAAA	2	8	590626	590633	75 %	0 %	25 %	0 %	527325126
13111	NC_021895	CCT	2	6	590728	590733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325126
13112	NC_021895	CT	3	6	590739	590744	0 %	50 %	0 %	50 %	527325126
13113	NC_021895	AAT	2	6	590751	590756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325126
13114	NC_021895	AAT	2	6	590796	590801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325126
13115	NC_021895	TGT	2	6	591027	591032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325126
13116	NC_021895	AAATA	2	10	591052	591061	80 %	20 %	0 %	0 %	527325126
13117	NC_021895	ACA	2	6	591089	591094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325126
13118	NC_021895	AAC	2	6	591117	591122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325126
13119	NC_021895	ATTC	2	8	591126	591133	25 %	50 %	0 %	25 %	527325126
13120	NC_021895	AAG	2	6	591273	591278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325126
13121	NC_021895	AAC	2	6	591309	591314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325126
13122	NC_021895	A	6	6	591356	591361	100 %	0 %	0 %	0 %	527325126
13123	NC_021895	GCAA	2	8	591475	591482	50 %	0 %	25 %	25 %	527325126
13124	NC_021895	T	6	6	591500	591505	0 %	100 %	0 %	0 %	527325126
13125	NC_021895	GCA	2	6	591617	591622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325127
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13127	NC_021895	TCTT	2	8	591700	591707	0 %	75 %	0 %	25 %	527325127
13128	NC_021895	GTTGT	2	10	591759	591768	0 %	60 %	40 %	0 %	527325127
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13131	NC_021895	TTC	2	6	591957	591962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325127
13132	NC_021895	ATA	2	6	592026	592031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325128
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13135	NC_021895	CAT	2	6	592216	592221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325128
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13148	NC_021895	CAT	2	6	592737	592742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325129
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13150	NC_021895	T	6	6	592906	592911	0 %	100 %	0 %	0 %	527325130
13151	NC_021895	GCT	2	6	592922	592927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325130
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13153	NC_021895	AACT	2	8	593029	593036	50 %	25 %	0 %	25 %	527325130
13154	NC_021895	GTCT	2	8	593271	593278	0 %	50 %	25 %	25 %	527325130
13155	NC_021895	AACA	2	8	593299	593306	75 %	0 %	0 %	25 %	527325130
13156	NC_021895	CTT	2	6	593334	593339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325130
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13158	NC_021895	ACCAA	2	10	593484	593493	60 %	0 %	0 %	40 %	527325131
13159	NC_021895	CGC	2	6	593505	593510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527325131
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13163	NC_021895	TCT	2	6	593720	593725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325131
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13172	NC_021895	TA	3	6	594419	594424	50 %	50 %	0 %	0 %	527325132
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13210	NC_021895	GGC	2	6	595923	595928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527325137
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13215	NC_021895	CA	3	6	596066	596071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13216	NC_021895	GCA	2	6	596095	596100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325138
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13221	NC_021895	CGA	2	6	596402	596407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325138
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13224	NC_021895	GCA	2	6	596593	596598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325138
13225	NC_021895	AAG	2	6	596606	596611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325138
13226	NC_021895	TCT	2	6	596615	596620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325138
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13228	NC_021895	CT	3	6	596768	596773	0 %	50 %	0 %	50 %	527325139
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13230	NC_021895	T	6	6	596952	596957	0 %	100 %	0 %	0 %	527325139
13231	NC_021895	CAA	2	6	597008	597013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325139
13232	NC_021895	TCA	2	6	597026	597031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325139
13233	NC_021895	GTAT	2	8	597068	597075	25 %	50 %	25 %	0 %	527325139
13234	NC_021895	T	6	6	597120	597125	0 %	100 %	0 %	0 %	527325140
13235	NC_021895	TTG	2	6	597149	597154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325140
13236	NC_021895	GA	3	6	597155	597160	50 %	0 %	50 %	0 %	527325140
13237	NC_021895	ACG	2	6	597270	597275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325140
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13239	NC_021895	TGA	2	6	597340	597345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325140
13240	NC_021895	CAA	2	6	597347	597352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325140
13241	NC_021895	TTA	2	6	597414	597419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325141
13242	NC_021895	CAC	2	6	597502	597507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527325141
13243	NC_021895	CGA	2	6	597573	597578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325141
13244	NC_021895	AC	3	6	597597	597602	50 %	0 %	0 %	50 %	527325141
13245	NC_021895	TTCA	2	8	597650	597657	25 %	50 %	0 %	25 %	527325141
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13247	NC_021895	GCA	2	6	597821	597826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325141
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13305	NC_021895	A	6	6	600382	600387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13333	NC_021895	TACA	2	8	601315	601322	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13337	NC_021895	T	6	6	601449	601454	0 %	100 %	0 %	0 %	527325146
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13356	NC_021895	CT	4	8	602461	602468	0 %	50 %	0 %	50 %	527325147
13357	NC_021895	TCT	2	6	602535	602540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325147
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13361	NC_021895	ACA	2	6	602850	602855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325147
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13364	NC_021895	AGG	2	6	602947	602952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325147
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