MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 23101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021895	AGA	2	6	518618	518623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325054
11502	NC_021895	CTT	2	6	518643	518648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325054
11503	NC_021895	ACA	2	6	518672	518677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325054
11504	NC_021895	CTC	2	6	518718	518723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325054
11505	NC_021895	AAG	2	6	518752	518757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325054
11506	NC_021895	GTA	2	6	518785	518790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325054
11507	NC_021895	AG	3	6	518804	518809	50 %	0 %	50 %	0 %	527325054
11508	NC_021895	GAA	2	6	518810	518815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325054
11509	NC_021895	CT	3	6	518869	518874	0 %	50 %	0 %	50 %	527325054
11510	NC_021895	CTT	2	6	519053	519058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325054
11511	NC_021895	T	6	6	519057	519062	0 %	100 %	0 %	0 %	527325054
11512	NC_021895	A	6	6	519083	519088	100 %	0 %	0 %	0 %	527325054
11513	NC_021895	TTCT	2	8	519100	519107	0 %	75 %	0 %	25 %	527325054
11514	NC_021895	AGA	2	6	519136	519141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325054
11515	NC_021895	CCCA	2	8	519170	519177	25 %	0 %	0 %	75 %	527325054
11516	NC_021895	AGA	2	6	519190	519195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325054
11517	NC_021895	ATC	2	6	519261	519266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325054
11518	NC_021895	ACGAC	2	10	519346	519355	40 %	0 %	20 %	40 %	527325054
11519	NC_021895	CTCTT	2	10	519429	519438	0 %	60 %	0 %	40 %	527325054
11520	NC_021895	TCC	2	6	519483	519488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325054
11521	NC_021895	GAG	2	6	519536	519541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325054
11522	NC_021895	T	6	6	519591	519596	0 %	100 %	0 %	0 %	527325054
11523	NC_021895	CTC	2	6	519638	519643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325054
11524	NC_021895	CAC	2	6	519676	519681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527325054
11525	NC_021895	CTA	2	6	519879	519884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_021895	AGGAA	2	10	519889	519898	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_021895	ATGAA	2	10	519913	519922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_021895	AG	3	6	520001	520006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_021895	ATTC	2	8	520007	520014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11530	NC_021895	CAA	2	6	520064	520069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_021895	A	12	12	520068	520079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_021895	CTG	2	6	520120	520125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_021895	TCTCTA	2	12	520142	520153	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	527325055
11534	NC_021895	TC	3	6	520209	520214	0 %	50 %	0 %	50 %	527325055
11535	NC_021895	CTTC	2	8	520246	520253	0 %	50 %	0 %	50 %	527325055
11536	NC_021895	TCT	2	6	520357	520362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325055
11537	NC_021895	AGT	2	6	520514	520519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325055
11538	NC_021895	TCT	2	6	520537	520542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325055
11539	NC_021895	ATAG	2	8	520556	520563	50 %	25 %	25 %	0 %	527325055
11540	NC_021895	TCT	2	6	520638	520643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325055
11541	NC_021895	TGC	2	6	520644	520649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325055
11542	NC_021895	TGAACT	2	12	520650	520661	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527325055
11543	NC_021895	TTG	2	6	520685	520690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325055
11544	NC_021895	TCC	2	6	520715	520720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11545	NC_021895	AAT	2	6	520766	520771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_021895	AGCG	2	8	520874	520881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11547	NC_021895	CAA	2	6	520930	520935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_021895	A	6	6	520934	520939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_021895	TTA	2	6	520941	520946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_021895	AAAT	2	8	520964	520971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_021895	T	6	6	521000	521005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_021895	GA	3	6	521013	521018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_021895	AG	3	6	521049	521054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_021895	ATA	2	6	521056	521061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_021895	CAA	2	6	521150	521155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325056
11556	NC_021895	ATA	2	6	521184	521189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325056
11557	NC_021895	TC	3	6	521282	521287	0 %	50 %	0 %	50 %	527325056
11558	NC_021895	TAA	2	6	521324	521329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325056
11559	NC_021895	AGA	2	6	521362	521367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325056
11560	NC_021895	AAG	2	6	521399	521404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325056
11561	NC_021895	GA	3	6	521437	521442	50 %	0 %	50 %	0 %	527325056
11562	NC_021895	ATCC	2	8	521444	521451	25 %	25 %	0 %	50 %	527325056
11563	NC_021895	CAT	2	6	521479	521484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325056
11564	NC_021895	AGA	2	6	521495	521500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325056
11565	NC_021895	T	6	6	521519	521524	0 %	100 %	0 %	0 %	527325056
11566	NC_021895	TCT	2	6	521544	521549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325056
11567	NC_021895	A	6	6	521594	521599	100 %	0 %	0 %	0 %	527325056
11568	NC_021895	GAA	2	6	521614	521619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325056
11569	NC_021895	TAA	2	6	521624	521629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325056
11570	NC_021895	AAT	2	6	521684	521689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325056
11571	NC_021895	AAT	2	6	521729	521734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325056
11572	NC_021895	ACA	2	6	521868	521873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325056
11573	NC_021895	TAATTC	2	12	521980	521991	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527325056
11574	NC_021895	CGA	2	6	522002	522007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325056
11575	NC_021895	T	6	6	522045	522050	0 %	100 %	0 %	0 %	527325056
11576	NC_021895	TC	3	6	522109	522114	0 %	50 %	0 %	50 %	527325056
11577	NC_021895	A	6	6	522162	522167	100 %	0 %	0 %	0 %	527325056
11578	NC_021895	AAG	2	6	522193	522198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325056
11579	NC_021895	CTG	2	6	522203	522208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325056
11580	NC_021895	TTC	2	6	522215	522220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325056
11581	NC_021895	ACTCCT	2	12	522249	522260	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527325056
11582	NC_021895	TGCAA	2	10	522311	522320	40 %	20 %	20 %	20 %	527325056
11583	NC_021895	CTG	2	6	522403	522408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325056
11584	NC_021895	GCA	2	6	522451	522456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325056
11585	NC_021895	AAG	2	6	522469	522474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325056
11586	NC_021895	TC	3	6	522478	522483	0 %	50 %	0 %	50 %	527325056
11587	NC_021895	TGT	2	6	522486	522491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325056
11588	NC_021895	ATC	2	6	522600	522605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325056
11589	NC_021895	ATT	2	6	522614	522619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325056
11590	NC_021895	TAC	2	6	522641	522646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325056
11591	NC_021895	GAG	2	6	522687	522692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325056
11592	NC_021895	GATGAA	2	12	522769	522780	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	527325056
11593	NC_021895	TCT	2	6	522793	522798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325056
11594	NC_021895	GGA	2	6	522845	522850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325056
11595	NC_021895	TACC	2	8	522870	522877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11596	NC_021895	A	8	8	522895	522902	100 %	0 %	0 %	0 %	527325057
11597	NC_021895	CTCC	2	8	522904	522911	0 %	25 %	0 %	75 %	527325057
11598	NC_021895	AGG	2	6	522918	522923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325057
11599	NC_021895	ATC	2	6	522938	522943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325057
11600	NC_021895	TCA	2	6	522979	522984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325057
11601	NC_021895	TTC	2	6	523004	523009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325058
11602	NC_021895	GGA	2	6	523035	523040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325058
11603	NC_021895	AATG	2	8	523088	523095	50 %	25 %	25 %	0 %	527325058
11604	NC_021895	GTT	2	6	523152	523157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325058
11605	NC_021895	TCT	2	6	523186	523191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325058
11606	NC_021895	CAT	2	6	523198	523203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325058
11607	NC_021895	TCT	2	6	523245	523250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325058
11608	NC_021895	AAT	2	6	523265	523270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325058
11609	NC_021895	TCA	2	6	523303	523308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325058
11610	NC_021895	TTGC	2	8	523318	523325	0 %	50 %	25 %	25 %	527325058
11611	NC_021895	AATC	2	8	523327	523334	50 %	25 %	0 %	25 %	527325058
11612	NC_021895	AGCAC	2	10	523368	523377	40 %	0 %	20 %	40 %	527325058
11613	NC_021895	TAA	2	6	523385	523390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325058
11614	NC_021895	AAT	2	6	523479	523484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325058
11615	NC_021895	AGT	2	6	523571	523576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325058
11616	NC_021895	GAA	2	6	523603	523608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325058
11617	NC_021895	GAT	2	6	523618	523623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325058
11618	NC_021895	TTCTG	2	10	523635	523644	0 %	60 %	20 %	20 %	527325058
11619	NC_021895	AT	3	6	523694	523699	50 %	50 %	0 %	0 %	527325058
11620	NC_021895	TTG	2	6	523760	523765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325058
11621	NC_021895	CA	4	8	523810	523817	50 %	0 %	0 %	50 %	527325058
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11623	NC_021895	ACT	2	6	523914	523919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325058
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