MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 23101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_021895	AGA	2	6	272908	272913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324837
6003	NC_021895	AAGTGT	2	12	272950	272961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324837
6004	NC_021895	GTTC	2	8	272969	272976	0 %	50 %	25 %	25 %	527324837
6005	NC_021895	ATTT	2	8	273087	273094	25 %	75 %	0 %	0 %	527324837
6006	NC_021895	GGA	2	6	273095	273100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527324837
6007	NC_021895	ATTT	2	8	273126	273133	25 %	75 %	0 %	0 %	527324837
6008	NC_021895	A	6	6	273152	273157	100 %	0 %	0 %	0 %	527324837
6009	NC_021895	GGT	2	6	273176	273181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527324837
6010	NC_021895	CTT	2	6	273256	273261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324837
6011	NC_021895	TAA	2	6	273304	273309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324837
6012	NC_021895	ACT	2	6	273324	273329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324837
6013	NC_021895	ACC	2	6	273359	273364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527324837
6014	NC_021895	A	7	7	273434	273440	100 %	0 %	0 %	0 %	527324837
6015	NC_021895	TAA	2	6	273478	273483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324837
6016	NC_021895	CTA	2	6	273546	273551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324837
6017	NC_021895	ACTAA	2	10	273611	273620	60 %	20 %	0 %	20 %	527324837
6018	NC_021895	TCTA	2	8	273632	273639	25 %	50 %	0 %	25 %	527324837
6019	NC_021895	TTA	2	6	273644	273649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324837
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6021	NC_021895	AAC	3	9	273706	273714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324837
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6029	NC_021895	ATG	2	6	273992	273997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324837
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6036	NC_021895	T	6	6	274162	274167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_021895	TTA	2	6	274193	274198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324838
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6041	NC_021895	CTG	2	6	274314	274319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324838
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6053	NC_021895	TTA	2	6	274665	274670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324838
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6057	NC_021895	T	6	6	274768	274773	0 %	100 %	0 %	0 %	527324839
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6126	NC_021895	CAC	2	6	277935	277940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527324841
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6129	NC_021895	TCT	2	6	278048	278053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324841
6130	NC_021895	ATCCT	2	10	278062	278071	20 %	40 %	0 %	40 %	527324841
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6133	NC_021895	TGA	2	6	278274	278279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324842
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6154	NC_021895	TTGTC	2	10	279000	279009	0 %	60 %	20 %	20 %	527324842
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6230	NC_021895	GGAACA	2	12	282311	282322	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	527324844
6231	NC_021895	ATGCT	2	10	282389	282398	20 %	40 %	20 %	20 %	527324844
6232	NC_021895	TCT	2	6	282510	282515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324844
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6241	NC_021895	GAG	2	6	282888	282893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527324844
6242	NC_021895	GCTT	2	8	282929	282936	0 %	50 %	25 %	25 %	527324844
6243	NC_021895	GTTT	2	8	282996	283003	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_021895	ATATTA	2	12	283019	283030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_021895	AAAG	2	8	283031	283038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_021895	A	6	6	283086	283091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6247	NC_021895	T	6	6	283110	283115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6248	NC_021895	AGG	2	6	283121	283126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6249	NC_021895	GCA	2	6	283205	283210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324845
6250	NC_021895	GCT	2	6	283227	283232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324845
6251	NC_021895	TCT	2	6	283233	283238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324845
6252	NC_021895	GCA	2	6	283263	283268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324845
6253	NC_021895	TTA	2	6	283378	283383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324845
6254	NC_021895	ACG	2	6	283444	283449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324845
6255	NC_021895	GTA	2	6	283478	283483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324845
6256	NC_021895	AGG	2	6	283504	283509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_021895	TGCC	2	8	283519	283526	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6258	NC_021895	TCT	2	6	283539	283544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324846
6259	NC_021895	TGA	2	6	283568	283573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324846
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6261	NC_021895	ATC	2	6	283622	283627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324846
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6265	NC_021895	AAAG	2	8	283716	283723	75 %	0 %	25 %	0 %	527324846
6266	NC_021895	ATA	2	6	283814	283819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324846
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6273	NC_021895	TAAT	2	8	284137	284144	50 %	50 %	0 %	0 %	527324846
6274	NC_021895	TTC	2	6	284147	284152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324846
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6278	NC_021895	TCC	2	6	284417	284422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324846
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6281	NC_021895	CACGCG	2	12	284684	284695	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	527324846
6282	NC_021895	ATT	3	9	284708	284716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324846
6283	NC_021895	TTTCTT	2	12	284863	284874	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	527324846
6284	NC_021895	A	6	6	284949	284954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6285	NC_021895	TAC	2	6	284958	284963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6286	NC_021895	TCT	2	6	284987	284992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324847
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6288	NC_021895	TGTT	2	8	285038	285045	0 %	75 %	25 %	0 %	527324847
6289	NC_021895	TTG	2	6	285051	285056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324847
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6300	NC_021895	CTG	2	6	285513	285518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324847
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6324	NC_021895	TCT	2	6	286759	286764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324847
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6326	NC_021895	ATG	2	6	286820	286825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324847
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6337	NC_021895	ATTC	2	8	287334	287341	25 %	50 %	0 %	25 %	527324847
6338	NC_021895	GGGA	2	8	287367	287374	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6339	NC_021895	CAAA	2	8	287412	287419	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6340	NC_021895	C	6	6	287574	287579	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6341	NC_021895	AT	4	8	287633	287640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6342	NC_021895	CAT	2	6	287653	287658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324848
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6344	NC_021895	TTC	2	6	287742	287747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324848
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6349	NC_021895	CAC	2	6	288138	288143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527324848
6350	NC_021895	CCT	2	6	288172	288177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324848
6351	NC_021895	CTCC	2	8	288220	288227	0 %	25 %	0 %	75 %	527324848
6352	NC_021895	AAGC	2	8	288242	288249	50 %	0 %	25 %	25 %	527324848
6353	NC_021895	ATG	2	6	288259	288264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324848
6354	NC_021895	T	6	6	288315	288320	0 %	100 %	0 %	0 %	527324848
6355	NC_021895	CTC	2	6	288321	288326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324848
6356	NC_021895	GAT	2	6	288370	288375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324848
6357	NC_021895	A	7	7	288376	288382	100 %	0 %	0 %	0 %	527324848
6358	NC_021895	AG	3	6	288443	288448	50 %	0 %	50 %	0 %	527324848
6359	NC_021895	CT	3	6	288485	288490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6360	NC_021895	AGA	2	6	288496	288501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6361	NC_021895	TAAA	2	8	288509	288516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6362	NC_021895	A	6	6	288514	288519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6363	NC_021895	T	6	6	288534	288539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6364	NC_021895	A	6	6	288554	288559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6365	NC_021895	TC	4	8	288576	288583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6366	NC_021895	T	6	6	288704	288709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6367	NC_021895	CTT	2	6	288746	288751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324849
6368	NC_021895	ACT	2	6	288775	288780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324849
6369	NC_021895	GCTGT	2	10	288788	288797	0 %	40 %	40 %	20 %	527324849
6370	NC_021895	GTC	2	6	288856	288861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324849
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6373	NC_021895	ACT	2	6	288972	288977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324849
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6499	NC_021895	TTTC	2	8	294373	294380	0 %	75 %	0 %	25 %	527324854
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