MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 23101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021895	GAA	2	6	250295	250300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324812
5502	NC_021895	CAAG	2	8	250331	250338	50 %	0 %	25 %	25 %	527324812
5503	NC_021895	ATA	2	6	250341	250346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324812
5504	NC_021895	TTA	2	6	250409	250414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324812
5505	NC_021895	TAAA	2	8	250441	250448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_021895	ATA	2	6	250463	250468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021895	TTA	2	6	250484	250489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_021895	ACG	2	6	250568	250573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324813
5509	NC_021895	TTA	2	6	250585	250590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324813
5510	NC_021895	ATG	2	6	250594	250599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324813
5511	NC_021895	CTG	2	6	250626	250631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324813
5512	NC_021895	GTA	2	6	250671	250676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324813
5513	NC_021895	AGA	2	6	250685	250690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324813
5514	NC_021895	TAG	2	6	250720	250725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324813
5515	NC_021895	AAG	2	6	250768	250773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324813
5516	NC_021895	TAA	2	6	250868	250873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324813
5517	NC_021895	TTA	2	6	250898	250903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324813
5518	NC_021895	T	6	6	250985	250990	0 %	100 %	0 %	0 %	527324813
5519	NC_021895	AAG	2	6	250993	250998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324813
5520	NC_021895	GGAA	2	8	251177	251184	50 %	0 %	50 %	0 %	527324813
5521	NC_021895	TCG	2	6	251186	251191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324813
5522	NC_021895	GAA	3	9	251322	251330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324813
5523	NC_021895	TGT	2	6	251365	251370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324813
5524	NC_021895	CTT	2	6	251377	251382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324813
5525	NC_021895	AGA	3	9	251390	251398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324813
5526	NC_021895	T	6	6	251441	251446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_021895	TACAA	2	10	251470	251479	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5528	NC_021895	ATA	2	6	251502	251507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_021895	CAG	2	6	251541	251546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324814
5530	NC_021895	TTTG	2	8	251567	251574	0 %	75 %	25 %	0 %	527324814
5531	NC_021895	TCT	2	6	251592	251597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324814
5532	NC_021895	TC	3	6	251613	251618	0 %	50 %	0 %	50 %	527324814
5533	NC_021895	TC	3	6	251634	251639	0 %	50 %	0 %	50 %	527324814
5534	NC_021895	TC	3	6	251665	251670	0 %	50 %	0 %	50 %	527324814
5535	NC_021895	T	6	6	251685	251690	0 %	100 %	0 %	0 %	527324814
5536	NC_021895	CTT	2	6	251787	251792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324814
5537	NC_021895	TGC	2	6	251809	251814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324814
5538	NC_021895	CT	3	6	251821	251826	0 %	50 %	0 %	50 %	527324814
5539	NC_021895	TTG	2	6	251849	251854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324814
5540	NC_021895	TC	3	6	251877	251882	0 %	50 %	0 %	50 %	527324814
5541	NC_021895	T	6	6	251991	251996	0 %	100 %	0 %	0 %	527324814
5542	NC_021895	CAT	2	6	251999	252004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324814
5543	NC_021895	CTT	2	6	252013	252018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324814
5544	NC_021895	TC	3	6	252019	252024	0 %	50 %	0 %	50 %	527324814
5545	NC_021895	TTA	2	6	252042	252047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324814
5546	NC_021895	GCA	2	6	252072	252077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324814
5547	NC_021895	AAG	2	6	252121	252126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324814
5548	NC_021895	TAGC	2	8	252193	252200	25 %	25 %	25 %	25 %	527324814
5549	NC_021895	CTT	2	6	252213	252218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324814
5550	NC_021895	TCT	2	6	252247	252252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324814
5551	NC_021895	TTC	2	6	252283	252288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324814
5552	NC_021895	CAA	2	6	252339	252344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324814
5553	NC_021895	TTTC	2	8	252347	252354	0 %	75 %	0 %	25 %	527324814
5554	NC_021895	T	6	6	252381	252386	0 %	100 %	0 %	0 %	527324814
5555	NC_021895	GTG	2	6	252437	252442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527324815
5556	NC_021895	GTATT	2	10	252462	252471	20 %	60 %	20 %	0 %	527324815
5557	NC_021895	CAT	2	6	252509	252514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324815
5558	NC_021895	TCA	2	6	252522	252527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324815
5559	NC_021895	A	6	6	252543	252548	100 %	0 %	0 %	0 %	527324815
5560	NC_021895	TAT	2	6	252554	252559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324815
5561	NC_021895	T	6	6	252577	252582	0 %	100 %	0 %	0 %	527324815
5562	NC_021895	TTC	2	6	252618	252623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324815
5563	NC_021895	AT	3	6	252627	252632	50 %	50 %	0 %	0 %	527324815
5564	NC_021895	ATC	2	6	252652	252657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324815
5565	NC_021895	TAT	2	6	252682	252687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324815
5566	NC_021895	GCA	2	6	252713	252718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324815
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5569	NC_021895	A	6	6	252777	252782	100 %	0 %	0 %	0 %	527324815
5570	NC_021895	CTC	2	6	252810	252815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324815
5571	NC_021895	CTCC	2	8	252872	252879	0 %	25 %	0 %	75 %	527324815
5572	NC_021895	AGA	2	6	252913	252918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324815
5573	NC_021895	TCT	2	6	253067	253072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324816
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5577	NC_021895	GCC	2	6	253351	253356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527324816
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5579	NC_021895	ACAA	2	8	253379	253386	75 %	0 %	0 %	25 %	527324816
5580	NC_021895	CT	3	6	253410	253415	0 %	50 %	0 %	50 %	527324816
5581	NC_021895	GAT	2	6	253426	253431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324816
5582	NC_021895	TCCGT	2	10	253442	253451	0 %	40 %	20 %	40 %	527324816
5583	NC_021895	CTC	2	6	253458	253463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324816
5584	NC_021895	AAT	2	6	253471	253476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324816
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5586	NC_021895	ATA	2	6	253607	253612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324816
5587	NC_021895	ATC	2	6	253622	253627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324816
5588	NC_021895	ATG	2	6	253667	253672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324816
5589	NC_021895	ACA	2	6	253686	253691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324816
5590	NC_021895	GGAA	2	8	253703	253710	50 %	0 %	50 %	0 %	527324816
5591	NC_021895	GCT	2	6	253730	253735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324816
5592	NC_021895	CCA	2	6	253757	253762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527324816
5593	NC_021895	GTATG	2	10	253881	253890	20 %	40 %	40 %	0 %	527324816
5594	NC_021895	GA	3	6	253923	253928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_021895	ACT	2	6	253983	253988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_021895	TG	3	6	254033	254038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_021895	AATA	2	8	254100	254107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_021895	T	6	6	254123	254128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_021895	T	7	7	254142	254148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_021895	A	6	6	254150	254155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_021895	ACA	2	6	254250	254255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324817
5602	NC_021895	CTT	2	6	254257	254262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324817
5603	NC_021895	AAG	2	6	254288	254293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324817
5604	NC_021895	GCA	2	6	254307	254312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324817
5605	NC_021895	TTG	2	6	254327	254332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_021895	CAAA	2	8	254491	254498	75 %	0 %	0 %	25 %	527324818
5607	NC_021895	CAAT	2	8	254598	254605	50 %	25 %	0 %	25 %	527324818
5608	NC_021895	CTTT	3	12	254650	254661	0 %	75 %	0 %	25 %	527324818
5609	NC_021895	CGA	2	6	254692	254697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324818
5610	NC_021895	CTT	2	6	254703	254708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324818
5611	NC_021895	ACA	2	6	254725	254730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324818
5612	NC_021895	CTC	2	6	254744	254749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5613	NC_021895	CAA	2	6	254788	254793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_021895	AG	3	6	254833	254838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_021895	A	8	8	254839	254846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_021895	AAG	2	6	254857	254862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_021895	ATC	2	6	254911	254916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324819
5618	NC_021895	TTA	2	6	255050	255055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324819
5619	NC_021895	TCGT	2	8	255085	255092	0 %	50 %	25 %	25 %	527324819
5620	NC_021895	AGT	2	6	255105	255110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324819
5621	NC_021895	GCAG	2	8	255152	255159	25 %	0 %	50 %	25 %	527324819
5622	NC_021895	TCTT	2	8	255169	255176	0 %	75 %	0 %	25 %	527324819
5623	NC_021895	CTT	2	6	255190	255195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324819
5624	NC_021895	AGA	2	6	255197	255202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324819
5625	NC_021895	TCT	2	6	255212	255217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324819
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5741	NC_021895	AAT	2	6	259887	259892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5742	NC_021895	AG	3	6	259949	259954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5743	NC_021895	A	8	8	259967	259974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5744	NC_021895	TC	3	6	259975	259980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5745	NC_021895	TC	3	6	260061	260066	0 %	50 %	0 %	50 %	527324826
5746	NC_021895	A	6	6	260070	260075	100 %	0 %	0 %	0 %	527324826
5747	NC_021895	ATG	2	6	260081	260086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324826
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5749	NC_021895	T	7	7	260172	260178	0 %	100 %	0 %	0 %	527324826
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