MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 23101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021895	GCA	2	6	226603	226608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324793
5002	NC_021895	AGA	2	6	226621	226626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324793
5003	NC_021895	T	6	6	226654	226659	0 %	100 %	0 %	0 %	527324793
5004	NC_021895	AGA	2	6	226668	226673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324793
5005	NC_021895	AGA	2	6	226698	226703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324793
5006	NC_021895	TAC	2	6	226709	226714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324793
5007	NC_021895	TAA	2	6	226717	226722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324793
5008	NC_021895	CAT	2	6	226756	226761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324793
5009	NC_021895	CAA	2	6	226769	226774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324793
5010	NC_021895	CTGCTT	2	12	226776	226787	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	527324793
5011	NC_021895	CAAA	2	8	226863	226870	75 %	0 %	0 %	25 %	527324793
5012	NC_021895	CGA	2	6	226871	226876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324793
5013	NC_021895	AT	3	6	226893	226898	50 %	50 %	0 %	0 %	527324793
5014	NC_021895	AAG	2	6	226986	226991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324793
5015	NC_021895	CCT	2	6	226998	227003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324793
5016	NC_021895	TCCT	2	8	227031	227038	0 %	50 %	0 %	50 %	527324793
5017	NC_021895	AGC	2	6	227061	227066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324793
5018	NC_021895	CTT	2	6	227067	227072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324793
5019	NC_021895	CAA	2	6	227078	227083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324793
5020	NC_021895	AGA	2	6	227113	227118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324793
5021	NC_021895	CTGA	2	8	227123	227130	25 %	25 %	25 %	25 %	527324793
5022	NC_021895	GAA	2	6	227232	227237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324793
5023	NC_021895	TTG	2	6	227279	227284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324793
5024	NC_021895	CTTT	2	8	227307	227314	0 %	75 %	0 %	25 %	527324793
5025	NC_021895	TTTC	2	8	227360	227367	0 %	75 %	0 %	25 %	527324793
5026	NC_021895	TC	3	6	227431	227436	0 %	50 %	0 %	50 %	527324793
5027	NC_021895	A	7	7	227448	227454	100 %	0 %	0 %	0 %	527324793
5028	NC_021895	ACG	2	6	227532	227537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324793
5029	NC_021895	ACA	2	6	227549	227554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324793
5030	NC_021895	AAT	2	6	227555	227560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324793
5031	NC_021895	CTTT	2	8	227564	227571	0 %	75 %	0 %	25 %	527324793
5032	NC_021895	TC	3	6	227658	227663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_021895	AG	3	6	227689	227694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021895	CAATA	2	10	227759	227768	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5035	NC_021895	CTA	2	6	227780	227785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324794
5036	NC_021895	GGC	2	6	227804	227809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527324794
5037	NC_021895	TGT	2	6	227810	227815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324794
5038	NC_021895	CTTT	2	8	227824	227831	0 %	75 %	0 %	25 %	527324794
5039	NC_021895	GTA	2	6	227836	227841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324794
5040	NC_021895	T	6	6	227854	227859	0 %	100 %	0 %	0 %	527324794
5041	NC_021895	ATT	2	6	227860	227865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324794
5042	NC_021895	ATG	2	6	227891	227896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324794
5043	NC_021895	TATCT	2	10	227977	227986	20 %	60 %	0 %	20 %	527324794
5044	NC_021895	TAT	2	6	228054	228059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324794
5045	NC_021895	TGC	2	6	228060	228065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324794
5046	NC_021895	A	7	7	228157	228163	100 %	0 %	0 %	0 %	527324794
5047	NC_021895	TTTTC	2	10	228179	228188	0 %	80 %	0 %	20 %	527324794
5048	NC_021895	TC	3	6	228293	228298	0 %	50 %	0 %	50 %	527324794
5049	NC_021895	CATT	2	8	228341	228348	25 %	50 %	0 %	25 %	527324794
5050	NC_021895	A	7	7	228384	228390	100 %	0 %	0 %	0 %	527324794
5051	NC_021895	TTA	2	6	228400	228405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324794
5052	NC_021895	TAA	2	6	228440	228445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324794
5053	NC_021895	AAC	2	6	228501	228506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324794
5054	NC_021895	TTG	2	6	228654	228659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324794
5055	NC_021895	ATA	2	6	228723	228728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527324794
5056	NC_021895	TAA	2	6	228732	228737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021895	AAAC	2	8	228748	228755	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5058	NC_021895	ACAA	2	8	228800	228807	75 %	0 %	0 %	25 %	527324795
5059	NC_021895	TTC	2	6	228861	228866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324795
5060	NC_021895	CT	3	6	228995	229000	0 %	50 %	0 %	50 %	527324795
5061	NC_021895	ATT	2	6	229025	229030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324795
5062	NC_021895	ACT	2	6	229045	229050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324795
5063	NC_021895	A	7	7	229078	229084	100 %	0 %	0 %	0 %	527324795
5064	NC_021895	ATT	2	6	229145	229150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324795
5065	NC_021895	TTA	2	6	229154	229159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324795
5066	NC_021895	CTGG	2	8	229209	229216	0 %	25 %	50 %	25 %	527324795
5067	NC_021895	TAT	2	6	229231	229236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324795
5068	NC_021895	TGT	2	6	229275	229280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527324795
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5070	NC_021895	TCA	2	6	229404	229409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324795
5071	NC_021895	CCT	2	6	229433	229438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324795
5072	NC_021895	CATT	2	8	229471	229478	25 %	50 %	0 %	25 %	527324795
5073	NC_021895	CTT	2	6	229501	229506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324795
5074	NC_021895	T	6	6	229517	229522	0 %	100 %	0 %	0 %	527324795
5075	NC_021895	TTA	2	6	229608	229613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527324796
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5081	NC_021895	CAT	2	6	229947	229952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324796
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5083	NC_021895	ATTGCT	2	12	230085	230096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527324796
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5085	NC_021895	CTA	2	6	230214	230219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324796
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5087	NC_021895	TG	3	6	230254	230259	0 %	50 %	50 %	0 %	527324796
5088	NC_021895	TCCTAG	2	12	230375	230386	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527324796
5089	NC_021895	CAA	2	6	230413	230418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324796
5090	NC_021895	AAC	2	6	230490	230495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324797
5091	NC_021895	GAG	2	6	230529	230534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527324797
5092	NC_021895	CT	3	6	230575	230580	0 %	50 %	0 %	50 %	527324797
5093	NC_021895	TCGA	2	8	230624	230631	25 %	25 %	25 %	25 %	527324797
5094	NC_021895	TCC	2	6	230641	230646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527324797
5095	NC_021895	GAT	2	6	230674	230679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324797
5096	NC_021895	ATG	2	6	230711	230716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324797
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5099	NC_021895	AAG	2	6	230781	230786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527324797
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5101	NC_021895	GCAACG	2	12	230863	230874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527324797
5102	NC_021895	GT	3	6	230897	230902	0 %	50 %	50 %	0 %	527324797
5103	NC_021895	AATT	2	8	230910	230917	50 %	50 %	0 %	0 %	527324797
5104	NC_021895	ATTT	2	8	230973	230980	25 %	75 %	0 %	0 %	527324797
5105	NC_021895	T	6	6	231010	231015	0 %	100 %	0 %	0 %	527324797
5106	NC_021895	TCA	2	6	231018	231023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527324797
5107	NC_021895	CTG	2	6	231036	231041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324797
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5109	NC_021895	CTT	2	6	231149	231154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324797
5110	NC_021895	T	8	8	231223	231230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021895	TCCT	2	8	231372	231379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_021895	GTT	2	6	231415	231420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021895	AGA	2	6	231424	231429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021895	ATT	2	6	231461	231466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021895	TTC	2	6	231545	231550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324798
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5120	NC_021895	TC	3	6	231798	231803	0 %	50 %	0 %	50 %	527324798
5121	NC_021895	TGA	2	6	231825	231830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324798
5122	NC_021895	TCG	2	6	231914	231919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527324798
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5124	NC_021895	CCTT	2	8	231994	232001	0 %	50 %	0 %	50 %	527324798
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5496	NC_021895	TCCCC	2	10	249963	249972	0 %	20 %	0 %	80 %	527324812
5497	NC_021895	CTT	2	6	250025	250030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324812
5498	NC_021895	GAT	2	6	250085	250090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527324812
5499	NC_021895	ACA	2	6	250100	250105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527324812
5500	NC_021895	TCT	2	6	250114	250119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527324812

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