MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/852

Total Repeats: 23821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_021888	TCTT	2	8	587441	587448	0 %	75 %	0 %	25 %	527319260
13003	NC_021888	CATC	2	8	587464	587471	25 %	25 %	0 %	50 %	527319260
13004	NC_021888	GAG	2	6	587486	587491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319260
13005	NC_021888	GT	3	6	587502	587507	0 %	50 %	50 %	0 %	527319260
13006	NC_021888	TAAA	2	8	587519	587526	75 %	25 %	0 %	0 %	527319260
13007	NC_021888	GAA	2	6	587783	587788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319261
13008	NC_021888	TAT	2	6	587895	587900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319261
13009	NC_021888	TCT	2	6	587929	587934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319261
13010	NC_021888	ATC	2	6	587966	587971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319261
13011	NC_021888	CT	3	6	587992	587997	0 %	50 %	0 %	50 %	527319261
13012	NC_021888	T	7	7	588100	588106	0 %	100 %	0 %	0 %	527319261
13013	NC_021888	T	6	6	588158	588163	0 %	100 %	0 %	0 %	527319262
13014	NC_021888	T	6	6	588179	588184	0 %	100 %	0 %	0 %	527319262
13015	NC_021888	ATTTC	2	10	588239	588248	20 %	60 %	0 %	20 %	527319262
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13017	NC_021888	CTT	2	6	588279	588284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319262
13018	NC_021888	GAA	2	6	588422	588427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319262
13019	NC_021888	TTTC	2	8	588440	588447	0 %	75 %	0 %	25 %	527319262
13020	NC_021888	TTCTC	2	10	588476	588485	0 %	60 %	0 %	40 %	527319262
13021	NC_021888	T	6	6	588491	588496	0 %	100 %	0 %	0 %	527319262
13022	NC_021888	CTT	2	6	588545	588550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319262
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13049	NC_021888	CT	3	6	589686	589691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13057	NC_021888	ATG	2	6	590058	590063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319264
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13104	NC_021888	CAT	2	6	592689	592694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319268
13105	NC_021888	TA	3	6	592815	592820	50 %	50 %	0 %	0 %	527319268
13106	NC_021888	T	6	6	592858	592863	0 %	100 %	0 %	0 %	527319269
13107	NC_021888	GCT	2	6	592874	592879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319269
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13109	NC_021888	AACT	2	8	592981	592988	50 %	25 %	0 %	25 %	527319269
13110	NC_021888	GTCT	2	8	593223	593230	0 %	50 %	25 %	25 %	527319269
13111	NC_021888	AACA	2	8	593251	593258	75 %	0 %	0 %	25 %	527319269
13112	NC_021888	CTT	2	6	593286	593291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319269
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13114	NC_021888	ACCAA	2	10	593436	593445	60 %	0 %	0 %	40 %	527319270
13115	NC_021888	CGC	2	6	593457	593462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527319270
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13119	NC_021888	TCT	2	6	593672	593677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319270
13120	NC_021888	TGC	2	6	593705	593710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319270
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13128	NC_021888	TA	3	6	594371	594376	50 %	50 %	0 %	0 %	527319271
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13244	NC_021888	TCC	2	6	599487	599492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319283
13245	NC_021888	T	6	6	599505	599510	0 %	100 %	0 %	0 %	527319283
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13256	NC_021888	CAAA	2	8	600046	600053	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13261	NC_021888	A	6	6	600334	600339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13289	NC_021888	TACA	2	8	601267	601274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13345	NC_021888	CCTG	2	8	604162	604169	0 %	25 %	25 %	50 %	527319288
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13348	NC_021888	GA	3	6	604391	604396	50 %	0 %	50 %	0 %	527319288
13349	NC_021888	TAT	2	6	604545	604550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13350	NC_021888	T	12	12	604553	604564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13351	NC_021888	AGCA	2	8	604565	604572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13352	NC_021888	A	6	6	604582	604587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13353	NC_021888	TAC	2	6	604589	604594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13354	NC_021888	A	7	7	604620	604626	100 %	0 %	0 %	0 %	527319289
13355	NC_021888	TGG	2	6	604633	604638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527319289
13356	NC_021888	TCTT	2	8	604643	604650	0 %	75 %	0 %	25 %	527319289
13357	NC_021888	GCA	2	6	604844	604849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319289
13358	NC_021888	TG	3	6	604858	604863	0 %	50 %	50 %	0 %	527319289
13359	NC_021888	TTG	2	6	604987	604992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319289
13360	NC_021888	CAG	2	6	605241	605246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319289
13361	NC_021888	ATCCA	2	10	605336	605345	40 %	20 %	0 %	40 %	527319289
13362	NC_021888	ACTT	2	8	605449	605456	25 %	50 %	0 %	25 %	527319289
13363	NC_021888	AAACC	2	10	605505	605514	60 %	0 %	0 %	40 %	527319289
13364	NC_021888	TCC	2	6	605535	605540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319289
13365	NC_021888	TGCA	2	8	605542	605549	25 %	25 %	25 %	25 %	527319289
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13492	NC_021888	A	6	6	611461	611466	100 %	0 %	0 %	0 %	527319297
13493	NC_021888	TAA	2	6	611503	611508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319297
13494	NC_021888	ATTTT	2	10	611516	611525	20 %	80 %	0 %	0 %	527319297
13495	NC_021888	GAAC	2	8	611600	611607	50 %	0 %	25 %	25 %	527319297
13496	NC_021888	GAT	2	6	611664	611669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319297
13497	NC_021888	GCT	2	6	611819	611824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319297
13498	NC_021888	T	6	6	611932	611937	0 %	100 %	0 %	0 %	527319297
13499	NC_021888	CAA	2	6	612104	612109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319297
13500	NC_021888	CTT	2	6	612168	612173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319297

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