MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/852

Total Repeats: 23821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021888	AAT	2	6	520718	520723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_021888	AGCG	2	8	520826	520833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11503	NC_021888	CAA	2	6	520882	520887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_021888	A	6	6	520886	520891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_021888	TTA	2	6	520893	520898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_021888	AAAT	2	8	520916	520923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_021888	T	6	6	520952	520957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_021888	GA	3	6	520965	520970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_021888	AG	3	6	521001	521006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_021888	ATA	2	6	521008	521013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_021888	CAA	2	6	521102	521107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319194
11512	NC_021888	ATA	2	6	521136	521141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319194
11513	NC_021888	TC	3	6	521234	521239	0 %	50 %	0 %	50 %	527319194
11514	NC_021888	TAA	2	6	521276	521281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319194
11515	NC_021888	AGA	2	6	521314	521319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319194
11516	NC_021888	AAG	2	6	521351	521356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319194
11517	NC_021888	GA	3	6	521389	521394	50 %	0 %	50 %	0 %	527319194
11518	NC_021888	ATCC	2	8	521396	521403	25 %	25 %	0 %	50 %	527319194
11519	NC_021888	CAT	2	6	521431	521436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319194
11520	NC_021888	AGA	2	6	521447	521452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319194
11521	NC_021888	T	6	6	521471	521476	0 %	100 %	0 %	0 %	527319194
11522	NC_021888	TCT	2	6	521496	521501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319194
11523	NC_021888	A	6	6	521546	521551	100 %	0 %	0 %	0 %	527319194
11524	NC_021888	GAA	2	6	521566	521571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319194
11525	NC_021888	TAA	2	6	521576	521581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319194
11526	NC_021888	AAT	2	6	521636	521641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319194
11527	NC_021888	AAT	2	6	521681	521686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319194
11528	NC_021888	ACA	2	6	521820	521825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319194
11529	NC_021888	TAATTC	2	12	521932	521943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527319194
11530	NC_021888	CGA	2	6	521954	521959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319194
11531	NC_021888	T	6	6	521997	522002	0 %	100 %	0 %	0 %	527319194
11532	NC_021888	TC	3	6	522061	522066	0 %	50 %	0 %	50 %	527319194
11533	NC_021888	A	6	6	522114	522119	100 %	0 %	0 %	0 %	527319194
11534	NC_021888	AAG	2	6	522145	522150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319194
11535	NC_021888	CTG	2	6	522155	522160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319194
11536	NC_021888	TTC	2	6	522167	522172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319194
11537	NC_021888	ACTCCT	2	12	522201	522212	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527319194
11538	NC_021888	TGCAA	2	10	522263	522272	40 %	20 %	20 %	20 %	527319194
11539	NC_021888	CTG	2	6	522355	522360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319194
11540	NC_021888	GCA	2	6	522403	522408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319194
11541	NC_021888	AAG	2	6	522421	522426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319194
11542	NC_021888	TC	3	6	522430	522435	0 %	50 %	0 %	50 %	527319194
11543	NC_021888	TGT	2	6	522438	522443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319194
11544	NC_021888	ATC	2	6	522552	522557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319194
11545	NC_021888	ATT	2	6	522566	522571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527319194
11546	NC_021888	TAC	2	6	522593	522598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319194
11547	NC_021888	GAG	2	6	522639	522644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319194
11548	NC_021888	GATGAA	2	12	522721	522732	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	527319194
11549	NC_021888	TCT	2	6	522745	522750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319194
11550	NC_021888	GGA	2	6	522797	522802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319194
11551	NC_021888	TACC	2	8	522822	522829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11552	NC_021888	A	8	8	522847	522854	100 %	0 %	0 %	0 %	527319195
11553	NC_021888	CTCC	2	8	522856	522863	0 %	25 %	0 %	75 %	527319195
11554	NC_021888	AGG	2	6	522870	522875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319195
11555	NC_021888	ATC	2	6	522890	522895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319195
11556	NC_021888	TCA	2	6	522931	522936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319195
11557	NC_021888	TTC	2	6	522956	522961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319196
11558	NC_021888	GGA	2	6	522987	522992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319196
11559	NC_021888	AATG	2	8	523040	523047	50 %	25 %	25 %	0 %	527319196
11560	NC_021888	GTT	2	6	523104	523109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319196
11561	NC_021888	TCT	2	6	523138	523143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319196
11562	NC_021888	CAT	2	6	523150	523155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319196
11563	NC_021888	TCT	2	6	523197	523202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319196
11564	NC_021888	AAT	2	6	523217	523222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319196
11565	NC_021888	TCA	2	6	523255	523260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319196
11566	NC_021888	TTGC	2	8	523270	523277	0 %	50 %	25 %	25 %	527319196
11567	NC_021888	AATC	2	8	523279	523286	50 %	25 %	0 %	25 %	527319196
11568	NC_021888	AGCAC	2	10	523320	523329	40 %	0 %	20 %	40 %	527319196
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11571	NC_021888	AGT	2	6	523523	523528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319196
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11573	NC_021888	GAT	2	6	523570	523575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319196
11574	NC_021888	TTCTG	2	10	523587	523596	0 %	60 %	20 %	20 %	527319196
11575	NC_021888	AT	3	6	523646	523651	50 %	50 %	0 %	0 %	527319196
11576	NC_021888	TTG	2	6	523712	523717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319196
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11578	NC_021888	ATCC	2	8	523805	523812	25 %	25 %	0 %	50 %	527319196
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11582	NC_021888	TC	4	8	523954	523961	0 %	50 %	0 %	50 %	527319196
11583	NC_021888	GAT	2	6	524033	524038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319196
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11587	NC_021888	CAG	2	6	524327	524332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319196
11588	NC_021888	GTA	2	6	524366	524371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527319196
11589	NC_021888	CAACA	2	10	524405	524414	60 %	0 %	0 %	40 %	527319196
11590	NC_021888	GA	3	6	524415	524420	50 %	0 %	50 %	0 %	527319196
11591	NC_021888	CTT	2	6	524464	524469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319196
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11593	NC_021888	CTCC	2	8	524643	524650	0 %	25 %	0 %	75 %	527319196
11594	NC_021888	T	6	6	524664	524669	0 %	100 %	0 %	0 %	527319196
11595	NC_021888	CTT	2	6	524683	524688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319196
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11598	NC_021888	AAG	2	6	524926	524931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319196
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11602	NC_021888	CTG	2	6	525217	525222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319196
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11605	NC_021888	CCT	2	6	525390	525395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319196
11606	NC_021888	TCT	2	6	525577	525582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319196
11607	NC_021888	TAC	2	6	525593	525598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319196
11608	NC_021888	TGT	2	6	525783	525788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319196
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11612	NC_021888	AACT	2	8	526202	526209	50 %	25 %	0 %	25 %	527319196
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11988	NC_021888	CT	3	6	542866	542871	0 %	50 %	0 %	50 %	527319213
11989	NC_021888	CTTT	2	8	542930	542937	0 %	75 %	0 %	25 %	527319213
11990	NC_021888	AGGGAA	2	12	542978	542989	50 %	0 %	50 %	0 %	527319213
11991	NC_021888	TCC	2	6	542993	542998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319213
11992	NC_021888	TCT	2	6	543005	543010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319213
11993	NC_021888	CGC	2	6	543033	543038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527319213
11994	NC_021888	CCT	2	6	543045	543050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319213
11995	NC_021888	TCC	2	6	543092	543097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319213
11996	NC_021888	C	6	6	543096	543101	0 %	0 %	0 %	100 %	527319213
11997	NC_021888	TAA	2	6	543150	543155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319213
11998	NC_021888	TTC	2	6	543353	543358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319214
11999	NC_021888	GCGTA	2	10	543410	543419	20 %	20 %	40 %	20 %	527319214
12000	NC_021888	AGA	2	6	543428	543433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319214

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