MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2(s)/46

Total Repeats: 22941

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021887	CCT	2	6	585105	585110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318344
13002	NC_021887	AAC	2	6	585113	585118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318344
13003	NC_021887	ACA	2	6	585122	585127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318344
13004	NC_021887	GAC	2	6	585134	585139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318344
13005	NC_021887	CT	3	6	585226	585231	0 %	50 %	0 %	50 %	527318345
13006	NC_021887	CTA	2	6	585252	585257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318345
13007	NC_021887	CTC	2	6	585276	585281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318345
13008	NC_021887	AAC	2	6	585289	585294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318345
13009	NC_021887	T	6	6	585362	585367	0 %	100 %	0 %	0 %	527318345
13010	NC_021887	AAAT	2	8	585408	585415	75 %	25 %	0 %	0 %	527318345
13011	NC_021887	CAT	2	6	585435	585440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318345
13012	NC_021887	TA	3	6	585561	585566	50 %	50 %	0 %	0 %	527318345
13013	NC_021887	T	6	6	585604	585609	0 %	100 %	0 %	0 %	527318346
13014	NC_021887	GCT	2	6	585620	585625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318346
13015	NC_021887	ACG	2	6	585637	585642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318346
13016	NC_021887	AACT	2	8	585727	585734	50 %	25 %	0 %	25 %	527318346
13017	NC_021887	GTCT	2	8	585969	585976	0 %	50 %	25 %	25 %	527318346
13018	NC_021887	CAA	2	6	585996	586001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318346
13019	NC_021887	CTT	2	6	586032	586037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318346
13020	NC_021887	TCA	2	6	586085	586090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318346
13021	NC_021887	ACCAA	2	10	586182	586191	60 %	0 %	0 %	40 %	527318347
13022	NC_021887	CGC	2	6	586203	586208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527318347
13023	NC_021887	GAG	2	6	586251	586256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318347
13024	NC_021887	TGC	2	6	586303	586308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318347
13025	NC_021887	AC	3	6	586338	586343	50 %	0 %	0 %	50 %	527318347
13026	NC_021887	TCT	2	6	586418	586423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318347
13027	NC_021887	TGC	2	6	586451	586456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318347
13028	NC_021887	CTT	2	6	586608	586613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318348
13029	NC_021887	ATTC	2	8	586686	586693	25 %	50 %	0 %	25 %	527318348
13030	NC_021887	ATC	2	6	586743	586748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318348
13031	NC_021887	CATA	2	8	586850	586857	50 %	25 %	0 %	25 %	527318348
13032	NC_021887	TTA	2	6	587033	587038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318348
13033	NC_021887	TCT	2	6	587042	587047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318348
13034	NC_021887	TCTT	2	8	587099	587106	0 %	75 %	0 %	25 %	527318348
13035	NC_021887	TA	3	6	587117	587122	50 %	50 %	0 %	0 %	527318348
13036	NC_021887	T	7	7	587124	587130	0 %	100 %	0 %	0 %	527318348
13037	NC_021887	TC	4	8	587152	587159	0 %	50 %	0 %	50 %	527318349
13038	NC_021887	GAA	2	6	587177	587182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318349
13039	NC_021887	ACGT	2	8	587269	587276	25 %	25 %	25 %	25 %	527318349
13040	NC_021887	GAG	2	6	587289	587294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318349
13041	NC_021887	T	6	6	587345	587350	0 %	100 %	0 %	0 %	527318349
13042	NC_021887	CAA	3	9	587370	587378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318349
13043	NC_021887	AAC	2	6	587391	587396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318349
13044	NC_021887	AGCA	2	8	587431	587438	50 %	0 %	25 %	25 %	527318349
13045	NC_021887	ATC	2	6	587593	587598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318350
13046	NC_021887	GAT	2	6	587599	587604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318350
13047	NC_021887	AAC	2	6	587686	587691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318350
13048	NC_021887	CTT	2	6	587698	587703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318350
13049	NC_021887	ATCAC	2	10	587744	587753	40 %	20 %	0 %	40 %	527318350
13050	NC_021887	CGA	2	6	587771	587776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318350
13051	NC_021887	TAT	2	6	587820	587825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318350
13052	NC_021887	ACT	2	6	587872	587877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318351
13053	NC_021887	CTT	2	6	587953	587958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318351
13054	NC_021887	ATA	2	6	587981	587986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318351
13055	NC_021887	ACC	2	6	588003	588008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527318351
13056	NC_021887	AAC	3	9	588047	588055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318351
13057	NC_021887	T	6	6	588058	588063	0 %	100 %	0 %	0 %	527318351
13058	NC_021887	TGA	2	6	588071	588076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318351
13059	NC_021887	ACT	2	6	588078	588083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318351
13060	NC_021887	T	7	7	588139	588145	0 %	100 %	0 %	0 %	527318352
13061	NC_021887	TAT	2	6	588153	588158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318352
13062	NC_021887	TGA	2	6	588196	588201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318352
13063	NC_021887	AGC	2	6	588225	588230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318352
13064	NC_021887	CGCA	2	8	588234	588241	25 %	0 %	25 %	50 %	527318352
13065	NC_021887	AG	3	6	588248	588253	50 %	0 %	50 %	0 %	527318352
13066	NC_021887	T	6	6	588255	588260	0 %	100 %	0 %	0 %	527318352
13067	NC_021887	TC	3	6	588299	588304	0 %	50 %	0 %	50 %	527318352
13068	NC_021887	TAA	2	6	588315	588320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318352
13069	NC_021887	T	6	6	588325	588330	0 %	100 %	0 %	0 %	527318352
13070	NC_021887	GCA	2	6	588389	588394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318353
13071	NC_021887	TCT	2	6	588419	588424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318353
13072	NC_021887	ACA	2	6	588467	588472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318353
13073	NC_021887	CAG	2	6	588519	588524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318353
13074	NC_021887	T	6	6	588526	588531	0 %	100 %	0 %	0 %	527318353
13075	NC_021887	GGC	2	6	588621	588626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527318353
13076	NC_021887	ATCC	2	8	588632	588639	25 %	25 %	0 %	50 %	527318353
13077	NC_021887	CAA	2	6	588675	588680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318353
13078	NC_021887	CTG	2	6	588718	588723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318353
13079	NC_021887	ATA	2	6	588755	588760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318353
13080	NC_021887	CA	3	6	588764	588769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13081	NC_021887	GCA	2	6	588793	588798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318354
13082	NC_021887	AGC	2	6	588807	588812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318354
13083	NC_021887	CTT	2	6	588840	588845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318354
13084	NC_021887	AGT	2	6	588888	588893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318354
13085	NC_021887	CCGA	2	8	588968	588975	25 %	0 %	25 %	50 %	527318354
13086	NC_021887	GAAA	2	8	589074	589081	75 %	0 %	25 %	0 %	527318354
13087	NC_021887	CGA	2	6	589115	589120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318354
13088	NC_021887	TTC	2	6	589225	589230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318354
13089	NC_021887	AAC	2	6	589293	589298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318354
13090	NC_021887	GCA	2	6	589306	589311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318354
13091	NC_021887	AAG	2	6	589319	589324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318354
13092	NC_021887	TCT	2	6	589328	589333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318354
13093	NC_021887	ATT	2	6	589386	589391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318354
13094	NC_021887	CT	3	6	589481	589486	0 %	50 %	0 %	50 %	527318355
13095	NC_021887	CAA	2	6	589490	589495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318355
13096	NC_021887	T	6	6	589665	589670	0 %	100 %	0 %	0 %	527318355
13097	NC_021887	CAA	2	6	589721	589726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318355
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13099	NC_021887	GTAT	2	8	589781	589788	25 %	50 %	25 %	0 %	527318355
13100	NC_021887	T	6	6	589833	589838	0 %	100 %	0 %	0 %	527318356
13101	NC_021887	TTG	2	6	589862	589867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318356
13102	NC_021887	GA	3	6	589868	589873	50 %	0 %	50 %	0 %	527318356
13103	NC_021887	ACG	2	6	589983	589988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318356
13104	NC_021887	TCT	2	6	590012	590017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318356
13105	NC_021887	TGA	2	6	590053	590058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318356
13106	NC_021887	CAA	2	6	590060	590065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318356
13107	NC_021887	TTA	2	6	590127	590132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318357
13108	NC_021887	CAC	2	6	590215	590220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527318357
13109	NC_021887	CGA	2	6	590286	590291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318357
13110	NC_021887	AC	3	6	590310	590315	50 %	0 %	0 %	50 %	527318357
13111	NC_021887	TTCA	2	8	590363	590370	25 %	50 %	0 %	25 %	527318357
13112	NC_021887	GAT	2	6	590426	590431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318357
13113	NC_021887	GCA	2	6	590534	590539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318357
13114	NC_021887	CTTC	2	8	590556	590563	0 %	50 %	0 %	50 %	527318357
13115	NC_021887	TTA	2	6	590709	590714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318357
13116	NC_021887	CTC	3	9	590749	590757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318357
13117	NC_021887	GGC	2	6	590764	590769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527318357
13118	NC_021887	A	6	6	590814	590819	100 %	0 %	0 %	0 %	527318357
13119	NC_021887	CTT	2	6	590844	590849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318357
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13121	NC_021887	TCA	2	6	590889	590894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318357
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