MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_021487	GCGA	2	8	2525235	2525242	25 %	0 %	50 %	25 %	512552144
49002	NC_021487	GCG	2	6	2525247	2525252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552144
49003	NC_021487	CAC	2	6	2525274	2525279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552144
49004	NC_021487	AAT	2	6	2525298	2525303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552144
49005	NC_021487	TC	3	6	2525350	2525355	0 %	50 %	0 %	50 %	512552144
49006	NC_021487	ATG	2	6	2525359	2525364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552144
49007	NC_021487	TCG	2	6	2525377	2525382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552144
49008	NC_021487	GGT	2	6	2525406	2525411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552144
49009	NC_021487	GC	3	6	2525487	2525492	0 %	0 %	50 %	50 %	512552144
49010	NC_021487	TCC	2	6	2525494	2525499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552144
49011	NC_021487	TCC	2	6	2525539	2525544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552144
49012	NC_021487	CCTC	2	8	2525639	2525646	0 %	25 %	0 %	75 %	512552144
49013	NC_021487	GCA	2	6	2525650	2525655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552144
49014	NC_021487	GTT	2	6	2525672	2525677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552144
49015	NC_021487	ACG	2	6	2525712	2525717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552144
49016	NC_021487	CT	3	6	2525725	2525730	0 %	50 %	0 %	50 %	512552144
49017	NC_021487	GTTTTC	2	12	2525784	2525795	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	512552144
49018	NC_021487	CTC	2	6	2525820	2525825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552144
49019	NC_021487	TCC	2	6	2525857	2525862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552144
49020	NC_021487	CT	3	6	2525865	2525870	0 %	50 %	0 %	50 %	512552144
49021	NC_021487	TC	3	6	2525881	2525886	0 %	50 %	0 %	50 %	512552144
49022	NC_021487	TG	4	8	2525908	2525915	0 %	50 %	50 %	0 %	512552144
49023	NC_021487	CTC	2	6	2525940	2525945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552144
49024	NC_021487	CGA	2	6	2525953	2525958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552144
49025	NC_021487	GAA	2	6	2525964	2525969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552144
49026	NC_021487	AAGG	2	8	2525988	2525995	50 %	0 %	50 %	0 %	512552144
49027	NC_021487	AAC	2	6	2526015	2526020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552144
49028	NC_021487	TAT	2	6	2526134	2526139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512552145
49029	NC_021487	CTT	2	6	2526163	2526168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552145
49030	NC_021487	GCA	2	6	2526206	2526211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552145
49031	NC_021487	T	6	6	2526219	2526224	0 %	100 %	0 %	0 %	512552145
49032	NC_021487	GC	4	8	2526290	2526297	0 %	0 %	50 %	50 %	512552145
49033	NC_021487	TCA	2	6	2526452	2526457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552145
49034	NC_021487	CCAC	2	8	2526460	2526467	25 %	0 %	0 %	75 %	512552145
49035	NC_021487	CTC	2	6	2526478	2526483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552145
49036	NC_021487	CT	3	6	2526605	2526610	0 %	50 %	0 %	50 %	512552145
49037	NC_021487	CTA	2	6	2526624	2526629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49038	NC_021487	CCT	2	6	2526630	2526635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552146
49039	NC_021487	CAT	2	6	2526658	2526663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552146
49040	NC_021487	GTG	2	6	2526702	2526707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552146
49041	NC_021487	ATG	2	6	2526716	2526721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552146
49042	NC_021487	CAG	2	6	2526734	2526739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552146
49043	NC_021487	GTT	2	6	2526757	2526762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552146
49044	NC_021487	TGGGT	2	10	2526795	2526804	0 %	40 %	60 %	0 %	512552146
49045	NC_021487	ATG	2	6	2526828	2526833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552146
49046	NC_021487	G	6	6	2526869	2526874	0 %	0 %	100 %	0 %	512552146
49047	NC_021487	GCA	2	6	2526961	2526966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552146
49048	NC_021487	CGG	2	6	2527083	2527088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552146
49049	NC_021487	CGA	2	6	2527152	2527157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552146
49050	NC_021487	GGT	2	6	2527177	2527182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552146
49051	NC_021487	GT	3	6	2527187	2527192	0 %	50 %	50 %	0 %	512552146
49052	NC_021487	ATG	2	6	2527401	2527406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552146
49053	NC_021487	GAG	2	6	2527469	2527474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49054	NC_021487	TGAT	2	8	2527542	2527549	25 %	50 %	25 %	0 %	512552147
49055	NC_021487	CGA	2	6	2527581	2527586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552147
49056	NC_021487	CCA	2	6	2527590	2527595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552147
49057	NC_021487	GT	3	6	2527606	2527611	0 %	50 %	50 %	0 %	512552147
49058	NC_021487	GCA	2	6	2527680	2527685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552147
49059	NC_021487	TGC	2	6	2527712	2527717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552147
49060	NC_021487	GGC	2	6	2527797	2527802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552147
49061	NC_021487	GTG	2	6	2527829	2527834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552147
49062	NC_021487	GCCT	2	8	2527929	2527936	0 %	25 %	25 %	50 %	512552147
49063	NC_021487	GTC	2	6	2527937	2527942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552147
49064	NC_021487	GCC	2	6	2527969	2527974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552147
49065	NC_021487	AGGG	2	8	2528021	2528028	25 %	0 %	75 %	0 %	512552147
49066	NC_021487	TCG	2	6	2528132	2528137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552147
49067	NC_021487	G	6	6	2528177	2528182	0 %	0 %	100 %	0 %	512552147
49068	NC_021487	GCAC	2	8	2528249	2528256	25 %	0 %	25 %	50 %	512552147
49069	NC_021487	GAG	2	6	2528331	2528336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552147
49070	NC_021487	CCT	2	6	2528364	2528369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552147
49071	NC_021487	G	6	6	2528404	2528409	0 %	0 %	100 %	0 %	512552147
49072	NC_021487	GGC	2	6	2528422	2528427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552147
49073	NC_021487	GC	3	6	2528473	2528478	0 %	0 %	50 %	50 %	512552147
49074	NC_021487	GGC	2	6	2528508	2528513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552147
49075	NC_021487	CCCCG	2	10	2528527	2528536	0 %	0 %	20 %	80 %	512552147
49076	NC_021487	ACC	2	6	2528552	2528557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552147
49077	NC_021487	GGC	2	6	2528563	2528568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552147
49078	NC_021487	CAG	2	6	2528604	2528609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49079	NC_021487	AAG	2	6	2528652	2528657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49080	NC_021487	GT	3	6	2528669	2528674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49081	NC_021487	GGT	2	6	2528692	2528697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49082	NC_021487	A	6	6	2528732	2528737	100 %	0 %	0 %	0 %	512552148
49083	NC_021487	GAAA	2	8	2528758	2528765	75 %	0 %	25 %	0 %	512552148
49084	NC_021487	CCTGC	2	10	2528781	2528790	0 %	20 %	20 %	60 %	512552148
49085	NC_021487	CGT	2	6	2528793	2528798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552148
49086	NC_021487	TTG	2	6	2528809	2528814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552148
49087	NC_021487	GCT	2	6	2528888	2528893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552148
49088	NC_021487	CTG	2	6	2529024	2529029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552148
49089	NC_021487	GCC	2	6	2529075	2529080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552148
49090	NC_021487	AGG	2	6	2529100	2529105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552148
49091	NC_021487	GGTG	2	8	2529108	2529115	0 %	25 %	75 %	0 %	512552148
49092	NC_021487	TGG	2	6	2529119	2529124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552148
49093	NC_021487	TGG	2	6	2529127	2529132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552148
49094	NC_021487	CTA	2	6	2529150	2529155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552148
49095	NC_021487	ATG	2	6	2529186	2529191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552148
49096	NC_021487	A	6	6	2529292	2529297	100 %	0 %	0 %	0 %	512552148
49097	NC_021487	A	6	6	2529385	2529390	100 %	0 %	0 %	0 %	512552148
49098	NC_021487	GGT	2	6	2529434	2529439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552148
49099	NC_021487	AGA	2	6	2529545	2529550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552148
49100	NC_021487	GCT	2	6	2529555	2529560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552148
49101	NC_021487	GCA	2	6	2529663	2529668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552148
49102	NC_021487	GAG	2	6	2529690	2529695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552148
49103	NC_021487	AG	3	6	2529978	2529983	50 %	0 %	50 %	0 %	512552148
49104	NC_021487	CGA	2	6	2529995	2530000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552148
49105	NC_021487	CTG	2	6	2530092	2530097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552148
49106	NC_021487	CGG	2	6	2530100	2530105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552148
49107	NC_021487	CCA	2	6	2530108	2530113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552148
49108	NC_021487	GGT	2	6	2530256	2530261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552148
49109	NC_021487	TCG	2	6	2530316	2530321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552148
49110	NC_021487	AG	3	6	2530388	2530393	50 %	0 %	50 %	0 %	512552148
49111	NC_021487	TGC	2	6	2530438	2530443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552148
49112	NC_021487	ATC	2	6	2530545	2530550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552148
49113	NC_021487	GGAGC	2	10	2530638	2530647	20 %	0 %	60 %	20 %	512552148
49114	NC_021487	GGCGA	2	10	2530657	2530666	20 %	0 %	60 %	20 %	512552148
49115	NC_021487	AGC	3	9	2530762	2530770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552148
49116	NC_021487	GAG	2	6	2530839	2530844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552148
49117	NC_021487	GTG	2	6	2530887	2530892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552148
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49120	NC_021487	GAT	2	6	2530970	2530975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552148
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49131	NC_021487	TTC	2	6	2531427	2531432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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49135	NC_021487	CT	3	6	2531506	2531511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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49138	NC_021487	TGT	2	6	2531678	2531683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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49222	NC_021487	TCCT	2	8	2536583	2536590	0 %	50 %	0 %	50 %	512552151
49223	NC_021487	GAG	2	6	2536597	2536602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552151
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49227	NC_021487	ATCAC	2	10	2536805	2536814	40 %	20 %	0 %	40 %	512552151
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49229	NC_021487	GAT	2	6	2536951	2536956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552151
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49231	NC_021487	A	6	6	2537117	2537122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49232	NC_021487	CTT	2	6	2537163	2537168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49233	NC_021487	CAA	2	6	2537179	2537184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49234	NC_021487	TGA	2	6	2537255	2537260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49235	NC_021487	TTA	2	6	2537314	2537319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49236	NC_021487	CG	3	6	2537323	2537328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49237	NC_021487	CAC	2	6	2537341	2537346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49238	NC_021487	CTG	2	6	2537363	2537368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49239	NC_021487	GAT	2	6	2537406	2537411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49240	NC_021487	CTG	2	6	2537421	2537426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49241	NC_021487	GAGG	2	8	2537438	2537445	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49242	NC_021487	TGC	2	6	2537453	2537458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49243	NC_021487	TC	3	6	2537558	2537563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49244	NC_021487	AG	3	6	2537566	2537571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49245	NC_021487	CGCAA	2	10	2537696	2537705	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49246	NC_021487	TCGG	2	8	2537824	2537831	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49247	NC_021487	GAGC	2	8	2537893	2537900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49248	NC_021487	AGC	2	6	2537931	2537936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49249	NC_021487	GAG	2	6	2538002	2538007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49250	NC_021487	GAC	2	6	2538008	2538013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49251	NC_021487	AAC	2	6	2538102	2538107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49252	NC_021487	TGG	2	6	2538282	2538287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552152
49253	NC_021487	AG	3	6	2538366	2538371	50 %	0 %	50 %	0 %	512552152
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49264	NC_021487	TCG	2	6	2538854	2538859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552152
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49272	NC_021487	TCG	2	6	2539004	2539009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552152
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49294	NC_021487	AGGAA	2	10	2540290	2540299	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49295	NC_021487	A	6	6	2540298	2540303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49296	NC_021487	GTTG	2	8	2540315	2540322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49297	NC_021487	CA	3	6	2540374	2540379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49298	NC_021487	TA	3	6	2540404	2540409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49299	NC_021487	ATG	2	6	2540414	2540419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49300	NC_021487	AG	3	6	2540443	2540448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49301	NC_021487	TGC	2	6	2540479	2540484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49302	NC_021487	AG	3	6	2540519	2540524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49303	NC_021487	CCT	2	6	2540596	2540601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552153
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49347	NC_021487	GAT	2	6	2542929	2542934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552154
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49351	NC_021487	GTC	2	6	2543040	2543045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552154
49352	NC_021487	ACG	2	6	2543086	2543091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552154
49353	NC_021487	GGC	2	6	2543106	2543111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552154
49354	NC_021487	GA	3	6	2543120	2543125	50 %	0 %	50 %	0 %	512552154
49355	NC_021487	CT	3	6	2543203	2543208	0 %	50 %	0 %	50 %	512552154
49356	NC_021487	GC	3	6	2543259	2543264	0 %	0 %	50 %	50 %	512552154
49357	NC_021487	GAAA	2	8	2543314	2543321	75 %	0 %	25 %	0 %	512552154
49358	NC_021487	GAAGC	2	10	2543408	2543417	40 %	0 %	40 %	20 %	512552154
49359	NC_021487	CT	3	6	2543419	2543424	0 %	50 %	0 %	50 %	512552154
49360	NC_021487	CTA	2	6	2543477	2543482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552154
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49362	NC_021487	T	6	6	2543597	2543602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49363	NC_021487	ATC	2	6	2543635	2543640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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49373	NC_021487	CGAAT	2	10	2544346	2544355	40 %	20 %	20 %	20 %	512552155
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49385	NC_021487	GCT	2	6	2545386	2545391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552156
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49391	NC_021487	GGCGA	2	10	2545573	2545582	20 %	0 %	60 %	20 %	512552156
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49453	NC_021487	ACTT	2	8	2548720	2548727	25 %	50 %	0 %	25 %	512552158
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49470	NC_021487	GAT	2	6	2549361	2549366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552158
49471	NC_021487	CG	3	6	2549432	2549437	0 %	0 %	50 %	50 %	512552158
49472	NC_021487	GATGG	2	10	2549440	2549449	20 %	20 %	60 %	0 %	512552158
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49474	NC_021487	GTT	2	6	2549472	2549477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552158
49475	NC_021487	GAA	2	6	2549496	2549501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552158
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49479	NC_021487	GCC	2	6	2549708	2549713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49480	NC_021487	CCG	2	6	2549734	2549739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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49482	NC_021487	CG	3	6	2549808	2549813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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