MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_021487	GCT	2	6	2499469	2499474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552125
48502	NC_021487	TTCCT	2	10	2499549	2499558	0 %	60 %	0 %	40 %	512552125
48503	NC_021487	CTG	2	6	2499611	2499616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552125
48504	NC_021487	TGGC	2	8	2499679	2499686	0 %	25 %	50 %	25 %	512552125
48505	NC_021487	TAC	2	6	2499698	2499703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552125
48506	NC_021487	TGA	2	6	2499708	2499713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552125
48507	NC_021487	CAAA	2	8	2499722	2499729	75 %	0 %	0 %	25 %	512552125
48508	NC_021487	AGA	2	6	2499814	2499819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552125
48509	NC_021487	AGC	2	6	2499878	2499883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48510	NC_021487	CCT	2	6	2499884	2499889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48511	NC_021487	GAG	2	6	2499903	2499908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48512	NC_021487	TCT	2	6	2499978	2499983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552126
48513	NC_021487	GTC	2	6	2500064	2500069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552126
48514	NC_021487	GC	3	6	2500086	2500091	0 %	0 %	50 %	50 %	512552126
48515	NC_021487	ACG	2	6	2500194	2500199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48516	NC_021487	AT	3	6	2500220	2500225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48517	NC_021487	ACA	2	6	2500339	2500344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552127
48518	NC_021487	GCT	2	6	2500415	2500420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552127
48519	NC_021487	AAG	2	6	2500614	2500619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552127
48520	NC_021487	C	6	6	2500631	2500636	0 %	0 %	0 %	100 %	512552127
48521	NC_021487	CGT	2	6	2500770	2500775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552127
48522	NC_021487	GCA	2	6	2500778	2500783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552127
48523	NC_021487	GCG	2	6	2500855	2500860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552127
48524	NC_021487	TCC	2	6	2500903	2500908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552127
48525	NC_021487	GAAG	2	8	2500922	2500929	50 %	0 %	50 %	0 %	512552127
48526	NC_021487	GCG	2	6	2500992	2500997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552127
48527	NC_021487	CAC	2	6	2501073	2501078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552127
48528	NC_021487	GAG	2	6	2501109	2501114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552127
48529	NC_021487	GAG	2	6	2501128	2501133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552127
48530	NC_021487	GGCA	2	8	2501162	2501169	25 %	0 %	50 %	25 %	512552127
48531	NC_021487	GCC	2	6	2501210	2501215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552127
48532	NC_021487	CTC	2	6	2501292	2501297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552127
48533	NC_021487	GCC	2	6	2501320	2501325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552127
48534	NC_021487	AAG	2	6	2501409	2501414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552127
48535	NC_021487	GAG	2	6	2501482	2501487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552127
48536	NC_021487	GTG	2	6	2501531	2501536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552127
48537	NC_021487	CT	3	6	2501566	2501571	0 %	50 %	0 %	50 %	512552127
48538	NC_021487	GA	3	6	2501591	2501596	50 %	0 %	50 %	0 %	512552127
48539	NC_021487	GCCA	2	8	2501603	2501610	25 %	0 %	25 %	50 %	512552127
48540	NC_021487	C	6	6	2501640	2501645	0 %	0 %	0 %	100 %	512552127
48541	NC_021487	AAGG	2	8	2501649	2501656	50 %	0 %	50 %	0 %	512552127
48542	NC_021487	GAT	2	6	2501696	2501701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552127
48543	NC_021487	CAG	2	6	2501703	2501708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552127
48544	NC_021487	C	6	6	2501830	2501835	0 %	0 %	0 %	100 %	512552127
48545	NC_021487	GCG	2	6	2501937	2501942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552127
48546	NC_021487	CTT	2	6	2501960	2501965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552127
48547	NC_021487	GC	3	6	2502013	2502018	0 %	0 %	50 %	50 %	512552127
48548	NC_021487	AG	3	6	2502022	2502027	50 %	0 %	50 %	0 %	512552127
48549	NC_021487	CCT	2	6	2502031	2502036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552127
48550	NC_021487	ATAG	2	8	2502042	2502049	50 %	25 %	25 %	0 %	512552127
48551	NC_021487	GAG	2	6	2502180	2502185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552127
48552	NC_021487	TCG	2	6	2502217	2502222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552127
48553	NC_021487	CCTT	2	8	2502285	2502292	0 %	50 %	0 %	50 %	512552127
48554	NC_021487	GCG	2	6	2502295	2502300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552127
48555	NC_021487	TCT	2	6	2502328	2502333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552127
48556	NC_021487	GCT	2	6	2502392	2502397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552127
48557	NC_021487	GA	3	6	2502463	2502468	50 %	0 %	50 %	0 %	512552127
48558	NC_021487	AAG	2	6	2502501	2502506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552127
48559	NC_021487	TTGCT	2	10	2502518	2502527	0 %	60 %	20 %	20 %	512552127
48560	NC_021487	GCA	2	6	2502554	2502559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552127
48561	NC_021487	GCA	2	6	2502566	2502571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552127
48562	NC_021487	CAC	2	6	2502576	2502581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552127
48563	NC_021487	AG	3	6	2502603	2502608	50 %	0 %	50 %	0 %	512552127
48564	NC_021487	TGGGA	2	10	2502621	2502630	20 %	20 %	60 %	0 %	512552127
48565	NC_021487	TGC	2	6	2502696	2502701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552127
48566	NC_021487	CCT	2	6	2502707	2502712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552127
48567	NC_021487	ATT	2	6	2502747	2502752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512552127
48568	NC_021487	GGT	2	6	2502764	2502769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552127
48569	NC_021487	AG	3	6	2502847	2502852	50 %	0 %	50 %	0 %	512552127
48570	NC_021487	GCG	3	9	2502871	2502879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552127
48571	NC_021487	GAC	2	6	2502953	2502958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552127
48572	NC_021487	GCAT	2	8	2502984	2502991	25 %	25 %	25 %	25 %	512552127
48573	NC_021487	GCT	2	6	2502993	2502998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552127
48574	NC_021487	CCT	2	6	2503012	2503017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552127
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48576	NC_021487	CGC	2	6	2503147	2503152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552127
48577	NC_021487	TAA	2	6	2503268	2503273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552127
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48579	NC_021487	TAGA	2	8	2503447	2503454	50 %	25 %	25 %	0 %	512552127
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48583	NC_021487	TCT	2	6	2503722	2503727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552128
48584	NC_021487	AG	3	6	2503736	2503741	50 %	0 %	50 %	0 %	512552128
48585	NC_021487	CTC	2	6	2503854	2503859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552128
48586	NC_021487	CGG	2	6	2503871	2503876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552128
48587	NC_021487	ACTCC	2	10	2503878	2503887	20 %	20 %	0 %	60 %	512552128
48588	NC_021487	GC	3	6	2503892	2503897	0 %	0 %	50 %	50 %	512552128
48589	NC_021487	AG	3	6	2503920	2503925	50 %	0 %	50 %	0 %	512552128
48590	NC_021487	CGT	2	6	2504042	2504047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552128
48591	NC_021487	TCG	2	6	2504060	2504065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552128
48592	NC_021487	CCATG	2	10	2504214	2504223	20 %	20 %	20 %	40 %	512552128
48593	NC_021487	GCA	2	6	2504229	2504234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552128
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48597	NC_021487	TAG	2	6	2504309	2504314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552128
48598	NC_021487	AGC	2	6	2504429	2504434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552128
48599	NC_021487	GCA	2	6	2504577	2504582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552128
48600	NC_021487	TGG	2	6	2504610	2504615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552128
48601	NC_021487	CAG	2	6	2504641	2504646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552128
48602	NC_021487	TCC	2	6	2504732	2504737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552128
48603	NC_021487	CTG	2	6	2504782	2504787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552128
48604	NC_021487	CAG	2	6	2504788	2504793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552128
48605	NC_021487	AG	3	6	2504884	2504889	50 %	0 %	50 %	0 %	512552128
48606	NC_021487	G	6	6	2504921	2504926	0 %	0 %	100 %	0 %	512552128
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48612	NC_021487	CT	3	6	2505435	2505440	0 %	50 %	0 %	50 %	512552129
48613	NC_021487	GTC	2	6	2505500	2505505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552129
48614	NC_021487	CGT	2	6	2505535	2505540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552129
48615	NC_021487	CCA	2	6	2505556	2505561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552129
48616	NC_021487	CAC	2	6	2505650	2505655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552129
48617	NC_021487	TGA	2	6	2505709	2505714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552129
48618	NC_021487	ATGG	2	8	2505758	2505765	25 %	25 %	50 %	0 %	512552129
48619	NC_021487	GCG	2	6	2505783	2505788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552129
48620	NC_021487	ATC	2	6	2505896	2505901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552129
48621	NC_021487	AGC	2	6	2506071	2506076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552130
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48623	NC_021487	GCT	2	6	2506130	2506135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552130
48624	NC_021487	CGAG	2	8	2506184	2506191	25 %	0 %	50 %	25 %	512552130
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48626	NC_021487	CGA	2	6	2506411	2506416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552130
48627	NC_021487	ATGG	2	8	2506419	2506426	25 %	25 %	50 %	0 %	512552130
48628	NC_021487	GGC	2	6	2506473	2506478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552130
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48631	NC_021487	GCC	2	6	2506662	2506667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552130
48632	NC_021487	CGC	2	6	2506727	2506732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552130
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48637	NC_021487	AG	3	6	2506991	2506996	50 %	0 %	50 %	0 %	512552131
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48644	NC_021487	CGT	2	6	2507266	2507271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552131
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48649	NC_021487	TG	3	6	2507629	2507634	0 %	50 %	50 %	0 %	512552131
48650	NC_021487	TG	3	6	2507668	2507673	0 %	50 %	50 %	0 %	512552131
48651	NC_021487	AGGC	2	8	2507679	2507686	25 %	0 %	50 %	25 %	512552131
48652	NC_021487	CCG	2	6	2507712	2507717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552131
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48658	NC_021487	T	7	7	2507925	2507931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48659	NC_021487	GTG	2	6	2507952	2507957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552132
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48686	NC_021487	CTCCGC	2	12	2509502	2509513	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512552133
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48690	NC_021487	CG	3	6	2509681	2509686	0 %	0 %	50 %	50 %	512552133
48691	NC_021487	ACG	2	6	2509754	2509759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552133
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48693	NC_021487	GCT	2	6	2509777	2509782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552133
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48698	NC_021487	CTT	3	9	2510025	2510033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48699	NC_021487	ACA	2	6	2510044	2510049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48700	NC_021487	AGGG	2	8	2510061	2510068	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48701	NC_021487	TCTCA	2	10	2510093	2510102	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48702	NC_021487	GCAA	2	8	2510104	2510111	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48703	NC_021487	AGCA	2	8	2510114	2510121	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48704	NC_021487	AGG	2	6	2510169	2510174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552134
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48707	NC_021487	TGGT	2	8	2510432	2510439	0 %	50 %	50 %	0 %	512552134
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48709	NC_021487	GCA	2	6	2510616	2510621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552134
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48721	NC_021487	ACGA	2	8	2511461	2511468	50 %	0 %	25 %	25 %	512552134
48722	NC_021487	AG	3	6	2511478	2511483	50 %	0 %	50 %	0 %	512552134
48723	NC_021487	AGGC	2	8	2511528	2511535	25 %	0 %	50 %	25 %	512552134
48724	NC_021487	TGG	2	6	2511588	2511593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552134
48725	NC_021487	CCG	2	6	2511594	2511599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552134
48726	NC_021487	TGGC	2	8	2511662	2511669	0 %	25 %	50 %	25 %	512552134
48727	NC_021487	TACC	2	8	2511714	2511721	25 %	25 %	0 %	50 %	512552134
48728	NC_021487	AAC	2	6	2511761	2511766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552134
48729	NC_021487	GTT	2	6	2511835	2511840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552134
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48731	NC_021487	CAA	3	9	2512012	2512020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552134
48732	NC_021487	CTT	2	6	2512117	2512122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552134
48733	NC_021487	CTCG	2	8	2512146	2512153	0 %	25 %	25 %	50 %	512552134
48734	NC_021487	CTC	2	6	2512161	2512166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552134
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48970	NC_021487	TGG	2	6	2523576	2523581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552142
48971	NC_021487	AG	3	6	2523601	2523606	50 %	0 %	50 %	0 %	512552142
48972	NC_021487	CGA	2	6	2523627	2523632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552142
48973	NC_021487	AT	3	6	2523670	2523675	50 %	50 %	0 %	0 %	512552143
48974	NC_021487	GCA	2	6	2523785	2523790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552143
48975	NC_021487	CAC	2	6	2523810	2523815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552143
48976	NC_021487	GAT	2	6	2523831	2523836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552143
48977	NC_021487	TG	6	12	2523919	2523930	0 %	50 %	50 %	0 %	512552143
48978	NC_021487	TAG	2	6	2524044	2524049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552143
48979	NC_021487	ATC	2	6	2524050	2524055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552143
48980	NC_021487	ATC	2	6	2524071	2524076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552143
48981	NC_021487	GATA	2	8	2524139	2524146	50 %	25 %	25 %	0 %	512552143
48982	NC_021487	GGGT	2	8	2524170	2524177	0 %	25 %	75 %	0 %	512552143
48983	NC_021487	GATGCC	2	12	2524308	2524319	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512552143
48984	NC_021487	ACC	2	6	2524342	2524347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552143
48985	NC_021487	GTC	2	6	2524412	2524417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552143
48986	NC_021487	ACG	2	6	2524420	2524425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552143
48987	NC_021487	TCC	2	6	2524459	2524464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48988	NC_021487	GCG	2	6	2524554	2524559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552144
48989	NC_021487	GGC	2	6	2524584	2524589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552144
48990	NC_021487	T	6	6	2524655	2524660	0 %	100 %	0 %	0 %	512552144
48991	NC_021487	CGGG	2	8	2524743	2524750	0 %	0 %	75 %	25 %	512552144
48992	NC_021487	CGT	2	6	2524808	2524813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552144
48993	NC_021487	TGG	2	6	2524816	2524821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552144
48994	NC_021487	CGG	2	6	2524826	2524831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552144
48995	NC_021487	GCA	2	6	2524934	2524939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552144
48996	NC_021487	GCT	2	6	2524981	2524986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552144
48997	NC_021487	GC	3	6	2525119	2525124	0 %	0 %	50 %	50 %	512552144
48998	NC_021487	TTC	2	6	2525145	2525150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552144
48999	NC_021487	CCT	2	6	2525153	2525158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552144
49000	NC_021487	TGGA	2	8	2525193	2525200	25 %	25 %	50 %	0 %	512552144

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