MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46502	NC_021487	TGC	2	6	2397315	2397320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552036
46503	NC_021487	ATC	2	6	2397358	2397363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552036
46504	NC_021487	GCT	2	6	2397396	2397401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552036
46505	NC_021487	GTA	2	6	2397450	2397455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46506	NC_021487	GAT	2	6	2397669	2397674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552037
46507	NC_021487	CCT	2	6	2397692	2397697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552037
46508	NC_021487	AGAGC	2	10	2397713	2397722	40 %	0 %	40 %	20 %	512552037
46509	NC_021487	TAG	2	6	2397766	2397771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552037
46510	NC_021487	ATA	2	6	2397786	2397791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512552037
46511	NC_021487	GCC	2	6	2397802	2397807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552037
46512	NC_021487	GCA	2	6	2397845	2397850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552037
46513	NC_021487	CGGCAT	2	12	2397860	2397871	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512552037
46514	NC_021487	ACCC	2	8	2397922	2397929	25 %	0 %	0 %	75 %	512552037
46515	NC_021487	TCT	2	6	2397937	2397942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552037
46516	NC_021487	GCG	2	6	2397946	2397951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552037
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46519	NC_021487	GCTT	2	8	2398027	2398034	0 %	50 %	25 %	25 %	512552037
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46527	NC_021487	AGAGG	2	10	2398429	2398438	40 %	0 %	60 %	0 %	512552037
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46533	NC_021487	TCT	2	6	2398627	2398632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46534	NC_021487	TAGTT	2	10	2398691	2398700	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46535	NC_021487	GGC	2	6	2398704	2398709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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46537	NC_021487	AG	3	6	2398813	2398818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46538	NC_021487	GCG	2	6	2398848	2398853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552038
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46601	NC_021487	GTAC	2	8	2402075	2402082	25 %	25 %	25 %	25 %	512552040
46602	NC_021487	ATG	2	6	2402089	2402094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552040
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46612	NC_021487	TGG	2	6	2402824	2402829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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46616	NC_021487	ATT	2	6	2402938	2402943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512552041
46617	NC_021487	T	6	6	2402958	2402963	0 %	100 %	0 %	0 %	512552041
46618	NC_021487	GTG	2	6	2402982	2402987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552041
46619	NC_021487	CTC	2	6	2403051	2403056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552041
46620	NC_021487	TTG	2	6	2403170	2403175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552042
46621	NC_021487	TTC	2	6	2403219	2403224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552042
46622	NC_021487	GCA	2	6	2403295	2403300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552042
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46625	NC_021487	ATC	3	9	2403408	2403416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552042
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46627	NC_021487	TGT	2	6	2403532	2403537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552042
46628	NC_021487	TCG	2	6	2403621	2403626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552042
46629	NC_021487	GGA	2	6	2403627	2403632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552042
46630	NC_021487	GCT	2	6	2403661	2403666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552042
46631	NC_021487	GCC	2	6	2403747	2403752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552042
46632	NC_021487	AGGC	2	8	2403849	2403856	25 %	0 %	50 %	25 %	512552042
46633	NC_021487	GCT	2	6	2403906	2403911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552042
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46635	NC_021487	ACT	2	6	2403933	2403938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552042
46636	NC_021487	TGC	2	6	2403964	2403969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552042
46637	NC_021487	CTTT	2	8	2403988	2403995	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46638	NC_021487	GAA	2	6	2404034	2404039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46639	NC_021487	TG	3	6	2404073	2404078	0 %	50 %	50 %	0 %	512552043
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46644	NC_021487	TCC	2	6	2404523	2404528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552043
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46646	NC_021487	GCC	2	6	2404613	2404618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552043
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46648	NC_021487	AG	3	6	2404636	2404641	50 %	0 %	50 %	0 %	512552043
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46650	NC_021487	TCG	2	6	2404715	2404720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552043
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46658	NC_021487	GTT	2	6	2405044	2405049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552043
46659	NC_021487	A	6	6	2405219	2405224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46660	NC_021487	GTT	2	6	2405309	2405314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46661	NC_021487	GCG	2	6	2405356	2405361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46662	NC_021487	CTTG	2	8	2405404	2405411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46663	NC_021487	CTG	2	6	2405478	2405483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552044
46664	NC_021487	TTG	2	6	2405484	2405489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552044
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46676	NC_021487	GCA	2	6	2406125	2406130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552044
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46681	NC_021487	CTACC	2	10	2406326	2406335	20 %	20 %	0 %	60 %	512552044
46682	NC_021487	GCG	2	6	2406412	2406417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552044
46683	NC_021487	GCA	2	6	2406515	2406520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552044
46684	NC_021487	GCCT	2	8	2406535	2406542	0 %	25 %	25 %	50 %	512552044
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46686	NC_021487	CAG	2	6	2406597	2406602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552044
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46696	NC_021487	TGC	2	6	2406932	2406937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552044
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46701	NC_021487	AT	4	8	2407186	2407193	50 %	50 %	0 %	0 %	512552044
46702	NC_021487	ATT	2	6	2407251	2407256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512552044
46703	NC_021487	ACA	2	6	2407453	2407458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552044
46704	NC_021487	TGG	2	6	2407498	2407503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552044
46705	NC_021487	GC	3	6	2407509	2407514	0 %	0 %	50 %	50 %	512552044
46706	NC_021487	GGAGC	2	10	2407521	2407530	20 %	0 %	60 %	20 %	512552044
46707	NC_021487	CGC	2	6	2407559	2407564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552044
46708	NC_021487	AGA	2	6	2407586	2407591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46709	NC_021487	CAT	2	6	2407608	2407613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552045
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46711	NC_021487	GGC	2	6	2407705	2407710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552045
46712	NC_021487	CAA	2	6	2407714	2407719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512552045
46713	NC_021487	GGT	2	6	2407890	2407895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552045
46714	NC_021487	ACG	2	6	2407940	2407945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552045
46715	NC_021487	GC	3	6	2407959	2407964	0 %	0 %	50 %	50 %	512552045
46716	NC_021487	AC	3	6	2407970	2407975	50 %	0 %	0 %	50 %	512552045
46717	NC_021487	CCCA	2	8	2408050	2408057	25 %	0 %	0 %	75 %	512552045
46718	NC_021487	CGG	2	6	2408225	2408230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552045
46719	NC_021487	TGC	2	6	2408393	2408398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552045
46720	NC_021487	CTC	2	6	2408415	2408420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552045
46721	NC_021487	GGC	2	6	2408467	2408472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552045
46722	NC_021487	T	7	7	2408493	2408499	0 %	100 %	0 %	0 %	512552045
46723	NC_021487	CTA	2	6	2408538	2408543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552045
46724	NC_021487	ATCA	2	8	2408692	2408699	50 %	25 %	0 %	25 %	512552045
46725	NC_021487	CAC	2	6	2408709	2408714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552045
46726	NC_021487	ACG	2	6	2408803	2408808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552045
46727	NC_021487	ATC	2	6	2408977	2408982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552045
46728	NC_021487	GCC	2	6	2409013	2409018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552045
46729	NC_021487	AG	3	6	2409053	2409058	50 %	0 %	50 %	0 %	512552045
46730	NC_021487	TGG	2	6	2409120	2409125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552045
46731	NC_021487	TCA	3	9	2409155	2409163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552045
46732	NC_021487	CCT	2	6	2409200	2409205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552045
46733	NC_021487	ATG	2	6	2409232	2409237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552045
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46844	NC_021487	ACCT	2	8	2415144	2415151	25 %	25 %	0 %	50 %	512552048
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46847	NC_021487	GA	4	8	2415376	2415383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46848	NC_021487	CGG	2	6	2415401	2415406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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46997	NC_021487	GC	3	6	2423860	2423865	0 %	0 %	50 %	50 %	512552056
46998	NC_021487	TCCC	2	8	2423869	2423876	0 %	25 %	0 %	75 %	512552056
46999	NC_021487	TGG	3	9	2423935	2423943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552056
47000	NC_021487	GCC	2	6	2423955	2423960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512552056

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