MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_021487	C	6	6	2370897	2370902	0 %	0 %	0 %	100 %	512552006
46003	NC_021487	ATG	2	6	2370918	2370923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552006
46004	NC_021487	TGG	2	6	2371072	2371077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552006
46005	NC_021487	CGG	2	6	2371123	2371128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552006
46006	NC_021487	GCGG	2	8	2371212	2371219	0 %	0 %	75 %	25 %	512552006
46007	NC_021487	CGA	2	6	2371279	2371284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552006
46008	NC_021487	GCA	2	6	2371330	2371335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552006
46009	NC_021487	TGT	2	6	2371374	2371379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512552007
46010	NC_021487	GAA	2	6	2371383	2371388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552007
46011	NC_021487	GAG	2	6	2371389	2371394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512552007
46012	NC_021487	TAG	2	6	2371428	2371433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552007
46013	NC_021487	TCT	2	6	2371500	2371505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512552007
46014	NC_021487	GC	3	6	2371511	2371516	0 %	0 %	50 %	50 %	512552007
46015	NC_021487	AAG	2	6	2371538	2371543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512552007
46016	NC_021487	TCG	2	6	2371613	2371618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552007
46017	NC_021487	CGA	2	6	2371624	2371629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552007
46018	NC_021487	T	6	6	2371646	2371651	0 %	100 %	0 %	0 %	512552007
46019	NC_021487	AGC	2	6	2371652	2371657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552007
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46021	NC_021487	C	6	6	2371734	2371739	0 %	0 %	0 %	100 %	512552008
46022	NC_021487	GCA	2	6	2371814	2371819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552008
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46024	NC_021487	GCGATG	2	12	2372008	2372019	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512552008
46025	NC_021487	CA	3	6	2372205	2372210	50 %	0 %	0 %	50 %	512552008
46026	NC_021487	AC	3	6	2372251	2372256	50 %	0 %	0 %	50 %	512552008
46027	NC_021487	AAGG	2	8	2372260	2372267	50 %	0 %	50 %	0 %	512552008
46028	NC_021487	GA	3	6	2372547	2372552	50 %	0 %	50 %	0 %	512552008
46029	NC_021487	ACG	2	6	2372609	2372614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552008
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46032	NC_021487	TG	3	6	2372816	2372821	0 %	50 %	50 %	0 %	512552008
46033	NC_021487	GGTTT	2	10	2372822	2372831	0 %	60 %	40 %	0 %	512552008
46034	NC_021487	CCAC	2	8	2372963	2372970	25 %	0 %	0 %	75 %	512552008
46035	NC_021487	ATC	2	6	2373062	2373067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552008
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46039	NC_021487	AT	3	6	2373392	2373397	50 %	50 %	0 %	0 %	512552008
46040	NC_021487	CT	3	6	2373417	2373422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46041	NC_021487	GCTG	2	8	2373441	2373448	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46042	NC_021487	GCA	2	6	2373581	2373586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552009
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46049	NC_021487	AGG	2	6	2373789	2373794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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46054	NC_021487	AG	3	6	2373965	2373970	50 %	0 %	50 %	0 %	512552010
46055	NC_021487	ATG	2	6	2374008	2374013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512552010
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46102	NC_021487	CGT	2	6	2376420	2376425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46103	NC_021487	TCG	2	6	2376467	2376472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46104	NC_021487	TGG	2	6	2376473	2376478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46105	NC_021487	GGC	2	6	2376556	2376561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552014
46106	NC_021487	CAG	2	6	2376578	2376583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512552014
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46115	NC_021487	CGG	2	6	2377161	2377166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552014
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46118	NC_021487	TCTT	2	8	2377480	2377487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46119	NC_021487	CTC	2	6	2377516	2377521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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46121	NC_021487	CTA	2	6	2377601	2377606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512552015
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46127	NC_021487	CGT	2	6	2378115	2378120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512552015
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46224	NC_021487	TAAAA	2	10	2383066	2383075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46225	NC_021487	A	6	6	2383072	2383077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46226	NC_021487	GAAG	2	8	2383121	2383128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46227	NC_021487	TAT	2	6	2383148	2383153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46228	NC_021487	CTT	2	6	2383170	2383175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46229	NC_021487	TGG	2	6	2383266	2383271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512552022
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46231	NC_021487	ACC	2	6	2383324	2383329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512552022
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46420	NC_021487	GAAGA	2	10	2393209	2393218	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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46464	NC_021487	CGAT	2	8	2395632	2395639	25 %	25 %	25 %	25 %	512552034
46465	NC_021487	TCT	2	6	2395640	2395645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46473	NC_021487	CCTT	2	8	2396137	2396144	0 %	50 %	0 %	50 %	512552035
46474	NC_021487	GGC	2	6	2396145	2396150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512552035
46475	NC_021487	GC	3	6	2396149	2396154	0 %	0 %	50 %	50 %	512552035
46476	NC_021487	GCGA	2	8	2396160	2396167	25 %	0 %	50 %	25 %	512552035
46477	NC_021487	CCT	2	6	2396224	2396229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512552035
46478	NC_021487	GCG	2	6	2396280	2396285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46479	NC_021487	ATG	2	6	2396298	2396303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46480	NC_021487	AG	3	6	2396315	2396320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46481	NC_021487	TC	3	6	2396328	2396333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46482	NC_021487	T	6	6	2396388	2396393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46483	NC_021487	A	6	6	2396479	2396484	100 %	0 %	0 %	0 %	512552036
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