MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_021487	CAG	2	6	2320223	2320228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551968
45002	NC_021487	GCG	2	6	2320364	2320369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551968
45003	NC_021487	CAC	2	6	2320394	2320399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551968
45004	NC_021487	ATG	2	6	2320515	2320520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551968
45005	NC_021487	CAC	2	6	2320673	2320678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551968
45006	NC_021487	CAG	3	9	2320703	2320711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551968
45007	NC_021487	TAGG	2	8	2320825	2320832	25 %	25 %	50 %	0 %	512551968
45008	NC_021487	A	7	7	2320843	2320849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45009	NC_021487	TCT	2	6	2320873	2320878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45010	NC_021487	AAC	2	6	2320914	2320919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45011	NC_021487	TC	3	6	2320975	2320980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45012	NC_021487	AAC	2	6	2320982	2320987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45013	NC_021487	CTT	2	6	2321106	2321111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45014	NC_021487	T	6	6	2321131	2321136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45015	NC_021487	TAT	2	6	2321181	2321186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45016	NC_021487	AGG	2	6	2321282	2321287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45017	NC_021487	TAC	2	6	2321333	2321338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551969
45018	NC_021487	G	6	6	2321366	2321371	0 %	0 %	100 %	0 %	512551969
45019	NC_021487	CTT	2	6	2321386	2321391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551969
45020	NC_021487	TGCCG	2	10	2321422	2321431	0 %	20 %	40 %	40 %	512551969
45021	NC_021487	GAA	2	6	2321476	2321481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551969
45022	NC_021487	CCAA	2	8	2321519	2321526	50 %	0 %	0 %	50 %	512551970
45023	NC_021487	GGT	2	6	2321550	2321555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551970
45024	NC_021487	TG	3	6	2321566	2321571	0 %	50 %	50 %	0 %	512551970
45025	NC_021487	GCT	3	9	2321704	2321712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551970
45026	NC_021487	GAA	2	6	2321714	2321719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551970
45027	NC_021487	TAG	2	6	2321738	2321743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45028	NC_021487	CAA	2	6	2321787	2321792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45029	NC_021487	GCC	2	6	2321803	2321808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45030	NC_021487	GAA	2	6	2321846	2321851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45031	NC_021487	GAG	3	9	2321852	2321860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45032	NC_021487	AG	3	6	2321880	2321885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45033	NC_021487	GTCGC	2	10	2321938	2321947	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45034	NC_021487	CAG	2	6	2322026	2322031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45035	NC_021487	GAAG	2	8	2322037	2322044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45036	NC_021487	TCCT	2	8	2322075	2322082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45037	NC_021487	ACG	2	6	2322095	2322100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45038	NC_021487	GGA	2	6	2322130	2322135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45039	NC_021487	GGA	2	6	2322208	2322213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551971
45040	NC_021487	GA	3	6	2322212	2322217	50 %	0 %	50 %	0 %	512551971
45041	NC_021487	CTT	2	6	2322244	2322249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551971
45042	NC_021487	C	6	6	2322295	2322300	0 %	0 %	0 %	100 %	512551971
45043	NC_021487	CTGC	2	8	2322400	2322407	0 %	25 %	25 %	50 %	512551971
45044	NC_021487	GTG	2	6	2322443	2322448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551971
45045	NC_021487	CTA	2	6	2322550	2322555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551971
45046	NC_021487	GCT	2	6	2322573	2322578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551971
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45048	NC_021487	CAT	2	6	2322631	2322636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551971
45049	NC_021487	CG	3	6	2322684	2322689	0 %	0 %	50 %	50 %	512551971
45050	NC_021487	CCG	2	6	2322717	2322722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551971
45051	NC_021487	GGA	2	6	2322745	2322750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551971
45052	NC_021487	CCA	2	6	2322816	2322821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551971
45053	NC_021487	CCG	2	6	2322849	2322854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551971
45054	NC_021487	GCC	2	6	2322857	2322862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551971
45055	NC_021487	GTG	2	6	2323052	2323057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551971
45056	NC_021487	GCC	2	6	2323085	2323090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551971
45057	NC_021487	GTG	2	6	2323136	2323141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551971
45058	NC_021487	A	6	6	2323170	2323175	100 %	0 %	0 %	0 %	512551971
45059	NC_021487	GCT	2	6	2323234	2323239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551971
45060	NC_021487	GGT	2	6	2323291	2323296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551971
45061	NC_021487	GATG	2	8	2323350	2323357	25 %	25 %	50 %	0 %	512551971
45062	NC_021487	TGG	2	6	2323394	2323399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551971
45063	NC_021487	TGG	2	6	2323418	2323423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551971
45064	NC_021487	CGA	2	6	2323426	2323431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551971
45065	NC_021487	GGGAG	2	10	2323432	2323441	20 %	0 %	80 %	0 %	512551971
45066	NC_021487	CGCA	2	8	2323456	2323463	25 %	0 %	25 %	50 %	512551971
45067	NC_021487	AAGATG	2	12	2323509	2323520	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512551971
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45069	NC_021487	CCA	2	6	2323608	2323613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551971
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45072	NC_021487	CTG	2	6	2323724	2323729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551971
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45075	NC_021487	GAGCAA	2	12	2323816	2323827	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512551971
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45082	NC_021487	GCC	2	6	2324239	2324244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551971
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45088	NC_021487	GCC	2	6	2324494	2324499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551971
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45091	NC_021487	TC	3	6	2324606	2324611	0 %	50 %	0 %	50 %	512551971
45092	NC_021487	CAG	2	6	2324630	2324635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551971
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45094	NC_021487	GC	3	6	2324809	2324814	0 %	0 %	50 %	50 %	512551971
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45098	NC_021487	TCCAT	2	10	2324945	2324954	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45099	NC_021487	CGA	2	6	2324972	2324977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45100	NC_021487	CTG	2	6	2325041	2325046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551972
45101	NC_021487	CGT	2	6	2325082	2325087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551972
45102	NC_021487	CGC	2	6	2325109	2325114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551972
45103	NC_021487	GGTT	2	8	2325126	2325133	0 %	50 %	50 %	0 %	512551972
45104	NC_021487	CTG	2	6	2325158	2325163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551972
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45106	NC_021487	AGC	2	6	2325213	2325218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551972
45107	NC_021487	CGTGGA	2	12	2325219	2325230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512551972
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45110	NC_021487	GTT	2	6	2325365	2325370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551972
45111	NC_021487	CCGC	2	8	2325394	2325401	0 %	0 %	25 %	75 %	512551972
45112	NC_021487	GTT	2	6	2325435	2325440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551972
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45117	NC_021487	CGG	2	6	2325724	2325729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551972
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45119	NC_021487	GAG	2	6	2325772	2325777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551972
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45229	NC_021487	TTC	2	6	2330472	2330477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45232	NC_021487	GTG	2	6	2330538	2330543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45233	NC_021487	GCT	2	6	2330648	2330653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551978
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45236	NC_021487	CAT	2	6	2330814	2330819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551978
45237	NC_021487	TG	3	6	2330875	2330880	0 %	50 %	50 %	0 %	512551978
45238	NC_021487	CAA	2	6	2331063	2331068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551978
45239	NC_021487	CAG	2	6	2331069	2331074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551978
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45241	NC_021487	CAC	2	6	2331132	2331137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551978
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45273	NC_021487	TCC	2	6	2332770	2332775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45274	NC_021487	GA	3	6	2332836	2332841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45275	NC_021487	TGGAA	2	10	2332870	2332879	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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45298	NC_021487	GGCA	2	8	2334171	2334178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45299	NC_021487	TGGT	2	8	2334206	2334213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45300	NC_021487	C	6	6	2334226	2334231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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45304	NC_021487	GT	3	6	2334345	2334350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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45306	NC_021487	TGGT	2	8	2334456	2334463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45307	NC_021487	C	6	6	2334476	2334481	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45308	NC_021487	TCG	2	6	2334509	2334514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45313	NC_021487	TG	3	6	2334757	2334762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45314	NC_021487	AAG	2	6	2334939	2334944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45316	NC_021487	TTCG	2	8	2335020	2335027	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45317	NC_021487	GGA	2	6	2335030	2335035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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45319	NC_021487	GC	3	6	2335074	2335079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45320	NC_021487	AGG	2	6	2335118	2335123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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45332	NC_021487	ATCA	2	8	2335586	2335593	50 %	25 %	0 %	25 %	512551982
45333	NC_021487	GGTG	2	8	2335615	2335622	0 %	25 %	75 %	0 %	512551982
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45337	NC_021487	GCTG	2	8	2335708	2335715	0 %	25 %	50 %	25 %	512551982
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45341	NC_021487	ACC	2	6	2335934	2335939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551982
45342	NC_021487	CTA	2	6	2335981	2335986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551982
45343	NC_021487	ACT	3	9	2336001	2336009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551982
45344	NC_021487	GCTC	2	8	2336112	2336119	0 %	25 %	25 %	50 %	512551982
45345	NC_021487	ACCGGT	2	12	2336120	2336131	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512551982
45346	NC_021487	CAA	2	6	2336347	2336352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551982
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45350	NC_021487	CAACC	2	10	2336596	2336605	40 %	0 %	0 %	60 %	512551982
45351	NC_021487	CGG	2	6	2336668	2336673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551982
45352	NC_021487	TCG	3	9	2336739	2336747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551982
45353	NC_021487	CAA	2	6	2336776	2336781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551982
45354	NC_021487	CCGA	2	8	2336864	2336871	25 %	0 %	25 %	50 %	512551982
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45470	NC_021487	AG	3	6	2343150	2343155	50 %	0 %	50 %	0 %	512551986
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45475	NC_021487	CT	3	6	2343361	2343366	0 %	50 %	0 %	50 %	512551986
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