MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42503	NC_021487	CACC	2	8	2194576	2194583	25 %	0 %	0 %	75 %	512551861
42504	NC_021487	TCC	2	6	2194687	2194692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551861
42505	NC_021487	TCA	2	6	2194794	2194799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551861
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42512	NC_021487	TTC	2	6	2195297	2195302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551862
42513	NC_021487	GCA	2	6	2195340	2195345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551862
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42519	NC_021487	CGCC	2	8	2195630	2195637	0 %	0 %	25 %	75 %	512551862
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42522	NC_021487	A	6	6	2195856	2195861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42523	NC_021487	CT	3	6	2195904	2195909	0 %	50 %	0 %	50 %	512551863
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42535	NC_021487	GCATA	2	10	2196754	2196763	40 %	20 %	20 %	20 %	512551864
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42588	NC_021487	CGGC	2	8	2199782	2199789	0 %	0 %	50 %	50 %	512551865
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42614	NC_021487	TTTCA	2	10	2201030	2201039	20 %	60 %	0 %	20 %	512551866
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42617	NC_021487	GGA	2	6	2201183	2201188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42618	NC_021487	GCA	2	6	2201205	2201210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42619	NC_021487	GCC	2	6	2201359	2201364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551867
42620	NC_021487	GCA	2	6	2201399	2201404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551867
42621	NC_021487	GCC	3	9	2201416	2201424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551867
42622	NC_021487	CCG	2	6	2201434	2201439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551867
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42626	NC_021487	ATC	2	6	2201524	2201529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551867
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42675	NC_021487	CCT	2	6	2203726	2203731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42676	NC_021487	GA	3	6	2204023	2204028	50 %	0 %	50 %	0 %	512551870
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42693	NC_021487	CGTGG	2	10	2205050	2205059	0 %	20 %	60 %	20 %	512551871
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42735	NC_021487	GAG	2	6	2207318	2207323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551872
42736	NC_021487	AGG	2	6	2207430	2207435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551872
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42738	NC_021487	AAG	2	6	2207501	2207506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551872
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42740	NC_021487	G	6	6	2207540	2207545	0 %	0 %	100 %	0 %	512551872
42741	NC_021487	GCT	2	6	2207553	2207558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551872
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42751	NC_021487	CT	3	6	2207960	2207965	0 %	50 %	0 %	50 %	512551872
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42756	NC_021487	ATC	2	6	2208138	2208143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551872
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42767	NC_021487	TTA	2	6	2208887	2208892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42768	NC_021487	TCT	2	6	2208988	2208993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551873
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42852	NC_021487	GCA	2	6	2214071	2214076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551878
42853	NC_021487	AG	3	6	2214083	2214088	50 %	0 %	50 %	0 %	512551878
42854	NC_021487	GAA	2	6	2214103	2214108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551878
42855	NC_021487	TCC	2	6	2214128	2214133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551878
42856	NC_021487	GT	3	6	2214146	2214151	0 %	50 %	50 %	0 %	512551878
42857	NC_021487	AGG	2	6	2214173	2214178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551878
42858	NC_021487	GAA	2	6	2214180	2214185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551878
42859	NC_021487	CAA	2	6	2214216	2214221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551878
42860	NC_021487	GCTG	2	8	2214227	2214234	0 %	25 %	50 %	25 %	512551878
42861	NC_021487	CAA	2	6	2214361	2214366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551878
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42863	NC_021487	AAGC	2	8	2214396	2214403	50 %	0 %	25 %	25 %	512551878
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42865	NC_021487	GC	3	6	2214553	2214558	0 %	0 %	50 %	50 %	512551878
42866	NC_021487	ACCGT	2	10	2214599	2214608	20 %	20 %	20 %	40 %	512551878
42867	NC_021487	TGGA	2	8	2214657	2214664	25 %	25 %	50 %	0 %	512551878
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42874	NC_021487	TGT	2	6	2215153	2215158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551879
42875	NC_021487	GT	3	6	2215157	2215162	0 %	50 %	50 %	0 %	512551879
42876	NC_021487	GAGGTG	2	12	2215185	2215196	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	512551879
42877	NC_021487	GGA	2	6	2215199	2215204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551879
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42879	NC_021487	GCT	2	6	2215281	2215286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551879
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42881	NC_021487	CCG	2	6	2215355	2215360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551879
42882	NC_021487	CCA	2	6	2215403	2215408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551879
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42885	NC_021487	GAG	2	6	2215621	2215626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42886	NC_021487	AG	3	6	2215679	2215684	50 %	0 %	50 %	0 %	512551880
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42902	NC_021487	CCGT	2	8	2216259	2216266	0 %	25 %	25 %	50 %	512551881
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42906	NC_021487	GCA	2	6	2216377	2216382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551881
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42909	NC_021487	GCAG	2	8	2216467	2216474	25 %	0 %	50 %	25 %	512551881
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42913	NC_021487	CT	3	6	2216650	2216655	0 %	50 %	0 %	50 %	512551881
42914	NC_021487	GAT	2	6	2216663	2216668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551881
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42925	NC_021487	TCT	2	6	2217122	2217127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42926	NC_021487	CT	3	6	2217126	2217131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42927	NC_021487	T	7	7	2217140	2217146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42928	NC_021487	GC	4	8	2217239	2217246	0 %	0 %	50 %	50 %	512551882
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42932	NC_021487	ATCC	2	8	2217455	2217462	25 %	25 %	0 %	50 %	512551882
42933	NC_021487	CCAG	2	8	2217471	2217478	25 %	0 %	25 %	50 %	512551882
42934	NC_021487	GC	3	6	2217493	2217498	0 %	0 %	50 %	50 %	512551882
42935	NC_021487	TC	3	6	2217504	2217509	0 %	50 %	0 %	50 %	512551882
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42947	NC_021487	GC	3	6	2218266	2218271	0 %	0 %	50 %	50 %	512551882
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42950	NC_021487	CAC	2	6	2218369	2218374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551882
42951	NC_021487	CGCC	2	8	2218404	2218411	0 %	0 %	25 %	75 %	512551882
42952	NC_021487	CT	3	6	2218481	2218486	0 %	50 %	0 %	50 %	512551882
42953	NC_021487	GAT	2	6	2218497	2218502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551882
42954	NC_021487	GAC	2	6	2218594	2218599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551882
42955	NC_021487	CCT	2	6	2218626	2218631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551882
42956	NC_021487	CAGCG	2	10	2218654	2218663	20 %	0 %	40 %	40 %	512551882
42957	NC_021487	TCC	2	6	2218735	2218740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42958	NC_021487	CT	3	6	2218813	2218818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42959	NC_021487	CTT	2	6	2218861	2218866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42960	NC_021487	CAG	2	6	2218880	2218885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42961	NC_021487	GCA	2	6	2218893	2218898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42962	NC_021487	AG	3	6	2218900	2218905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42963	NC_021487	CGG	2	6	2218964	2218969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551883
42964	NC_021487	CGTG	2	8	2219031	2219038	0 %	25 %	50 %	25 %	512551883
42965	NC_021487	T	6	6	2219093	2219098	0 %	100 %	0 %	0 %	512551883
42966	NC_021487	CCG	2	6	2219134	2219139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551883
42967	NC_021487	CGG	2	6	2219190	2219195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551883
42968	NC_021487	GAC	2	6	2219211	2219216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551883
42969	NC_021487	CG	3	6	2219228	2219233	0 %	0 %	50 %	50 %	512551883
42970	NC_021487	T	6	6	2219254	2219259	0 %	100 %	0 %	0 %	512551883
42971	NC_021487	GTA	2	6	2219298	2219303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551883
42972	NC_021487	CCG	2	6	2219317	2219322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551883
42973	NC_021487	TCG	2	6	2219324	2219329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551883
42974	NC_021487	TCT	2	6	2219357	2219362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551883
42975	NC_021487	GCC	2	6	2219386	2219391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551883
42976	NC_021487	TGCA	2	8	2219448	2219455	25 %	25 %	25 %	25 %	512551883
42977	NC_021487	CTCC	2	8	2219480	2219487	0 %	25 %	0 %	75 %	512551883
42978	NC_021487	CA	3	6	2219526	2219531	50 %	0 %	0 %	50 %	512551883
42979	NC_021487	ATA	2	6	2219566	2219571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551883
42980	NC_021487	TGT	2	6	2219589	2219594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551883
42981	NC_021487	ATCCAC	2	12	2219616	2219627	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512551883
42982	NC_021487	TCT	2	6	2219696	2219701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551883
42983	NC_021487	TCG	2	6	2219729	2219734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551883
42984	NC_021487	GCC	2	6	2219787	2219792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551883
42985	NC_021487	ACA	2	6	2219872	2219877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551883
42986	NC_021487	TCT	2	6	2219978	2219983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42987	NC_021487	TGC	2	6	2220005	2220010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551884
42988	NC_021487	CAAC	2	8	2220276	2220283	50 %	0 %	0 %	50 %	512551884
42989	NC_021487	GCG	2	6	2220353	2220358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551884
42990	NC_021487	CAC	2	6	2220412	2220417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551884
42991	NC_021487	A	6	6	2220437	2220442	100 %	0 %	0 %	0 %	512551884
42992	NC_021487	A	6	6	2220565	2220570	100 %	0 %	0 %	0 %	512551884
42993	NC_021487	AAAG	2	8	2220675	2220682	75 %	0 %	25 %	0 %	512551885
42994	NC_021487	CTAT	2	8	2220691	2220698	25 %	50 %	0 %	25 %	512551885
42995	NC_021487	GTA	2	6	2220855	2220860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551885
42996	NC_021487	GCA	3	9	2220866	2220874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551885
42997	NC_021487	GCG	2	6	2220884	2220889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551885
42998	NC_021487	AGC	2	6	2220934	2220939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551885
42999	NC_021487	CTG	2	6	2220984	2220989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551885
43000	NC_021487	TGTA	2	8	2221036	2221043	25 %	50 %	25 %	0 %	512551885

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