MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_021487	CGC	2	6	2145252	2145257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551824
41502	NC_021487	ACCCG	2	10	2145277	2145286	20 %	0 %	20 %	60 %	512551824
41503	NC_021487	CAT	2	6	2145320	2145325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551824
41504	NC_021487	CGT	2	6	2145336	2145341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551824
41505	NC_021487	CGT	2	6	2145380	2145385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551824
41506	NC_021487	GCT	2	6	2145414	2145419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551824
41507	NC_021487	ACTG	2	8	2145483	2145490	25 %	25 %	25 %	25 %	512551824
41508	NC_021487	GCT	2	6	2145551	2145556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551824
41509	NC_021487	GTG	2	6	2145652	2145657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551824
41510	NC_021487	GTCG	2	8	2145669	2145676	0 %	25 %	50 %	25 %	512551824
41511	NC_021487	GTT	3	9	2145720	2145728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551824
41512	NC_021487	TGC	2	6	2145758	2145763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551824
41513	NC_021487	GGTC	2	8	2145797	2145804	0 %	25 %	50 %	25 %	512551824
41514	NC_021487	CTG	3	9	2145897	2145905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551824
41515	NC_021487	CGT	3	9	2145924	2145932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551824
41516	NC_021487	TGA	2	6	2145973	2145978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551824
41517	NC_021487	ACC	2	6	2145991	2145996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551824
41518	NC_021487	CGTC	2	8	2146049	2146056	0 %	25 %	25 %	50 %	512551824
41519	NC_021487	CCA	2	6	2146064	2146069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551824
41520	NC_021487	CGT	2	6	2146071	2146076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41521	NC_021487	CTG	2	6	2146099	2146104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41522	NC_021487	N	464	464	2146169	2146632	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41523	NC_021487	CCT	2	6	2146636	2146641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41524	NC_021487	AG	3	6	2146658	2146663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41525	NC_021487	GGC	2	6	2146756	2146761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41526	NC_021487	GA	3	6	2146780	2146785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41527	NC_021487	C	7	7	2146817	2146823	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41528	NC_021487	GCG	2	6	2146831	2146836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41529	NC_021487	G	14	14	2146850	2146863	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41530	NC_021487	C	6	6	2146882	2146887	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41531	NC_021487	G	6	6	2146906	2146911	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41532	NC_021487	G	14	14	2146923	2146936	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41533	NC_021487	CTT	2	6	2146960	2146965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41534	NC_021487	TGT	2	6	2146974	2146979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41535	NC_021487	TCT	2	6	2147081	2147086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41536	NC_021487	AGTA	2	8	2147167	2147174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41537	NC_021487	AC	3	6	2147177	2147182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41538	NC_021487	T	6	6	2147204	2147209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41539	NC_021487	T	6	6	2147227	2147232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41540	NC_021487	GA	3	6	2147235	2147240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41541	NC_021487	T	7	7	2147241	2147247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41542	NC_021487	AG	3	6	2147358	2147363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41543	NC_021487	CGC	2	6	2147401	2147406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41544	NC_021487	AGA	2	6	2147411	2147416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41545	NC_021487	CGT	2	6	2147481	2147486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41546	NC_021487	GAA	2	6	2147508	2147513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41547	NC_021487	TTTC	2	8	2147632	2147639	0 %	75 %	0 %	25 %	512551825
41548	NC_021487	ACC	2	6	2147665	2147670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551825
41549	NC_021487	TG	3	6	2147759	2147764	0 %	50 %	50 %	0 %	512551825
41550	NC_021487	ACC	2	6	2147860	2147865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551825
41551	NC_021487	CTC	2	6	2148031	2148036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551825
41552	NC_021487	CTTC	2	8	2148086	2148093	0 %	50 %	0 %	50 %	512551825
41553	NC_021487	CCT	2	6	2148111	2148116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41554	NC_021487	TAGAGC	2	12	2148271	2148282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512551826
41555	NC_021487	GGT	2	6	2148302	2148307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551826
41556	NC_021487	CG	3	6	2148325	2148330	0 %	0 %	50 %	50 %	512551826
41557	NC_021487	GC	3	6	2148333	2148338	0 %	0 %	50 %	50 %	512551826
41558	NC_021487	AGG	2	6	2148371	2148376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551826
41559	NC_021487	CGCC	2	8	2148407	2148414	0 %	0 %	25 %	75 %	512551826
41560	NC_021487	GCC	2	6	2148468	2148473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551826
41561	NC_021487	CCG	2	6	2148500	2148505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551826
41562	NC_021487	GCC	2	6	2148534	2148539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551826
41563	NC_021487	GTT	2	6	2148548	2148553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551826
41564	NC_021487	GCC	2	6	2148579	2148584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551826
41565	NC_021487	CTT	2	6	2148716	2148721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551826
41566	NC_021487	CAT	2	6	2148731	2148736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551826
41567	NC_021487	GCGT	2	8	2148785	2148792	0 %	25 %	50 %	25 %	512551826
41568	NC_021487	GAAC	2	8	2148869	2148876	50 %	0 %	25 %	25 %	512551826
41569	NC_021487	AGC	2	6	2148880	2148885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551826
41570	NC_021487	GAA	2	6	2148894	2148899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551826
41571	NC_021487	GC	3	6	2149034	2149039	0 %	0 %	50 %	50 %	512551826
41572	NC_021487	GTG	2	6	2149068	2149073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551826
41573	NC_021487	GCT	2	6	2149097	2149102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551826
41574	NC_021487	AGG	2	6	2149178	2149183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551826
41575	NC_021487	GGA	2	6	2149253	2149258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551826
41576	NC_021487	CAG	2	6	2149320	2149325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551826
41577	NC_021487	CTG	2	6	2149401	2149406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551826
41578	NC_021487	CGG	2	6	2149432	2149437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551826
41579	NC_021487	GA	5	10	2149477	2149486	50 %	0 %	50 %	0 %	512551826
41580	NC_021487	GTG	2	6	2149494	2149499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551826
41581	NC_021487	CA	3	6	2149505	2149510	50 %	0 %	0 %	50 %	512551826
41582	NC_021487	TCGA	2	8	2149573	2149580	25 %	25 %	25 %	25 %	512551826
41583	NC_021487	GA	3	6	2149579	2149584	50 %	0 %	50 %	0 %	512551826
41584	NC_021487	GT	3	6	2149603	2149608	0 %	50 %	50 %	0 %	512551826
41585	NC_021487	CTC	2	6	2149625	2149630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551826
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41587	NC_021487	CAG	2	6	2149680	2149685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551826
41588	NC_021487	GC	4	8	2149686	2149693	0 %	0 %	50 %	50 %	512551826
41589	NC_021487	AGC	2	6	2149735	2149740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551826
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41591	NC_021487	CGC	2	6	2149760	2149765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551826
41592	NC_021487	GCC	2	6	2149788	2149793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551826
41593	NC_021487	ACGCGC	2	12	2149808	2149819	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512551826
41594	NC_021487	AGG	3	9	2149882	2149890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551826
41595	NC_021487	TC	3	6	2149901	2149906	0 %	50 %	0 %	50 %	512551826
41596	NC_021487	GCC	2	6	2150022	2150027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551826
41597	NC_021487	CAC	2	6	2150070	2150075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551826
41598	NC_021487	TCG	2	6	2150081	2150086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551826
41599	NC_021487	GAA	2	6	2150144	2150149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551826
41600	NC_021487	GC	3	6	2150180	2150185	0 %	0 %	50 %	50 %	512551826
41601	NC_021487	ACA	2	6	2150229	2150234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551826
41602	NC_021487	GAT	2	6	2150370	2150375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551826
41603	NC_021487	GCC	2	6	2150382	2150387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551826
41604	NC_021487	GGGAA	2	10	2150415	2150424	40 %	0 %	60 %	0 %	512551826
41605	NC_021487	TCA	2	6	2150447	2150452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551826
41606	NC_021487	GACC	2	8	2150459	2150466	25 %	0 %	25 %	50 %	512551826
41607	NC_021487	GGC	2	6	2150508	2150513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551826
41608	NC_021487	GAG	2	6	2150565	2150570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41609	NC_021487	ATGGG	2	10	2150578	2150587	20 %	20 %	60 %	0 %	512551827
41610	NC_021487	TGG	2	6	2150590	2150595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551827
41611	NC_021487	GGA	2	6	2150626	2150631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551827
41612	NC_021487	GGC	2	6	2150650	2150655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551827
41613	NC_021487	CTG	2	6	2150695	2150700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551827
41614	NC_021487	ACCT	2	8	2150737	2150744	25 %	25 %	0 %	50 %	512551827
41615	NC_021487	TGGG	2	8	2150749	2150756	0 %	25 %	75 %	0 %	512551827
41616	NC_021487	CTG	2	6	2150767	2150772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551827
41617	NC_021487	GT	3	6	2150870	2150875	0 %	50 %	50 %	0 %	512551828
41618	NC_021487	GCT	2	6	2150890	2150895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551828
41619	NC_021487	GCC	2	6	2150905	2150910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551828
41620	NC_021487	TCT	2	6	2150935	2150940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551828
41621	NC_021487	TGG	2	6	2150957	2150962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551828
41622	NC_021487	AG	3	6	2150990	2150995	50 %	0 %	50 %	0 %	512551828
41623	NC_021487	CCT	2	6	2151008	2151013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551828
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41625	NC_021487	CT	3	6	2151038	2151043	0 %	50 %	0 %	50 %	512551828
41626	NC_021487	GTG	2	6	2151052	2151057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551828
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41657	NC_021487	TAG	2	6	2152601	2152606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551829
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41667	NC_021487	AAG	2	6	2153097	2153102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551830
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41682	NC_021487	GAAA	2	8	2154145	2154152	75 %	0 %	25 %	0 %	512551830
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41688	NC_021487	TAG	2	6	2154258	2154263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551831
41689	NC_021487	TAG	2	6	2154268	2154273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551831
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41706	NC_021487	CT	3	6	2154868	2154873	0 %	50 %	0 %	50 %	512551831
41707	NC_021487	GC	3	6	2154898	2154903	0 %	0 %	50 %	50 %	512551831
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41710	NC_021487	TGT	2	6	2155123	2155128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551831
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41718	NC_021487	CGCC	2	8	2155572	2155579	0 %	0 %	25 %	75 %	512551832
41719	NC_021487	GC	3	6	2155660	2155665	0 %	0 %	50 %	50 %	512551832
41720	NC_021487	TCG	2	6	2155679	2155684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551832
41721	NC_021487	A	6	6	2155798	2155803	100 %	0 %	0 %	0 %	512551832
41722	NC_021487	TGA	2	6	2155809	2155814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551832
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41725	NC_021487	CTC	2	6	2155912	2155917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551832
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41728	NC_021487	GCC	2	6	2156074	2156079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551832
41729	NC_021487	CAC	2	6	2156083	2156088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551832
41730	NC_021487	CGATGG	3	18	2156163	2156180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512551832
41731	NC_021487	CTT	2	6	2156189	2156194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551832
41732	NC_021487	GC	3	6	2156206	2156211	0 %	0 %	50 %	50 %	512551832
41733	NC_021487	CAC	2	6	2156212	2156217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551832
41734	NC_021487	TG	3	6	2156494	2156499	0 %	50 %	50 %	0 %	512551832
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41854	NC_021487	GCG	2	6	2162999	2163004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551835
41855	NC_021487	T	7	7	2163010	2163016	0 %	100 %	0 %	0 %	512551835
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41969	NC_021487	TCG	2	6	2168620	2168625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551840
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41971	NC_021487	GAT	2	6	2168679	2168684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551840
41972	NC_021487	ATGG	2	8	2168691	2168698	25 %	25 %	50 %	0 %	512551840
41973	NC_021487	GTAC	2	8	2168776	2168783	25 %	25 %	25 %	25 %	512551840
41974	NC_021487	AAG	2	6	2168969	2168974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551841
41975	NC_021487	CCGG	2	8	2169008	2169015	0 %	0 %	50 %	50 %	512551841
41976	NC_021487	CTC	2	6	2169060	2169065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551841
41977	NC_021487	GC	4	8	2169122	2169129	0 %	0 %	50 %	50 %	512551841
41978	NC_021487	TCGAT	2	10	2169167	2169176	20 %	40 %	20 %	20 %	512551841
41979	NC_021487	CTG	2	6	2169285	2169290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551841
41980	NC_021487	GTT	2	6	2169381	2169386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551841
41981	NC_021487	ACG	2	6	2169418	2169423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551841
41982	NC_021487	GAAA	2	8	2169502	2169509	75 %	0 %	25 %	0 %	512551841
41983	NC_021487	AGC	2	6	2169552	2169557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551841
41984	NC_021487	GCC	2	6	2169579	2169584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551841
41985	NC_021487	CG	3	6	2169602	2169607	0 %	0 %	50 %	50 %	512551841
41986	NC_021487	ACGC	2	8	2169611	2169618	25 %	0 %	25 %	50 %	512551841
41987	NC_021487	GGT	2	6	2169657	2169662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551841
41988	NC_021487	TCC	2	6	2169682	2169687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551841
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41990	NC_021487	TTC	2	6	2169877	2169882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551841
41991	NC_021487	CCAT	2	8	2169931	2169938	25 %	25 %	0 %	50 %	512551841
41992	NC_021487	CAA	2	6	2169968	2169973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551841
41993	NC_021487	CGTC	2	8	2170168	2170175	0 %	25 %	25 %	50 %	512551841
41994	NC_021487	T	7	7	2170217	2170223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41995	NC_021487	CTT	2	6	2170228	2170233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41996	NC_021487	AGA	2	6	2170324	2170329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551842
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41999	NC_021487	AG	3	6	2170584	2170589	50 %	0 %	50 %	0 %	512551842
42000	NC_021487	ATC	2	6	2170633	2170638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551842

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